Książka Abstraktów III SKBM

5/27/2018 Ksika Abstraktw III SKBM

1/119

III Studencka KonferencjaBiologii Molekularnej

d, 20-22 marca 2014 roku

Ksika abstraktw


2/119

Opiekunowie k naukowc!"

Studenckie Koo Naukowe Modych Biofizykw dr hab. ukasz PuaskiSekcja enetyczna Studenckie!o Koa Naukowe!o Bio"o!w dr hab. #o$asz %"iwi&ski' (rof. )

Koordnator#"

uzik Kas(er#o$a Monika

Komitet or$ani#ac%n"

Bartko *wa Koche" Krzysztof Bia"ik Piotr Koryci&ska +nna

&orowska 'mi(ia Kuk(ewic# )#abe(a*ieniewski +dam emies# +$ata*#ubatka +nna ie(c#arek +(eksandra.$as /au(ina owak rs#u(a'ppa ukas# O(e%nic#ak #mon3orna(c#k Karo(ina /itek /awe3ra%kowska Kin$a ikorska onikaa%ek abrie(a rebr#5ski ic!are(a Karo(ina 6a(c#ak +nna7enin$ /au(ina 6erecki /r#emsawKare5ko +$nies#ka

!ttp"88www9stud9bio(9uni9(od#9p(8:sknmb8


3/119

Wstp

Drodzy Uczestnicy,

z ogromn przyjemnoci witamy Was na II Studenckiej Konferencji Biologii Molekularnej, ktrej

idea po raz kolejny dosz!a do skutku dzi"ki wsp!pracy Studenckiego Ko!a #aukowego M!odyc$

Biofizykw, Sekcji %enetycznej Studenckiego Ko!a #aukowego Biologw oraz dzi"ki opiekunom

naukowym w&w k! ' (gromnie pomocne )y!o rwnie* wsparcie ze strony W!adz +niwersytetu

dzkiego i samego Wydzia!u Biologii i (c$rony -rodowiska, za co pragniemy serdecznie

podzi"kowa.'

/ako studenci, przyszli naukowcy oraz uczestnicy konferencji naukowyc$, pragn"limy

stworzy. w!asn konferencj", ktrej tematyka dotyczy!a)y szeroko poj"tego zagadnienia, jakim

jest )iologia molekularna' 0esz!oroczne efekty pokaza!y nam, i* jestemy w stanie zrealizowa.

nasze zamierzenia' 1latego te* w o)ecnym roku akademickim, c$cemy powtrzy. u)ieg!oroczne

osigni"cia' 2o wi"cej, naszym zamys!em jest udoskonalenie prze)iegu tego wydarzenia, a)y

stworzy. jeszcze lepsze warunki, mo*liwoci interdyscyplinarnego porozumienia, wymiany

dowiadcze3, spostrze*e3, analizy wynikw )ada3, wzajemnej inspiracji do stawiania pyta3

i szukania odpowiedzi'

0ac$"camy nowyc$ +czestnikw do skorzystania z czasu konferencji w pe!nym jego

wymiarze, a wi"c nawizania kontaktw nie tylko na stopie zawodowej, ale tak*e towarzyskiej oraz

zapoznania si" pokrtce z odzi, jej $istori i arc$itektur' 1la os), ktre po raz drugi zaszczycnas swoj o)ecnoci, namawiamy do odwie*enia kontaktw i wymiany dowiadcze3 minionego

roku'

#aszym celem jest to, a)y III SKBM sprosta!a stawianym wo)ec niej oczekiwaniom i okaza!a

si" jeszcze lepsza od poprzedniej, co spowoduje, *e )"dziemy mogli Was ponownie powita. za

rok'

Organizatorzy III Studenckiej

Konferencji Biologii Molekularnej


4/119

Sesje referatowe:

Genotoksyczne dziaanie WP 631 oraz epotilonu B, podanych cznie, w komrkach raka anika !"#$%3&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&1'

Wpyw o(ni)one ekspresi #%Glc*+c transerazy na ekspres- wy(ranych .enw re.ulowanych przez kompleksyPolycom( w komrkach raka piersi&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&11

Identyfikacja oraz charakterystyka fizjologiczna i molekularna bakterii psychrofilnych

z Jardine Peak (Antarktyda)............ ............... ............... ............... ............... ............... ................ ............... .............. ..... ..... ...1

#dpowied/ humoralna w zakresie przeciwcia 0.G przeciwko 2elico(acter pylori a polimorizm .enu receptorac4500+ w choro(ie niedokrwienne serca&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&13

Badanie symulacyne wasnoci statystyk pokrycia 7*+ w procesach sekwenconowania&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&18

Pr(a wykazania aktywnoci ureolityczne w klinicznych szczepachPseudomonas aeruginosa&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&19

Proapoptotyczne waciwoci ko(altowych pochodnych errocenylowych wz.l-dem ludzkich komrekraka sutka :; i (iaaczki :


5/119

Sesje posterowe:

Bakterie nitkowate w osadzie czynnym @ metody analizy akociowe&&&&&&&&&&&&& &&&&&&&&&&&&&&& &&&&&&&&&&&&&&& &&&&&&&&&&&&&& &&&&& &&&&&& &&&&& &&&&& &36


6/119

36&&&&&&&&&&&&&&& &&&&&&&&&&&&&&& &&&&&&&&&&&&&&& &&&&&&&&&&&&&&& &&&&&&&&&&&&&&& &&&&&&&&&&&&&&& &&&&&&& &&&&& &&&&& &&&&& CA

"inaza aktywowana przez +;P :+;P"> w terapii otyoci i cukrzycy typu &&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&CC

Biolo.iczne waciwoci dendrymerw wiolo.enowo%kar(okrzemowo%osorowych :!;F>&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&1''


7/119

;ikro5*+ a rak prostaty&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&1'9

Kastosowanie metody ?I C= do lokalizaci sekwenci intronowych w ciaach


8/119


9/119

III Studencka Konferencja Biologii Molekularnej

Sesje referatowe


10/119

Sesje referatowe III Studencka Konferencja Biologii Molekularnej

Genotoksyczne dziaanie WP 631 oraz epotilonu B, podanych cznie, w komrkach raka

anika !"#$%3

Barbara Bukowska, Aneta Rogalska, Agnieszka Marczak

Wydzia Biologii i Ochrony rodowiska Uniwersytetu dzkiego, Katedra TermoiologiiNowotwory jajnika stanowi jedn z gwnych przyczyn !ierci wrd kobiet" #decydowana wi$kszo%

przypadkw diagnozowana jest w &&& i &' stadiu! zaawansowania klinicznego, kiedy dost$pne !etody leczenia snieskuteczne" (odstawow !etod walki z ty! rodzaje! nowotworu jest che!ioterapia skojarzona" #astosowaniewi$cej ni) jednego leku u!o)liwia z!niejszenie dawek ka)dego z ko!ponentw ko!binacji" *edny! z gwnychogranicze+ che!ioterapii jest rozwj opornoci wielolekowej, w ty! tak)e na obecnie stosowane leki doksorubicyn$i paklitaksel" -latego zasadne jest poszukiwanie nowych substancji, ktre !og przea!ywa% te ograniczenia"

.( /01 jest now pochodn antracyklinow o plejotropowy! !echaniz!ie dziaania" #wizek ten interkalujedo -NA, wpywa na generowanie wolnych rodnikw, aktywno% topoizo!erazy & i && oraz indukuje apoptoz$ 21, 34"# kolei epotilon B 56po B7, o !echaniz!ie dziaania zbli)ony! do taksanw, stabilizuje !ikrotubule, zapobiegajc ichdepoli!eryzacji, co w konsekwencji zaburza proces !itozy 204" Mi!o od!iennego punktu uchwytu, leki te wywoujten sa! e8ekt !ier% ko!rki dlatego zastosowane cznie !aj szanse dziaa% synergistycznie" 9ipoteza ta zostaa

potwierdzona dla ko!rek :;4 Marczak A", Bukowska B", Rogalska A" 3C10" W% -. and '+o B synergize in 3KO4- human o*ariancancer cells" 6nOiron ?oLicol (har!acol 0 517E 3/=3// doiE 1C"1C1/Pj"etap"3C10"13"CC3"

1C


11/119

III Studencka Konferencja Biologii Molekularnej Sesje referatowe

Wpyw o&ni'one ekspresi #%Glc()c trans*erazy na ekspres+ wy&ranych enw

reulowanych przez kompleksy Polycom& w komrkach raka piersi

(iotr Hiesielski, Magdalena .ojtera, 6wa Qor!a, (awe *Kwiak

;atedra Hytobioche!ii @niwersytetu dzkiego


12/119


-denty*ikaca oraz charakterystyka *izoloiczna i molekularna &akterii psychro*ilnych

z .ardine Peak /)ntarktyda0

(rze!ysaw -ecewicz, ukasz -ziewit

#akad Jenetyki Bakterii, &nstytut Mikrobiologii, .ydzia Biologii, @niwersytet .arszawskiAntarktyka jest ekstre!alny! rodowiskie!, w ktry! podstawowy! czynnikie! li!itujcy! rozwj

organiz!w )ywych jest niska te!peratura" Trednia roczna a!plituda te!peratur w ty! regionie plasuje si$ poni)ejCUH" Mi!o to, wielu organiz!o! udao si$ przystosowa% do tych warunkw, a wrd nich najliczniejsz grup$stanowi bakterie" . ostatnich latach wzrasta zainteresowanie ty!i !ikroorganiz!a!i, !"in" ze wzgl$du na

poszukiwania nowych enzy!w, aktywnych w niskich te!peraturach 214" Ho ciekawe, nadal niewiele wiado!o nate!at rucho!ych ele!entw bakterii psychro8ilnych 234"

Bakterie analizowane w tej pracy pochodz z prbek gleby pobranych ze wzniesienia *ardine (eak, na wyspie;rla *erzego, na Antarktydzie" Badan przez nas pul$ stanowi szczepw bakterii, zakwali8ikowanych do czterechrodzajwE%seudomonas 50I szczepw7, %olaromonas 57,8la*oacterium 5117oraz 00=>>>, May 3C10

13


13/119


#dpowied humoralna w zakresie przeciwcia -G2przeciwkoHelicobacter pylori

a polimor*izm enu receptora c45--) w choro&ie niedokrwienne serca

Matusiak A"1, Jajewski A"1, Hhaubi+ski M"3, Broncel M"3, :trapagiel -"0, Rudnicka ;"1 , Miszczyk

6"1

, Hh!iela M"1

1(racownia Jastroi!!unologii, ;atedra &!!unologii i Biologii &n8ekcyjnej, .ydzia Biologiii dK,0&nstytut Bio8izyki, .ydzia Biologii i


14/119


Badanie symulacyne wasno9ci statystyk pokrycia :() w procesach sekwenconowania

Mateusz Jarbulowski, Andrzej (ola+ski

.ydzia Auto!atyki, 6lektroniki i &n8or!atyki, (olitechnika Tlska

:ekwencjonowanie !etod F:hotgunG jest powszechnie wykorzystywan !etod, dzi$ki ktrej !o)liwy jestodczyt poszczeglnych nukleotydw w a+cuchu -NA" Badanie sy!ulacyjne wasnoci statystyk pokrycia -NA w tej!etodzie su)y lepsze!u przyjrzeniu si$ wado! i zaleto! tej !etody, ktre !ogy by posu)y% jako podstawa do

poprawy jakoci !etody" *ako wasnoci statystyczne w !etodzie F:hotgunG !o)na rozu!ie% wzory przewidujce !in"ilo% powstajcych contigw 5w peni odtworzonych 8rag!entw a+cucha -NA7 214, obliczajce prawdopodobndugo% contigu 2>4 czy wyznaczenie przedziaw u8noci dla !etody za po!oc !odelu"

Hele! projektu jest sy!ulacyjne przebadanie wasnoci statystyk pokrycia -NA w procesachsekwencjonowania" Na chwil$ obecn badanie to dotyczy techniki sekwencjonowania F:hotgunG" (ierwszy! etape!

pracy byo zai!ple!entowanie !etody F:hotgunG = pokrycia -NA" :tworzony !odel opiera si$ o !etody!ate!atyczne andera=.ater!ana234 ktre badaj statystyki pokrycia -NA" #asada jego dziaania jest opartao !etod$ laboratoryjn tego rodzaju sekwencjonowania" (ierwszy! krokie! algoryt!u byo wczytanie sekwencjiw celu pozyskania jej dugoci, a nast$pnie losowy podzia na 8rag!enty o zadanej dugoci" (rogra! na podstawie

8rag!entw odtwarza cae -NA i sprawdza czy nie istniej przerwy w ko+cowy! rezultacie" (rocedura ta odbywaasi$ poprzez sortowanie i nao)enie na siebie kolejnych sekwencji zwanych reada!i" Napisany progra! porwnywauzyskane wyniki z rezultata!i uzyskany!i za po!oc wzorw statystycznych2142042>4" ;olejny! etape! projektu

byo wyznaczenie przedziaw u8noci w oparciu o stworzony !odel" (o stworzeniu przedziaw u8noci przystpionodo przebadania danych dowiadczalnych oraz ich odniesienia do zao)onych !odeli w celu sprawdzenia poprawnoci!etody"

(rezentowane wyniki pokazuj, )e proces sekwencjonowania !etod F:hotgunG !o)na w atwy sposbodtworzy% i bada% za po!oc ko!putera oraz, )e stworzony !odel pozwala na wery8ikacje danych rzeczywistych"

