1

Techniki Monitoringu Środowiskowego

Dr Zbigniew Dąbrowiecki Zakład Medycyny Morskiej i Hiperbarycznej Wojskowy Instytut Medyczny

bullCzyli co i jak wykrywamy w środowisku bullJak analizujemy otrzymane informacje bullJak stawiamy i weryfikujemy hipotezy robocze bullJak symulujemy i modelujemy obserwowane zjawiska bullJak zmieniamy definicje bullMetaanaliza i umiejetność pracy grupowej bullSzum informacyjny bullKiedy ogłaszamy alarm

Aby decydenci nie mogli spać spokojnie

2

Zacznijmy od przypomnienia definicji

Epidemia - bullmasowe szerzenie się ( wybuch) określonej

choroby ( zw zakaźnej)

lub

bulljakichkolwiek ujemnych szkodliwych zjawisk w zbiorowisku ludzkim na

określonym obszarze

3

Osobą przenoszącą patogeny może być każdy turysta

uchodźca azylant

uczestnicy misji pokojowych ratunkowych itp

personel oddelegowany do pracy w warunkach tropikalnych

Analiza zagrożeń

4

Osobą przenoszącą fałszywe informacje lub towary może być każdy INTERNET

Mity i plotki

fałszywa reklama

Fałszywe leki

działania terrorystyczne w cyberprzestrzeni

Analiza zagrożeń

5

LUDNOŚĆ WOJEWOacuteDZTWA

Gdańsk ndash 447 tys

Sopot ndash 40 tys

Gdynia ndash 247 tys

Słupsk ndash 99 tys

Starogard Gd ndash 49 tys

Wejherowo ndash 46 tys

Rumia ndash 43 tys

Malbork ndash 39 tys

Chojnice ndash 40 tys

Kwidzyn ndash 38 tys

Lębork ndash 37 tys

Tczew ndash 60 tys 6

Polpharma ndash 33 t

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE AMONIAK

OSM Kwidzyn ndash 08 t Z-dy Owoc-Warz ndash 30 t

Rapbol Miastko ndash 5 t

Szkuner Wład-wo ndash 15 t Korab Ustka ndash 8 t

Farm-Frites ndash 12 t

OSM Chojnice ndash 4 t

Nestle Kobylnica ndash 10 t

Intersrys ndash 45 t Elbro - 6 t

Prima Food Przechlewo ndash 32 t

Drożdże ndash 2 t

Z-dy Mięsne Kośc ndash 4 t

Kaso Kartuzy ndash 3 t Kaper Fish ndash 9 t OSM Kartuzy ndash 05 t

Drobpol Żukowo ndash 9 t

Prima Chmielno ndash 9 t

Unilever Banino ndash 115 t

Dalmor Gdynia ndash 37 t Igloport ndash 23 t Lacpol ndash 78 t Wilbo-Seafood ndash 12 t

Chłodnie Hel ndash 2 t Gd Korp Handlowa ndash 2 t

Lodmor ndash 49 t Olvit ndash 6 t Maćkowy ndash 6 t

Bimet ndash 23 t Inlet-Rogal ndash 44 t

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE

GAZY I CIECZE

Rafineria Gdańska ndash propan butan Poligaz ndash acetylen tlen c azot c Fregata ndash ksylen EC II ndash chlorowodoacuter wodorot sodu Fosfory ndash siarka pł kw siar kwas az Gazpol ndash propan butan SAUR Neptun ndash chlor

Polpharma ndash chlor fosgen brom tl etylenu Polmos ndash kw siarkowy

Intern Paper ndash chlor chloran sodowy metanol nadtl wodoru dwutl chloru kw siarkowy

EC I ndash k solny wod sodu

Organika - izocyn

Przeds Wodociągoacutew i Kanalizacji ndash chlor

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE

SIARKA FOSFOR

Siarkopol ndash siarka stała i płynna Fosfory ndash soda granul kw fosfor

Polpharma ndash tlenochlorek fosforu

Rafineria ndash węglowod siarkowodoacuter

Pandemia śmiercionośnej choroby zakaźnej zamach bioterrorystyczny lub katastrofa ekologiczna ( tsunami Azja huragan Katrina USA) mogą wywołać ogoacutelny kryzys

Zmiany potrzebne OD ZARAZ

Narastająca groźba ataku nowych drobnoustrojoacutew chorobotwoacuterczych sprawia że wszystkie państwa świata jadą na jednym woacutezku W epoce globalizacji zarazki za nic mają granice państwowe i mogą się rozprzestrzeniać z prędkością odrzutowca

Rozpowszechnianie fałszywych informacji o szkodliwym wpływie obowiązkowych szczepień

10

Według WHO wśroacuted ośmiu zaleceń ktoacuterych zastosowanie radykalnie poprawiłoby stan zdrowia w skali światowej wymienia się roacutewnież

inwestowanie w system monitorowania choroacuteb zakaźnych

Zmiany potrzebne OD ZARAZ Rozpowszechnianie informacji wywołującej efekt naśladownictwa bull samoboacutejstwa bullAgresja w szkole

Nieetyczne działania przemysłu farmaceutycznego ndash epidemia pandemia i manipulacja danymi

11

Rozpoznanie Rozpoznanie jest ciągłym

systematycznym zbieraniem poroacutewnywaniem analizą i interpretacją danych a następnie przekazywaniem

informacji do tych ktoacuterzy powinni wiedzieć aby zostały podjęte

odpowiednie działania

12

Co jest przedmiotem rozpoznania

13

Rozpoznanie przedmiotcele

Specyficzne

Mierzalne

Wywołujące reakcję

Realistyczne

Aktualne ( w czasie realnym) 14

Rozpoznanie biozagrożeń ( biosurveillance) zintegrowany system gromadzenia i przetwarzania informacji niezbędnych do wczesnego wykrycia czynnika patogennego u ludzizwierząt lub roślin pojawiającego się w sposoacuteb naturalny ( SARS ) lub zamierzony ( biologiczny środek masowego rażenia - BSMR )

15

Klasyczne Techniki Instrumentalne

16

dr hab Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG

Diagnostyka mikrobiologiczna

Obecnie w diagnostyce mikrobiologicznej znajdują zastosowanie klasyczne metody badania drobnoustrojoacutew oparte na analizie ich cech fenotypowych

(metody fenotypowe)

oraz metody oparte na analizie ich materiału genetycznego wykorzystujące nowoczesne techniki biologii molekularnej

(metody genotypowe)

18

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Standardowy PCR bull Wykorzystuje chemiczne barwniki

interkalujące aparat nie wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub

nie ma szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywych topnienia produktoacutew reakcji PCR

19

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Real-time PCR czyli PCR w czasie rzeczywistym bull Wykorzystuje sondy genetyczne znakowane

fluorescencyjnie aparat wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub nie ma 3

rodzajoacutew szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Otrzymujemy wynik ilościowy ndash wartość w CFUml czyli liczba szukanego patogenu ktoacutery poddany był lizie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywej obrazującej przyrost zamplifikowanego produktu w czasie rzeczywistym

20

System BAX Q7reg Automatyczny system do molekularnej detekcji patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach

środowiskowych

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

bullCzyli co i jak wykrywamy w środowisku bullJak analizujemy otrzymane informacje bullJak stawiamy i weryfikujemy hipotezy robocze bullJak symulujemy i modelujemy obserwowane zjawiska bullJak zmieniamy definicje bullMetaanaliza i umiejetność pracy grupowej bullSzum informacyjny bullKiedy ogłaszamy alarm

Aby decydenci nie mogli spać spokojnie

2

Zacznijmy od przypomnienia definicji

Epidemia - bullmasowe szerzenie się ( wybuch) określonej

choroby ( zw zakaźnej)

lub

bulljakichkolwiek ujemnych szkodliwych zjawisk w zbiorowisku ludzkim na

określonym obszarze

3

Osobą przenoszącą patogeny może być każdy turysta

uchodźca azylant

uczestnicy misji pokojowych ratunkowych itp

personel oddelegowany do pracy w warunkach tropikalnych

Analiza zagrożeń

4

Osobą przenoszącą fałszywe informacje lub towary może być każdy INTERNET

Mity i plotki

fałszywa reklama

Fałszywe leki

działania terrorystyczne w cyberprzestrzeni

Analiza zagrożeń

5

LUDNOŚĆ WOJEWOacuteDZTWA

Gdańsk ndash 447 tys

Sopot ndash 40 tys

Gdynia ndash 247 tys

Słupsk ndash 99 tys

Starogard Gd ndash 49 tys

Wejherowo ndash 46 tys

Rumia ndash 43 tys

Malbork ndash 39 tys

Chojnice ndash 40 tys

Kwidzyn ndash 38 tys

Lębork ndash 37 tys

Tczew ndash 60 tys 6

Polpharma ndash 33 t

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE AMONIAK

OSM Kwidzyn ndash 08 t Z-dy Owoc-Warz ndash 30 t

Rapbol Miastko ndash 5 t

Szkuner Wład-wo ndash 15 t Korab Ustka ndash 8 t

Farm-Frites ndash 12 t

OSM Chojnice ndash 4 t

Nestle Kobylnica ndash 10 t

Intersrys ndash 45 t Elbro - 6 t

Prima Food Przechlewo ndash 32 t

Drożdże ndash 2 t

Z-dy Mięsne Kośc ndash 4 t

Kaso Kartuzy ndash 3 t Kaper Fish ndash 9 t OSM Kartuzy ndash 05 t

Drobpol Żukowo ndash 9 t

Prima Chmielno ndash 9 t

Unilever Banino ndash 115 t

Dalmor Gdynia ndash 37 t Igloport ndash 23 t Lacpol ndash 78 t Wilbo-Seafood ndash 12 t

