8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
1/88
1
BIOKIMI
A
( 2 SKS)
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
2/88
SILABUS BIOKIMIA
2
TUJUANINSTRUKSIONAL
UMUM
Setelah mengikuti matakuliah ini mahasiswa
mampu menjelaskanbiomolekul essensial danmikroorganisma sertaaplikasina pada industri!
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
3/88
"
Pokok Bahasan
I:Protein
EnzimKarbohidrat
Lipid
Asam Nukleat
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
4/88
PENAN!A" #IK"$BI$L$I #IK"$$"ANIS#E %ALA# IN%&S!"I
#I'"$BIAL #E!AB$LIS#
#I'"$BIAL #E%IA "$!* +
'$N!"$L KUA#$I%IKASI & KUL$I'ASI MIK(OBA
)
Pokok BahasanII:
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
5/88
Selamat *atangSelamat *atangdi dunia Biokimiadi dunia Biokimia
+
,Mengajar tidak bertujuan mengisibotol kosong-
tetapi mengajar adalah untuk
menulut api dari suatu obor.
Mi/hel de Montaigne
+
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
6/88
0ara Belajar0ara Belajar
Ba/a bab ang akan dikuliahkansebelum perkuliahanBelajar "+ jam untuk setiap jam
perkuliahan
Latihan peme/ahan masalahIngat istilahistilah- struktur- dan jalurjalur
metabolismeBelajar berkelompok
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
7/88
%iloso3 4embelajaran
5
Menjelaskan- bukan mengindoktrinasi
Menunjukkan hal ang perlu diketahui danang tidak perlu diketahui
Menghargai pertanaan tentang hal angbelum diketahui
Mempelajari semua hal adalah tidakmungkin- tetapi ang lebih penting adalahmengorganisir hal ang kita ketahui agardapat digunakan
5
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
8/88
BIOKIMIA
6
Kimia organik dari biomolekul Molekulna komplek Berat molekulna 77!!besar 88888
#amun7!si9at kimia and 3sikana samaseperti senawa organik lainna 8
biologi
Kimiaorgan
ik
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
9/88
BI$#$LEK&L %ANSEL
:
;irarkhi organisasi molekular
Inti, mitokondria
Kloroplast, badan
golgi
Ribosom,mikrotubul,
Kompleks enzim,
Sistem kontraktil
Asam nukleat,
Protein, lipid
Polisakarida
CO2, H2O, NH3 ,N2SEL
Piruat, Sitrat, !alat"liseralde#id$3$pospat
Nukleotida, asam amino
!onosakarida,
asam lemak, gliserol
Organel
Supramolekul
Makromolekul Building block
Intermediet metabolit
Prekursor
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
10/88
#etabolisme
Biomolekul
1<
Sen%a&a pen%usunSen%a&a pen%usun
"ula seder#ana"ula seder#ana Asam amino Asam amino
NukleotidaNukleotida
Asam lemak Asam lemak
!akromolekul
Polisakarida Protein 'peptida(
RNA atau )NA
*ipida
Katabolik
Anabolik
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
11/88
11
BiosintesisMembutuhkan
Molekul
Sederhana
untuk
*igabung
se/ara Ko=alen
melalui Berbagai0ara 7
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
12/88
12
P"$!EIN
http://id.wikipedia.org/wiki/Berkas:Milk_glass.jpg
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
13/88
1"
Berasal dari bahasa >unani ?
, 4rotos ,
@erardus Mulder 16"6
,o9 prime importan/eC
ang pertama atau angterpenting
!olekul %ang sangat ital untuk organisme
Si+at +isik dan kimia&i
dipengaru#iole# asam amino pen%usunn%a1"
P"$!EIN
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
14/88
4(O$DI# ?
