Wła ściwo ści ogólne i metody hodowli wirusów ... · Klasyfikacja wirusów DNA. 4 ......
Transcript of Wła ściwo ści ogólne i metody hodowli wirusów ... · Klasyfikacja wirusów DNA. 4 ......
1
Właściwości ogólne i metody hodowli wirusów, odczyny
serologiczne
Maciej Przybylski
Katedra i zakład Mikrobiologii Lekarskiej WUM
Definicja wirusa
Organizm o budowie niekomórkowej, którego genom zbudowany jest z kwasu nukleinowego
i który bezwzględnie musi namnażać sięwewnątrz żywych komórek, wykorzystując ich metabolizm i aparat syntezy białek do
syntezy komponentów, które składają się w struktur ę zwaną wirionem, chroniącą kwas
nukleinowy i umożliwiaj ącą transport wirusa między komórkami
2
I. Systematyka wirusów
Taksonomia wirusów
�(Rząd) -virales–rodzina -viridae
• podrodzina –virinae–rodzaj –virus
»gatunek
9th Report of International Committee on Taxonomy ofViruses (2011)
3
Przykłady
Wirus opryszczki typu 1
� Rząd: Herpesvirales
� Rodzina: Herpesviridae
� Podrodzina: Alphaherpesvirinae
� Rodzaj: Simplexvirus
� Gatunek: HumanHerpesvirus 1 (HHV-1)
Syncytialny wirus oddechowy
� Rząd: Mononegavirales
� Rodzina: Paramyxoviridae
� Podrodzina: Paramyxovirinae
� Rodzaj: Pneumovirus
� Gatunek: Human Respiratory Syncytial Virus
Klasyfikacja wirusów DNA
6
Wielkość wirusów RNA
Budowa wirusów
�kwas nukleinowy
�kapsyd
�białka matrix i białka związane z kwasem nukleinowym (niektóre rodziny)
�osłonka (niektóre rodziny)
�białka powierzchniowe związane z osłonką(niektóre rodziny)
8
Replikacja wirusów w komórce
� adsorpcja
�wniknięcie
� odpłaszczenie
� synteza białek wczesnych
� powielenie genomu
� synteza białek późnych
� składanie i dojrzewanie wirionów potomnych
� uwolnienie dojrzałych wirionów
Następstwa zakażenia komórki
9
III. Metody hodowliwirusów
Izolacja i namnażanie wirusów kręgowców
2. Sposoby namnażania wirusów:� w zwierzętach laboratoryjnych (próba
biologiczna)
� w zarodkach ptaków
� w hodowlach komórkowych
10
Namnażanie wirusów w hodowlach komórkowych
1. Rodzaje hodowli stosowanych do namnażania wirusów:
� pierwotne
� półciągłe
� ciągłe
2. Źródła komórek używanych do hodowli komórkowych:
� tkanki embrionalne
� tkanki nowotworowe
� tkanki dojrzałe
Namnażanie wirusów w hodowlach komórkowych
Wygląd współczesnych butelek do hodowli komórkowych
11
Namnażanie wirusów:� diagnostyka zakażenia
� badania naukowe
� produkcja antygenów
monolayer - jednowarstwowa hodowla komórkowa
Linia komórkowa Vero
12
Pożywki do hodowlikomórkowych zawierają:
- cukry
- aminokwasy
- witaminy
- sole mineralne
- związek buforujący (do pH 7,2 - 7,4)
- antybiotyki
- surowicę (najcześciej płodową cielęcą)
• w stężeniu 10 - 20% pożywka wzrostowa
• w stężeniu 2 - 5% pożywka utrzymująca
- wskaźnik barwny pH
Warunki hodowli:
• temperatura 37OC• stężenie CO2 5%• odpowiednia wilgotność
13
Efekty cytopatyczne (cytopathogeniceffect – CPE)
�wtręty wewnątrzkomórkowe (wewnątrzjądrowe, cytoplazmatyczne)
�wielojądrzaste komórki olbrzymie
�zmiana kształtu komórki
�zniszczenie komórki (liza)
�transformacja nowotworowa
Przykładowe efekty cytopatyczneAdenowirus
Wirus ECHO
HSV-1 Wirus świnki
14
Zmiany niecytopatyczne
1. hemadsorpcja - np. ortomyksowirusy, paramyksowirusy
2. interferencja - np. wirusróżyczki
Hemadsorpcja w komórkach zakażonych wirusem parainfluenzy
16
Patogeneza zakażenia wirusowego
�wniknięcie wirusa (skóra, błony śluzowe)
� namnożenie wirusa we wrotach zakażenia
� zmiany miejscowe
� replikacja w węzłach chłonnych
i RES
�wiremia
� zakażenie uogólnione
� zakażenie narządów
� śmierć
Odpornośćkomórkowanieswoista i swoista
Wszystkie elementyukładu odpornościowego
Formy zakażeń wirusowych
� ostre� przewlekłe
� objawowe� bezobjawowe� poronne
� pierwotne� powtórne
� miejscowe� narządowe� uogólnione
� latentne� persystentne� wynikaj ące z