Chłodnie Hel ndash 2 t Gd Korp Handlowa ndash 2 t

Lodmor ndash 49 t Olvit ndash 6 t Maćkowy ndash 6 t

Bimet ndash 23 t Inlet-Rogal ndash 44 t

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE

GAZY I CIECZE

Rafineria Gdańska ndash propan butan Poligaz ndash acetylen tlen c azot c Fregata ndash ksylen EC II ndash chlorowodoacuter wodorot sodu Fosfory ndash siarka pł kw siar kwas az Gazpol ndash propan butan SAUR Neptun ndash chlor

Polpharma ndash chlor fosgen brom tl etylenu Polmos ndash kw siarkowy

Intern Paper ndash chlor chloran sodowy metanol nadtl wodoru dwutl chloru kw siarkowy

EC I ndash k solny wod sodu

Organika - izocyn

Przeds Wodociągoacutew i Kanalizacji ndash chlor

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE

SIARKA FOSFOR

Siarkopol ndash siarka stała i płynna Fosfory ndash soda granul kw fosfor

Polpharma ndash tlenochlorek fosforu

Rafineria ndash węglowod siarkowodoacuter

Pandemia śmiercionośnej choroby zakaźnej zamach bioterrorystyczny lub katastrofa ekologiczna ( tsunami Azja huragan Katrina USA) mogą wywołać ogoacutelny kryzys

Zmiany potrzebne OD ZARAZ

Narastająca groźba ataku nowych drobnoustrojoacutew chorobotwoacuterczych sprawia że wszystkie państwa świata jadą na jednym woacutezku W epoce globalizacji zarazki za nic mają granice państwowe i mogą się rozprzestrzeniać z prędkością odrzutowca

Rozpowszechnianie fałszywych informacji o szkodliwym wpływie obowiązkowych szczepień

10

Według WHO wśroacuted ośmiu zaleceń ktoacuterych zastosowanie radykalnie poprawiłoby stan zdrowia w skali światowej wymienia się roacutewnież

inwestowanie w system monitorowania choroacuteb zakaźnych

Zmiany potrzebne OD ZARAZ Rozpowszechnianie informacji wywołującej efekt naśladownictwa bull samoboacutejstwa bullAgresja w szkole

Nieetyczne działania przemysłu farmaceutycznego ndash epidemia pandemia i manipulacja danymi

11

Rozpoznanie Rozpoznanie jest ciągłym

systematycznym zbieraniem poroacutewnywaniem analizą i interpretacją danych a następnie przekazywaniem

informacji do tych ktoacuterzy powinni wiedzieć aby zostały podjęte

odpowiednie działania

12

Co jest przedmiotem rozpoznania

13

Rozpoznanie przedmiotcele

Specyficzne

Mierzalne

Wywołujące reakcję

Realistyczne

Aktualne ( w czasie realnym) 14

Rozpoznanie biozagrożeń ( biosurveillance) zintegrowany system gromadzenia i przetwarzania informacji niezbędnych do wczesnego wykrycia czynnika patogennego u ludzizwierząt lub roślin pojawiającego się w sposoacuteb naturalny ( SARS ) lub zamierzony ( biologiczny środek masowego rażenia - BSMR )

15

Klasyczne Techniki Instrumentalne

16

dr hab Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG

Diagnostyka mikrobiologiczna

Obecnie w diagnostyce mikrobiologicznej znajdują zastosowanie klasyczne metody badania drobnoustrojoacutew oparte na analizie ich cech fenotypowych

(metody fenotypowe)

oraz metody oparte na analizie ich materiału genetycznego wykorzystujące nowoczesne techniki biologii molekularnej

(metody genotypowe)

18

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Standardowy PCR bull Wykorzystuje chemiczne barwniki

interkalujące aparat nie wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub

nie ma szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywych topnienia produktoacutew reakcji PCR

19

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Real-time PCR czyli PCR w czasie rzeczywistym bull Wykorzystuje sondy genetyczne znakowane

fluorescencyjnie aparat wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub nie ma 3

rodzajoacutew szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Otrzymujemy wynik ilościowy ndash wartość w CFUml czyli liczba szukanego patogenu ktoacutery poddany był lizie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywej obrazującej przyrost zamplifikowanego produktu w czasie rzeczywistym

20

System BAX Q7reg Automatyczny system do molekularnej detekcji patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach

środowiskowych

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Zacznijmy od przypomnienia definicji

Epidemia - bullmasowe szerzenie się ( wybuch) określonej

choroby ( zw zakaźnej)

lub

bulljakichkolwiek ujemnych szkodliwych zjawisk w zbiorowisku ludzkim na

określonym obszarze

3

Osobą przenoszącą patogeny może być każdy turysta

uchodźca azylant

uczestnicy misji pokojowych ratunkowych itp

personel oddelegowany do pracy w warunkach tropikalnych

Analiza zagrożeń

4

Osobą przenoszącą fałszywe informacje lub towary może być każdy INTERNET

Mity i plotki

fałszywa reklama

Fałszywe leki

działania terrorystyczne w cyberprzestrzeni

Analiza zagrożeń

5

LUDNOŚĆ WOJEWOacuteDZTWA

Gdańsk ndash 447 tys

Sopot ndash 40 tys

Gdynia ndash 247 tys

Słupsk ndash 99 tys

Starogard Gd ndash 49 tys

Wejherowo ndash 46 tys

Rumia ndash 43 tys

Malbork ndash 39 tys

Chojnice ndash 40 tys

Kwidzyn ndash 38 tys

Lębork ndash 37 tys

Tczew ndash 60 tys 6

Polpharma ndash 33 t

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE AMONIAK

OSM Kwidzyn ndash 08 t Z-dy Owoc-Warz ndash 30 t

Rapbol Miastko ndash 5 t

Szkuner Wład-wo ndash 15 t Korab Ustka ndash 8 t

Farm-Frites ndash 12 t

OSM Chojnice ndash 4 t

Nestle Kobylnica ndash 10 t

Intersrys ndash 45 t Elbro - 6 t

Prima Food Przechlewo ndash 32 t

Drożdże ndash 2 t

Z-dy Mięsne Kośc ndash 4 t

Kaso Kartuzy ndash 3 t Kaper Fish ndash 9 t OSM Kartuzy ndash 05 t

Drobpol Żukowo ndash 9 t

Prima Chmielno ndash 9 t

Unilever Banino ndash 115 t

Dalmor Gdynia ndash 37 t Igloport ndash 23 t Lacpol ndash 78 t Wilbo-Seafood ndash 12 t

Chłodnie Hel ndash 2 t Gd Korp Handlowa ndash 2 t

Lodmor ndash 49 t Olvit ndash 6 t Maćkowy ndash 6 t

Bimet ndash 23 t Inlet-Rogal ndash 44 t

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE

GAZY I CIECZE

Rafineria Gdańska ndash propan butan Poligaz ndash acetylen tlen c azot c Fregata ndash ksylen EC II ndash chlorowodoacuter wodorot sodu Fosfory ndash siarka pł kw siar kwas az Gazpol ndash propan butan SAUR Neptun ndash chlor

Polpharma ndash chlor fosgen brom tl etylenu Polmos ndash kw siarkowy

Intern Paper ndash chlor chloran sodowy metanol nadtl wodoru dwutl chloru kw siarkowy

EC I ndash k solny wod sodu

Organika - izocyn

Przeds Wodociągoacutew i Kanalizacji ndash chlor

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE

SIARKA FOSFOR

Siarkopol ndash siarka stała i płynna Fosfory ndash soda granul kw fosfor

Polpharma ndash tlenochlorek fosforu

Rafineria ndash węglowod siarkowodoacuter

Pandemia śmiercionośnej choroby zakaźnej zamach bioterrorystyczny lub katastrofa ekologiczna ( tsunami Azja huragan Katrina USA) mogą wywołać ogoacutelny kryzys

Zmiany potrzebne OD ZARAZ

Narastająca groźba ataku nowych drobnoustrojoacutew chorobotwoacuterczych sprawia że wszystkie państwa świata jadą na jednym woacutezku W epoce globalizacji zarazki za nic mają granice państwowe i mogą się rozprzestrzeniać z prędkością odrzutowca

Rozpowszechnianie fałszywych informacji o szkodliwym wpływie obowiązkowych szczepień

10

Według WHO wśroacuted ośmiu zaleceń ktoacuterych zastosowanie radykalnie poprawiłoby stan zdrowia w skali światowej wymienia się roacutewnież

inwestowanie w system monitorowania choroacuteb zakaźnych

Zmiany potrzebne OD ZARAZ Rozpowszechnianie informacji wywołującej efekt naśladownictwa bull samoboacutejstwa bullAgresja w szkole

Nieetyczne działania przemysłu farmaceutycznego ndash epidemia pandemia i manipulacja danymi