1)
Eat organik terbanak dalam sel hidup )< F 5< G-Hat ang paling utama pada kulit- otot- urat-
sara9- darah- enHim- anti bodi dan hormon
polimer alam ang disusun oleh rantai asam
amino melalui ikatan ko=alen ang spesi3k ?PEP!I%A
molekul protein single terdiri dari ratusan F ribuanunit asam amino- ang disusun oleh 2< jenis asamamino
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
15/88
K$#P$SISI &NS&",&NS&"PEN-&S&N P"$!EIN
1+
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
16/88
%ungsi protein
1
Sour/e o9 energ)k/algram
@rowth- Maintenan/e -(epair
DnHmes
;ormones and Antibodies
%luid Balan/e
A/idBase Balan/e buJers
$ransporter o9 substan/es
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
17/88
15
%ungsi 4rotein
15
Pada sebagian besar aringan tubu#, proteinmerupakan komponen terbesar setela# air-
Sebagai zat pembangun, protein merupakan ba#an
pembentuk aringan$aringan baru danmemperta#ankan aringan %ang tela# ada-
Kekurangan protein dalam &aktu lama dapatmengganggu berbagai proses dalam tubu# dan
menurunkan da%a ta#anProtein %ang dikonsumsi manusia akan diserap ole#
usus dalam bentuk asam amino
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
18/88
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
19/88
1:
Sour/e o9 energ
1:
Protein merupakankomponen utama dalamdaging-
Setiap gram proteinmeng#asilkan energi
'k.algram(Pada keadaan starasi
'staration( dan dietrenda# karbo#idrat ,
protein merupakansumber energ% %angterak#ir %ang akandigunakan-
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
20/88
2<
Kebutuhan 4rotein
2<
Kebutu#an protein untuk tubu# manusia rata$rata
sebesar 4 g proteinkg berat badan per #ariKebutu#an manusia akan protein dapat di#itung
dengan mengeta#ui umla# nitrogen %ang #ilang-
5ila seseorang mengkonsumsi ransum tanpa
protein, maka nitrogen %ang #ilang tersebut pasti
berasal dari protein tubu# %ang dipe.a# untuk
memenu#i kebutu#an metabolisme
6ubu# kita tidak men%impan asam amino, sepertilemak dan karbo#idrat, maka dibutu#kan suplai
asam amino tiap #ari untuk membentuk protein
baru-
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
21/88
Importance of Proteins in Our BodyImportance of Proteins in Our Body
21
Vitalactivity Example ofproteins Functions
Nutrition Digestive enzymes
e-g- tr%psin, 7 Catal%zes t#e#%drol%sis o+ proteins topol%peptides
am%lase 7 Catal%zes t#e#%drol%sis o+ star.# to
maltose
lipase 7 Catal%zes t#e#%drol%sis o+ +ats to +att%a.ids and gl%.erol
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
22/88
Importance of Proteins in Our BodyImportance of Proteins in Our Body
22
Vitalactivity
Example ofproteins
Functions
Respirationandtransport
Haemoglobin 7 Responsible +or t#etransport o+ o8%gent#roug#out t#e bod%
Immuneresponse
Antibodies 7 9ssential to t#ede+en.e o+ t#e bod%'e-g- against ba.terial
inasion(
"ro&t# Hormones'e-g- t%rosine(
7 Controls gro&t# andmetabolism
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
23/88
Importance of Proteins in Our BodyImportance of Proteins in Our Body
2"
Vital activity Example ofproteins
Functions
Support andmoement
A.tin and m%osin 7 Responsible +ormus.le .ontra.tion
Collagen 7 "ies strengt# &it#
+le8ibilit% in tendonsand .artilage
Sensitiit% and.oordination
Hormones'e-g- insulin(
7 Controls bloodsugar leel
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
24/88
KLASI.IKASI
P"$!EIN
2)
Berdasarkan komposisi
Berdasarkan kon9ormasi
Berdasarkan 9ungsi biologis
I/ Berdasarkan Komposisi ? a/ Protein sederhana ? pada hidrolisisna
hana menghasilkan asam amino
b/ Protein kon0u1asi ? pada hidrolisis
dihasilkan asam amino dan komponenorganik dan anorganik lain u1us P"$S!E!IK ! Misal ? nu/leo protein- lipoprotein- 9os9o protein- metallo protein- glu/o
protein
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
25/88
II/ Berdasarkan Konormasi ?
a/ Protein Serat ? Hat pembentuk struktur
pada hewan- tidak larut dalam air! Merupakanserat ang kaku- kuat dan dibangun oleh rantaipolipeptida ang ditata sejajar sepanjang satusumbu! Misal ? keratin- kolagen- sutera
2+
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
26/88
2
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
27/88
b/ Protein lobular ? rantai polipeptida melipat kedalam menjadi bentuk globular bulat! Umumnalarut dalam air - mempunai 9ungsi ang mobil dan
dinamis dalam sel! Misal ? enHim- hormon-haemoglobin- mioglobin!