214 A" (ola+ski, M" ;i!!el WBioin8or!aticsG, 3tatistics o# the 6enome 5o*erage,3>0=33, 3CC

234 6ric :" ander, Michael :" .ater!an WJeno!ic Mapping by Qingerprinting Rando! HlonesEA Mathe!atical AnalysisG, 6enomics >, 301=30 51II7

204 Michael H" .endl, :hiaw=(yng ang WJap statistics 8or whole geno!e shotgun -NA se_uencing projectsG,Bioin#ormatics, 13=10> Ool" 3C no" 1C 3CC>

2>4 Michael H" .endl, Robert 9" .aterson WJeneralized Jap Model 8or Bacterial arti8icial Hhro!oso!e HloneQingerprint Mapping and :hotgun :e_uencingG 6enome ?es110>=10, 3CC3

1>


15/119


Pr&a wykazania aktywno9ci ureolityczne w klinicznych szczepachPseudomonas aeruginosa

-awid J!iter , Jrzegorz Hzerwonka, .iesaw ;aca

#akad Mikrobiologii, @niwersytet *ana ;ochanowskiego w ;ielcach

Wst+p;@reaza jest enzy!e!, ktrego rola polega na hydrolizie !ocznika z wytworzenie! a!oniaku i dwutlenkuw$gla" . przypadku =elicoacter +ylori skada si$ z dwch polipeptydw @reA i @reB, z centru! aktywny!w @reB " @reaza cz$sto stanowi czynnik wirulencji dla wielu !ikroorganiz!w 214" *edn z bakterii, w ktrejobserwuj$ si$ obecno% enzy!u jest %seudomonas aeruginosa, jakkolwiek nie jest to szeroko opisane w literaturze"%1 aeruginosa jest oportunistyczny! patogene!, zwizany! !"in" z in8ekcja!i drg !oczowych, zaka)enia!iszpitalny!i oraz in8ekcja!i w przebiegu !ukowiscydozy 5cistic 8ibrosis, HQ7234"

7ele; Hele! pracy jest potwierdzenie obecnoci genw kodujcych podjednostki ureazy w geno!ach szczepwklinicznych%seudomonas aeruginosa,wykazanie ich ekspresji, a tak)e okrelenie, czy bakteria jest zdolna do wzrostuw warunkach beztlenowych, dzi$ki wykorzystaniu a!oniaku, powstaego z hydrolizy !ocznika, jako alternatywnegoakceptora elektronowego"

8ateriay i metody; . pracy wykorzystano kolekcj$ >3 szczepw klinicznych %1 aeruginosa, ktra powstaa

z inicjatywy organizacji 6uropean @nion Ho=ordinated :cienti8ic and ?echnology 5H3 klinicznych szczepw potwierdza analiz$ bioin8or!atyczn" #aobserwowanona )elu agarozowy! produkt o oczekiwanej dugoci" 9odowla w warunkach tlenowych wykazaa zdolno% wszystkich>3 szczepw do rozkadu !ocznika, nato!iast w przypadku pozostaych hodowli zaobserwowano zaha!owanieaktywnoci enzy!u ureaza, co wskazuj$ na brak zdolnoci szczepw do wykorzystania a!oniaku pochodzcego z tegoKrda jako akceptor elektronw w procesie oddychania beztlenowego"

214 &wona ;onieczna i inni Bacterial @rease and its Role in ong=asting 9u!an -iseases Hurrent (rotein and(eptide :cience, 3C13, 10, I=IC/

234 :ophie de Bentz!ann i (atrick (lsiat ?he (seudo!onas aeruginosa opportunistic pathogen and hu!anin8ection 6nOiron!ental Microbiology 53C117 1357, 1/1//

204 Anthony -e :oyza i inni" 3C10 -eOeloping an international (seudo!onas aeruginosa re8erence panel"

1


16/119


Proapoptotyczne wa9ciwo9ci ko&altowych pochodnych *errocenylowych wzl+dem

ludzkich komrek raka sutka /87% i 117, wzgl$de! linii ko!rkowych wywodzcych si$ z ludzkichnowotworw estrogenozale)nego raka piersi 5MHQ=7 oraz 5HHRQ=H6M7"


17/119


#cena ekspresi enu COX-2w sarkoidozie ukadu oddechoweo ? &adania wst+pne

!gr *ustyna ;iszakiewicz1, !gr Agnieszka ;$dzierska3, !gr -aria -o!a+ska1, pro8" 6waBrzezia+ska0

1 :tudia -oktoranckie w #akadzie Molekularnych (odstaw Medycyny @niwersytetu Medycznegow odzi

3" &nterdyscyplinarne aboratoriu! Modych Naukowcw przy #akadzie Molekularnych (odstawMedycyny @niwersytetu Medycznego w odzi

0" #akad Molekularnych (odstaw Medycyny @niwersytetu Medycznego w odzi

:arkoidoza jest wieloukadow chorob o podo)u i!!unologiczny! o nie do ko+ca wyjanionej etiologii,charakteryzujc si$ wytwarzanie! nieserowaciejcych ziarniniakw nie podlegajcych !artwicy"

Hyklooksygenaza 5H7, pobrana od pacjentw zezdiagnozowan sarkoidoz oraz BAQ 5n3C7 pobrany od pacjentw stanowicych grup$ kontroln"# !akro8agw p$cherzykowych oraz li!8ocytw krwi obwodowej izolowano RNA" Analizy wzgl$dnej ekspresjigenw 5R[7 dokonano !etod R?= [(HR" -okonano statystycznej analizy zale)noci po!i$dzy wartocia!i R[a stopnie! rozwoju sarkoidozy 5C=&&&7"

Wyniki; #!niejszony pozio! ekspresji 5O9(>zaobserwowano zarwno w !akro8agach p$cherzykowych u pacjentwwe wszystkich stadiach choroby 5R[E grupa C=& C,31, grupa &&=&&& C,1I7 jak i w li!8ocytach 5R[E grupa & C,>,grupa && C,>>07 w porwnaniu do grupy kontrolnej 5R[E C,33I7" :tatystycznie istotn zale)no% uje!nzaobserwowano po!i$dzy pozio!e! ekspresji 5O9(>, a wartoci H->PH-I, zarwno w p$cherzykach!akro8agw 5p C,C>1C ;ruskala .allisa7 jak i w li!8ocytach z krwi obwodowej 5p C,C>>3 ;ruskala .allisa7" Niestwierdzono korelacji po!i$dzy ekspresj badanego genu a wartocia!iE Q6' 1, Q6'H, Q6'1PQ6'H, :AH6, biakie!HR(, oraz zdolnoci dy8uzji H< w pucach 5-Hw grupie osb chorych w stosunku do kontroli, szczeglnie w !akro8agachp$cherzykowych, wskazuje na de8ektywno% tego genu w pucu w przebiegu sarkoidozy ukadu oddechowego, co !o)ewiza% si$ z pro!ocj 8ibrogenezy w wy)szych stadiach zaawansowania choroby, jednak ta hipoteza wy!agarozszerzenia bada+ na wi$kszej grupie pacjentw"

1


18/119


-mmunoterapia raka puc z zastosowaniem komrek dendrytycznych trans*ekowanych

nowotworowym 5()

6welina ejnweber, ?o!asz .andtke, *oanna .ielikdzie+, Renata 9er!an

@niwersytet Mikoaja ;opernika w ?oruniu, Hollegiu! Medicu! i!" udwika Rydygieraw Bydgoszczy, .ydzia ekarski, ;atedra i #akad Jenoterapii

&!!unoterapia polega na skierowaniu naszej odpornoci przeciw niepo)dany! ko!rko! w naszy!organiz!ie" *edny! z powa)nych zagro)e+ dzisiejszej doby s choroby nowotworowe, nie dziwi wi$c 8akt )e uwaga

badaczy zwraca si$ w kierunku leczenia chorb o taki! podo)u" ;o!rki nowotworowe s badane w celu znalezieniacharakteryzujcych je czstek, by !c skierowa% przeciw ni! jak najbardziej swoist terapi$ wykorzystujcsubstytuty ukadu i!!unologicznego" 7 raka puc"

(rzeprowadzone badania dowiody z!ian !or8ologicznych ko!rek dendrytycznych po wprowadzeniu donich nowotworowego RNA" #a po!oca cyto!etru przepywowego wykazano wy)sz ekspresj$ czsteczek H-IC,HHR, H-3, H-I/, H-I0 i 9A=-R" (otwierdza to po!ylnie przeprowadzon izolacj$ i gotowo% -H do

prezentacji nowotworowego antygenu li!8ocyto! ?"

@zyskane wyniki potwierdzaj !o)liwo% wykorzystania specjalnie przygotowanych ko!rekdendrytycznych do walki z nowotwora!i puc"

214 -udek AM, Martin :, Jarg A-, Agostinis, W&!!ature, :e!i=Mature, and Qully Mature -endritic HellsE?oward a -H=Hancer Hells &nter8ace ?hat Aug!ents Anticancer &!!unity"G, Qrontiers in i!!unology,Ool">, article no" >0I, -ec" 3C10"

234 6rika 'acchelli, &lio 'itale, AleLander 6gger!ont, .ol8 9erO Qrid!an, *itka QufVkoO, &sabelle Hre!er,*r!e Jalon, 6ric ?artour, aurence #itOogel, Juido ;roe!er, orenzo Jalluzzi, W?rial watchE-endritic cell=based interOentions 8or cancer therapy"G,


19/119


#cena wa9ciwo9ci proapoptotycznych nanos*er hy&rydowych P)66@P#8

(aulina ewarska, Anna (ieni)ek, Aneta ;oceOa=Hhya

;atedra ?er!obiologii, .ydzia Biologii i =godzinnej hodowli poinkubacyjnej ko!rek w wie)y! !ediu! 5czas 3> godz"7 oznaczano odsetek poszczeglnychrodzajw ko!rek" ;o!rki barwiono 9oechst003I oraz jodkie! propidyny (&" (odwjne barwienie ko!rek ty!i8luorochro!a!i u!o)liwia identy8ikacj$ nast$pujcych subpopulacji ko!rekE i@)ywych, e!itujcych jasnoniebieska8luorescencj$ o saby! nat$)eniuX ii@ wczesnoapoptotycznych, wykazujcych jasnoniebiesk 8luorescencj$ o silny!nat$)eniuX pKnoapoptotycznych, charakteryzujcych si$ 8ioletow 8luorescencj$ i i*@ nekrotycznych wykazujcychczerwon 8luorescencj$" Analizy !or8ologii i 8luorescencji ko!rek dokonywano przy u)yciu !ikroskopu8luorescencyjnego z odwrcony! obiektywe!


20/119


Badania nad ekspres czsteczki 7:A3 w wy&ranych liniach ustalonych ludzkich

nowotworw zo9liwych

Anna abejszo, ?o!asz .andtke, *oanna .ielikdzie+, Arkadiusz Joede,

@niwersytet Mikoaja ;opernika w ?oruniu, Hollegiu! Medicu! i!" udwika Rydygieraw Bydgoszczy, .ydzia ekarski, ;atedra i #akad Jenoterapii

;o!rki dendrytyczne 5-H7 odgrywaj znaczc rol$ w pobudzaniu li!8ocytw, zwaszcza dziewiczych, gdy)stanowi najsilniejsz 8rakcj$ ko!rek prezentujcych antygen" #naczc rol$ w dojrzewaniu -H peni czsteczkaH-I0, ktra jest jednoczenie ich !arkere!" *ej ekspresj$ odkryto, zarwno na innych prawidowych ko!rkach A(H5ang" Antigen (resenting Hells7, jak i na ko!rkach nowotworowych, co skania do re8leksji nad pytanie!, czyczsteczka H-I0 !o)e bra% udzia w patogenezie nowotworw" Niezwykle wa)ny! wydaje si$ wi$c poznanie roli tej!olekuy w nieco szerszy! kontekcie, co !o)e skutkowa% obranie! nowych kierunkw bada+ nad leczenie!nowotworw"

Hele! pracy bya ocena pozio!u ekspresji czsteczki H-I0, w wybranych !odelowych liniach ustalonych,ludzkich nowotworw zoliwych 5M-A=301 = rak sutka, ?7, -R> 5linieE A>, ?