11

Rozpoznanie Rozpoznanie jest ciągłym

systematycznym zbieraniem poroacutewnywaniem analizą i interpretacją danych a następnie przekazywaniem

informacji do tych ktoacuterzy powinni wiedzieć aby zostały podjęte

odpowiednie działania

12

Co jest przedmiotem rozpoznania

13

Rozpoznanie przedmiotcele

Specyficzne

Mierzalne

Wywołujące reakcję

Realistyczne

Aktualne ( w czasie realnym) 14

Rozpoznanie biozagrożeń ( biosurveillance) zintegrowany system gromadzenia i przetwarzania informacji niezbędnych do wczesnego wykrycia czynnika patogennego u ludzizwierząt lub roślin pojawiającego się w sposoacuteb naturalny ( SARS ) lub zamierzony ( biologiczny środek masowego rażenia - BSMR )

15

Klasyczne Techniki Instrumentalne

16

dr hab Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG

Diagnostyka mikrobiologiczna

Obecnie w diagnostyce mikrobiologicznej znajdują zastosowanie klasyczne metody badania drobnoustrojoacutew oparte na analizie ich cech fenotypowych

(metody fenotypowe)

oraz metody oparte na analizie ich materiału genetycznego wykorzystujące nowoczesne techniki biologii molekularnej

(metody genotypowe)

18

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Standardowy PCR bull Wykorzystuje chemiczne barwniki

interkalujące aparat nie wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub

nie ma szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywych topnienia produktoacutew reakcji PCR

19

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Real-time PCR czyli PCR w czasie rzeczywistym bull Wykorzystuje sondy genetyczne znakowane

fluorescencyjnie aparat wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub nie ma 3

rodzajoacutew szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Otrzymujemy wynik ilościowy ndash wartość w CFUml czyli liczba szukanego patogenu ktoacutery poddany był lizie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywej obrazującej przyrost zamplifikowanego produktu w czasie rzeczywistym

20

System BAX Q7reg Automatyczny system do molekularnej detekcji patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach

środowiskowych

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Osobą przenoszącą patogeny może być każdy turysta

uchodźca azylant

uczestnicy misji pokojowych ratunkowych itp

personel oddelegowany do pracy w warunkach tropikalnych

Analiza zagrożeń

4

Osobą przenoszącą fałszywe informacje lub towary może być każdy INTERNET

Mity i plotki

fałszywa reklama

Fałszywe leki

działania terrorystyczne w cyberprzestrzeni

Analiza zagrożeń

5

LUDNOŚĆ WOJEWOacuteDZTWA

Gdańsk ndash 447 tys

Sopot ndash 40 tys

Gdynia ndash 247 tys

Słupsk ndash 99 tys

Starogard Gd ndash 49 tys

Wejherowo ndash 46 tys

Rumia ndash 43 tys

Malbork ndash 39 tys

Chojnice ndash 40 tys

Kwidzyn ndash 38 tys

Lębork ndash 37 tys

Tczew ndash 60 tys 6

Polpharma ndash 33 t

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE AMONIAK

OSM Kwidzyn ndash 08 t Z-dy Owoc-Warz ndash 30 t

Rapbol Miastko ndash 5 t

Szkuner Wład-wo ndash 15 t Korab Ustka ndash 8 t

Farm-Frites ndash 12 t

OSM Chojnice ndash 4 t

Nestle Kobylnica ndash 10 t

Intersrys ndash 45 t Elbro - 6 t

Prima Food Przechlewo ndash 32 t

Drożdże ndash 2 t

Z-dy Mięsne Kośc ndash 4 t

Kaso Kartuzy ndash 3 t Kaper Fish ndash 9 t OSM Kartuzy ndash 05 t

Drobpol Żukowo ndash 9 t

Prima Chmielno ndash 9 t

Unilever Banino ndash 115 t

Dalmor Gdynia ndash 37 t Igloport ndash 23 t Lacpol ndash 78 t Wilbo-Seafood ndash 12 t

Chłodnie Hel ndash 2 t Gd Korp Handlowa ndash 2 t

Lodmor ndash 49 t Olvit ndash 6 t Maćkowy ndash 6 t

Bimet ndash 23 t Inlet-Rogal ndash 44 t

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE

GAZY I CIECZE

Rafineria Gdańska ndash propan butan Poligaz ndash acetylen tlen c azot c Fregata ndash ksylen EC II ndash chlorowodoacuter wodorot sodu Fosfory ndash siarka pł kw siar kwas az Gazpol ndash propan butan SAUR Neptun ndash chlor

Polpharma ndash chlor fosgen brom tl etylenu Polmos ndash kw siarkowy

Intern Paper ndash chlor chloran sodowy metanol nadtl wodoru dwutl chloru kw siarkowy

EC I ndash k solny wod sodu

Organika - izocyn

Przeds Wodociągoacutew i Kanalizacji ndash chlor

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE

SIARKA FOSFOR

Siarkopol ndash siarka stała i płynna Fosfory ndash soda granul kw fosfor

Polpharma ndash tlenochlorek fosforu

Rafineria ndash węglowod siarkowodoacuter

Pandemia śmiercionośnej choroby zakaźnej zamach bioterrorystyczny lub katastrofa ekologiczna ( tsunami Azja huragan Katrina USA) mogą wywołać ogoacutelny kryzys

Zmiany potrzebne OD ZARAZ

Narastająca groźba ataku nowych drobnoustrojoacutew chorobotwoacuterczych sprawia że wszystkie państwa świata jadą na jednym woacutezku W epoce globalizacji zarazki za nic mają granice państwowe i mogą się rozprzestrzeniać z prędkością odrzutowca

Rozpowszechnianie fałszywych informacji o szkodliwym wpływie obowiązkowych szczepień

10

Według WHO wśroacuted ośmiu zaleceń ktoacuterych zastosowanie radykalnie poprawiłoby stan zdrowia w skali światowej wymienia się roacutewnież

inwestowanie w system monitorowania choroacuteb zakaźnych

Zmiany potrzebne OD ZARAZ Rozpowszechnianie informacji wywołującej efekt naśladownictwa bull samoboacutejstwa bullAgresja w szkole

Nieetyczne działania przemysłu farmaceutycznego ndash epidemia pandemia i manipulacja danymi

11

Rozpoznanie Rozpoznanie jest ciągłym

systematycznym zbieraniem poroacutewnywaniem analizą i interpretacją danych a następnie przekazywaniem

informacji do tych ktoacuterzy powinni wiedzieć aby zostały podjęte

odpowiednie działania

12

Co jest przedmiotem rozpoznania

13

Rozpoznanie przedmiotcele

Specyficzne

Mierzalne

Wywołujące reakcję

Realistyczne

Aktualne ( w czasie realnym) 14

Rozpoznanie biozagrożeń ( biosurveillance) zintegrowany system gromadzenia i przetwarzania informacji niezbędnych do wczesnego wykrycia czynnika patogennego u ludzizwierząt lub roślin pojawiającego się w sposoacuteb naturalny ( SARS ) lub zamierzony ( biologiczny środek masowego rażenia - BSMR )

15

Klasyczne Techniki Instrumentalne

16

dr hab Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG

Diagnostyka mikrobiologiczna

Obecnie w diagnostyce mikrobiologicznej znajdują zastosowanie klasyczne metody badania drobnoustrojoacutew oparte na analizie ich cech fenotypowych

(metody fenotypowe)

oraz metody oparte na analizie ich materiału genetycznego wykorzystujące nowoczesne techniki biologii molekularnej

(metody genotypowe)

18

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Standardowy PCR bull Wykorzystuje chemiczne barwniki

interkalujące aparat nie wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub

nie ma szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywych topnienia produktoacutew reakcji PCR

19

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Real-time PCR czyli PCR w czasie rzeczywistym bull Wykorzystuje sondy genetyczne znakowane

fluorescencyjnie aparat wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub nie ma 3

rodzajoacutew szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Otrzymujemy wynik ilościowy ndash wartość w CFUml czyli liczba szukanego patogenu ktoacutery poddany był lizie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywej obrazującej przyrost zamplifikowanego produktu w czasie rzeczywistym

20

System BAX Q7reg Automatyczny system do molekularnej detekcji patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach

środowiskowych

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Osobą przenoszącą fałszywe informacje lub towary może być każdy INTERNET

Mity i plotki

fałszywa reklama

Fałszywe leki

działania terrorystyczne w cyberprzestrzeni

Analiza zagrożeń

5

LUDNOŚĆ WOJEWOacuteDZTWA

Gdańsk ndash 447 tys

Sopot ndash 40 tys

Gdynia ndash 247 tys

Słupsk ndash 99 tys

Starogard Gd ndash 49 tys

Wejherowo ndash 46 tys

Rumia ndash 43 tys

Malbork ndash 39 tys

Chojnice ndash 40 tys

Kwidzyn ndash 38 tys

Lębork ndash 37 tys

Tczew ndash 60 tys 6

Polpharma ndash 33 t

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE AMONIAK

OSM Kwidzyn ndash 08 t Z-dy Owoc-Warz ndash 30 t

Rapbol Miastko ndash 5 t

Szkuner Wład-wo ndash 15 t Korab Ustka ndash 8 t

Farm-Frites ndash 12 t

OSM Chojnice ndash 4 t

Nestle Kobylnica ndash 10 t

Intersrys ndash 45 t Elbro - 6 t

Prima Food Przechlewo ndash 32 t

Drożdże ndash 2 t

Z-dy Mięsne Kośc ndash 4 t

Kaso Kartuzy ndash 3 t Kaper Fish ndash 9 t OSM Kartuzy ndash 05 t

Drobpol Żukowo ndash 9 t

Prima Chmielno ndash 9 t

Unilever Banino ndash 115 t

Dalmor Gdynia ndash 37 t Igloport ndash 23 t Lacpol ndash 78 t Wilbo-Seafood ndash 12 t