3/ Protein den1an konormasi antara seratdan 1lobular ? protein ang bentukna sepertiserat tapi larut dalam air dan larutan garam!Misal ? mosin dan 3brinogen
25
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
28/88
III. Berdasarkan Fungsi Biologis
26
a/ Seba1ai Enzim ?katalis biologis!;ampir semuareaksi biologis
dikatalis olehenHim- dari reaksiang sangatsederhana sepertireaksi transportasi0O2 sampai angsangat rumit sepertireplikasi kromosom!
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
29/88
2:
b/ Protein 'adan1an - misal ? o=albumin- /asein
3/ Protein !ransport - misal ? haemoglobin-moglobin- lipoproteinBanak molekul dengan BM ke/il serta beberapa
ion dapat diangkut atau dipindahkan oleh proteinprotein tertentu! Misalna hemoglobin mengangkut oksigen dalam eritrosit- sedangkan
moglobin mengangkut oksigen dalam otot!
Stru/tur " * moglobin-warna menunjukkan alpha heli/
Merupakan protein angpertama kali dipelajari strukturn*engan ra /rstallograph
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
30/88
"<
$ransport lipid dalamdarah ? Lipoproteins
Mekanisme transportmaterial melewatimembran /ell
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
31/88
"1
d/ Protein Pelindun1 - misal ? antibodi- 3brinogen4ertahanan tubuh biasana dalam bentuk antibodi-
aitu suatu protein khusus ang dapat mengenal
dan menempel atau mengikat bendabenda asingang masuk ke dalam tubuh seperti =irus- bakteri-dan selsel asing lain!
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
32/88
"2
Antibodi adalah protein ang dapatmenahan melawan atau menginakti9kan bakteri - =irus dan selselasing lain ang menebabkan in9eksi
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
33/88
e/ *ormon
""
$idak semua hormon merupakan
protein! Misalna- . hormon steroid .bukan protein8
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
34/88
")
*e3siensi Insulin pada
manusia merupakanpenebab utama daridiabetes mellitus!
Stru/ture insulin bo=inehal!"" ditentukan olehSanger tahun 1:+"!;uman insulin berbeda
dari bo=ine insulin hanapada tiga asam aminopada rangkaian ini
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
35/88
"+
Bo4ine Insulin hormon 5an1men1atur metabolisme 1lu3osa
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
36/88
"
/ Protein Struktural- misal ? glu/oproteinmerupakan dinding sel
1/ Protein Kontraktil - misal ? Mosinmerupakan 3lamen tebal dalam mo3bril
h/ !oksin - misal ? bisa ular
4erbandingan ukuran molekul beberapaprotein! *ari kiri ke kanan ? antibod Ig@-hemoglobin- insulin hormone- adenlatekinase enHme- dan glutamine snthetase enHme!
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
37/88
ASA# A#IN$ 6
A#IN$ A'I%
"5
"ugus R rantai samping , berbeda$beda
pada setiap enis asam amino
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
38/88
"6
Merupakan monomer ang menusun proteinMerupakan monomer ang menusun protein
AdaAda 20 jenis20 jenis asam amino pembentuk proteinasam amino pembentuk protein angang
disebut sebagaidisebut sebagai asam amino standar asam amino standar @ugus amino terikat pada atom@ugus amino terikat pada atom '' gugus karboksilatgugus karboksilat
Mempunai kon3gurasi L sejenis dengan gliseralMempunai kon3gurasi L sejenis dengan gliseral
dehid - ke/uali asam aminodehid - ke/uali asam amino 1lisin1lisin
CH
H ! C ! H
CH"H
# ! $liseral de%id
CH
H"& ! C ! H
'
(sam ! #! amino
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
39/88
":
Asam amino ke 21 disebut
seleno35stein jarang ditemukan $erdapat di beberapa enHim seperti
gluthatione peroidase
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
40/88
)<
Asam amino dapat digolongkan menadi dua
kelompok %aitu asam amino eksogen dan asamamino endogen-
Asam amino endogen dapat dibentuk dalam
tubu# manusia, sedangkan 4: asam amino
eksogen tidak dapat dibentuk ole# tubu#
manusia, karena itu disebut asam amino
esensial, artin%a #arus didapatkan dari makanan
;ntuk orang de&asa, umla#asam amino essensial < ma.am
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
41/88
)1
*alam teknologi pangan- asam aminomempunai beberapa si9at ang
menguntungkan maupun ang kurang menguntungkan!
Misalna *tripto9an mempunai rasa
manis "+ kali kemanisan sukrosa-sebalikna Ltripto9an mempunai rasaang sangat pahit!
Asam glutamat sangat penting peranannadalam pengolahan makanan- karena dapatmenimbulkan rasa ang leHat!