21/119


)naliza tandemowych powtrze 8-5C%$(D5 w molekularnych &adaniach

epidemioloicznych nad rulic

Anna Macieja

1, Anna Brzostek3, Arkadiusz .ojtasik3, *arosaw -ziadek3, Anna :ajduda1

1 @niwersytet dzki, .ydzia Biologii i poli!or8iczne loci a!pli8ikowano w reakcji (HR z u)ycie! specy8icznychstarterw" (rodukty a!pli8ikacji rozdzielano elektro8oretycznie w )elu agarozowy!" Na podstawie oceny ich wielkoci,dla ka)dego z badanych szczepw okrelono 3>=cy8rowy kod stanowicy jego !olekularn charakterystyk$"

.zory M&R@='N?R, odzwierciedlajce liczb$ tande!owych powtrze+ w 3> analizowanych loci,poddanoko!puterowej analizie porwnawczej" Na jej podstawie sporzdzono dendrogra! obrazujcy podobie+stwo genetyczne!i$dzy badany!i szczepa!i" loci7 najcz$ciej stosowanych w badaniach epide!iologicznych 1Najwy)sz warto% 59J-& C,I7 otrzy!ano dla zestaww 1 i 3> loci"

#aobserwowano z!iany w sposobie grupowania badanych szczepw w zale)noci od zastosowanego zestawuloci" #identy8ikowano rwnie) grupy szczepw o identycznych wzorach M&R@='N?R, co !o)e wskazywa% naaktywn trans!isj$ tych szczepw wrd !ieszka+cw regionu dzkiego" @zyskane wyniki pozwoliy na

potwierdzenie przydatnoci analizy tande!owych powtrze+ M&R@='N?R w !olekularnych badaniachepide!iologicznych nad gruKlic"

31


22/119


Wykorzystanie koncepci 9rednich nielokalnych do redukci szumw w mikroskopowych

o&razach cy*rowych

Magdalena


23/119


=kspresa enw 7:( /conserEed dopamine neurotrophic *actor0 oraz 8)(

/mesencephalic%astrocyte%deriEed neurotrophic *actor0 w zwierz+cych modelach depresi

(iotr (ankiewicz 1,3, Magdalena :owa=;u%!a 1,3

1 Hentru! 6kspery!entalne ;atedry Qizjologii i Rozrodu #wierzt, @niwersytet Rzeszowski,.erynia C3, 0/=1CC ;olbuszowa3 (ozawydziaowy &nstytut Biotechnologii :tosowanej i Nauk (odstawowych, @niwersytetRzeszowski, .erynia C3, 0/=1CC ;olbuszowa

;luczowy! dla rozwoju psycho8ar!akologii zaburze+ depresyjnych, jest poszukiwanie nowych hipotezdotyczcych etiologii chorb a8ektywnych" Badania bioche!iczne wskazuj !"in" na udzia neuronw dopa!inowychw pato8izjologii depresji" . zwierz$cych !odelach depresji wykazano z!niejszon neurotrans!isj$ dopa!inergicznw obszarze rd!zgowia i pr)kowia, a e8ekt ten by odwracany po zastosowaniu lekw przeciwdepresyjnych 2I42342042>4"

#a odpowiedni kondycj$ neuronw odpowiada rodzina biaek o charakterze neurotro8iczny!" .pywaj onena )ywotno%, r)nicowanie oraz prawidowe 8unkcjonowanie ko!rek nerwowych" -otychczas najbardziejszczegowo opisan neurotro8in oddziaywujc na neurony !onoa!inergiczne jest glejopochodny czynnikneurotro8iczny 5J-NQ,glial(cell(line(deri*ed neurotro+hic #actor7" . ostatni! czasie zidenty8ikowano specy8iczny dla

populacji neuronw dopa!inowych czynnik neurotro8iczny 5H-NQ, conser*ed do+amine neurotro+hic #actor7, ktrywraz z biakie! MANQ 5mesence+halic(astrocyte(deri*ed neurotro+hic #actor7 tworzy now, unikaln i silniezakonserwowan ewolucyjnie grup$ neurotro8in, dzi$ki obecnoci I reszt cysteinowych w a+cuchu a!inokwasowy!24 2/4" . warunkach in *i*o H-NQ oraz MANQ wykazuj charakter prewencyjny w stosunku do neuronwdopa!inowych co udowodniono w zwierz$cych !odelach choroby (arkinsona, czterotygodniowe podawanie MANQi H-NQ do pr)kowia spowodowao przywrcenie 8unkcji dopa!inergicznej oraz zapobiegao degeneracji neuronww istocie szarej" >3>/, 3CCI"234 Berton


24/119


#cena wpywu inhi&itorw metylotrans*eraz :() oraz deacetylaz &iaek histonowych na

ekspres+ enu Klotho w komrkach raka p+cherza moczoweo

(aulina (rzybylska, (rze!ysaw .erecki, Agnieszka :zy!czyk, 6wa Qor!a

;atedra Hytobioche!ii, .ydzia Biologii i godziny przed zako+czenie! ekspery!entu"

(o traktowaniu ko!rek wy)ej wy!ieniony!i zwizka!i dokonano analizy ekspresji genu CKlotho na pozio!ie!RNA oraz oceny stopnia !etylacji jego regionu pro!otorowego" Analiz$ ekspresji genu CKlothoprowadzono !etoda+cuchowej reakcji poli!erazy z analiz przyrostu iloci produktw w czasie rzeczywisty! 5Real ?i!e (HR, ang 1?eal Time %olymerase 5hain ?eaction7"


25/119


REG!"C#" EK$PRE$#% GE& %'( ) )"$*O$O+"&%E, siR&"

+ OPR"CO++"&% *ER"P%% PR)EC%+&O+O*+ORO+CH

Bo)ena Rolnik, Anna alik

(olitechnika Tlska, #akad &n)ynierii :yste!w, &nstytut Auto!atyki, ul" Akade!icka 1/, >>=1CCJliwice

Biaka z rodziny NQB s grup jdrowych czynnikw transkrypcyjnych odpowiedzialnych za aktywacj$transkrypcji bardzo licznej grupy genw zwizanych z regulacj procesw takich jak przebieg cyklu ko!rkowego,apoptoza i proli8eracja ko!rek, czy odpowiedK na czynniki stresowe 214" Aktywno% biaek NQB jest regulowana przezich inhibitory = biaka &B zdolne do zatrzy!ywania ko!pleksw NQB, wykazujcych aktywno% biologiczn,na terenie cytoplaz!y poprzez !askowanie sekwencji N: 5ang" nuclear localization seDuence7 w ich strukturze214"Biaka z rodziny NQB zostaj aktywowane w wyniku zaistniaej in8ekcji lub innych czynnikw stresowych

prowadzcych do proteolizy ich inhibitorw, std z!iany pozio!u ekspresji genw biaek &B !aj bezporedni wpywna ilo% aktywnych ko!pleksw NQB214" &stnienie !echaniz!u regulacji ekspresji genw zwizanych z procese!apoptozy czy proli8eracji, poprzez regulowanie iloci aktywnych biaek NQB, niesie !o)liwo% opracowania terapii!ajcej na celu niszczenie ko!rek o niepo)dany! 8enotypie, co jest szczeglnie istotne z punktu widzenia chorb

nowotworowych"Hele! prezentowanej pracy byo wst$pne zbadanie !o)liwoci obni)enia ekspresji genu jednego z inhibitorw

NQB = &B oraz zbadanie wpywu uzyskanego e8ektu na 8unkcjonowanie ko!rek" .yniki prowadzonych bada+zostan wykorzystane do uzupenienia otrzy!anego !odelu !ate!atycznego dla cie)ek sygnaowych NQB oraz p0o rwnania zwizane z wpywe! zastosowanej !ieszaniny siRNA o sekwencjach ko!ple!entarnych do !RNA genu&B234" .ykonanie takiego !odelu potencjalnie u!o)liwia opracowanie terapii, ktrej cele! jest z!niejszenie

prze)ywalnoci ko!rek nowotworowych poprzez zastosowanie siRNA w odpowiedniej dawce" . celu okreleniaopty!alnej dawki wywoujcej po)dany e8ekt zastosowano !ieszanin$ siRNA w trzech dawkachE 1p!ol, 3p!ol oraz>p!ol" Badania przeprowadzono na ko!rkach linii ko!rkowej raka jelita grubego 9H?11/"

@zyskane wyniki potwierdziy !o)liwo% wykorzystania zastosowanej !ieszaniny siRNA do obni)eniaekspresji genu &B na pozio!ie powstajcego !RNA oraz biaka" . zale)noci od wykorzystanej dawki !ieszaninysiRNA otrzy!ywano obni)enie pozio!u transkryptu w analizowany! punkcie czasowy! 3> godziny po trans8ekcji

w granicy >C=/CD wartoci pozio!u prby kontrolnej" (onadto zaobserwowano z!iany w 8unkcjonowaniu ko!rekpolegajce na obni)eniu ich aktywnoci !etabolicznej i zdolnoci do proli8eracji oraz z!iany w przebiegu cykluko!rkowego" @zyskany e8ekt by zale)ny od zastosowanej dawki !ieszaniny siRNA" #aprezentowane wst$pnewyniki zostan powtrzone cele! potwierdzenia wiarygodnoci zaobserwowanych tendencji"

Badania byy prowadzone w ra!ach grantuE B;M 1>PRAu=1P3C10

214 Hhen Q", HastranoOa '", :hi S",&ew :nsights into the role o# &uclear 8actor(EB in 5ell 6rowth ?egulation,A!" *" (athol" 53CC17 1 E 0I=01"

234 (uszynski ;", Bertolusso R", ipniacki ?", 5rosstalk etween +7- and &8EB systems/ +ro( and anti(a+o+totic #unction o# &8EB, &6? :yst Biol" 53CC7 E 0/=0/"

3


26/119


Wpyw !oF2 na ekspres+ =G5 i =G5E--- w linii komrkowe :"%8G

(aulina :iejka

.ydzia Nauk Bio!edycznych i ;sztacenia (odyplo!owego, @M dK

(ro!otor pro8" (iotr Rieske

Mutacje oraz a!pli8ikacje genu kodujcego nabonkowopochodny czynnik wzrostu 56JQR7 s cz$sty!zjawiskie! w glejaku wielopostaciowy! 214" Hharakterystyczn rearan)acj wyst$pujc w obr$bie tego genu jestdelecja prowadzca do utraty egzonw 3= co skutkuje ekspresj z!utowanego wariantu 6JQR 56JQRO&&&7

pozbawionego cz$ci do!eny zewntrzko!rkowej, dzi$ki cze!u biako !o)e by% konstytutywnie aktywnieniezale)nie od dost$pnoci liganda 234"

-otychczasowe badaniawykazay, )e linie ko!rkowe ustabilizowane z tkanek nowotworowych pacjentwcierpicych na glejaka trac charakterystyczne !olekularne cechy takie jak a!pli8ikacja 6JQR oraz ekspresja6JQRO&&&, zwaszcza w przypadku klasycznych warunkw hodowli 20,>4" . wyniku tego zjawiska otrzy!ane linieko!rkowe nie !og by% wiarygodny! !odele! glejaka in *itro1Mody8ikacja warunkw hodowli ko!rkowych !"in"zastosowanie !ediu! hodowlanego bez surowicy, prowadzenie hodowli w s8erach oraz !odulowanie st$)enie 6JQ

w po)ywce !og wpyn% na utrzy!anie a!pli8ikacji 6JQR oraz ekspresji 6JQRO&&&" Badania wasne sugeruj )e s tee8ekty przejciowe 20,>,4" . zwizku z ty! opracowanie alternatywnych rozwiza+ jest nadal potrzebne"

(rzeprowadzony ekspery!ent oparty byo o doniesienia sugerujce, )e ekspresja czynnika transkrypcyjnego:oL3 !o)e wpyn% znaczco na zwi$kszenie ekspresji 6JQR w ko!rkach oraz pro!owa% ich zdolnoci dosa!oodnowy 2/,4" . badaniach wasnych zaobserwowano spadek ekspresji :oL3 towarzyszcy zanikowi ekspresji6JQR i 6JQRO&&&" (odstawowy! cele! ekspery!entu byo zbadanie wpywu :oL3 na ekspresj$ 6JQR i 6JQRO&&&w linii ko!rek glejaka -;=MJ oraz ocen$ potencjau tego biaka do stabilizacji ekspresji 6JQRO&&& na wysoki!

pozio!ie w klasycznych warunkach hodowli"

:ekwencjonowanie !etod :angera potwierdzio obecno% !utacji warunkujcej ekspresj$ 6JQRO&&&w ko!rkach -;=MJ na pozio!ie geno!owy!" .yniki byy zgodne z wczeniejszy!i doniesienia!i"

. celu sprawdzenia wpywu :oL3 na 6JQR i 6JQRO&&& w -;=MJ przeprowadzono in8ekcj$ wektore!lentiwirusowy! z :oL3" Analiza ekspresji 6JQR i 6JQRO&&& !etod real=ti!e R?=(HR dni po transdukcji wykazaaspadek ekspresji tych genw co jest sprzeczne z wczeniejszy!i doniesienia!i" -odatkowo dwukrotnie wykonano

barwienie i!!unocytoche!iczne na :oL3 i cakowity 6JQR 0 dni i 3 tygodnie po zain8ekowaniu ko!rek" Niezaobserwowano istotnego wpywu :oL3 na pozio! cakowitego 6JQR" =1C=C11P11

14 ay8ield *, .ill!ore H, ?ripp :, *ones H, *ensen R" 6pider!al growth 8actor receptor gene a!pli8ication and proteineLpression in glioblasto!a!ulti8or!eE prognostic signi8icanceand relationship to other prognostic 8actors"Appl&!!unohistoche!MolMorphol" 3CC/ 1>517E1/

2H Jan 9;, ;aye A9, uwor RB" ?he 6JQRO&&& Oariant in glioblasto!a!ulti8or!e" * HlinNeurosci" 3CC 1/5/7E>I>3H :chulte A, Junther 9:, Martens ?, #ap8 :, Riethord8 :, .ul8ing H, :toupiec M, .estphal M, a!szus ;" Jlioblasto!aste!like cell lines with either !aintenance or loss o8 high=leOel 6JQR a!pli8ication, generated Oia !odulation o8ligand concentration" Hlin Hancer Res"3C13 AprX 1I57"

IH .itusik=(erkowska M, Rieske (, 9uas=Bigoszewska ;, #akrzewska M, :tawski R, ;ulczycka=.ojdala -, Bie+kowski M,:toczy+ska=Qidelus 6, Jresner :M, (iaskowski :, *asklski -*, (apierz ., #akrzewski ;, ;olasa M, &ronside *.,iberski ((" Jlioblasto!a=deriOed spheroid cultures as an eLperi!ental !odel 8or analysis o8 6JQR ano!alies" *Neurooncol"3C11X 1C3E0>C

JH :tockhausen M?, Brohol! 9, 'illingshqj M, ;irchho88 M, Jerdes ?, ;risto88ersen ;, ;osteljanetz M, :pang=?ho!sen M,:koOgaard(oulsen 9"Maintenance o8 6JQR and 6JQRO&&& eLpressions in an in OiOo andin Oitro !odel o8 hu!anglioblasto!a!ulti8or!e"6Lp Hell Res" 3C11 *ul 1X015117E110=3/"