Chłodnie Hel ndash 2 t Gd Korp Handlowa ndash 2 t

Lodmor ndash 49 t Olvit ndash 6 t Maćkowy ndash 6 t

Bimet ndash 23 t Inlet-Rogal ndash 44 t

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE

GAZY I CIECZE

Rafineria Gdańska ndash propan butan Poligaz ndash acetylen tlen c azot c Fregata ndash ksylen EC II ndash chlorowodoacuter wodorot sodu Fosfory ndash siarka pł kw siar kwas az Gazpol ndash propan butan SAUR Neptun ndash chlor

Polpharma ndash chlor fosgen brom tl etylenu Polmos ndash kw siarkowy

Intern Paper ndash chlor chloran sodowy metanol nadtl wodoru dwutl chloru kw siarkowy

EC I ndash k solny wod sodu

Organika - izocyn

Przeds Wodociągoacutew i Kanalizacji ndash chlor

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE

SIARKA FOSFOR

Siarkopol ndash siarka stała i płynna Fosfory ndash soda granul kw fosfor

Polpharma ndash tlenochlorek fosforu

Rafineria ndash węglowod siarkowodoacuter

Pandemia śmiercionośnej choroby zakaźnej zamach bioterrorystyczny lub katastrofa ekologiczna ( tsunami Azja huragan Katrina USA) mogą wywołać ogoacutelny kryzys

Zmiany potrzebne OD ZARAZ

Narastająca groźba ataku nowych drobnoustrojoacutew chorobotwoacuterczych sprawia że wszystkie państwa świata jadą na jednym woacutezku W epoce globalizacji zarazki za nic mają granice państwowe i mogą się rozprzestrzeniać z prędkością odrzutowca

Rozpowszechnianie fałszywych informacji o szkodliwym wpływie obowiązkowych szczepień

10

Według WHO wśroacuted ośmiu zaleceń ktoacuterych zastosowanie radykalnie poprawiłoby stan zdrowia w skali światowej wymienia się roacutewnież

inwestowanie w system monitorowania choroacuteb zakaźnych

Zmiany potrzebne OD ZARAZ Rozpowszechnianie informacji wywołującej efekt naśladownictwa bull samoboacutejstwa bullAgresja w szkole

Nieetyczne działania przemysłu farmaceutycznego ndash epidemia pandemia i manipulacja danymi

11

Rozpoznanie Rozpoznanie jest ciągłym

systematycznym zbieraniem poroacutewnywaniem analizą i interpretacją danych a następnie przekazywaniem

informacji do tych ktoacuterzy powinni wiedzieć aby zostały podjęte

odpowiednie działania

12

Co jest przedmiotem rozpoznania

13

Rozpoznanie przedmiotcele

Specyficzne

Mierzalne

Wywołujące reakcję

Realistyczne

Aktualne ( w czasie realnym) 14

Rozpoznanie biozagrożeń ( biosurveillance) zintegrowany system gromadzenia i przetwarzania informacji niezbędnych do wczesnego wykrycia czynnika patogennego u ludzizwierząt lub roślin pojawiającego się w sposoacuteb naturalny ( SARS ) lub zamierzony ( biologiczny środek masowego rażenia - BSMR )

15

Klasyczne Techniki Instrumentalne

16

dr hab Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG

Diagnostyka mikrobiologiczna

Obecnie w diagnostyce mikrobiologicznej znajdują zastosowanie klasyczne metody badania drobnoustrojoacutew oparte na analizie ich cech fenotypowych

(metody fenotypowe)

oraz metody oparte na analizie ich materiału genetycznego wykorzystujące nowoczesne techniki biologii molekularnej

(metody genotypowe)

18

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Standardowy PCR bull Wykorzystuje chemiczne barwniki

interkalujące aparat nie wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub

nie ma szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywych topnienia produktoacutew reakcji PCR

19

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Real-time PCR czyli PCR w czasie rzeczywistym bull Wykorzystuje sondy genetyczne znakowane

fluorescencyjnie aparat wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub nie ma 3

rodzajoacutew szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Otrzymujemy wynik ilościowy ndash wartość w CFUml czyli liczba szukanego patogenu ktoacutery poddany był lizie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywej obrazującej przyrost zamplifikowanego produktu w czasie rzeczywistym

20

System BAX Q7reg Automatyczny system do molekularnej detekcji patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach

środowiskowych

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

LUDNOŚĆ WOJEWOacuteDZTWA

Gdańsk ndash 447 tys

Sopot ndash 40 tys

Gdynia ndash 247 tys

Słupsk ndash 99 tys

Starogard Gd ndash 49 tys

Wejherowo ndash 46 tys

Rumia ndash 43 tys

Malbork ndash 39 tys

Chojnice ndash 40 tys

Kwidzyn ndash 38 tys

Lębork ndash 37 tys

Tczew ndash 60 tys 6

Polpharma ndash 33 t

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE AMONIAK

OSM Kwidzyn ndash 08 t Z-dy Owoc-Warz ndash 30 t

Rapbol Miastko ndash 5 t

Szkuner Wład-wo ndash 15 t Korab Ustka ndash 8 t

Farm-Frites ndash 12 t

OSM Chojnice ndash 4 t

Nestle Kobylnica ndash 10 t

Intersrys ndash 45 t Elbro - 6 t

Prima Food Przechlewo ndash 32 t

Drożdże ndash 2 t

Z-dy Mięsne Kośc ndash 4 t

Kaso Kartuzy ndash 3 t Kaper Fish ndash 9 t OSM Kartuzy ndash 05 t

Drobpol Żukowo ndash 9 t

Prima Chmielno ndash 9 t

Unilever Banino ndash 115 t

Dalmor Gdynia ndash 37 t Igloport ndash 23 t Lacpol ndash 78 t Wilbo-Seafood ndash 12 t

Chłodnie Hel ndash 2 t Gd Korp Handlowa ndash 2 t

Lodmor ndash 49 t Olvit ndash 6 t Maćkowy ndash 6 t

Bimet ndash 23 t Inlet-Rogal ndash 44 t

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE

GAZY I CIECZE

Rafineria Gdańska ndash propan butan Poligaz ndash acetylen tlen c azot c Fregata ndash ksylen EC II ndash chlorowodoacuter wodorot sodu Fosfory ndash siarka pł kw siar kwas az Gazpol ndash propan butan SAUR Neptun ndash chlor

Polpharma ndash chlor fosgen brom tl etylenu Polmos ndash kw siarkowy

Intern Paper ndash chlor chloran sodowy metanol nadtl wodoru dwutl chloru kw siarkowy

EC I ndash k solny wod sodu

Organika - izocyn

Przeds Wodociągoacutew i Kanalizacji ndash chlor

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE

SIARKA FOSFOR

Siarkopol ndash siarka stała i płynna Fosfory ndash soda granul kw fosfor

Polpharma ndash tlenochlorek fosforu

Rafineria ndash węglowod siarkowodoacuter

Pandemia śmiercionośnej choroby zakaźnej zamach bioterrorystyczny lub katastrofa ekologiczna ( tsunami Azja huragan Katrina USA) mogą wywołać ogoacutelny kryzys

Zmiany potrzebne OD ZARAZ

Narastająca groźba ataku nowych drobnoustrojoacutew chorobotwoacuterczych sprawia że wszystkie państwa świata jadą na jednym woacutezku W epoce globalizacji zarazki za nic mają granice państwowe i mogą się rozprzestrzeniać z prędkością odrzutowca

Rozpowszechnianie fałszywych informacji o szkodliwym wpływie obowiązkowych szczepień

10

Według WHO wśroacuted ośmiu zaleceń ktoacuterych zastosowanie radykalnie poprawiłoby stan zdrowia w skali światowej wymienia się roacutewnież

inwestowanie w system monitorowania choroacuteb zakaźnych

Zmiany potrzebne OD ZARAZ Rozpowszechnianie informacji wywołującej efekt naśladownictwa bull samoboacutejstwa bullAgresja w szkole

Nieetyczne działania przemysłu farmaceutycznego ndash epidemia pandemia i manipulacja danymi

11

Rozpoznanie Rozpoznanie jest ciągłym

systematycznym zbieraniem poroacutewnywaniem analizą i interpretacją danych a następnie przekazywaniem

informacji do tych ktoacuterzy powinni wiedzieć aby zostały podjęte

odpowiednie działania

12

Co jest przedmiotem rozpoznania

13

Rozpoznanie przedmiotcele

Specyficzne

Mierzalne

Wywołujące reakcję

Realistyczne

Aktualne ( w czasie realnym) 14

Rozpoznanie biozagrożeń ( biosurveillance) zintegrowany system gromadzenia i przetwarzania informacji niezbędnych do wczesnego wykrycia czynnika patogennego u ludzizwierząt lub roślin pojawiającego się w sposoacuteb naturalny ( SARS ) lub zamierzony ( biologiczny środek masowego rażenia - BSMR )