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
42/88
ASAM AMI#O AMI#O A0I*S
)2
Essential (78) Phen5lalanin
e
9aline
!hreonine !r5ptophan
Isoleu3ine
#ethionine
*istidine Ar1inine
Leu3ine
L5sine
Nonessential(78)
Alanine
Aspara1ine
Asparti3 a3id '5steine
lutami3 a3id
lutamine
l53ine Proline
Serine
!5rosine
'onditionall5essential ()'5steinelutamine
!5rosine
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
43/88
)"
4erbedaan rantaisamping ,(Cmenebabkan
perbedaan dari jenisasam amino- seperti ?
! Struktur
! Ukuran
! Muatan elektrik
! Si9at kelarutan didalam air
Asam amino angpaling sederhanaadalah @l/ine-dimana ( ;
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
44/88
SI.A!,SI.A! ASA#A#IN$
))
1! *alam larutan- kedua gugus asam dan amino bersi9at dipolar ion (zwitter ion)
Seperti larutan ang mempunai moment dipol tinggi
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
45/88
)+
!isal, asam amino alanin mempun%ai rantai samping
netral- Alanin dapat digunakan untuk menggambarkan
si+at asam amino pada berbagai pH
Bentuk dipolar ion dari alanin adalah ?
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
46/88
)
2! Bersi9at amphoter- aitu dapat bersi9at sebagaiasam pada p* tin11i dan bersi9at sebagai basa pada p* rendah
" Nika asam amino diletakkan dalam medan listrik-maka asam amino akan bergerak ke katoda padap* rendah dan bergerak ke anoda pada p*tin11i
'! C ! CH
)&H
*
HH
&H*
)
H'! C ! CH
)H'! C ! C
+
&H"
+ +
)H
= H
pada pH rend a# dip olar ion
'netral(pada pH tinggi
'asam( 'basa(sebagai basa sebagai asam
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
47/88
)5
$itik disaat asam amino tidak lagi bergerak ketikadiletakkan dalam medan listrik disebut ? titikisoelektrik, atau pH isolelektrik ( pI )/
;arga pIsoelektrik merupakan ratarata dari duaharga pKa! Misal pKa1 pKa2 2 ! *iagram p;untuk alanin ?
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
48/88
)6
*%sin, mempun%ai rantai samping basa,
memberikan bentuk kesetimbangan %ang
lebi# kompleks-
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
49/88
):
) Bersi9at optis akti9
Semua asam amino bersi9at /hiral- ke/ualigl/ine dan mempunai kon3gurasi leu=o- L-
sama seperti gl/eraldhde pada /arbon
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
50/88
+<
+! Kristal non =olatilang melelehdenganterdekomposisi
pada $ tinggi
! $ak larut dalampelarut non polar-/ukup larut dalamair
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
51/88
+1
Asam amino
Klasi;kasi Asamamino
)iklasi+ikasikan berdasar gugus R 'rantai samping(5iasan%a mempun%ai si+at$si+at seperti> #idro+obik
#idro+ilik, polarnon polar, ada tidakn%a gugus terionisasi
A"$#A!IK
P$LA"
A'I%I' (,)BASI' (
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
52/88
+2
Asam amino non
polar!emiliki gugus R ali+atik"lisin, alanin, alin, leusin, isoleusin dan prolin
5ersi+at #idro+obik- Semakin #idro+obik suatu a-aseperti Ile 'I( biasa terdapat di bagian dalamprotein-
Prolin berbeda dengan a-a siklis- 6api
mempun%ai ban%ak kesamaan si+at dengankelompok ali+atis ini-;mum terdapat pada protein %ang berinteraksi
dengan lipid
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
53/88
+"
Asam amino polar
!emiliki gugus R %ang tidak bermuatan
Serin , t#reonin, .%stein, metionin, asparagin, glutamin
5ersi+at #idro+ilik muda# larut dalam air Cenderung terdapat di bagian luar protein
C%stein berbeda dgn %g lain, karena ggs R terionisasi
pada pH tinggi 'pH ?
