GENETYKA

STUDIA STACJONARNE II STOPNIA

Studia na kierunku GENETYKA oferowane

przez Uniwersytet Łódzki na Wydziale

Biologii i Ochrony Środowiska

są jedynymi tego typu w Polsce

Zasadnicze cele kształcenia

• Przekazanie szerokiej wiedzy o cytogenetyce i genetyce molekularnej człowieka.

• Przekazanie szerokiej wiedzy o procesach biochemi-cznych związanych z funkcjonowaniem genomów zwierząt, roślin i bakterii.

• Wykształcenie umiejętności identyfikowania i analizy struktury genomu człowieka, zwierząt, roślin i bakterii.

• Wykształcenie umiejętności wykorzystywania danych z zakresu genetyki molekularnej w biologii, biochemii, nauce o ewolucji, biogeografii i ochronie środowiska.

Absolwent kierunku GENETYKA może

znaleźć zatrudnienie jako genetyk w:

• placówkach naukowo-badawczych związanych

z ochroną zdrowia i środowiska,

• ośrodkach hodowli roślin i zwierząt,

• laboratoriach medycyny sądowej,

• szkolnictwie, po zaliczeniu dodatkowego kształcenia dla nauczycieli.

Po pierwszym semestrze nauki Student

wybiera katedrę lub zakład, w której planuje

przygotować pracę magisterską

Na kolejnych slajdach przedstawiono

propozycje tematów prac magisterskich na

kierunku GENETYKA planowanych do

realizacji w roku akademickim 2014/2015

Katedra Cytobiochemii Kierownik: prof. dr hab. Wanda M. Krajewska

prof. dr hab. Wanda M. Krajewska

• Zaburzenia kaskady sygnalizacyjnej, niestabilność genetyczna

i polimorfizm genów w aspekcie transformacji nowotworowej

prof. dr hab. Zofia Kiliańska

• Zaburzenia limfoproliferacyjne (białaczki B-komórkowe);

apoptoza komórek jednojądrzastych indukowana wybranymi

lekami

Katedra Cytobiochemii dr hab. Magdalena Bryś

dr hab. Anna Krześlak

• Modyfikacje epigenetyczne a nowotwory

• Receptory hormonów steroidowych a modyfikacje

epigenetyczne chromatyny

• Uszkodzenia i naprawa mitochondrialnego DNA w komórkach przewlekłej białaczki szpikowej wrażliwych i opornych na imatinib

• Ekspresja genów związanych z apoptozą w komórkach BCR/ABL+

• Regulacja cyklu komórkowego a naprawa DNA

• Udział RUNX2 w reakcji komórki na uszkodzenia DNA i różnicowaniu osteoblastów

• Znaczenie modyfikacji epigenetycznych w reakcji komórki na uszkodzenia DNA

• Zmienność genetyczna miRNA w nowotworach człowieka

• Analiza właściwości biologicznych syntetycznych tiocukrów w komórkach nowotworowych

• Określenie poziomu i aktywności białka OGG1 u osób z chorobą Alzheimera

Proponowane tematy prac magisterskich:

• Ekspresja genów szlaku BER oraz ocena stopnia ich metylacji w chorobie Alzheimera

• Zmienność genów naprawy DNA w chorobach depresyjnych

• Białka naprawy pęknięć dwuniciowych DNA jako cele dla spersonalizowanej terapii przeciwnowotworowej opartej na syntetycznej letalności

• Efektywność naprawy jedno i dwuniciowych pęknięć DNA w raku endometrium

• Naprawa DNA w warunkach hipoksji

• Znaczenie sumoilacji białek w naprawie DNA

Proponowane tematy prac magisterskich:

Źródła grafiki: materiały Katedry Genetyki Molekularnej UŁ

Pracownia Cytogenetyki Katedry Genetyki Ogólnej, Biologii Molekularnej i Biotechnologii Roślin

prof. dr hab. Regina Osiecka (regos@biol.uni.lodz.pl; pok. A333) - kierownik Pracowni dr hab. Alina Błaszczyk, prof. nadzw. UŁ (ablasz@biol.uni.lodz.pl; pok. A308)

dr Renata Kontek, st. wykładowca (renkon@biol.uni.lodz.pl; pok. A307) Tematyka badawcza: • badania biologicznych właściwości nanocząsteczek węglowych (nanodiamenty, nanorurki,

grafit) • cytotoksyczność (indukcja apoptozy i nekrozy, indeks mitotyczny) i genotoksyczność

związków o potencjalnej aktywności przeciwnowotworowej oraz antyoksydacyjnej • badania indukcji uszkodzeń DNA i ich naprawy w warunkach in vitro • badanie indukcji aberracji chromosomowych i mikrojąder oraz zaburzeń w przebiegu

mitozy (test A-T)

Materiał badawczy: • Prawidłowe (limfocyty) i nowotworowe komórki człowieka • komórki roślinne: merystemy korzeni pierwotnych Vicia faba

Metody: hodowle komórkowe, test MTT, test komety (analiza uszkodzeń i naprawy DNA),

cytometria przepływowa, podwójne barwienia fluorochromami, mikroskopia świetlna i fluorescencyjna, metoda TUNEL, metody immunofluorescencyjne pozwalające na

analizę struktur komórkowych (np. mikrotubul i wrzeciona podziałowego), cytofotometr (oznaczanie stopnia poliploidalności jąder komórkowych)