reaktywacji w. latentnego
17
Odpowiedź immunologiczna w zakażeniu wirusowym� odpowiedź komórkowa i humoralna
� odpowiedź nieswoista – bariery, makrofagi, komórki NK, apoptoza, interferony, TNF
�wirusy = antygeny endogenne
� odpowiedź swoista – MHC-I, limfocyty Tc, ADCC: niszczenie komórek zakażonych wirusem
� odpowiedź swoista – MHC-II, limfocyty Th, limfocyty B, przeciwciała: IgA na błonach śluzowych, IgM, IgG – neutralizacja wirionów we krwi i płynach ciała
V. Diagnostyka wirusologiczna
18
Metody diagnostyki wirusologicznej
� Wykrywanie wirusa:– zakaźnych cząstek
wirusa– białek wirusowych
(antygenów)– wirusowego kwasu
nukleinowego
� Wykrywanie przeciwciałswoistych wobec wirusa wywołującego zakażenie
Objawy wskazujące na etiologię wirusową
– zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych i mózgu
– zapalenie wątroby
– zapalenie mięśnia sercowego, osierdzia, wsierdzia
– objawy porażenne
– gorączki krwotoczne
– przedłużające się stany gorączkowe
– biegunki niemowląt i dzieci poniżej 2 roku życia
– zespół nabytego upośledzenia odporności
19
Grupy osób, u których należy wykonywaćdiagnostyczne badania wirusologiczne
– u kobiet w ciąży (ryzyko uszkodzenia płodu)
– u noworodków (ryzyko zakażenia okołoporodowego lub wrodzonego)
– u biorców przeszczepów
– u chorych na AIDS
– u dawców krwi
– u dawców narządów do przeszczepów
– u osób z upośledzeniem odporności
Pobieranie materiału do badańwirusologicznych
� do jałowych pojemników z zachowaniem zasad aseptyki
� wystarczająca do badania ilośćmateriału
� do każdego badania (nie materiału!) musi byćdołączone skierowanie
20
Transport materiału do badańwirusologicznych
�SZYBKO� optymalna temperatura = 4°C�wymazy, popłuczyny - w odpowiednim płynie
transportowym
�między odległymi placówkami - w odpowiednich zestawach transportowych
� do materiału nie wolno dodawać żadnych związków chemicznych
Izolacja wirusów w hodowlach komórkowych� Materiałem pobranym od
chorego zakaża się wrażliwe linie komórkowe
� Jeżeli w materiale klinicznym byłwirus (aktywny!), wywoła on zmiany w komórkach hodowli = efekt cytopatyczny
� Efekt cytopatyczny może służyć do wstępnej identyfikacji wirusa
� Konieczna jest późniejsza dokładna identyfikacja
22
Antygeny
�Antygen jest to cząsteczka rozpoznawana jako obcaprzez organizm immunokompetentny (czyli zdolny do prawidłowej odpowiedzi immunologicznej)
�Epitop jest to część antygenu rozpoznawana przez receptory komórek odpornościowych i przeciwciała (odpowiedzialna za jego immunogenność)
białkapowierzchniowe
białkakapsydu
białkategumentu
białka związane z RNA lub DNA
Cechy charakterystyczne antygenów
� Immunogenność - zdolność do wywoływania odpowiedzi immunologicznej
�Swoistość - komórki odpornościowe uczulone (aktywowane) przez jeden typ antygenu reagują
potem tylko na ten typ antygenu
Własności immunogenne mają białka, węglowodany i wiele innych związków chemicznych
23
Wykrywanie antygenów wirusowych
� do wykrywania antygenów używa się swoistych wzorcowych przeciwciał
� najczęściej wykorzystuje sięprzeciwciała znakowane:– fluoresceiną– enzymem– izotopem radioaktywnym
� zastosowanie znacznika umożliwia uwidocznienie wzorcowych przeciwciałzwiązanych z wykrywanym wirusem
Wykrywanie wirusowych kwasów nukleinowych
�opiera się na wykryciu wysoce swoistych sekwencji DNA lub RNA wirusów– bezpośrednie wykrycie genu wirusowego
(metody hybrydyzacji)
– namnożenie wirusowego KN obecnego w materiale klinicznym, następnie wykrycie (PCR)
– kombinacje powyższych metod
24
Przeciwciała
�Przeciwciałami (albo immunoglobulinami) nazywamy cząsteczki białkowe syntetyzowanepo pobudzeniu antygenem, skierowane swoiścieprzeciwko temu antygenowi.
�Przeciwciała są wytwarzane przez komórkiplazmatyczne(aktywowane limfocyty B).