6H 9u [,#hang ,.en *,.ang :,i M,Qeng R,^ang S,i " ?he 6JQ receptor=soL3=6JQ receptor 8eedback looppositiOely regulates the sel8= renewal o8 neural precursor cells":te! Hells"3C1C QebX3I537E3=I/"


27/119


8odelowanie i testowanie miesc wi'cych czynniki transkrypcyne

;arolina :!oli+ska,

Marcin (acholczyk

.ydzia Auto!atyki, 6lektroniki i &n8or!atyki, (olitechnika Tlska

;o!pleksy biako=-NA odgrywaj wa)n rol$ w procesach wewntrzko!rkowych" :zczeglnie wa)ne zewzgl$du na proces regulacji transkrypcji genw s interakcje zachodzce po!i$dzy czynnika!i transkrypcyjny!ia regiona!i a+cucha -NA" Hzynniki transkrypcyjne charakteryzuj si$ specy8iczn budow, ktra pozwala natworzenie wiza+ z powierzchni czsteczki -NA na krtki!, specy8iczny! odcinku zwany! !iejsce! wizaniaczynnika transkrypcji"


28/119


!pektrum aktywno9ci antyproli*eracyne oraz charakterystyka spektralna wy&ranych

pochodnych chinoliny

6welina :paczy+ska

, Anna Mrozek=.ilczkiewicz, .ioleta Hielik, Marzena Ra!s=Baron,

Agnieszka :zurko, Robert Musio.ydzia Mate!atyki, Qizyki i Hhe!ii @T

.iele z opisywanych w literaturze zwizkw zawierajcych w swej strukturze 8rag!ent chinolinycharakteryzuje si$ szeroko poj$t aktywnoci biologiczn" (ochodne chinoliny wykazuj waciwoci

przeciwgrzybiczne i przeciwbakteryjne 21,34, a tak)e aktywno% wobec integrazy wirusa 9&' 204 czy aktywno%przeciwnowotworow 2>4"

Metod otrzy!ywania styrylowych pochodnych chinoliny jest reakcja pochodnych chinaldyny z aldehyda!iaro!atyczny!i" (ochodne chinoliny otrzy!ano w reakcjach konwencjonalnych oraz wspo!aganych pole!!ikro8alowy!" ipo8ilowo% badanych zwizkw, stanowica znaczcy para!etr w przewidywaniu aktywnoci

biologicznej zwizku zostaa z!ierzona z wykorzystanie! R(=9(H" Aktywno% antyproli8eracyjna analogwchinoliny zostaa okrelona wzgl$de! ludzkich nowotworowych ko!rek jelita grubego linii 9ct11/ typu dzikiego

oraz z nokaute! genu ?(0" Najbardziej aktywne zwizki zostay przebadane na ko!rkach nienowotworowych ludzkich 8ibroblastach linii JM C>3" Aktywno% cytotoksyczna badanych pochodnych zostaa okrelona za po!ockolory!etrycznej !etody M?:" Najbardziej aktywny! zwizkie! o &HC 3,30 M okaza si$ zwizek ,=dichloro=3=23=5>=etoksy8enylo7winylo4=I=chinolinol 5Rysunek 17" (ochodna ta wykazywaa aktywno% wzgl$de! ko!rek linii9ct11/, nato!iast wzgl$de! ko!rek prawidowych nie wykazywaa aktywnoci, co wiadczy o jej wysokiejselektywnoci" :tyrylochinoliny ha!uj proli8eracj$ ko!rek nowotworowych, przez co !og by% wykorzystane jakoleki przeciwnowotworowe"

N

OH

Cl

Cl

O

Rysunek 1"

.aciwoci spektroskopowe pochodnych chinoliny okrelono poprzez po!iar wid! absorpcji oraz8luorescencji z wykorzystanie! spektroskopii @'='&:" -la zwizkw o szczeglnie wartociowej charakterystycespektralnej dodatkowo przeprowadzono barwienie ko!rek ludzkiego nowotworu jelita grubego linii 9ct11/ p0Pz wykorzystanie! !ikroskopu 8luorescencyjnego" .ykonane badania dowiody, )e pochodne chinoliny !o)nazaklasy8ikowa% jako barwniki 8luorescencyjne, ktre !og by% wykorzystywane do obrazowania strukturko!rkowych"

214 R" Musiol, *" *a!pilek, '" Buchta , " :ilOa, 9" Niedbala, B" (odeszwa, A" (alka, ;" Majesz=Maniecka,B">, no" 3, pp" I>=I0, Qeb"3CC"

204 Q" #ouhiri, M" -anet, H" Bnard, M" Nor!and=Bayle, *"Q" Mouscadet, 9" eh, H"M" ?ho!as, J" Mbe!ba,*" d`Angelo, -" -es!ale, G9&'=1 replication inhibitors o8 the styryl_uinoline classEintroduction o8 anadditional carboLyl group at the H= position o8 the _uinolone"G, Tetrahedron )etters, Ool" >/, no" 10, pp" 33C1=33C, Mar" 3CC"

2>4 R" Musiol, *" *a!pilek, ;" ;raloOa, -es R" Richardson, -" ;alinowski, B" (odeszwa, *" Qinster, 9" Niedbala,A" (alka, *" (olanski, G&nOestigating biological actiOity spectru! 8or noOel _uinoline analogues"G, BioorganicF $edicinal 5hemistry, Ool" 1, no" 0, pp" 13IC=13II, Qeb" 3CC"

3I
http://europepmc.org/search?page=1&query=AUTH:http://europepmc.org/search?page=1&query=AUTH:http://europepmc.org/search?page=1&query=AUTH:http://europepmc.org/search?page=1&query=AUTH:http://europepmc.org/search?page=1&query=AUTH:http://europepmc.org/search?page=1&query=AUTH:http://europepmc.org/search?page=1&query=AUTH:


29/119


Poprawa parametrw pola sioweo #PK! )ll%)tom w zastosowaniu do n%pentadekanu,

octanu metylu i *os*oranu dimetylu

(iotr :roka

.ydzia Bioche!ii, Bio8izyki i Biotechnologii @*Hzsteczki istotne z biologicznego punktu widzenia, takie jak biaka, kwasy nukleinowe czy w$glowodany

stanowi ukady zbyt sko!plikowane i zo)one, aby !odelowa% je w caoci przy u)yciu oblicze+ kwantowo=!echanicznych" (roble! stanowi zbyt du)a liczba elektronw obecnych w ukadzie" Rozwizanie tego proble!ustanowi !etody wykorzystujce tzw" pola siowe" 6nergia ukadu w tych !etodach obliczana jest jako 8unkcja poo)e+

jder ato!owych, z po!ini$cie! ruchu elektronw" . kontekcie !odelowania !olekularnego, pole siowe oznacza!ate!atyczn 8or!u$ i zbir para!etrw, u)ywanych do opisu energii potencjalnej czsteczki"


30/119


)naliza enomiczna plazmidw p.2P1 i p"AP1 pochodzcych z antarktycznych szczepw

Pseudomonasspp

Marcin Twistak, Magdalena :zuplewska, -ariusz Bartosik

#akad Jenetyki Bakterii, &nstytut Mikrobiologii, @niwersytet .arszawski, .arszawaJeno!y bakteryjne s bardzo z!ienne" &ch plastyczno% uwarunkowana jest, !i$dzy inny!i, !o)liwoci

wprowadzania do nich egzogennego -NA, nabytego w wyniku horyzontalnego trans8eru genw 59J? = ang"horizontalgene trans#er7"

Jwny!i sprawca!i 9J? s !obilne ele!enty genetyczne 5MJ6 = ang" moilegenetic elements7, ktre sskadnikie! nie!al ka)dego geno!u prokariotycznego 214" .rd MJ6 najliczniejsz grup$ stanowi plaz!idy =naturalne wektory 9J?, ktre !og by% przenoszone !i$dzy ko!rka!i bakterii drog koniugacji bdK transdukcji". geno!ie plaz!idu wyr)nia si$ zarwno konserwowany rdze+, nioscy in8or!acj$ warunkujc 5i7 replikacj$ oraz5ii7 stabilne utrzy!ywanie replikonu w ko!rce, jak i dodatkowy adunek genetyczny 5ang" load7, cz$sto warunkujcywaciwoci o charakterze adaptacyjny!" ?ego typu cechy uatwiaj konkurencj$ z inny!i !ikroorganiz!a!izasiedlajcy!i dan nisz$ ekologiczn, bdK pozwalaj na zasiedlanie nowych, pierwotnie niedost$pnych rodowisk"

. #akadzie Jenetyki Bakterii @niwersytetu .arszawskiego zgro!adzono kolekcj$ kilkudziesi$ciu szczepwbakterii wyizolowanych ze rodowisk wodnych Antarktyki" :zczepy te, jak wykazano, nios cznie kilkadziesitpozachro!oso!owych replikonw"


31/119


Wpyw nadtlenoazotynu i kwasu podchloraweo na czsteczk+ *i&rynoenu i struktur+

skrzepu *i&ryny

*ustyna ?adeusiewicz, Monika Majchrzak, (awe Nowak

.ydzia Biologii i C, -ec" 3C13"

204 M" Martinez, *"." .eisel, 9" &schiropoulos, W Qunctional i!pact o8 oLidatiOe posttranslational !odi8icationson 8ibrinogen and 8ibrin clots",G 8ree ?adical Biology F $edicine, Ool" /, pp" >11=>1I, -ec" 3C10"

01


32/119


Lnaczenie reulaci pro*ilu epienetyczneo w podatno9ci komrek na&onka &arwnikoweo

siatkwki na uszkodzenia oksydacyne

(aulina ?okarz1, Aleksandra Nowakowska1, Monika 9o88t1, ;ai ;aarniranta3,0, *anusz Basiak1

.ydzia Biologii i


33/119


Wpyw witaminy B1na prze&ie reakci zapalne w modelowych in*ekcach &akterynych

NA?A&A .


34/119


35/119

III Studencka Konferencja Biologii Molekularnej

Sesje posterowe


36/119

Sesje posterowe III Studencka Konferencja Biologii Molekularnej

Bakterie nitkowate w osadzie czynnym metody analizy jakociowej.

Olga Andrzejczak

Wydzia Biotechnologii i Nauk o ywnoci P

Metoda oczyszczania ciekw z zastosowanie! osadu czynnego stanowi o"ecnie jedn# z naj$o$ularniejszychs$oso"w "iologicznego oczyszczania ciekw% Bakterie nitkowate s# naturalny! skadnikie! "iocenozy osaduczynnego% Peni# w ni! wa&n# rol'( u!o&liwiaj#c $roces waciwego )or!owania kaczkw osadu czynnego%*ednoczenie ich nad!ierny wzrost $owoduje takie niekorzystne zjawiska jak $uchni'cie oraz $ienienie osadu +,-%

.o !etod stosowanych o"ecnie w celu ilociowej oceny organiz!w nitkowatych zaliczy/ !o&na klasyczn#identy)ikacj' wedug 0ikel"loo!a +1- )luorescencyjn# hy"rydyzacj' sin situ 234567 +8(9-%

Pierwsza z !etod zakada identy)ikacj' w o$arciu o klucze identy)ikacyjne% Wykorzystywane s# w ty! celu"ez$orednie o"serwacje w $re$aracie $rzy&yciowy!( "arwienia !etoda!i :ra!!a oraz Naissera a tak&e testsiarkowy% Mi!o stosunkowo niskich kosztw i $owszechnej dost'$noci( !etoda ta $osiada $ewne ograniczenia +1-%

Od$owied; na ni# stanowi/ !o&e !etoda )luorescencyjnej hy"rydyzacji in situ 2ang% )luorescent in situhy"ridization( 34567% Polega ona na zastosowaniu gotowych )rag!entw !ateriau genetycznego( ko!$le!entarnychdo znanego )rag!entu ,ak $owstae hy"rydy o"serwowane s# nast'$nie $rzy $o!ocy !ikrosko$u )luorescencyjnego +8(9-%Metoda 3456 znajduje o"ecnie szerokie zastosowanie w licznych "adaniach w zakresie "iotechnologii rodowiskowej+?(y$eLLF1 in Actiated 5ludge Plants in Australia 4s a Me!"er o) the Phylu! hloro)leQiC A$$l 0nironMicro"iol% Gol% @?( no% ( $$% 199reat!ent $lant in .u"ai "y 3luorescence in situ hy"ridization >echniKueC nternational *ournal o)0niron!ental =esearch( ol% @( no% 1( $$ 9@FH99( 5$ring 1L,8%

8


37/119

III Studencka Konferencja Biologii Molekularnej Sesje posterowe

Czy tabaka zastpi e-papierosy

Wojciech BaczyJski

Wydzia Biotechnologii i Nauk o ywnoci Politerchnika dzka

W 0uro$ie i Polsce od okoo SG4 wieku ta"aka "ya naj$o$ularniejsz# )or!# s$o&ywania tytoniu i do$iero!oda na $alenie $a$ierosw( ktra rozwin'a si' na $ocz#tku SS wieku 2w szczeglnoci $o 44 wojnie wiatowej7wy$ara t' u&ywk' z s$oeczeJstwa%

iedy ta"aka znajdzie si' w "onie luzowej czowieka( nikotyna w niej zawarta( $o$rzez "on' luzow# nosa($rzedostaje si' do krwio"iegu( $o czy! "ez $ro"le!u $rzedostaje si' do naszego !zgu% >a! nikotyna #czy si'z rece$tora!i%