15

Klasyczne Techniki Instrumentalne

16

dr hab Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG

Diagnostyka mikrobiologiczna

Obecnie w diagnostyce mikrobiologicznej znajdują zastosowanie klasyczne metody badania drobnoustrojoacutew oparte na analizie ich cech fenotypowych

(metody fenotypowe)

oraz metody oparte na analizie ich materiału genetycznego wykorzystujące nowoczesne techniki biologii molekularnej

(metody genotypowe)

18

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Standardowy PCR bull Wykorzystuje chemiczne barwniki

interkalujące aparat nie wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub

nie ma szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywych topnienia produktoacutew reakcji PCR

19

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Real-time PCR czyli PCR w czasie rzeczywistym bull Wykorzystuje sondy genetyczne znakowane

fluorescencyjnie aparat wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub nie ma 3

rodzajoacutew szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Otrzymujemy wynik ilościowy ndash wartość w CFUml czyli liczba szukanego patogenu ktoacutery poddany był lizie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywej obrazującej przyrost zamplifikowanego produktu w czasie rzeczywistym

20

System BAX Q7reg Automatyczny system do molekularnej detekcji patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach

środowiskowych

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Polpharma ndash 33 t

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE AMONIAK

OSM Kwidzyn ndash 08 t Z-dy Owoc-Warz ndash 30 t

Rapbol Miastko ndash 5 t

Szkuner Wład-wo ndash 15 t Korab Ustka ndash 8 t

Farm-Frites ndash 12 t

OSM Chojnice ndash 4 t

Nestle Kobylnica ndash 10 t

Intersrys ndash 45 t Elbro - 6 t

Prima Food Przechlewo ndash 32 t

Drożdże ndash 2 t

Z-dy Mięsne Kośc ndash 4 t

Kaso Kartuzy ndash 3 t Kaper Fish ndash 9 t OSM Kartuzy ndash 05 t

Drobpol Żukowo ndash 9 t

Prima Chmielno ndash 9 t

Unilever Banino ndash 115 t

Dalmor Gdynia ndash 37 t Igloport ndash 23 t Lacpol ndash 78 t Wilbo-Seafood ndash 12 t

Chłodnie Hel ndash 2 t Gd Korp Handlowa ndash 2 t

Lodmor ndash 49 t Olvit ndash 6 t Maćkowy ndash 6 t

Bimet ndash 23 t Inlet-Rogal ndash 44 t

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE

GAZY I CIECZE

Rafineria Gdańska ndash propan butan Poligaz ndash acetylen tlen c azot c Fregata ndash ksylen EC II ndash chlorowodoacuter wodorot sodu Fosfory ndash siarka pł kw siar kwas az Gazpol ndash propan butan SAUR Neptun ndash chlor

Polpharma ndash chlor fosgen brom tl etylenu Polmos ndash kw siarkowy

Intern Paper ndash chlor chloran sodowy metanol nadtl wodoru dwutl chloru kw siarkowy

EC I ndash k solny wod sodu

Organika - izocyn

Przeds Wodociągoacutew i Kanalizacji ndash chlor

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE

SIARKA FOSFOR

Siarkopol ndash siarka stała i płynna Fosfory ndash soda granul kw fosfor

Polpharma ndash tlenochlorek fosforu

Rafineria ndash węglowod siarkowodoacuter

Pandemia śmiercionośnej choroby zakaźnej zamach bioterrorystyczny lub katastrofa ekologiczna ( tsunami Azja huragan Katrina USA) mogą wywołać ogoacutelny kryzys

Zmiany potrzebne OD ZARAZ

Narastająca groźba ataku nowych drobnoustrojoacutew chorobotwoacuterczych sprawia że wszystkie państwa świata jadą na jednym woacutezku W epoce globalizacji zarazki za nic mają granice państwowe i mogą się rozprzestrzeniać z prędkością odrzutowca

Rozpowszechnianie fałszywych informacji o szkodliwym wpływie obowiązkowych szczepień

10

Według WHO wśroacuted ośmiu zaleceń ktoacuterych zastosowanie radykalnie poprawiłoby stan zdrowia w skali światowej wymienia się roacutewnież

inwestowanie w system monitorowania choroacuteb zakaźnych

Zmiany potrzebne OD ZARAZ Rozpowszechnianie informacji wywołującej efekt naśladownictwa bull samoboacutejstwa bullAgresja w szkole

Nieetyczne działania przemysłu farmaceutycznego ndash epidemia pandemia i manipulacja danymi

11

Rozpoznanie Rozpoznanie jest ciągłym

systematycznym zbieraniem poroacutewnywaniem analizą i interpretacją danych a następnie przekazywaniem

informacji do tych ktoacuterzy powinni wiedzieć aby zostały podjęte

odpowiednie działania

12

Co jest przedmiotem rozpoznania

13

Rozpoznanie przedmiotcele

Specyficzne

Mierzalne

Wywołujące reakcję

Realistyczne

Aktualne ( w czasie realnym) 14

Rozpoznanie biozagrożeń ( biosurveillance) zintegrowany system gromadzenia i przetwarzania informacji niezbędnych do wczesnego wykrycia czynnika patogennego u ludzizwierząt lub roślin pojawiającego się w sposoacuteb naturalny ( SARS ) lub zamierzony ( biologiczny środek masowego rażenia - BSMR )

15

Klasyczne Techniki Instrumentalne

16

dr hab Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG

Diagnostyka mikrobiologiczna

Obecnie w diagnostyce mikrobiologicznej znajdują zastosowanie klasyczne metody badania drobnoustrojoacutew oparte na analizie ich cech fenotypowych

(metody fenotypowe)

oraz metody oparte na analizie ich materiału genetycznego wykorzystujące nowoczesne techniki biologii molekularnej

(metody genotypowe)

18

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Standardowy PCR bull Wykorzystuje chemiczne barwniki

interkalujące aparat nie wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub

nie ma szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywych topnienia produktoacutew reakcji PCR

19

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Real-time PCR czyli PCR w czasie rzeczywistym bull Wykorzystuje sondy genetyczne znakowane

fluorescencyjnie aparat wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub nie ma 3

rodzajoacutew szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Otrzymujemy wynik ilościowy ndash wartość w CFUml czyli liczba szukanego patogenu ktoacutery poddany był lizie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywej obrazującej przyrost zamplifikowanego produktu w czasie rzeczywistym

20

System BAX Q7reg Automatyczny system do molekularnej detekcji patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach

środowiskowych

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE

GAZY I CIECZE

Rafineria Gdańska ndash propan butan Poligaz ndash acetylen tlen c azot c Fregata ndash ksylen EC II ndash chlorowodoacuter wodorot sodu Fosfory ndash siarka pł kw siar kwas az Gazpol ndash propan butan SAUR Neptun ndash chlor

Polpharma ndash chlor fosgen brom tl etylenu Polmos ndash kw siarkowy

Intern Paper ndash chlor chloran sodowy metanol nadtl wodoru dwutl chloru kw siarkowy

EC I ndash k solny wod sodu

Organika - izocyn

Przeds Wodociągoacutew i Kanalizacji ndash chlor

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE

SIARKA FOSFOR

Siarkopol ndash siarka stała i płynna Fosfory ndash soda granul kw fosfor

Polpharma ndash tlenochlorek fosforu

Rafineria ndash węglowod siarkowodoacuter

Pandemia śmiercionośnej choroby zakaźnej zamach bioterrorystyczny lub katastrofa ekologiczna ( tsunami Azja huragan Katrina USA) mogą wywołać ogoacutelny kryzys

Zmiany potrzebne OD ZARAZ

Narastająca groźba ataku nowych drobnoustrojoacutew chorobotwoacuterczych sprawia że wszystkie państwa świata jadą na jednym woacutezku W epoce globalizacji zarazki za nic mają granice państwowe i mogą się rozprzestrzeniać z prędkością odrzutowca

Rozpowszechnianie fałszywych informacji o szkodliwym wpływie obowiązkowych szczepień

10

Według WHO wśroacuted ośmiu zaleceń ktoacuterych zastosowanie radykalnie poprawiłoby stan zdrowia w skali światowej wymienia się roacutewnież

inwestowanie w system monitorowania choroacuteb zakaźnych

Zmiany potrzebne OD ZARAZ Rozpowszechnianie informacji wywołującej efekt naśladownictwa bull samoboacutejstwa bullAgresja w szkole

Nieetyczne działania przemysłu farmaceutycznego ndash epidemia pandemia i manipulacja danymi

11

Rozpoznanie Rozpoznanie jest ciągłym

systematycznym zbieraniem poroacutewnywaniem analizą i interpretacją danych a następnie przekazywaniem

informacji do tych ktoacuterzy powinni wiedzieć aby zostały podjęte

odpowiednie działania

12

Co jest przedmiotem rozpoznania

13

Rozpoznanie przedmiotcele

Specyficzne

Mierzalne

Wywołujące reakcję

Realistyczne

Aktualne ( w czasie realnym) 14

Rozpoznanie biozagrożeń ( biosurveillance) zintegrowany system gromadzenia i przetwarzania informacji niezbędnych do wczesnego wykrycia czynnika patogennego u ludzizwierząt lub roślin pojawiającego się w sposoacuteb naturalny ( SARS ) lub zamierzony ( biologiczny środek masowego rażenia - BSMR )