Swoista aktywacja limfocytów B
25
Budowa immunoglobuliny
Klasy immunoglobulin
� organizm człowieka produkuje 5 klas przeciwciał:
– immunoglobuliny G (IgG)– immunoglobuliny M (IgM)
– immunoglobuliny A (IgA)– immunoglobuliny E (IgE)
– immunoglobuliny D (IgD)
�W odpowiedzi przeciwzakaźnej najważniejsząrolę odgrywają przeciwciała klas IgG, IgM i IgA
26
Swoista odpowiedź humoralna
Metody serologiczne w badaniach wirusologicznych
�metody serologiczne (serum = surowica) opierają
się na wykrywaniu przeciwciał swoistych wobec antygenówwirusów, które wywołały zakażenie
�metody te opierają się na swoistości reakcji antygen - przeciwciało
27
Metody serologiczne - wykrywanie przeciwciał
� szczególnie przydatne w diagnostyce chorób wirusowych, w których napotykamy trudności w izolacji lub wykryciu czynnika etiologicznego:– AIDS
– WZW A-E
– różyczka
– odra
– wirusowe zapalenia mózgu
– mononukleoza zakaźna)
� metodami laboratoryjnymi przeciwciała wykrywa się
najczęściej w surowicy lub płynie mózgowo-rdzeniowym(neuroinfekcje)
Wykrywanie przeciwciał - zastosowanie
� badanie surowic parzystych– określenie wzrostu miana swoistych przeciwciał
� wykrywanie przeciwciał w klasie IgM– w surowicy - wykrywanie bieżącego zakażenia;
– w płynie mózgowo-rdzeniowym - potwierdzenie neuroinfekcji
– u noworodków - potwierdzenie zakażenia wrodzonego
� wykrywanie przeciwciał w klasie IgG– potwierdzenie kontaktu z antygenem (po zakażeniu lub
szczepieniu IgG utrzymują się w surowicy nawet przez wiele lat)
� metody jakościowe lub ilościowe
28
Badanie surowic parzystych
Laboratoryjne metody wykrywania przeciwciał
� odczyny aglutynacji� odczyny precypitacyjne� odczyny hemaglutynacji� test ELISA (enzymatyczny odczyn immunosorbcyjny)� Immunobloting (Western-Blott)� odczyn immunofluorescencji� odczyn wiązania dopełniacza
� odczyn zahamowania hemaglutynacji
30
Aglutynacja
Reakcja zachodząca pomiędzy immunoglobulinami a
antygenem w formie komórkowej (bakterie, drożdże,
erytrocyty, leukocyty itp.). Polega ona na zlepianiu się
komórek pod wpływem swoistych Ig i wypadaniu ich z
roztworu w obecności elektrolitów.
Precypitacja
Reakcja zachodząca pomiędzy immunoglobulinami i
rozpuszczalnym antygenem przejawiająca się
powstawaniem strątów
Zakażenie miejscowe
Przykłady: opryszczka zwykła, zapalenie spojówek
Diagnostyka:� najczęściej na podstawie objawów klinicznych
� laboratoryjne wykrycie wirusów w zmianach miejscowych
31
Ostre Ostre zakażenie uoguogóólnionelnione
Przykłady: odra, różyczka, ospa wietrzna i wiele innych
Diagnostyka:� objawy kliniczne
� wykrycie wirusa w zmianach miejscowych, wydzielinach, wydalinach, krwi
� wykrycie przeciwciał
Zakażenie przewlekłePrzykłady: przewlekłe WZW, zakażenie HIV
Diagnostyka:� objawy kliniczne� wykrycie wirusa we krwi
� monitorowanie poziomu wirusa we krwi (przewlekła wiremia)
� wykrycie wirusa w narządach wewnętrznych
� monitorowanie obecności i poziomu przeciwciał
32
III. Wybrane wirusy
chorobotwórcze dlaczłowieka
Wirusy ważne ze względu na groźne następstwa zakażenia
�wirusy wywołujące choroby zgłaszane i zwalczane z urzędu
�wirusy badane we krwi dawców
�wirusy stanowiące zagrożenie w przypadku zakażenia wrodzonego
33
Choroby wirusowe zgłaszane i zwalczane z urzędu (I)
� obowiązek zgłaszania, rejestracji i hospitalizacji:
– wirusowe zapalenia wątroby wszystkich typów
– biegunki wirusowe wieku dziecięcego
– wirusowe zapalenia mózgu i opon mózgowo-rdzeniowych
– nagminne porażenie dziecięce (poliomyelitis)
– wirusowe gorączki krwotoczne i tropikalne
– zespół nabytego upośledzenia odporności (obowiązek rejestracji i leczenia)
– wścieklizna
Choroby wirusowe podlegające obowiązkowi zgłaszania i rejestracji
�mononukleoza zakaźna
�różyczka
�świnka
�odra (+ szczepienia)
�grypa (obowiązek zgłaszania)
34
Wirusy badane we krwi dawców
�wirus zapalenia wątroby typu B
�wirus zapalenia wątroby typu C
�ludzki wirus upośledzenia odporności
Wirusy groźne w przypadku zakażenia wrodzonego
�HIV�WZW typu C�WZW typu B�wirus różyczki� ludzkie herpeswirusy typu 1 i 2 (wirusy
opryszczki typu 1 i 2)�wirus cytomegalii� także inne wirusy (wirus ospy wietrznej i
półpaśca, wirusy Coxsackie)