Oczywicie e)ekty dziaania nikotyny s# oglnoustrojowe( $o$rzez zwi'kszenie wydzielania adrenaliny($odnosi si' cinienie krwi( akcja serca $rzys$iesza( zanika gd( z!niejsza si' odczuwanie "lu% .odatkowo $ojawiasi' oglne rozlu;nienie i "ogostan%

Najwi'kszy $ro"le!( "owie! $ojawia si' z racji niekiedy "ardzo zo&onego skadu( $rzez co ci'&ko dokadnieokreli/ $een w$yw tej u&ywki na nasz organiz!% Wiele su"stancji !o&e "y/ w naszy! organiz!ie!eta"olizowanych do szkodliwych )or! $rzejciowych( co !a !iejsce w $rzy$adku nikotyny% Nato!iast znacznacz'/ !echaniz!w( ktre !og# !ie/ tutaj !iejsce $ozostaje jak dot#d nieznana%

I jednej strony ta"aka jest wyro"e! tytoniowy!( zawieraj#cy! nikotyn'( a wi'c !o&e $rowadzi/ douzale&nieJ% I drugiej strony takich $rzy$adkw jest do/ niewiele% *ako wyr" za&ywany do nosowo ta"aka !o&e

$owodowa/ r&nego rodzaju uszkodzenia "ony luzowej nosa( jej wysuszenie 2tytoJ !a waciwoci ci#gaj#ce(osuszaj#ce7( ktre !o&e $rowadzi/ do $owa&niejszych $owikaJ% .ane literaturowe wskazuj# na !eta$lazj' na"onkwu os" konsu!uj#cych ta"ak'( a !eta$lazja "ardzo cz'sto jest wst'$e! do rozwoju nowotworw% .odatkowo !o&liwe

jest wyst#$ienie krwawienia( nad&erki $rzegrody nosowej( za$alenia zatok( czy chronicznego kataru% *ednak&elaryngologo! nie udao si' jednoznacznie tego wykaza/% o wi'cej( ludzie za&ywaj#cy ta"ak' twierdz#( i& ta"aka

$o!oga i! zwalczy/ $rzewleke nie&yty nosa( czy rozwi#zaa $ro"le!y z zatoka!i%

*ak wi'c !o&na zauwa&y/( w$yw za&ywania ta"aki na zdrowie $eene jest s$rzecznoci i do!ysw% *est takgownie dlatego( i& wszelkie "adania w ty! te!acie $rowadzone "yy na !aych gru$ach( a co za ty! idzie( ich wyniki

nie koniecznie !usz# "y/ $rawdziwe dla caej $o$ulacji%Eekarze zastanawiaj# si' czy! !o&liwe jest wykorzystanie tego rodka do $odawania lekw )or!ie do

nosowej( "owie! jest to jeden z najstarszych s$oso"w leczenia czowieka( o"ecnie jednak $raktykownych w krajachdo$iero rozwijaj#cych si' jak A)ryka( jednak jest to !ylenie !ylne( "owie! nie zna!y wszystkich konsekwencjizdrowotnych s$o&ywania tej u&ywki( a skutki u"oczne !ogy"y si' okaza/ o$akane%

>a"aka !o&e jednak $osu&y/ na! w nieco inny! celu% Od kilku lat w 0uro$ie toczy si' de"ata nad tzw%Tstrategi# redukcji szkdC 2ang% har!Hreduction strategy7 w kontekcie chor" odtytoniowych( ktre w gwnej !ierze

$owodowane s# $rzez zgu"ny w$yw dy!u tytoniowego% hodzi tutaj o zast'$owanie "ardziej szkodliwych $roduktw2n$% $a$ierosw7( !niej szkodliwy!i ekwiwalenta!i( taki!i jak gu!y i $lastry nikotynowe ( czy te& inne )or!ytytoniu% *eli ta"aka( $rzy ktrej s$o&ywaniu nie dochodzi do s$alania tytoniu( okazaa"y si' u&ywk# relatywnieniegro;n#( $rzynaj!niej w $orwnaniu do $a$ierosw( to doskonale w$isywaa"y si' w tak# wanie strategi'%

8@


38/119


Haploidyzacja. Czynniki wpywajce na efektywno androenezy.

*ulia Bartosiewicz

Wydzia =olnictwa i Bioin&ynierii UP w Poznaniu

Uzyskiwanie rolin ha$loidalnych !etod# androgenezy $olega na $o"udzeniu !ikros$or do $rzeksztacania si'w e!"rioidy lu" tkank' kalusow#% olejny! eta$e! jest $owstanie $odwojonych ha$loidw $rzy $o!ocy za"iegukolchicynowania% Powstae w ten s$os" nowe od!iany s# niezwykle $odane( z uwagi na znaczne skrcenie 2o 8H9lata7 czasu ich $ozyskiwania% .o gwnych korzyci stosowania technik ha$loidyzacji nale&y zaliczy/ rwnie& wzrostwydajnoci selekcji% *ednak&e !nogo/ czynnikw !aj#cych w$yw na ha$loidyzacj' rolin $otwierdza zo&ono/ tego

$rocesu( a tak&e $rzyczynia si' do o$;niania $ost'$u $rac nad otrzy!anie linii .6 +,-%

zynniki w$ywaj#ce na e)ektywno/ androgenezy !o&na $odzieli/ na trzy gru$yD czynniki zwi#zanez wy"ore! !etody uzyskiwania rolin ha$loidalnych( stan )izjologiczny rolin dawcw $ylnikw i wy"rod$owiedniego !ateriau genetycznego oraz warunki $rowadzenia kultury%

0)ektywno/ androgenezy zale&y $rzede wszystki! od gatunku roliny u$rawnej% 5tanowi on "ardzo istotnyele!ent w$ywaj#cy na $owodzenie i ostateczny wynik eks$ery!entu% W $eni uzasadnione jest wi'c uzyskanieszczegowych in)or!acji na te!at $ochodzenia roliny donorowej% .o rwnie znacz#cych czynnikw warunkuj#cych

$roces androgenezy nale wst'$ne traktowanie kosw i $ylnikw( a tak&e skad $o&ywki%orelacja !i'dzy wiekie! roliny( z ktrej $ochodz# $ylniki( a reakcj# !ikros$or na tworzenie zarodka lu"

kalusa jest "ardzo wa&na% U rolin roz$oczynaj#cych okres kwitnienia wi'cej jest !ikros$or zdolnych do$rzeksztacenia si' w zarodek lu" kalus ni& $od koniec kwitnienia +1-% Warunki $rowadzenia hodowli czyli stosowaniestresu 2n$% ter!icznego7( skad $o&ywki oraz su"stancje j# uzu$eniaj#ce rwnie& deter!inuj# $roces androgenezy%

5tres $owoduje wejcie na s$oro)ityczn# drog' rozwoju +8-% 5tosowane s# rwnie&D gd azotowy( krtki dzieJi niska te!$eratura w hodowli rolin dawcw( szok ter!iczny 2gor#cy i zi!ny7( che!iczne traktowanie kwiatostanw(

$#kw kwiatowych lu" $ylnikw( szok os!otyczny( a tak&e na$ro!ieniowanie% Najcz'ciej stosuje si' nisk#te!$eratur' na $ozio!ie 9H?V w r&ny! czasie( od 1 do a& ,9 dni% O$ty!alny czas traktowania o"ni&on# te!$eratur#

jest zale&ny od genoty$u roliny% 5kadnikie! $o&ywek deter!inuj#cy! e)ektywno/ androgenezy jest w'giel(najcz'ciej jako jego ;rdo wy"iera si' sacharoz'% Mo&e "y/ ona rwnie& zast#$iona !altoz#( glukoz# lu" !ieszank#cukrw% rdo w'gla organicznego oraz rodek zestalaj#cy $o&ywk' !aj# du&e znaczenie w kwestii $rze"iegu $rocesu

androgenezy% Ia ;rdo azotu w $o&ywkach su jony NO8X i N69Y( a tak&e gluta!ina( hydrolizat kazeiny( a tak&eas$aragina% Maj# one w$yw na $roces indukcji( jak i regeneracji% .odatka!i stosowany!i do $o&ywek s#D wita!iny(a!inokwasy i inne 2azotan sre"ra( "iotyna( glicyna( gluta!ina( hydrolizat kazeiny( kwas )oliowy( kwas nikotynowy(!ioHinozytol( siarczan !iedzi( tia!ina( wita!ina ( ZHtoco)erol7 +9-%

Podniesienie $ozio!u e)ektywno/ androgenezy jest !o&liwe $rzy ci#gej o$ty!alizacji $rocedury% Badania$rze$rowadzone dotychczas nie wyczer$ay "owie! wszystkich !o&liwych do w$rowadzenia !ody)ikacji +?-%

+,- [%H.% :uo( 5%Puli 4solated !icros$ore culture and $lant regeneration in rye 25ecale cereale E%7%(C Plant ell=e$orts( ,F\s% @?HL( 1LLL%

+1- % :recka( .% rzy&anowska( W% iszczak( U% owalska( =% :recki Wykorzystanie androgenezyw kulturach $ylnikowych do otrzy!ywania ho!ozygotycznych rolin !archwi%(C Prace 0ks$ery!entalne%Biotechnologia 1 2,7( ,91H,?1( 1LL%

+8- 5% 4!!onen( *% =o"inson 5tress treat!ents and )icoll )or i!$roing green $lant regeneration in triticaleanther culture%(C Plant 5cience ,?L( @@H9( 1LLL%

+9- =% Ma( 5% Pulli 3actors in)luencing so!atic e!"ryogenesis and regeneration a"ility in so!atic tissueculture o) s$ring and winter rye%(C Agricultural and 3ood 5cience( Gol% ,8( 8% Ada!ski( M% 5ur!a 6a$loidy i linie $odwojonych ha$loidw w genetyce i hodowli rolin%(C 4nstytut:enetyki =olin Polskiej Akade!ii Nauk( 1LL


39/119


!odyfikacja enetyczna zwierzt dla potrzeb ksenotransplantacji

Magdalena Boksa( *oanna Ieyland( Agnieszka Nowak( =yszard 5o!ski( .aniel Ei$iJski

atedra Bioche!ii i Biotechnologii Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu

:wny! $ro"le!e! ws$czesnej trans$lantologii jest istniej#ca dys$ro$orcja !i'dzy licz"# dost'$nychorganw a licz"# $acjentw kwali)ikuj#cych si' do $rzeszcze$u% Niedo"r narz#dw do $rzeszcze$w jest $owode!!ierci wielu ludzi na cay! wiecie( st#d konieczno/ $oszukiwania nowych drg ich $ozyskiwania% *edn#z alternatyw jest ksenotrans$lantacja czyli za"ieg $rzeszcze$iania ko!rek( tkanek lu" organw !i'dzy oso"nika!i

$ochodz#cy!i z r&nych gatunkw%

O$ty!alny! dawc# organw do $rzeszcze$w jest winia do!owa 25us scro)a7% Inaczny dystans)ilogenetyczny $o!i'dzy ty! $otencjalny! dawc# a czowiekie!( jest jednak $rzyczyn# ogro!nych $ro"le!wi!!unologicznych $o $rzeszcze$ie i nie!al natych!iast dochodzi do reakcji nadostrego odrzucenia% Ma to zwi#zekz wyst'$owanie! ksenoreaktywnych $rzeciwcia 2skierowanych $rzeciwko antygenowi :al wini7 i r&nic w ukadziedo$eniacza%

.zi'ki osi#gni'cio! in&ynierii genetycznej stao si' !o&liwe w$rowadzanie do geno!u wini genwczowieka reguluj#cych syste! do$eniacza 2czynniki .93P4 wini jest niee)ektywny! inhi"itore! czynnika Sa czowieka%=&nice $o!i'dzy czynnikie! on Wille"randa czowieka i wini $rowadz# do aktywacji i agregacji $ytek czowieka%0ks$resja ludzkiego .8F u !yszy za$o"iega zakrze$icy zarwno w $rzy$adku allogenicznych $rzeszcze$w sercu !yszy( jak i $oddanych $er)uzji ludzk# krwi# !ysich wyse$ek Eangerhansa%

W odrzuceniu $rzeszcze$u "ior# udzia rwnie& !akro)agi% zynnikie! ha!uj#cy! )agocytoz' jest antygen$owierzchniowy .9@% zynnik .9@ wyst'$uj#cy na $owierzchni ko!rek rd"onka dawcy $rzeszcze$u r&ni si'od jego od$owiednika wyst'$uj#cego na $owierzchni rd"onka "iorcy( nie jest roz$oznawany $rzez rece$tor 54=PZ(co $rowadzi do aktywacji !akro)agw% W celu wyeli!inowania tego $ro"le!u $ro$onuje si' w$rowadzanie ludzkiegoczynnika .9@ do geno!u dawcy $rzeszcze$u%

Aktywowane ko!rki N s# zdolne do cytotoksycznego zniszczenia ko!rek rd"onka% Podatno/ko!rek rd"onka wini na liz' s$owodowan# ludzki!i ko!rka!i N jest s$owodowana !i'dzy inny!inie!o&noci# roz$oznania wiJskich cz#steczek M6 klasy 4 $rzez ha!uj#ce rece$tory ludzkich ko!rek N(wynikaj#c# z r&nic w o"r'"ie M6 wini 25EA7 i czowieka 26EA7% W ty! kontekcie cz#steczki 6EAH0 s#

$otencjalny!i aktywatora!i rece$torw inhi"uj#cych ko!rek N 2.F9\N:1A7% 6a!owanie od$owiedzii!!unologicznej z udziae! ko!rek N stanowi gwny $ro"le! "adawczy !ojej $racy doktorskiej i kontynuacj'tego niezwykle wa&nego kierunku "adawczego%

8F


40/119


"zczypce optyczne zasada dziaania i zastosowanie w badaniac# biofizycznyc#

Alicja ielewicz

Wydzia Bioche!ii( Bio)izyki i Biotechnologii( Uniwersytet *agielloJski( oo 5tudentw

Bio)izyki TNo"elCeH!ailD alicja%cieslewicz]g!ail%co!