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
54/88
+)
Asam amino dengan gugus R aromatik
@enilalanin, tirosin dan tripto+an5ersi+at relati+ non polar #idro+obik
@enilalanin bersama dengan , * B I a-a paling
#idro+obik
6irosin gugus #idroksil , tripto+an .in.in indol
Se#ingga mampu membentuk ikatan #idrogen
penting untuk menentukan struktur ensim
Asam amino aromatik mampu men%erap sinar ; 2
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
55/88
++
Asam amino dengan gugus R bermuatan 'D(
*isin, arginin, dan #istidinPun%a gugus bersi+at basa pada rantai samping
5ersi+at polar terletak di permukaan protein dapat
mengikat air-
Histidin mempun%ai muatan mendekati netral 'pada
gugus imidazol( dibanding
lisin gugus amino
arginin gugus guanidinoHistidin dpt terionisasi pada pH mendekati pH +isioligis
sering berperan dalam reaksi ensimatis %ang melibatkan
pertukaran proton
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
56/88
+
Asam amino dengan gugus (
bermuatan Aspartat dan glutamat
!empun%ai gugus karboksil pada rantai
sampingn%a bermuatan '$( a.id pada pH E
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
57/88
+5
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
58/88
+6
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
59/88
+:
P"$!EIN
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
60/88
<
P"$!EIN
Hydrolysis
Pol%peptide dapat di#idrolisis dengan .ara re+luks selama2 am menggunakan HCl ,-
Hasil #idrolisis dapat dipisa#kan menadi asam$asamamino %ang terpisa# satu dengan %ang lainn%a dengancation!exc%ange resin
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
61/88
1
Pada metoda orisinil, eluen diperlakukan dengan
nin%ydrin, untuk mendeteksi dan menentukan enis
asam amino %ang keluar dari kolom- Saat ini analisa
.ampuran asam amino dilakukan dengan H#C
Degradasi Edman
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
62/88
2
Degradasi Edman
Degradasi Edman untuk pemutusan rangkaian dan
identi+ikasi N !terminal asam amino- 9+ekti+ bila rantai
polipeptida terdiri dari F: residu asam amino-
$ (nalisa N !/erminaldengan metoda 0anger
;ung N $terminal pol%peptida dilabel dengan "12!dinitrofluoro3enzene, selanutn%a di#irolisis- Asam
amino N $terminal %ang dilabel dipisa#kan dari
.ampurann%a dan diidenti+ikasi ter#adap standar
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
63/88
"
Penggunaan metoda Sanger tidak seluas
penggunaan metoda 9dman
(nalisa asam amino C !/erminal
Asam amino C $terminal se.ara selektidi#idrolisa menggunakan enz%m
.arbo8%peptidase- 9nz%m ini se.ara
kontinu akan memutuskan atau
melepaskan asam amino C $terminal %angbaru- Hasil #idrolisis dapat dianalisis
dengan HP*C
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
64/88
)
Analisa dengan metoda 0anger dan Edman lebi#aplikati+ untuk polipeptida %ang rantai asam aminon%a
tidak terlalu panang 'kira$kira F: residu asam amino
;ntuk protein dan pol%peptida dengan 5! besar,sampel di#idrolisa parsial dengan asam en.er-
Pol%peptida dengan 5! besar dapat uga diputusmenadi rantai$rantai %ang lebi# pendek dengan reagentsite-specific atau dengan enzymatis
!ass spe.trometr% dapat uga digunakan untukdeterminasi rantai polipeptida dan protein- !assspe.tra dari +ragment pol%peptida %ang berasal dariprotein dibandingkan ter#adap database rantaipol%peptida standar
i
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
65/88
++
asam aminostandar
Kromato1ram *PL' AsamA i
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
66/88
Amino
Sampel Bulu A5am
=enis dan kadar asam amino dari bulu
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
67/88
5
No Jenis asam amino Kadar (% b/ b)
1234
56789101112131415
Aspartat!"tamat#erina$istidina
!sina&'reoninaArininaA!anina&rosinaet'ionina*a!ina+eni!!atanina,so!e"sina-e"sina-sina
6.199.1710.460.26
5.724.255.783.052.050.256.164.103.966.200.77
a5amdari kromato1ram *PL'
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
68/88
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
69/88
Ikatan dalam peptida
protein
:
amide linka1e
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
70/88
5<
Asam amino dengan bantuan enHim akanberpolimerisasi membentuk rantai Amida-
ang biasa disebut peptida.
