P e d i a t r i a P o l s k a t o m 8 6 , n r 4 , l i p i e c – s i e r p i e ń 2 0 1 1

PRACE POGLĄDOWE / REVIEWS376

Zastosowanie technologii mikromacierzy w onkologii dziecięcej

Microarray technology in pediatric oncology

Joanna Szczepanek1,2, Jan Styczyński1, Andrzej Tretyn2, Mariusz Wysocki1

STRESZCZENIENowotwory występujące u dzieci kształtują ważny i trudny dział medycyny. Wykazują ogromne zróżnicowanie, a ich diagnoza jest często utrudniona ze względu na brak specyficznych objawów. Profilowanie ekspresji dzięki technice mikromacierzy jest często stosowane w badaniach pediatrycznych nowotworów hematologicznych i guzów litych. W wielu badaniach uzyskano profile ekspresji umożliwiające ich precyzyjną klasyfikację, monitorowanie przebiegu klinicznego, ocenę reakcji na leczenie i w konsekwencji rokowania. Za pomocą profilu genetycznego możliwa jest identyfikacja nowych podklas w obrębie danego nowotworu dziecięcego, poszukiwanie nowych markerów genetycz-nych o znaczeniu prognostycznym oraz opracowywanie terapii dostosowanej do pacjenta. W pracy zaprezentowano przegląd najnowszych analiz z zakresu wykorzystania technik monitorowania genomu i transkryptomu komórek no-wotworowych w onkologii wieku dziecięcego. Słowa kluczowe: profil ekspresji genów, mikromacierze, nowotwory, onkologia dziecięca, genomika, transkryptomika

SUMMARYCancers occurring in children create an important and difficult section of medicine. There is a large diversity of cases, and their diagnosis is often difficult because of the lack of specific symptoms. Expression profiling with microarray technology is nowadays used in studies of pediatric hematological malignancies and solid tumors. In many studies, expression profiles were obtained to enable their accurate classification, monitoring the clinical course, evaluation response to treatment and prognosis. Using genetic profile it is possible to identify new subclasses of children tumors, to search for new genetic markers with prognostic significance, and to develop therapies tailored for the patient. This paper presents an overview of recent studies of the use of genome and transcriptome monitoring techniques for cancer cells in childhood oncology.Key words: genes expression profile, microarrays, cancer, pediatric oncology, genomics, transcriptomics

Pediatr Pol 2011; 86 (4): 376–384

© 2011 by Polskie Towarzystwo Pediatryczne

Otrzymano/Received: 21.06.2011

Zaakceptowano do druku/Accepted:

9.07.2011

1Katedra i Klinika Pediatrii, Hematologii i Onkologii,

Collegium Medicum, Uniwersytet Mikołaja Kopernika, Bydgoszcz

Kierownik: prof. dr hab. Mariusz Wysocki

2Zakład Biotechnologii, Katedra Fizjologii Roślin

i Biotechnologii, Uniwer-sytet Mikołaja Kopernika,

Toruń Kierownik: prof. dr hab.

Andrzej Tretyn

Konflikt interesu/ Conflicts of interest:

Autor pracy nie zgłasza konfliktu interesów

Adres do korespondencji/ Address for

correspondence: Prof. dr hab. n. med.

Jan Styczyński Katedra i Klinika Pediatrii,

Hematologii i Onkologii Collegium Medicum

Uniwersytet im. Mikołaja Kopernika

ul. Curie-Skłodowskiej 9 85-094 Bydgoszcz tel: (52) 585 4860

fax: (52) 585 4867 e-mail:

jstyczynski@cm.umk.pl

Wprowadzenie

P e d i a t r i a P o l s k a t o m 8 6 , n r 4 , l i p i e c – s i e r p i e ń 2 0 1 1

PRACE POGLĄDOWE / REVIEWS 377

Ryc. 1. Przebieg eksperymentu mikromacierzowego Fig. 1. Phases of microarray experiment

P e d i a t r i a P o l s k a t o m 8 6 , n r 4 , l i p i e c – s i e r p i e ń 2 0 1 1

PRACE POGLĄDOWE / REVIEWS378

κ

P e d i a t r i a P o l s k a t o m 8 6 , n r 4 , l i p i e c – s i e r p i e ń 2 0 1 1

PRACE POGLĄDOWE / REVIEWS 379

P e d i a t r i a P o l s k a t o m 8 6 , n r 4 , l i p i e c – s i e r p i e ń 2 0 1 1

PRACE POGLĄDOWE / REVIEWS380

α α

α

α

Podsumowanie

P e d i a t r i a P o l s k a t o m 8 6 , n r 4 , l i p i e c – s i e r p i e ń 2 0 1 1

PRACE POGLĄDOWE / REVIEWS 381

P i ś m i e n n i c t w o

P e d i a t r i a P o l s k a t o m 8 6 , n r 4 , l i p i e c – s i e r p i e ń 2 0 1 1

PRACE POGLĄDOWE / REVIEWS382

P e d i a t r i a P o l s k a t o m 8 6 , n r 4 , l i p i e c – s i e r p i e ń 2 0 1 1

PRACE POGLĄDOWE / REVIEWS 383

P e d i a t r i a P o l s k a t o m 8 6 , n r 4 , l i p i e c – s i e r p i e ń 2 0 1 1

PRACE POGLĄDOWE / REVIEWS384