O$rcz che!icznego do$asowania su"stancji( dla reakcji zachodz#cych w ko!rkach organiz!w &ywych(istotne jest rwnie& !echaniczne dziaanie od$owiednich enzy!w nazywanych !ikro!aszyna!i% 3izyczne !etody

$o!iaru si dostarczaj# nowych danych o !ateriaach "iologicznych% Przykade! jest !ikrosko$ia si ato!owych2A3M7( ktrej zastosowanie zrewolucjonizowao "adanie skr'cania si' "iaek i uatwio "adanie waciwocili$oso!w%

*ednak gdy $rzychodzi na! z!ierzy/ n$% siy zwi#zane z $rac# "iaek !otorycznych czy re$likacj# .NAczuo/ A3M okazuje si' niewystarczaj#ca% Metod#( ktra u!o&liwia na! $o!iar tak niewielkich si s# szczy$ceo$tyczne% .zi'ki ni! !o&e!y wykona/ $o!iar si o wartociach rz'du L(, ^ ,LL $N( ktry to zakres do"rzeod$owiada wanie $roceso! zachodz#cy! w ko!rkach% .odatkow# zalet# jest to( &e $ro!ieniowanie u&ywane w tej!etodzie !ieci si' w zakresie widzialny! oraz $odczerwony!( wi'c nie $owoduje uszkodzeJ delikatnych !ateriaw

"iologicznych

Ponadto $ua$kowanie o$tyczne u!o&liwia !ani$ulacj' ko!rka!i( organella!i( a nawet $ojedynczy!i!akro!olekua!i z nies$otykan# do tej $ory $recyzj#( $ozwalaj#c o"serwowa/ wyniki w czasie rzeczywisty!%

ele! $racy jest za$rezentowanie zasady dziaania szczy$cw o$tycznych oraz $orwnanie wynikwuzyskiwanych za ich $o!oc# z inny!i !etoda!i "io)izyczny!i%

9L


41/119


$dentyfikacja i c#arakterystyka f%nkcjonalna potencjalnyc# interon&w bakterii z rodzaj%'se%domonas poc#odzcyc# z kopalni miedzi (%bin i skadowiska odpad&w poflotacyjnyc#

)elazny !ost

Anna iok( Marcin Ada!czuk( .ariusz Bartosik( ukasz .ziewit

Iakad :enetyki Bakterii( 4nstytut Mikro"iologii( Wydzia Biologii( Uniwersytet Warszawski

4ntegrony to gru$a szeroko roz$owszechnionych "akteryjnych ele!entw genetycznych( ktre gro!adz#ogro!n# ilo/ in)or!acji oraz u!o&liwiaj# na"ywanie nowego !ateriau genetycznego $o$rzez w"udowywaniekolejnych kaset genowych% 4n)or!acja zawarta w kasetach genowych integronw !a cz'sto charakter ada$tacyjnyi !o&e w okrelonych warunkach zadecydowa/ o $rze&yciu !ikroorganiz!u +,-% W ostatnich latach wzrosozainteresowanie integrona!i identy)ikowany!i w szcze$ach "akterii rodowiskowych( gdy&( jak si' zakada(in)or!acja niesiona $rzez ich kasety genowe !o&e "y/ u&yteczna w $rocesach "iore!ediacji +1-%

W strukturze integronw wyr&nia si' konserwowany szkielet( na ktry skadaj# si' ele!enty warunkuj#ce ich)unkcjonowanie jako syste!w u!o&liwiaj#cych gro!adzenie( wy!ian' oraz eks$resj' in)or!acji genetycznej% 5# toD2i7 gen reko!"inazy tyrozynowej 2integrazy7( 2ii7 !iejsce reko!"inacji zlokalizowanej att4 oraz 2iiiHi7 dwa $ro!otory(z ktrych $rowadzona jest eks$resja genu reko!"inazy i genw kaset% asety genowe to ele!enty !o"ilne( ktre

w wi'kszoci $rzy$adkw nios# $ojedyncz# "ez$ro!otorow# otwart# ra!k' odczytu( $oni&ej ktrej wyst'$ujesekwencja att "ior#ca udzia w $rocesie w#czania kaset do integronu% Wielko/ integronu jest z!ienna i zale&y odlicz"y kaset genowych +,-%

W ra!ach $rezentacji zostan# $rzedstawione wyniki "adaJ $uli szcze$w z rodzaju Pseudo!onas( w ktrychzidenty)ikowano $otencjalne integrony o niety$owej strukturze% Badane "akterie wyizolowano z ekstre!alnychrodowisk 2ko$alna !iedzi Eu"in oraz z"iornik od$adw $o)lotacyjnych elazny Most7% Prze$rowadzaj#c analiz' insilico zidenty)ikowanych ele!entw nie wyr&niono !iejsc reko!"inacji zlokalizowanej att4 oraz att% o wi'cej(zidenty)ikowane integrazy nie wykazuj# $odo"ieJstwa do ty$owych reko!"inaz kodowanych $rzez integrony%Wyznaczono nato!iast trzy $otencjalne kasety genowe% W o$arciu o analizy "ioin)or!atyczne za$lanowanodowiadczenia in io( ktre !iay na celu wyjanienie s$oso"u )unkcjonowania o$isanych ele!entw%Prze$rowadzone analizy dotyczyy "adania !o&liwoci integracji\wycinania kaset genowych oraz lokalizacjii aktywnoci $otencjalnych $ro!otorw%

+,- :% a!"ray( A% M% :uerout and .% Mazel( T4ntegrons%C Annual reiew o) genetics( ol% 99( no% __( $$% ,9,H,


42/119


*naliza wybranyc# marker&w molek%larnyc# w trakcie d%oterminowej #odowli zawiesinykom&rkowej *rabidopsis t#aliana +,

*ustyna zarnik( Aleksandra wiatkowska

Pozawydziaowy Ia!iejscowy instytut Biotechnologii 5tosowanej i Nauk PodstawowychUniwersytetu =zeszowskiego

5tarzenie jest wa&ny! eta$e! w rozwoju wszystkich organiz!w( $rowadz#cy! do szeregu z!ian!or)ologicznych i czynnociowych na $ozio!ie caego organiz!u% 5tarzenie u rolinH w $rzeciwieJstwie do zwierz#tHnie jest $rzed!iote! z"yt wielu "adaJ naukowych( dlatego te& $odj'to ten te!at w $rezentowanej $racy% *ako !odel

"adawczy wykorzystano zawiesin' ko!rkow# Ara"ido$sis thaliana >@% *est ona coraz $owszechniejwykorzystywana w wielu "adaniach $odstawowych( jak rwnie& jest $otencjalny! narz'dzie!( !og#cy! !ie/zastosowanie n$% w $rze!yle "iotechnologiczny! do $rodukcji "iaek heterologicznych% Nie!niej jednak "ardzoniewiele wiado!o na te!at z!ian zachodz#cych w czasie dugoter!inowej hodowli in itro ko!rek Ara"ido$sis(cho/ jest to zagadnienie zarwno ciekawe z "adawczego $unktu widzenia( jak rwnie& !aj#ce $otencjalne znaczeniew $rze!yle "iotechnologiczny! i\lu" )ar!aceutyczny!% W ty! ostatni! $rzy$adku rwnolega analiza szeregu!arkerw !o&e u!o&liwi/ o$ty!alizacj' warunkw hodowli tak( a"y unikn#/ nie$odanych z!ian( wynikaj#cych n$%ze z!iennoci so!aklonalnej ko!rek rolinnych hodowanych in itro% I reguy z!iany te( !aj#ce $odo&e zarwnogenetyczne( jak i e$igenetyczne( s# niekorzystne( $oniewa& !og# n$% utrudnia/ utrzy!anie szy"kiego wzrostu liniiko!rkowych i w$ywa/ negatywnie na wydajno/ $rodukowanych $rzez nie "iaek heterologicznych%

W $rezentuj#cej $racy analizowano z!iany genetyczne i e$igenetyczne zachodz#ce wraz z wiekie! hodowliko!rkowej Ara"ido$sis >@% Modele! "adawczy! "yy dugoter!inowe zawiesiny ko!rkowe( tj% kulturyhodowane $rzez 91 dni "ez wy!iany !ediu! hodowlanego% Badane !arkery $orwnywano we wczesnej 2@Hdniowej7(rodkowej 2,9Hi 1,H dniowej7 i $;nej 291H dniowej7 )azie wzrostu zawiesiny% Wykazano( &e zarwno &ywotno/( jaki $otencja $roli)eracyjny ko!rek s$ady o okoo @L` w $;nej )azie wzrostu% *ako !arkery $otencjau

$roli)eracyjnego wykorzystano eks$resje kinazy !itotycznej AtAurora1 2najwi'ksza eks$resja w )azie M cykluko!rkowego7 oraz kontrolowan# $rzez )os)orylacj' seryny ,L w histonie 8 2e$igenetyczny !arker $odziawko!rkowych7% Nast'$nie za $o!oc# $$orwnawczego =>HP= wykazano( &e w $;nej )azie wzrostu zawiesinynast'$owa wzrost eks$resji genw 2!ierzonej $ozio!e! transkry$tw7( "'d#cych $ozytywny!i regulatora!istarzenia( takich jak W=[?8 oraz 04N1% Wskazywao to na roz$ocz'cie $rocesw starzenia w tej )azie wzrostu

zawiesiny% *ednoczenie( zao"serwowano wzrost $ozio!u !ody)ikacji $otranslacyjnych "iaek histonowych( takich jakdi!etylacja lizyny F oraz tri!etylacja lizyny 1@ w histonie 8 2analiza WesternH "lot7% Mody)ikacje te s# znacznika!inieaktywnej transkry$cyjnie chro!atyny( a zwi'kszenie ich $ozio!u w $;nej )azie wzrostu zawiesiny !o&e !ie/zwi#zek z roz$oczynaj#cy! si' $rocese! kondensacji chro!atyny( ktry jest charakterystyczny dla wczesnych eta$wstarzenia%

+,- AQelos M( %%( Bardet ( Eescure B 2,FF17% A $rotocol )or transient eQ$ression in Ara"ido$sis thaliana$roto$lasts isolated )ro! cell sus$ension cultures% Plant Physiol Bioche! 8LD ,18H,1

+1- .e!ido .%( .% Gan .a!!e( et al% 21LL?7% 4denty)ication and dyna!ics o) two classes o) AuroraHlikekinases in Ara"ido$sis and other $lants% Plant ell ,@287D 8


43/119


/lowodany w terapii kombinowanej z lekami przeciwnowotworowymi

Anna zu"atkaa7( *oanna 5arnika7( I"igniew Witczak"7( >o!asz Po$awskia7

a7.e$art!ent o) Molecular :enetics( Uniersity o) Eodz( Eodz( Poland

"7.e$art!ent o) Phar!aceutical 5ciences( Nes"itt 5chool o) Phar!acy( Wilkes Uniersity( 9 W%5outh 5treet( WilkesHBarre( PA ,@iocukry dzi'ki $osiadaniu ato!usiarki w swojej cz#steczce r&ni# si' $od wzgl'de! swoich waciwoci "iologicznych od swych analogw% 4chnajistotniejsz# cech# jest niewra&liwo/ na enzy!y rozkadaj#ce w'glowodany( co u!o&liwia i! "lokowanie r&nychszlakw wewn#trzko!rkowych% >e i inne ich waciwoci 2!%in% roz$uszczalno/ w li$idach7 s$rawiaj#( &e tiocukrynale do interesuj#cych zwi#zkw che!icznych !aj#cych $otencjalne zastosowanie jako leki $rzeciwnowotworowe%Uzyskane dotychczas wyniki wskazuj#( &e "adane w'glowodany zawieraj#ce ato! siarki dziaaj# cytotoksycznie nawy"rane linie ko!rek nowotworowych% 5t#d $o!ys zastosowania ich w $o#czeniu z leka!i

$rzeciwnowotworowy!i jako ele!entw tera$ii ko!"inowanej%

ele! $racy jest okrelenie cytotoksycznoci wy"ranych tiocukrw jako zwi#zkw ws$o!agaj#cych dziaanieche!iotera$eutykw na ko!rki nowotworowe%

=&nice w toksycznoci zwi#zkw okrelono $o$rzez $o!iar $ozio!u cytotoksycznoci sa!ych tiocukrw(a tak&e w $o#czeniu ich z che!iotera$eutyka!i% Badania $rowadzono na 1 r&nych liniach ko!rkowychD A?9F2niedro"noko!rkowy rak $uc7 oraz EoGo 2rak jelita gru"ego7( ktre $oddano ,1Ho godzinnej inku"acji z "adany!izwi#zka!i% Prze&ywalno/ ko!rek nowotworowych okrelano kolory!etrycznie z zastosowanie! testu ell ounting

itH%*eli "adane zwi#zki wyka wy&sz# toksyczno/ w ko!"inacji z che!iotera$eutyka!i( !og# sta/ si'

$odstaw# do za$rojektowania nowych tera$ii ko!"inowanych w leczeniu chor" nowotworowych%

Praca )inansowana z $rojektu NN nr .0H1L,,\L,\B\NI9\L88F,

98


44/119


0anoczstki jako potencjalne narz/dzie do walki z nowotworami opornymi na standardowc#emioterapi/

Marta .enel

Wydzia Biologii i Ochrony rodowiska U( atedra >er!o"iologiiNowotwory stanowi# gwn# $rzyczyn' zgonw na wiecie% a&dego roku choro"' nowotworow# diagnozujesi' u $onad ,L !ilionw os"% O"ecnie najcz'ciej stosowan# !etod# zwalczania tych schorzeJ jest che!iotera$ia%>aki s$os" leczenia !a jednak liczne wady% he!iotera$ia jest !etod# oglnoustrojow#( wywouj#c# ogro!nes$ustoszenie w organiz!ie $acjentw% olejny! $ro"le!e! w skutecznej tera$ii chor" nowotworowych jest zjawiskoo$ornoci wielolekowej 2ang% !ultidrug resistance( M.=7( de)iniowane jako na"ycie $rzez ko!rki nowotworowe

jednoczesnej niewra&liwoci na kilka gru$ czynnikw tera$eutycznych% Niewra&liwo/ ta rozwija si' w od$owiedzi nastosowanie $ojedynczego cytostatyku% Wrd gwnych $rzyczyn $owstawania M.= wy!ieni/ !o&na wz!o&on#aktywno/ "iaek nalecych do rodziny AB 2ang% A>PH"inding casette7% *est to gru$a "onowych trans$orterwusuwaj#cych kseno"iotyki 2w ty! leki7 z wn'trza ko!rki do rodowiska zewn'trznego% .rugi !echaniz!