Ikatan amino ini disebut ? IKA!ANPEP!I%A
4rotein dapat terdiri dari satu atau lebih rantai
polipeptida dan juga dapat berasosiasidengan molekul atau ion lain
Sebuah molekul ang terdiri dari dua buahasam amino disebut ? dipeptida! Kalau adatiga asam amino disebut ? tripeptida - dst
%ipeptida
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
71/88
51
)ipeptida teradi melalui penggabungan dua molekul
as-amino dengan melepaskan satu molekul air,'H2:(
%ipeptida
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
72/88
$(I4D4$I*A
52
aa7
aa2aa
6ripeptida teradi melalui penggabungan tiga
molekul as-amino
ikatan peptida
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
73/88
5"
Suatu rantai pol5peptida residu N,terminal berada sebelah kiri danresidue ',terminal disebelah kanan
4olpeptida
S$(UK$U( ASAM AMI#O
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
74/88
5)
7/ Struktur Primer : Struktur rantai polipeptida linier ang terjadikarena ikatan peptida residu asam aminodengan residu asam amino lainna!
Pada struktur primer dapat dianalisis ? Urutan aa dalam suatu rantai poli peptida Nenis aa penusun rantai Numlah aa
Urutan dan jenis asam amino dapat dianalisadengan metoda Sanger atau Ddman untukresidu asam amino ujung-N dan reduksidengan LiB;) untuk residu asam amino
ujung-5)
S$(UK$U( ASAM AMI#O*ALAM 4(O$DI#
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
75/88
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
76/88
". 0truktur 0ekunder
5
Struktur sekunder protein distabilkan olehikatan Hidrogen
Bila ikatan hidrogen terjadi antara atom !
dr gugus amino residu asam amino-" dengan atom O dari gugus /arbonil residuasam amino-#- akan terjadi struktur
sekunderα
"-F ;eli
Untuk struktur P pleated sheet- ikatanhidrogen terjadi antar rantai peptida
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
77/88
55
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
78/88
Struktur sekunder G$ pleated s#eet
56
3 0truktur /ersier ?
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
79/88
5:
3- 0truktur /ersier ?
Struktur sekunder ang membelok dan berlipatke dalam tiga dimensi- membentuk proteinserat dan 1lobular
4rotein globular myoglobin-
dengan gugus heme
2 0truktur 45arterner ?
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
80/88
6<
Hemoglobin adala# protein
globular %ang ber+ungsi sbg alat
transports o8%gen dalam dara#
Hemoglobin terdiri dari subunitpol%peptida '2α, B 2 β(
6iap subunit protein memba&a
gugus #eme
2. 0truktur 45arterner ?Merupakan gabungan antara strukturstruktur
tertier!
Banak protein BM tinggi merupakan agregatdari beberapa sub unit! Agregat inimenebabkan terjadina struktur kwarterner
protein! Misal pada hemoglobin;emoglobin
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
81/88
61
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
82/88
62
S!"&K!&"ASA#A#IN$dalamProtein :
PrimerSekunder!ertierkuarterner
*i khi St kt
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
83/88
*ierarkhi StrukturProtein0truktur rimer > berbentuk rantai asam amino
linear sebagaimana polipeptida %ang di#asilkan
ole# suatu translasi
0truktur sekunder > perkembangan berupa
pelipatan dari struktur primer akibat adan%aikatan Hidrogen antar asam amino 'tiap aa(
0truktur tertier > bentuk tiga dimensi #asil
pelipatan struktur sekunder karena ikatan ion,
ikatan disul+ida antar gugus R asam amino
0truktur kuarterner > gabungan beberapa
polipeptida berstruktur tersier 6"
Si9 t i9 t 3 ik ki i t i
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
84/88
Si9atsi9at 3siko kimia protein
6)
Si9at 3sikokimia setiap protein tidak sama-tergantung pada jumlah dan jenis asamaminona!
Berat molekul protein sangat besar
Ada protein ang larut dalam air- ada pula
ang tidak dapat larut dalam air- tetapisemua protein tidak larut dalam pelarutlemak non polar!
Si9atsi9at 3sikokimia protein
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
85/88
6+
Bila dalam suatu larutan protein
ditambahkan garam- daa larut proteinakan berkurang- akibatna protein akanterpisah sebagai endapan! 4eristiwapemisahan protein ini disebut salting out !
Apabila protein dipanaskan atauditambahkan alkohol maka protein
akan menggumpal!
4rotein dapat bereaksi dengan
asam dan basa
#akanan sumber
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
86/88
#akanan sumberprotein
6
Makanan ang
mengandungprotein?
*aging- ikan- telur)5G
0ereals 1:GSaur dan buah
buahan 5G *air produ/ts
21G $umbuhan
polong2an +!)G
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
87/88
8/19/2019 1. Protein & Asam Amino
88/88
What
do we
do now??