15

Klasyczne Techniki Instrumentalne

16

dr hab Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG

Diagnostyka mikrobiologiczna

Obecnie w diagnostyce mikrobiologicznej znajdują zastosowanie klasyczne metody badania drobnoustrojoacutew oparte na analizie ich cech fenotypowych

(metody fenotypowe)

oraz metody oparte na analizie ich materiału genetycznego wykorzystujące nowoczesne techniki biologii molekularnej

(metody genotypowe)

18

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Standardowy PCR bull Wykorzystuje chemiczne barwniki

interkalujące aparat nie wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub

nie ma szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywych topnienia produktoacutew reakcji PCR

19

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Real-time PCR czyli PCR w czasie rzeczywistym bull Wykorzystuje sondy genetyczne znakowane

fluorescencyjnie aparat wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub nie ma 3

rodzajoacutew szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Otrzymujemy wynik ilościowy ndash wartość w CFUml czyli liczba szukanego patogenu ktoacutery poddany był lizie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywej obrazującej przyrost zamplifikowanego produktu w czasie rzeczywistym

20

System BAX Q7reg Automatyczny system do molekularnej detekcji patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach

środowiskowych

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO

ZAGROŻENIA CZASU bdquoPrdquo SKAŻENIA

CHEMICZNE I KATASTROFY EKOLOGICZNE

SIARKA FOSFOR

Siarkopol ndash siarka stała i płynna Fosfory ndash soda granul kw fosfor

Polpharma ndash tlenochlorek fosforu

Rafineria ndash węglowod siarkowodoacuter

Pandemia śmiercionośnej choroby zakaźnej zamach bioterrorystyczny lub katastrofa ekologiczna ( tsunami Azja huragan Katrina USA) mogą wywołać ogoacutelny kryzys

Zmiany potrzebne OD ZARAZ

Narastająca groźba ataku nowych drobnoustrojoacutew chorobotwoacuterczych sprawia że wszystkie państwa świata jadą na jednym woacutezku W epoce globalizacji zarazki za nic mają granice państwowe i mogą się rozprzestrzeniać z prędkością odrzutowca

Rozpowszechnianie fałszywych informacji o szkodliwym wpływie obowiązkowych szczepień

10

Według WHO wśroacuted ośmiu zaleceń ktoacuterych zastosowanie radykalnie poprawiłoby stan zdrowia w skali światowej wymienia się roacutewnież

inwestowanie w system monitorowania choroacuteb zakaźnych

Zmiany potrzebne OD ZARAZ Rozpowszechnianie informacji wywołującej efekt naśladownictwa bull samoboacutejstwa bullAgresja w szkole

Nieetyczne działania przemysłu farmaceutycznego ndash epidemia pandemia i manipulacja danymi

11

Rozpoznanie Rozpoznanie jest ciągłym

systematycznym zbieraniem poroacutewnywaniem analizą i interpretacją danych a następnie przekazywaniem

informacji do tych ktoacuterzy powinni wiedzieć aby zostały podjęte

odpowiednie działania

12

Co jest przedmiotem rozpoznania

13

Rozpoznanie przedmiotcele

Specyficzne

Mierzalne

Wywołujące reakcję

Realistyczne

Aktualne ( w czasie realnym) 14

Rozpoznanie biozagrożeń ( biosurveillance) zintegrowany system gromadzenia i przetwarzania informacji niezbędnych do wczesnego wykrycia czynnika patogennego u ludzizwierząt lub roślin pojawiającego się w sposoacuteb naturalny ( SARS ) lub zamierzony ( biologiczny środek masowego rażenia - BSMR )

15

Klasyczne Techniki Instrumentalne

16

dr hab Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG

Diagnostyka mikrobiologiczna

Obecnie w diagnostyce mikrobiologicznej znajdują zastosowanie klasyczne metody badania drobnoustrojoacutew oparte na analizie ich cech fenotypowych

(metody fenotypowe)

oraz metody oparte na analizie ich materiału genetycznego wykorzystujące nowoczesne techniki biologii molekularnej

(metody genotypowe)

18

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Standardowy PCR bull Wykorzystuje chemiczne barwniki

interkalujące aparat nie wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub

nie ma szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywych topnienia produktoacutew reakcji PCR

19

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Real-time PCR czyli PCR w czasie rzeczywistym bull Wykorzystuje sondy genetyczne znakowane

fluorescencyjnie aparat wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub nie ma 3

rodzajoacutew szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Otrzymujemy wynik ilościowy ndash wartość w CFUml czyli liczba szukanego patogenu ktoacutery poddany był lizie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywej obrazującej przyrost zamplifikowanego produktu w czasie rzeczywistym

20

System BAX Q7reg Automatyczny system do molekularnej detekcji patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach

środowiskowych

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Pandemia śmiercionośnej choroby zakaźnej zamach bioterrorystyczny lub katastrofa ekologiczna ( tsunami Azja huragan Katrina USA) mogą wywołać ogoacutelny kryzys

Zmiany potrzebne OD ZARAZ

Narastająca groźba ataku nowych drobnoustrojoacutew chorobotwoacuterczych sprawia że wszystkie państwa świata jadą na jednym woacutezku W epoce globalizacji zarazki za nic mają granice państwowe i mogą się rozprzestrzeniać z prędkością odrzutowca

Rozpowszechnianie fałszywych informacji o szkodliwym wpływie obowiązkowych szczepień

10

Według WHO wśroacuted ośmiu zaleceń ktoacuterych zastosowanie radykalnie poprawiłoby stan zdrowia w skali światowej wymienia się roacutewnież

inwestowanie w system monitorowania choroacuteb zakaźnych

Zmiany potrzebne OD ZARAZ Rozpowszechnianie informacji wywołującej efekt naśladownictwa bull samoboacutejstwa bullAgresja w szkole

Nieetyczne działania przemysłu farmaceutycznego ndash epidemia pandemia i manipulacja danymi

11

Rozpoznanie Rozpoznanie jest ciągłym

systematycznym zbieraniem poroacutewnywaniem analizą i interpretacją danych a następnie przekazywaniem

informacji do tych ktoacuterzy powinni wiedzieć aby zostały podjęte

odpowiednie działania

12

Co jest przedmiotem rozpoznania

13

Rozpoznanie przedmiotcele

Specyficzne

Mierzalne

Wywołujące reakcję

Realistyczne

Aktualne ( w czasie realnym) 14

Rozpoznanie biozagrożeń ( biosurveillance) zintegrowany system gromadzenia i przetwarzania informacji niezbędnych do wczesnego wykrycia czynnika patogennego u ludzizwierząt lub roślin pojawiającego się w sposoacuteb naturalny ( SARS ) lub zamierzony ( biologiczny środek masowego rażenia - BSMR )

15

Klasyczne Techniki Instrumentalne

16

dr hab Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG

Diagnostyka mikrobiologiczna

Obecnie w diagnostyce mikrobiologicznej znajdują zastosowanie klasyczne metody badania drobnoustrojoacutew oparte na analizie ich cech fenotypowych

(metody fenotypowe)

oraz metody oparte na analizie ich materiału genetycznego wykorzystujące nowoczesne techniki biologii molekularnej

(metody genotypowe)

18

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Standardowy PCR bull Wykorzystuje chemiczne barwniki

interkalujące aparat nie wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub

nie ma szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywych topnienia produktoacutew reakcji PCR

19

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Real-time PCR czyli PCR w czasie rzeczywistym bull Wykorzystuje sondy genetyczne znakowane

fluorescencyjnie aparat wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub nie ma 3

rodzajoacutew szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Otrzymujemy wynik ilościowy ndash wartość w CFUml czyli liczba szukanego patogenu ktoacutery poddany był lizie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywej obrazującej przyrost zamplifikowanego produktu w czasie rzeczywistym

20

System BAX Q7reg Automatyczny system do molekularnej detekcji patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach

środowiskowych

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Według WHO wśroacuted ośmiu zaleceń ktoacuterych zastosowanie radykalnie poprawiłoby stan zdrowia w skali światowej wymienia się roacutewnież

inwestowanie w system monitorowania choroacuteb zakaźnych

Zmiany potrzebne OD ZARAZ Rozpowszechnianie informacji wywołującej efekt naśladownictwa bull samoboacutejstwa bullAgresja w szkole

Nieetyczne działania przemysłu farmaceutycznego ndash epidemia pandemia i manipulacja danymi

11

Rozpoznanie Rozpoznanie jest ciągłym

systematycznym zbieraniem poroacutewnywaniem analizą i interpretacją danych a następnie przekazywaniem

informacji do tych ktoacuterzy powinni wiedzieć aby zostały podjęte

odpowiednie działania

12

Co jest przedmiotem rozpoznania

13

Rozpoznanie przedmiotcele

Specyficzne

Mierzalne

Wywołujące reakcję

Realistyczne

Aktualne ( w czasie realnym) 14

Rozpoznanie biozagrożeń ( biosurveillance) zintegrowany system gromadzenia i przetwarzania informacji niezbędnych do wczesnego wykrycia czynnika patogennego u ludzizwierząt lub roślin pojawiającego się w sposoacuteb naturalny ( SARS ) lub zamierzony ( biologiczny środek masowego rażenia - BSMR )