$owstawania o$ornoci wielolekowej zwi#zany jest z aktywacj# antya$o$totycznych "iaek rodziny BclH1( czegoskutkie! jest zaha!owanie a$o$tozy ko!rek nowotworowych +BadowskaHozakiewicz 1L,,-% o!rki z )enoty$e!M.= s# niewra&liwe na dziaanie che!iotera$eutykw( co znacznie utrudnia tera$i'% =ozwi#zanie! tego $ro"le!u

!o&e "y/ wykorzystanie nanocz#stek( ktre selektywnie kieroway"y leki do ko!rek nowotworowych z $o!ini'cie!ko!rek $rawidowych i uatwiay"y zwi'kszon# aku!ulacj' cz#steczek lekw w ko!rkach rakowych%

Nanocz#steczka!i nazywa!y struktury 2$oli!ery( nanocz#stki !etali( cz#steczki li$idowe i inne7o roz!iarach w zakresie od ,L do ,LLL n!% 5# to struktury "ardzo r&norodne% =&nice dotycz# zarwno ich wielkoci(

jak i waciwoci takich jak $rzewodno/( wytrzy!ao/( stosunek $ola $owierzchni do o"j'toci oraz waciwocio$tyczne +>horley( >etley 1L,8-% Nanostruktury znajduj# zastosowanie w wielu dziedzinach nauki( !i'dzy inny!iw elektronice( kos!etyce oraz in&ynierii o$tycznej% 5# stosowane tak&e w !edycynie% Najnowsze "adania sku$iaj# si'na zastosowaniu nanocz#stek w celu zwi'kszenia skutecznoci leczenia nowotworw o$ornych na standardow#che!iotera$i' o$art# na niskocz#steczkowych lekach( dostaj#cych si' do ko!rek na drodze dy)uzji $rostej% Badanio!

$oddawane s# nie tylko $ojedyncze nanocz#steczki( ale rwnie& zo&one ko$oli!ery $ozwalaj#ce na jednoczesne$rzenoszenie che!iotera$eutykw oraz !odulatorw trans$orterw o$ornoci wielolekowej( co w e)ekcie u!o&liwiaznaczne zwi'kszenie skutecznoci lekw w ko!rkach o$ornych na standardow# tera$i' +Patel i in% 1L,,-%

Powy&sze in)or!acje jasno wskazuj#( &e nanocz#stki s# struktura!i o du&y! $otencjale% 4ch niewielkieroz!iary oraz !o&liwo/ $rzy#czenia do $owierzchni r&nego ty$u zwi#zkw daj# !o&liwo/ zastosowania tychstruktur jako skutecznych trans$orterw lekw $rzeciwnowotworowych rwnie& w ko!rkach o )enoty$ie M.=%.zi'ki ty! cecho! !o&na $rzy$uszcza/( &e w $rzyszoci nanocz#stki "'d# standardowo stosowane w leczeniur&nych ty$w nowotworw%

+,- BadowskaHozakiewicz A% M% 1L,,% Ijawisko o$ornoci wielolekowej w nowotworach R rola gliko$roteinyP% ycie Weterynaryjne horley A%*%( >etley >%.% 1L,8% New $ers$ecties in nano!edicine% Phar!acology b thera$eutics,9LD1D ,@orchilin( G% P% 1L,,% Multidrug resistance reersal "y coHdeliery o)tariKuidar 2S=F?@


45/119


1inetyna ind%k%je specyficzn dla etylen% 2potr&jn reakcj/3 w korzeniac# siewek 4icia fabassp. minor

Magdalena .oniak( Anita unikowska( Andrzej a;!ierczak

atedra yto)izjologii( Wydzia Biologii i Ochrony rodowiska( Uniwersytet dzki( ul% Po!orska,9,\,98( FLH18< d;

!agdadoniak]o1%$l

0tylen 261617( naj$rostszy $od wzgl'de! "udowy che!icznej( jedyny gazowy hor!on rolinny(towarzyszy rolinie $rzez cae jej &ycie( od !o!entu wykiekowania nasiona a& do jej !ierci( reguluj#c wiele

$rocesw !eta"olicznych i rozwojowych na $ozio!ie organiz!alny! jak i ko!rkowy! +1-% 0tylen to hor!on"ior#cy udzia w $rocesie kiekowania nasion i ziaren $yku( wzrostu i rozwoju organw rolinnych( $eni#c zarwnorol' inhi"itora jak i sty!ulatora( deter!inacji $ci( zsynchronizowanego kwitnienia i dojrzewania owocw( starzenia si'i !ierci ko!rek r&nych organw rolinnych( w ty! tworzenia si' $rzestworw aerenchy!atycznych% 0tylen jestrwnie& nazywany Thor!one! stresowy!C( ze wzgl'du na )akt( &e jego $odwy&szone st'&enie jest o"serwowane

$odczas stresw "iotycznych i a"iotycznych( na ktre jest nara&ona rolina $odczas caego swojego &ycia +8( 9-%

5$ecy)iczno/ dziaania etylenu o"jawia si' w !or)ologii zjawiskie! tzw% T$otrjnej reakcjiC( $olegaj#cej(w $rzy$adku siewek grochu( na 2,7 zaha!owaniu wzrostu elongacyjnego korzeni i siewek( 217 zwi'kszenie! gru"ociko!rek( co skutkuje gru"ienie! organw i na 287 indukcji wzrostu horyzontalnego $'dw +?-% W wyniku $odaniakinetyny do hodowli siewek G% )a"a ss$% !inor o"serwuje si'D 2,7 zaha!owanie wzrostu korzeni siewek na dugo/s$owodowane za"lokowanie! wzrostu wydu&eniowego ko!rek korzeni( 217 gru"ienie korzeni siewek zwi#zany!z indukcj# $o$rzecznego kierunku wzrostu ko!rek oraz 287 rozwj tzw% ThaczykaC w cz'ci a$ikalnej korzenia%Podo"ne zjawisko o"serwuje si' w korzeniach Ara"ido$sis thaliana +


46/119


'owierzc#niowy rezonans plazmonowy jako imm%noloiczna metoda wykrywania marker&wzawa% mi/nia sercoweo

atarzyna .udziak,( Anna 5kotny1

,Iakad hirurgii 0ks$ery!entalnej i Badania Bio!ateriaw( Uniwersytet Medyczny i!% Piastwl#skich( Wrocaw

1atedra i linika hor" Wewn'trznych( :eriatrii i Alergologii( Uniwersytet Medyczny i!%Piastw l#skich( Wrocaw

=ozwj "iosensorw w szczeglnoci i!!unosensorw o$artych na $owierzchniowy! rezonansie$laz!onowy! 25P=7 s$owodowa du&e zainteresowanie je&eli chodzi o czue testy wykrywaj#ce zawarto/ tro$oniny%Oznaczenie sercowych izoenzy!w tro$onin !a $odstawowe znaczenie w diagnostyce zawau !i'nia sercowego%5P= u!o&liwia !ierzenie interakcji cz#steczek na granicy )az staej i ciekej i $ozwala na !ierzenie "ardzo !aychz!ian st'&enia analitw% .latego te& !etoda ta znajduje zastosowanie w "ardzo wczesnej diagnostyce zawau !i'niasercowego( $oniewa& ryzyko zawau wyst'$uje ju& gdy warto/ >n> $rzewy&sza L(LL8 g\l( nato!iast granicawykrywalnoci tro$oniny za $o!oc# 5P= to ok% 1(? i L(1? ng \ !l w zale&noci od ty$u czujnika%

W czujnikach 5P= do wykrywania !arkerw zawau !i'nia sercowego( $rzeciwciaa s# unierucho!ione na$owierzchni czujnika i $oddawane o"owi#zuj#cy! interakcj# z analite!% I!iana k#ta rezonansu $o$rzez wi#ceinterakcje !i'dzy analite! a $rzeciwciaa!i jest w$rost $ro$orcjonalna do st'&enia analitu%

>echniki i!!unologiczne !aj# dwie $odstawowe klasy)ikacje( heterogeniczne i ho!ogeniczne%W heterogenicznych( $rzeciwciaa 2lu" antygeny7 s# unierucho!ione na $odo&u $rzetwornika wi#cego interakcja!iz analite!% W !iejscu styku analitu z $odo&e! nast'$uje z!iana sygnau czujnika% W $rzy$adku ho!ogenicznychtestw( reakcja od"ywa si' w caej )azie roztworu% Poniewa& zjawisko 5P= jest selektywne do $owierzchni wi#cejreakcje wyst'$uj# jedynie na $owierzchni kilkuset nano!etrw%

4!!unologiczne 5P= s# dalej klasy)ikowane $rzez wy"r !etodologii wykrywania co znacznie zale&y odrodzaju analitu docelowego( $r"ek analitycznych( czuoci a$aratury analitycznej i zastosowania% Naj"ardziej

$owszechne ty$y $o!iarowe to test "ez$oredni( test TsandwichC( test $rze!ieszczenia( test $oredniegokonkurencyjny ha!owania% .o wykrywania z!ian st'&enia tro$oniny najcz'ciej stosuje si' test "ez$oredni dla

ktrego granica wykrywalnoci sercowego "iaka tro$oniny to ok% 1(? $$"% Nato!iast wykrywanie tro$oninyw $rzy$adku czujnika ty$u Tkana$kaC wynosi ok% L(1? ng \ !l%

+,- =% 3ire!an .%( E% >atsuo u"ota( An 5P= i!!unosensor )or hu!an cardiac tro$onin > using s$eci)ic"inding aidin to "iotin at car"oQy!ethyldeQtranH!odi)ied gold chi$% linica hi!ica Acta 8@< 21LL@7

+1- .% =% 5hankaran( N% Miura( =ecent adance!ents in sur)ace $las!on resonance i!!unosensors )ordetection o) s!all !olecules o) "io!edical( )ood and eniron!ental interest% 5ensors and Actuators B ,1,21LL@7 ,?R,@@

+8- *% 4% 5oler .az( :uia $ractica% Marcadores BioKui!icos ardiacos% >ro$onina% Mioglo"ina( ardiologia(ursos de Medicina ( 1LL@

9


47/119


0anotec#noloia posprzta +w&j dom

a!il .urka( rzyszto) ochel

Uniwersytet dzki( Wydzia Biologii i Ochrony rodowiska( 4nstytut Bio)izyki( atedra

>er!o"iologiiO"serwowany w ostatnich latach rozwj nanotechnologii !o&e w znaczny! sto$niu zrewolucjonizowa/ wieledziedzin nauki% :wny! o"szare!( w ktry! nowa technologia !o&e $rzynie/ istotne korzyci dla s$oeczeJstwastaa si' !edycyna% z#stki o wielkoci $oni&ej ,LL n! wykazuj# s$ecjalne waciwoci( r&ne od tychcharakterystycznych dla !ateriaw w skali !akro( i charakteryzuj# si' du $owierzchni# w stosunku do swojejo"j'toci% Powierzchni' nanocz#stek !o&na !ody)ikowa/ w r&ny s$os"( a ich wielko/ $ozwala na "ez$orednieoddziaywania na $ozio!ie ko!rkowy! w s$os" nieosi#galny dla konwencjonalnych !ateriaw% Wrd naj"ardziejo"iecuj#cych gru$ nanocz#tek s# nanocz#stki sre"ra( ktre dzi'ki swoi! waciwocio! anty"akteryjny! !og# "y/szeroko wykorzystywane w $roduktach gos$odarstwa do!owego% Przykada!i !og# "y/D lodwki( $ralki( rodkiczystoci( a nawet suszarki do woswf Producenci tych urz#dzeJ za$ewniaj# o $rawie ,LL` skutecznoci

"akteriologicznej( ale rwnie& o ochronie konsu!enta $rzed inny!i dro"noustroja!i choro"otwrczy!i% :wny!$ro"le!e! zastosowania nano!ateriaw $ozostaje nadal !aa wiedza na te!at ich oddziaywania na organiz!y inio% O"ecnie $rowadzone "adania $ozwol# na szersze wykorzystanie tych !ateriaw z korzyci# dla ludzi%

9@


48/119


5etrotranspozony non-(+5 w enomac# rolinnyc# b%dowa6 f%nkcja i mec#anizmydziaania