Pracownia Cytogenetyki Katedry Genetyki Ogólnej, Biologii Molekularnej i Biotechnologii Roślin

Tematyka planowanych prac magisterskich: • Badanie biologicznych właściwości nanocząstek węglowych • Badanie aktywności przeciwnowotworowej nowych związków z grupy

aminofosfonianów • Cytotoksyczność i genotoksyczność nowych analogów kurkuminy • Badanie indukcji apoptozy przez chalkony, związki o potencjalnym działaniu

przeciwnowotworowym • Cytotoksyczność i genotoksyczność nowo zsyntetyzowanych surfaktantów • Cytotoksyczność i genotoksyczność wybranych pestycydów na komórkach

roślinnych • Oznaczenie stopnia poliploidalności jąder komórkowych po działaniu

pendimetaliny (herbicyd) oraz test komety w komórkach Vicia faba

Obraz „komety” (metoda elektroforezy pojedynczych komórek w żelu agarozowym)

Metody podwójnych barwień fluorochromami (rozróżnianie komórek żywych, apoptotycznych i nekrotycznych)

Test MTT (ocena cytotoksyczności związków chemicznych)

Aberracje chromosomowe w komórkach roślinnych

http://www.usc.edu/dept/LAS/biosci/mcb/

dr hab. Paweł Stączek, prof. nadzw. UŁ - kierownik zakładu, dr hab. Anna Sajduda, prof. nadzw. UŁ , dr Anita Ciesielska, dr Marek Gadzalski, mgr Aleksandra Strzelczyk (doktorantka)

• Oznaczanie aktywności mutagennej i genotoksycznej nowosyntetyzowanych pochodnych tiosemikarbazydów jako potencjalnych leków antybakteryjnych

- Małocząsteczkowe związki (masa <400)

- Syntetyzowane w wyniku reakcji hydrazydu kwasu heterokarboksylowego z odpowiednim izotiocyjanianem

- Siarkoorganiczne odpowiedniki semikarbazydów – hydrazydów kwasu karbaminowego (aminomocznika)

ogólny wzór tiosemikarbazydu

Wykazują właściwości: antybakteryjne, przeciwgrzybicze,

przeciwwirusowe, przeciwpasożytnicze, owadobójcze i chwastobójcze,

przeciwnowotworowe, przeciwzapalne, antydepresyjne

Zakład Genetyki Drobnoustrojów

Zakład Genetyki Drobnoustrojów

• Poszukiwanie polimorfizmów sekwencji mikrosatelitarnych dla

celów genotypowania izolatów klinicznych dermatofitów

• komputerowe analizy genomów

dermatofitów

Trichophyton

Microsporum

Epidermophyton

• poszukiwanie wysokozmiennych

sekwencji powtarzających się do

genotypowania

• genotypowanie

Ocena różnorodności biologicznej

wykrywanie gatunków kryptycznych

DNA barcoding (markery mitochondrialne)

Filogeneza molekularna

pochodzenie

i różnicowanie się fauny

bezkręgowej Europy

Filogeografia

ocena dróg i dynamiki rozprzestrzeniania

się gatunków inwazyjnych przy pomocy

markerów molekularnych

Wykrywanie

i molekularna

identyfikacja

pasożytów

zwierząt

bezkręgowych

http://invertebrates.uni.lodz.pl

źródła grafiki: rgbstock, Senckenberg World of Biodiversity, birdtree.org, StudyBlue, Wikipedia, own works

http://invertebrates.uni.lodz.pl

Proponowane tematy prac magisterskich:

Filogeneza molekularna wybranych grup skorupiaków

obunogich Europy rekonstruowana na podstawie markerów

mitochondrialnych i jądrowych

DNA barcoding skorupiaków w wodach Europy Środkowej

- użyteczność różnych markerów mitochondrialnych

w identyfikacji gatunków

źródła grafiki: rgbstock, Senckenberg World of Biodiversity, birdtree.org, StudyBlue, Wikipedia, own works

http://invertebrates.uni.lodz.pl

Polimorfizm markerów COI, 16S oraz ITS jako wyznacznik struktury

genetycznej inwazyjnego skorupiaka w rodzimym obszarze występowania

Diagnostyka molekularna mikrosporidioz inwazyjnych gatunków

skorupiaków w Europie

Proponowane tematy prac magisterskich:

źródła grafiki: rgbstock, Senckenberg World of Biodiversity, birdtree.org, StudyBlue, Wikipedia, own works

Kierownicy Katedr i Zakładów, do których można

zgłaszać się w związku z realizacją pracy magisterskiej

• Prof. dr hab. Wanda Małgorzata Krajewska – Katedra Cytobiochemii

• Dr hab. Katarzyna Woźniak, prof. nadzw. UŁ – Katedra Genetyki Molekularnej

• Prof. dr hab. Regina Osiecka – Pracownia Cytogenetyki w Katedrze Genetyki Ogólnej,

Biologii Molekularnej i Biotechnologii Roślin

• Prof. dr hab. Janusz Maszewski – Katedra Cytofizjologii

• Dr hab. Paweł Stączek, prof. nadzw. UŁ – Zakład Genetyki Drobnoustrojów

• Dr hab. Elżbieta Żądzińska, prof. nadzw. UŁ – Katedra Antropologii

• Dr hab. Michał Grabowski, prof. nadzw. UŁ – Zakład Biogeografii i Ekologii

Bezkręgowców w Katedrze Zoologii Bezkręgowców i Hydrobiologii