15

Klasyczne Techniki Instrumentalne

16

dr hab Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG

Diagnostyka mikrobiologiczna

Obecnie w diagnostyce mikrobiologicznej znajdują zastosowanie klasyczne metody badania drobnoustrojoacutew oparte na analizie ich cech fenotypowych

(metody fenotypowe)

oraz metody oparte na analizie ich materiału genetycznego wykorzystujące nowoczesne techniki biologii molekularnej

(metody genotypowe)

18

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Standardowy PCR bull Wykorzystuje chemiczne barwniki

interkalujące aparat nie wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub

nie ma szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywych topnienia produktoacutew reakcji PCR

19

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Real-time PCR czyli PCR w czasie rzeczywistym bull Wykorzystuje sondy genetyczne znakowane

fluorescencyjnie aparat wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub nie ma 3

rodzajoacutew szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Otrzymujemy wynik ilościowy ndash wartość w CFUml czyli liczba szukanego patogenu ktoacutery poddany był lizie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywej obrazującej przyrost zamplifikowanego produktu w czasie rzeczywistym

20

System BAX Q7reg Automatyczny system do molekularnej detekcji patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach

środowiskowych

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Rozpoznanie Rozpoznanie jest ciągłym

systematycznym zbieraniem poroacutewnywaniem analizą i interpretacją danych a następnie przekazywaniem

informacji do tych ktoacuterzy powinni wiedzieć aby zostały podjęte

odpowiednie działania

12

Co jest przedmiotem rozpoznania

13

Rozpoznanie przedmiotcele

Specyficzne

Mierzalne

Wywołujące reakcję

Realistyczne

Aktualne ( w czasie realnym) 14

Rozpoznanie biozagrożeń ( biosurveillance) zintegrowany system gromadzenia i przetwarzania informacji niezbędnych do wczesnego wykrycia czynnika patogennego u ludzizwierząt lub roślin pojawiającego się w sposoacuteb naturalny ( SARS ) lub zamierzony ( biologiczny środek masowego rażenia - BSMR )

15

Klasyczne Techniki Instrumentalne

16

dr hab Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG

Diagnostyka mikrobiologiczna

Obecnie w diagnostyce mikrobiologicznej znajdują zastosowanie klasyczne metody badania drobnoustrojoacutew oparte na analizie ich cech fenotypowych

(metody fenotypowe)

oraz metody oparte na analizie ich materiału genetycznego wykorzystujące nowoczesne techniki biologii molekularnej

(metody genotypowe)

18

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Standardowy PCR bull Wykorzystuje chemiczne barwniki

interkalujące aparat nie wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub

nie ma szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywych topnienia produktoacutew reakcji PCR

19

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Real-time PCR czyli PCR w czasie rzeczywistym bull Wykorzystuje sondy genetyczne znakowane

fluorescencyjnie aparat wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub nie ma 3

rodzajoacutew szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Otrzymujemy wynik ilościowy ndash wartość w CFUml czyli liczba szukanego patogenu ktoacutery poddany był lizie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywej obrazującej przyrost zamplifikowanego produktu w czasie rzeczywistym

20

System BAX Q7reg Automatyczny system do molekularnej detekcji patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach

środowiskowych

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Co jest przedmiotem rozpoznania

13

Rozpoznanie przedmiotcele

Specyficzne

Mierzalne

Wywołujące reakcję

Realistyczne

Aktualne ( w czasie realnym) 14

Rozpoznanie biozagrożeń ( biosurveillance) zintegrowany system gromadzenia i przetwarzania informacji niezbędnych do wczesnego wykrycia czynnika patogennego u ludzizwierząt lub roślin pojawiającego się w sposoacuteb naturalny ( SARS ) lub zamierzony ( biologiczny środek masowego rażenia - BSMR )

15

Klasyczne Techniki Instrumentalne

16

dr hab Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG

Diagnostyka mikrobiologiczna

Obecnie w diagnostyce mikrobiologicznej znajdują zastosowanie klasyczne metody badania drobnoustrojoacutew oparte na analizie ich cech fenotypowych

(metody fenotypowe)

oraz metody oparte na analizie ich materiału genetycznego wykorzystujące nowoczesne techniki biologii molekularnej

(metody genotypowe)

18

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Standardowy PCR bull Wykorzystuje chemiczne barwniki

interkalujące aparat nie wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub

nie ma szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywych topnienia produktoacutew reakcji PCR

19

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Real-time PCR czyli PCR w czasie rzeczywistym bull Wykorzystuje sondy genetyczne znakowane

fluorescencyjnie aparat wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub nie ma 3

rodzajoacutew szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Otrzymujemy wynik ilościowy ndash wartość w CFUml czyli liczba szukanego patogenu ktoacutery poddany był lizie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywej obrazującej przyrost zamplifikowanego produktu w czasie rzeczywistym

20

System BAX Q7reg Automatyczny system do molekularnej detekcji patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach

środowiskowych

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Rozpoznanie przedmiotcele

Specyficzne

Mierzalne

Wywołujące reakcję

Realistyczne

Aktualne ( w czasie realnym) 14

Rozpoznanie biozagrożeń ( biosurveillance) zintegrowany system gromadzenia i przetwarzania informacji niezbędnych do wczesnego wykrycia czynnika patogennego u ludzizwierząt lub roślin pojawiającego się w sposoacuteb naturalny ( SARS ) lub zamierzony ( biologiczny środek masowego rażenia - BSMR )

15

Klasyczne Techniki Instrumentalne

16

dr hab Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG

Diagnostyka mikrobiologiczna

Obecnie w diagnostyce mikrobiologicznej znajdują zastosowanie klasyczne metody badania drobnoustrojoacutew oparte na analizie ich cech fenotypowych

(metody fenotypowe)

oraz metody oparte na analizie ich materiału genetycznego wykorzystujące nowoczesne techniki biologii molekularnej

(metody genotypowe)

18

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Standardowy PCR bull Wykorzystuje chemiczne barwniki

interkalujące aparat nie wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub

nie ma szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywych topnienia produktoacutew reakcji PCR

19

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Real-time PCR czyli PCR w czasie rzeczywistym bull Wykorzystuje sondy genetyczne znakowane

fluorescencyjnie aparat wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub nie ma 3

rodzajoacutew szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Otrzymujemy wynik ilościowy ndash wartość w CFUml czyli liczba szukanego patogenu ktoacutery poddany był lizie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywej obrazującej przyrost zamplifikowanego produktu w czasie rzeczywistym

20

System BAX Q7reg Automatyczny system do molekularnej detekcji patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach

środowiskowych

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Rozpoznanie biozagrożeń ( biosurveillance) zintegrowany system gromadzenia i przetwarzania informacji niezbędnych do wczesnego wykrycia czynnika patogennego u ludzizwierząt lub roślin pojawiającego się w sposoacuteb naturalny ( SARS ) lub zamierzony ( biologiczny środek masowego rażenia - BSMR )

15

Klasyczne Techniki Instrumentalne

16

dr hab Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG

Diagnostyka mikrobiologiczna

Obecnie w diagnostyce mikrobiologicznej znajdują zastosowanie klasyczne metody badania drobnoustrojoacutew oparte na analizie ich cech fenotypowych

(metody fenotypowe)

oraz metody oparte na analizie ich materiału genetycznego wykorzystujące nowoczesne techniki biologii molekularnej

(metody genotypowe)

18

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Standardowy PCR bull Wykorzystuje chemiczne barwniki

interkalujące aparat nie wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub

nie ma szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywych topnienia produktoacutew reakcji PCR

19

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Real-time PCR czyli PCR w czasie rzeczywistym bull Wykorzystuje sondy genetyczne znakowane

fluorescencyjnie aparat wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub nie ma 3

rodzajoacutew szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Otrzymujemy wynik ilościowy ndash wartość w CFUml czyli liczba szukanego patogenu ktoacutery poddany był lizie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywej obrazującej przyrost zamplifikowanego produktu w czasie rzeczywistym

20

System BAX Q7reg Automatyczny system do molekularnej detekcji patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach

środowiskowych

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Klasyczne Techniki Instrumentalne

16

dr hab Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG

Diagnostyka mikrobiologiczna

Obecnie w diagnostyce mikrobiologicznej znajdują zastosowanie klasyczne metody badania drobnoustrojoacutew oparte na analizie ich cech fenotypowych

(metody fenotypowe)

oraz metody oparte na analizie ich materiału genetycznego wykorzystujące nowoczesne techniki biologii molekularnej

(metody genotypowe)

18

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Standardowy PCR bull Wykorzystuje chemiczne barwniki

interkalujące aparat nie wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub

nie ma szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywych topnienia produktoacutew reakcji PCR

19

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Real-time PCR czyli PCR w czasie rzeczywistym bull Wykorzystuje sondy genetyczne znakowane

fluorescencyjnie aparat wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub nie ma 3

rodzajoacutew szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Otrzymujemy wynik ilościowy ndash wartość w CFUml czyli liczba szukanego patogenu ktoacutery poddany był lizie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywej obrazującej przyrost zamplifikowanego produktu w czasie rzeczywistym

20

System BAX Q7reg Automatyczny system do molekularnej detekcji patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach

środowiskowych

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

dr hab Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG

Diagnostyka mikrobiologiczna

Obecnie w diagnostyce mikrobiologicznej znajdują zastosowanie klasyczne metody badania drobnoustrojoacutew oparte na analizie ich cech fenotypowych