5eweryn 3rasiJski( 4za"ela oodziejczyk( >o!asz 5akowicz

Wydzia Biologii i Ochrony rodowiska U5ekwencje niekoduj#ce w geno!ach organiz!w &ywych s# $rzed!iote! zainteresowania "adaczy od $onadtrzech dekad% Inaczn# ich cz'/ stanowi# tzw% rucho!e ele!enty genetyczne 2eng% trans$osa"le ele!ents7 $osiadaj#cezdolno/ do $rze!ieszczania si' w o"r'"ie geno!u% Wyst'$uj# one $owszechnie u 0ukaryota i w wi'kszociProkaryota% 5zczeglnie licznie re$rezentowane s# one w geno!ach rolinnych( cho/ ich $rocentowy udzia jest r&nyw zale&noci od gatunku%

W celu ochrony integralnoci geno!u ich aktywno/ jest cile regulowana za $o!oc# !echaniz!we$igenetycznych i $osttranskry$cyjnych% *ednoczenie wydaj# si' "y/ jedny! z istotnych ;rde z!iennocigenetycznej%

Podzia rucho!ych ele!entw genetycznych zosta dokonany na $odstawie o"ecnoci =NA jak nonikatrans$ozycji retrotrans$ozony charakteryzuje o"ecno/ tego eta$u( w $rzeciwieJstwie do klasy trans$oznw .NA%I kolei klasy)ikacja retrotrans$ozonw uwzgl'dnia )akt wyst'$owania w ich strukturze 2lu" "rak7 )lankuj#cych je

dugich ter!inalnych $owtrzeJ 2E>=7% 0le!enty nonHE>= o"ej!uj# sekwencje ty$u 54N0 i E4N0 r&ni#ce si'zarwno "udow# jaki i !echaniz!e! trans$ozycji 54N0 nale do gru$y ele!entw nieautono!icznych( ktrych

$owielanie w geno!ie zale&y od sekwencji E4N0%

=ucho!e ele!enty genetyczne "'d#c jedny! z czynnikw s$rawczych z!iennoci genetycznej !aja szerokies$ektru! oddziaywaJ na geno!% Potwierdzono ich udzia w $owstawaniu licznych chor" genetycznych% *ednak ichzdolno/ do regulacji aktywnoci genw i tworzenia nowej jakoci w geno!ie s$rawia( &e $resja selekcyjna wo"ecnich "ya ograniczona%

Pula nadal aktywnych ele!entw genetycznych tego ty$u nie jest du&a( znaczna ich cz'/ ulega "owie!roz!aity! uszkodzenio! w toku ewolucji% =etrotrans$ozony wykorzystywane s# !%in% w $raktyce w jako rodzajs$ecy)icznych !arkerw genetycznych% I uwagi na zdolno/ oddziaywania na geno! znalazy si' one tak&e w kr'guzainteresowaJ ws$czesnej "iotechnologii rolin%

9


49/119


"irt%iny w c#orobac# ne%rodeeneracyjnyc#

*% :erszon( A% =odacka( M% Puchaa

Iakad =adio"iologii( atedra Bio)izyki Molekularnej( Wydzia Biologii i Ochrony rodowiska(

Uniwersytet dzki( ul% Po!orska ,9,\,98( FLH18< d;(eH!ailD joanna%gerszon]g!ail%co!

5irtuiny zaliczaj# si' do rodziny NA.YHzale&nych deactetylaz histonowych i stanowi# wysoce konserwatywn#gru$' "iaek wyst'$uj#c# zarwno u archeo"akterii jak i eukariotw% U ssakw zidenty)ikowano @ ho!ologwnalecych do rodziny "iaek 5ir1 254=>,H@7% =&ni# si' one lokalizacj# oraz )unkcj# $enion# w ko!rce%Prze$rowadzone do tej $ory "adania( $oszerzyy znacznie wiedz' dotycz#c# roli sirtuin w organiz!ie% Wiado!o( &eenzy!y te s# zaanga&owane w r&norodne $rocesy takie jak starzenie( regulacj' $rocesw !eta"olicznych 2w ty!gos$odarki li$idowo R w'glowodanowej7( a$o$toz'( wyciszanie transkry$cji( urucha!ianie !echaniz!wna$rawczych( regulacj' $otranskry$cyjnych !ody)ikacji "iaek% .u&e nadzieje wi#&e si' z wykorzystanie! aktywnocikatalitycznej sirtuin w $rewencji chor" neurodegeneracyjnych% Wykazano "owie!( &e uczestnicz# one nie tylkow utrzy!aniu ho!eostazy "iaek "ez$orednio zaanga&owanych w tworzenie agregatw 2n$% a!yloidu ( ZHsynukleiny7ale tak&e "ior# udzia w zwi'kszeniu neuro$lastycznoci oraz za$ewniaj# $rawidowe )unkcjonowanie !itochondriw%Ponadto reguluj# !ody)ikacje e$igenetyczne% I choro"a!i zwi#zany!i z wiekie! w najwi'kszy! sto$niu $owi#zane

s# dwie z nich( sirtuina , i sirtuina 8% Potwierdzono( &e ich aktywno/ deacetylazowa odgrywa rol' w $rzeciwidziaaniuagregacji niskocz#steczkowych $e$tydw% Poza ty! wz!agaj# eks$resj' genw koduj#cych enzy!y antyoksydacyjnetakie jak !anganowa dys!utaza $onadtlenkowa( dehydrogenaza izocytrynianowa 1 oraz ha!uj# $owstawanie stanwza$alnych( $o$rzez inaktywacj' czynnika transkry$cyjnego N3HB%

+,- BAE0=I[ A( P4=OEA E% >hera$eutic $otential o) actiators and inhi"itors o) sirtuins% Bio3actors%1L,L 8O ( AUW0=S *% aloric restriction( 54=>, and longeity% >rends 0ndocrinol Meta"% 1LLF @D 81?H88,

8% .ONM0I :( uteiro >3% 54=>, and 54=>1D e!erging targets in neurodegeneration% 0MBO Mol% Med% 1L,8 ?D899R8?1

9% 4NA4.AN. B( BO55[HW0>I0E% 3oreer youngD 54=>8 a shield against !itochondrial !elt down( aging( andneurodegeneration% 3rontiers in aging neurodegenearation% 3ront Aging Neurosci% 1L,8 ?D 9

Praca )inansowana z grantu "adawczego 1L,1\L?\B\NI,\LL@L, $rzyznanego $rzez Narodowe entru! Nauki

9F


50/119


5&7ne oblicza sekrecjonowanyc# aspartylowyc# proteinaz - czyli jak dziaaj dro7d7aki.

Mariusz :ogl

Wydzia Bioche!ii( Bio)izyki i Biotechnologii U*

andida al"icans jest o$ortunistyczny! ko!ensale! ok% ?L` $o$ulacji ludzkiej% iedy ukad od$ornociowygos$odarza jest osa"iony "#d; rwnowaga !ikro"iologiczna zachwiana( % al"icans !o&e $owodowa/ in)ekcje$owierzchniowe% *ej niekontrolowany rozwj $rowadz#cy do zaka&eJ oglnoustrojowych !o&e "y/ nie"ez$ieczny dla&ycia $acjenta %

Wrd szerokiego arsenau od$owiedzialnego za wirulentno/ dro&d&akw( o$rcz u!iej'tnoci z!iany)enoty$u( zdolnoci do adhezji( istotn# rol' odgrywaj# sekrecjonowane as$artylowe $roteinazy 25AP7% .o tej $oryscharakteryzowano ich ,L izo)or! cechuj#cych si' gwnie kwany! o$ti!u! $6% Wi'kszo/ z nich istnieje w )or!iewolnej( za wyj#tkie! 5APF i 5AP,L( ktre zakotwiczone s# na $owierzchni $atogenu $rzy $o!ocy kotwicH:P4% Wrd5AP !o&na wskaza/ te charakterystyczne dla "lastos$or( o"serwowane gownie we wczesny! eta$ie in)ekcji 2 5AP,H5AP87( oraz waciwe dla )or!y strz'$kowej 25AP9H


51/119


C#arakterystyka kariotyp% wybranyc# szczep&w dro7d7y "acc#aromyces cere8isiaew oparci% o metod/ elektroforezy pojedynczyc# c#romosom&w.

0welina :olec( Anita Panek( 4wona =zeszutek( Anna Eewinska( Maciej Wnuk

4nstytut Biotechnologii 5tosowanej i Nauk Podstawowych Uniwersytet =zeszowski*ednoko!rkowe dro&d&e 5accharo!yces cereisiae s# jedny! z naj$o$ularniejszych organiz!w!odelowych stosowanych do "adania !echaniz!w $rocesw zachodz#cych u wy&szych eukariontw% 6a$loidalnygeno! dro&d&y 5accharo!yces cereisiae zo&ony jest z ,< chro!oso!w( ktre !o&na rozdzieli/ $rzy u&yciuelektro)orezy w z!ienny!( ho!ogenny! $olu elektryczny! 2ang% $ulsedH)ield gel electro$horesis( P3:07% Precyzyjnyrozdzia chro!oso!w u!o&liwia wykrycie $oli!or)iz!w wielkoci chro!oso!w oraz ewentualnych za"urzeJw strukturze chro!oso!owej 2n$% translokacje( du$likacje7% Nie!niej !etoda ta u!o&liwia wykrycie z!ian na

$ozio!ie chro!oso!owy! wy#cznie( jeli w te z!iany zaanga&owane s# !ini!u! dwa chro!oso!ynieho!ologiczne i jeli z!iany s# dostatecznie du&e i dotycz# wi'kszoci lu" caej $o$ulacji ko!rek( co stanowi

$owa&n# $rzeszkod' !etodyczn# w szacowaniu z!iennoci chro!oso!owej na $ozio!e $ojedynczych ko!rek%I kolei !etoda ko!etowa 2ang% co!et assay7 u!o&liwia !onitorowanie z!ian na $ozio!ie $ojedynczej ko!rki( alewy#cznie $'kni'/ 2$ojedynczych\$odwjnych7 w o"r'"ie caego jej geno!u "ez !o&liwoci rozr&nienia( ktregodokadnie chro!oso!u dotycz# analizowane $'kni'cia .NA% >y! sa!y! w $rzy$adku ko!rek dro&d&owych

$owa&ny! $ro"le! jest dost'$no/ narz'dzi do analizy uszkodzeJ .NA oraz ich $odatnoci na $'kni'cia( ktre !o&na"yo"y stosowa/ w odniesieniu tylko do wy"ranych chro!oso!w $ojedynczych ko!rek% 5t#d istnieje $ilna $otrze"ao$racowania nowych !etod( ktre $rzezwyci'&aa"y te !etodyczne trudnoci% Wykorzystuj#c wy"rane szcze$yla"oratoryjne 5% cereisiae dokonano charakterystyki ich $oszczeglnych chro!oso!w $rzy zastosowaniu nowoo$racowanej !etody elektro)orezy $ojedynczych chro!oso!w jako syntetycznego $o#czenia !etody P3:0 oraztradycyjnej !etody ko!etowej +,-% W analizach wykorzystano szcze$y ha$loidalne z serii B[9@9, z delecja!iwy"ranych genw( !%in% zaanga&owanych w kontrol' cyklu ko!rkowego 2geny BUB,( BUB1( MA.,7( od$owied; nauszkodzenia .NA 2geny >0E, czy =A.,7 czy kontrol' od$owiedzi na skadniki $okar!owe oraz dugoci &ycia 2gen>O=,7 oraz od$owiednie szcze$y di$loidalne "'d#ce he!izygotyczny!i !utanta!i izogeniczny!i do di$loidalnegoszcze$u B[9@98 2szcze$y BUB,\"u",( BUB1\"u"1( MA.,\!ad,( >0E,\tel,( =A.,\rad, oraz >O=,\tor,7%Prze$rowadzona analiza u!o&liwia $o raz $ierwszy ko!$leksow# ocen' karioty$u 5% cereisiae $od wzgl'de! ich

$odatnoci na za"urzenia strukturalne 2w ty! a"erracje zrwnowa&one oraz $owstae w skutek $ro"le!w w trakciere$likacji .NA7( jak rwnie& $odatnoci na $'kni'cia( a tak&e skorelowanie ich z okrelony!i !utacja!i genowy!i

"adanych szcze$w% Otrzy!ane wyniki wskazuj#( i& okrelone chro!oso!y 5% cereisiae wykazuj# $odwy&szon#$odatno/ na $'kni'cia oraz za"urzenia strukturalne%

+,- Eewinska A( Miedziak B( Wnuk M% Assess!ent o) yeast chro!oso!e S44 insta"ilityD 5ingle chro!oso!eco!et assay% 3ungal :enet Biol% 1L,9


52/119


5ola Helicobacter pyroli w patoenezie mia7d7ycy t/tnic

Weronika :onciarz,( arolina !ijewska1

,5ekcja Mikro"iologiczna 5tudenckiego oa Naukowego Biologw( atedra 4!!unologii

i Biologii 4n)ekcyjnej( Wydzia Biologii i Ochrony rodowiska( Uniwersytet dzki1Uniwersytet dzki

Mia&d&yca t'tnic zaliczana jest do $rzewlekych chor" za$alnych( ktry! towarzyszy oglnoustrojowy$odostry odczyn za$alny( !aj#cy taki sa! $rze"ieg jak TklasyczneC za$alenie towarzysz#ce in)ekcji( "'d#ce wynikie!aktywacji wrodzonego syste!u od$ornoci% Wykadnika!i nieswoistej od$owiedzi za$alnej organiz!u s# zw

Książka Abstraktów III SKBM

Documents

Transcript of Książka Abstraktów III SKBM