(metody fenotypowe)

oraz metody oparte na analizie ich materiału genetycznego wykorzystujące nowoczesne techniki biologii molekularnej

(metody genotypowe)

18

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Standardowy PCR bull Wykorzystuje chemiczne barwniki

interkalujące aparat nie wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub

nie ma szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywych topnienia produktoacutew reakcji PCR

19

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Real-time PCR czyli PCR w czasie rzeczywistym bull Wykorzystuje sondy genetyczne znakowane

fluorescencyjnie aparat wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub nie ma 3

rodzajoacutew szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Otrzymujemy wynik ilościowy ndash wartość w CFUml czyli liczba szukanego patogenu ktoacutery poddany był lizie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywej obrazującej przyrost zamplifikowanego produktu w czasie rzeczywistym

20

System BAX Q7reg Automatyczny system do molekularnej detekcji patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach

środowiskowych

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Diagnostyka mikrobiologiczna

Obecnie w diagnostyce mikrobiologicznej znajdują zastosowanie klasyczne metody badania drobnoustrojoacutew oparte na analizie ich cech fenotypowych

(metody fenotypowe)

oraz metody oparte na analizie ich materiału genetycznego wykorzystujące nowoczesne techniki biologii molekularnej

(metody genotypowe)

18

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Standardowy PCR bull Wykorzystuje chemiczne barwniki

interkalujące aparat nie wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub

nie ma szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywych topnienia produktoacutew reakcji PCR

19

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Real-time PCR czyli PCR w czasie rzeczywistym bull Wykorzystuje sondy genetyczne znakowane

fluorescencyjnie aparat wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub nie ma 3

rodzajoacutew szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Otrzymujemy wynik ilościowy ndash wartość w CFUml czyli liczba szukanego patogenu ktoacutery poddany był lizie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywej obrazującej przyrost zamplifikowanego produktu w czasie rzeczywistym

20

System BAX Q7reg Automatyczny system do molekularnej detekcji patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach

środowiskowych

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Standardowy PCR bull Wykorzystuje chemiczne barwniki

interkalujące aparat nie wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub

nie ma szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywych topnienia produktoacutew reakcji PCR

19

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Real-time PCR czyli PCR w czasie rzeczywistym bull Wykorzystuje sondy genetyczne znakowane

fluorescencyjnie aparat wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub nie ma 3

rodzajoacutew szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Otrzymujemy wynik ilościowy ndash wartość w CFUml czyli liczba szukanego patogenu ktoacutery poddany był lizie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywej obrazującej przyrost zamplifikowanego produktu w czasie rzeczywistym

20

System BAX Q7reg Automatyczny system do molekularnej detekcji patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach

środowiskowych

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR

Real-time PCR czyli PCR w czasie rzeczywistym bull Wykorzystuje sondy genetyczne znakowane

fluorescencyjnie aparat wymaga kalibracji bull Otrzymujemy wynik jakościowy jest lub nie ma 3

rodzajoacutew szukanego patogenu dodatkowo przy każdej reakcji mamy dodatnią kontrolę wewnętrzną przy każdej proacutebie

bull Otrzymujemy wynik ilościowy ndash wartość w CFUml czyli liczba szukanego patogenu ktoacutery poddany był lizie

bull Wyniki otrzymujemy w postaci krzywej obrazującej przyrost zamplifikowanego produktu w czasie rzeczywistym

20

System BAX Q7reg Automatyczny system do molekularnej detekcji patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach

środowiskowych

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

System BAX Q7reg Automatyczny system do molekularnej detekcji patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach

środowiskowych

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

System BAX Q7reg to automatyczny system do molekularnej detekcji

patogenoacutew w żywności oraz proacutebkach środowiskowych oparty na reakcji łańcuchowej

polimerazy czyli reakcji PCR (ang Polimerase Chain Raction) oraz detekcji

temperatury topnienia i zmian fluorescencji powielonych w reakcji PCR genoacutew

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System

Mleko i przetwory mleczne

Mięso i wędliny

Owoce morza

OwoceWarzywaSałatki

Pasze

Przyprawy

Czekolada

Karma dla zwierząt

Proacutebki środowiskowe

Inne

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku Obecność Salmonella Obecność Listeria monocytogenes Obecność Rodzaju Listeria Obecność Rodzaju Listeria w 8 h z powierzchni Obecność liczba Pleśnie i drożdże Obecność E coli O157H7 MP Obecność Enterobacter sakazakii

Liczba obecność Staphylococcus aureus Liczba obecność Campylobacter jejunicolilari

Każdy KIT zestaw zawiera odczynniki (na 96 oznaczeń) a w nim

bull Proboacutewki do PCR wraz z tabletkami bull Korki optyczne bull Bufor lizujący

bull Proteaza

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg Szukany patogen Czas namnażania Czas lizy Czas trwania PCR Całkowity czas do

uzyskania

Salmonella 16-24 godzin (niektoacutere proacuteby zawierające uszkodzone komoacuterki wymagają dodatkowo 3 godzinnego namnażania)

30 min 35 godz 24-33 godz Praktycznie na drugą dobę

Listeria monocytogenes 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

345-645 godz Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Rodzaj Listeria 24-30 godz lub

30-50 godz

80 min 35 godz

265-345 godz

Praktycznie druga albo na trzecią dobę

Real-Time czyli liczba S aureus

20-22 godz

80 min 90 min 23-24 godz Praktycznie na drugą dobę

E coli O157H7 MP 8-24 godz (wołowina)

30 min 35godz (lt3 godz dla MP Express)

11-28 godz Praktycznie na drugą dobę

Enterobacter sakazakii 24godz

30 min 35 godz

28 godz Praktycznie na drugą dobę

Pleśnie i drożdże 44 godz

30 min 35 godz

48 godz

Real-Time czyli liczba C jejunicolilari

24-48 godz

30 min 90 min 26-50 godz

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Gas Chromatography Mass Spectrometry

26

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

SEWAGE EPIDEMIOLOGY

2001 Prof Daughton (US EPA - raised theoretical idea of sewage epidemiology

- Objective ldquogiant urine testrdquo - Less time consuming - Anonymous 2005 First measurements of drugs in

wastewater (Zuccato et al 2005) =gt SEWAGE EPIDEMIOLOGY

27

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji

28

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

29

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau In this study of wastewater treatment plants in three

Canadian cities selected illicit drugs including cocaine and its major metabolite benzoylecgonine (BE) amphetamine methamphetamine and ecstasy(ie MDMA) were detected in untreated wastewater

30

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau Cocaine was the most widely used illicit drug at a median

level for the 3 cities of 157 doses per day per 1000 people For the other drugs the median doses per day per 1000 people were 18 for amphetamine 45 for methamphetamine and 04 for ecstasy

Methamphetamine use was highest in the largest city and cocaine use was lowest in the smallest city

31

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Overall total levels of the studied illicit drugs and metabolites observed in surface water (in the low ngL range) were one and two orders of magnitude lower than those determined in effluent (in the ngL range) and influent sewage water (microgL range) respectively Drug consumption estimates pointed out cocaine as the most abused drug followed by cannabis amphetamine heroin ecstasy and methamphetamine which slightly differs from national official estimates (cannabis followed by cocaine ecstasy amphetamine and heroin)

32

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Extrapolation of the consumption data obtained for the studied area to Spain points out a total annual consumption of drugs of abuse of the order of 36 tonnes which would translate into 1100million Euros in the black market

33

Environ Int 2010 Jan36(1)75-84 Epub 2009 Nov 13 Drugs of abuse and their metabolites in the Ebro River basin occurrence in sewage and surface water sewage treatment plants removal efficiency and collective drug usage estimation Postigo C Loacutepez de Alda MJ Barceloacute D

Przetwarzanie strumieniowe informacji

34

• Techniki Monitoringu Środowiskowego
• Slide Number 2
• Slide Number 3
• Osobą przenoszącą patogeny może być każdy
• Osobą przenoszącą fałszywe informacje lub towary może być każdy
• Slide Number 6
• MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO
• MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO
• MOŻLIWE ZAGROŻENIA WOJEWOacuteDZTWA POMORSKIEGO
• Slide Number 10
• Slide Number 11
• Rozpoznanie
• Co jest przedmiotem rozpoznania
• Slide Number 14
• Slide Number 15
• Klasyczne Techniki Instrumentalne
• dr hab Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG
• Diagnostyka mikrobiologiczna
• Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR
• Roacuteżnice pomiędzy standardową reakcją PCR a real-time PCR
• System BAX Q7reg
• System BAX Q7reg to
• Rodzaje żywności badane przy użyciu BAXreg System
• Oznaczenia dostępne w BAXreg w kierunku
• Czas uzyskania wyniku w Systemie BAXreg
• Gas Chromatography Mass Spectrometry
• SEWAGE EPIDEMIOLOGY
• Epidemiologia ściekoacutew lub kanalizacji
• Slide Number 29
• Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau
• Illicit drugs in Canadian municipal wastewater and estimates of community drug use Chris Metcalfe Kathryn Tindale Hongxia Li a Angela Rodayan b Viviane Yargeau
• Slide Number 32
• Slide Number 33
• Przetwarzanie strumieniowe informacji