Kul Gen Mikroba

8/18/2019 Kul Gen Mikroba

1/23

MIKROBIOLOGIMIKROBIOLOGIDASARDASAR

http://mikrobiolunsoed.wordpress.com/http://mikrobiolunsoed.wordpress.com/http://mikrobiolunsoed.wordpress.com/http://www.animationartgallery.com/artpages/superheroart.html


2/23

1. PENDAHULUAN

2. PENGGOLONGAN MIKROORGANISME

3. STRUKTUR DAN FUNGSI SEL MIKROORGANISME

4. PERTUMBUHAN MIKROORGANISME

5. GENETIKA MIKROORGANISME

6. BIOENERGETIKA MIKROORGANISME

7. PENGENDALIAN PERTUMBUHAN MIKROORGANISME8. INTERAKSI DAN PENYEBARAN MIKROORGANISME

9. PERANAN MIKROORGANISME

POKOK BAHASAN

http://www.animationartgallery.com/artpages/superheroart.html


3/23

I. PENDAHULUAN

II. EVOLUSI DAN KERAGAMAN MIKROBA

III. TINGKATAN TAKSONOMI

IV. SISTEM KLASIFIKASI

V. KARAKTERISTIK UTAMA YANG DIGUNAKAN DALAM

TAKSONOMI

VI. FILOGENI MIKROBA

VII. DIVISI UTAMA ORGANISME

VIII. BERGEYS MANUAL OF SYSTEMATI! BA!TERIOLOGY

I". GARIS BESAR FILOGENI DAN KERAGAMAN PROKARIOT

POKOK BAHASAN

#2. PENGGOLONGAN MIKROORGANISME


4/23

I. PENDAHULUAN


Taksonomi adalah ilmu klasifikasi biologis

Klasifikasi adalah penataan organisme ke dalam kelompok-

kelompok (taksa)

Nomenklatur adalah pemberian nama untuk kelompok-

kelompok taksonomi

dentifikasi adalah penentuan isolat tertentu pada takson

tertentu

Peranan taksonomi mikroba!

"emungkinkan ilmu#an mengorganisasikan se$umlah

besar pengetahuaann%a

"emungkinkan ilmu#an membuat prediksi dan kerangkahipotesis tentang organisme

"enempatkan organisme dalam kelompok-kelompok

bermakna dengan memberi nama se&ara tepat' $adi akan

mempermudah komunikasi ilmiah

Penting untuk identifikasi mikroorganisme se&ara tepat


5/23

Sistematik adalah ka$ian ilmiah organisme dengan tu$uan

akhir untuk mengkarakterisasi dan menempatkan organisme

dengan &ara %ang teratur

Taksonomi mikroba saat ini sedang memasuki perode

perubahan besar %ang disebabkan oleh penggunaan teknik

molekuler


6/23

I. PENDAHULUAN





TAKSONOMI





POKOK BAHASAN



7/23



Bumi berumur kira-kira '* mil%ar tahun dan sisa-sisa fosil

sel prokariotik berumur +',-+' mil%ar tahun terdapat dalam

stromatolit dan batuan sedimen

Stromatolit adalah batuan berlapis %ang dibentuk dari

penggabungan sedimen mineral men$adi hamparan

mikroba (mi&robial mats)

Prokariot pertama mungkin bersifat anaerob

Sianobakteri aerobik mungkin mun&ul .',-+'/ mil%ar

tahun %ang lalu


8/23

Hasil penelitan 0arl 1oese dan ka#an-ka#an

men%arankan bah#a organisme dibagi dalam tiga

domain!

2 3ukaria-meliputi seluruh organisme eukariotik

. Bakteria-terdiri dari organisme prokariotik %ang mempun%ai

r4NA bakterial and lipid membran terutama berupa diasil

gliserol eter

+ Ar&haea-terdiri dari organisme prokariotik %ang mempun%ai

r4NA ar&haeal dan lipid membran terutama berupada

isoprenoid gliseral dieter atau turunan diglesrol tetraeter


9/23

The Three-Domain SystemThe Three-Domain System


10/23

Sel eukariotik modern %ang mun&ul kurang lebih 2'

mil%ar tahun %ang lalu berasal dari prokariot

Hipotesis ! perkembangan kloroplast dan mitokondria

merupakan pelipatan (in5aginasi) membran plasma dan

kemudian membentuk ruang- ruang (&ompartmentali6ation)

dengan fungsi tertentu


11/23

Hipotesis (hipotesis endosimbiotik) men%arankan sebagai

berikut!

Proses pertama pembentukan sel eukariot adalah pembentuk

nukleus (mungkin fusi bakteri dan ar&haea purba) Kloroplast dibentuk ketika bakteri fotosintetik %ang hidup

bebas bersimbiosis dengan sel eukariotik primitif

(sianobakteria dan proklron disarankan sebagai kandidat

%ang paling kuat)

"itokondria mungkin terbentuk melalui proses %ang sama

(tetua Agroba&terium' 4hi6obium' dan riketsia men$adi

kandidatn%a)

Hopotesis endosimbiotik mendapat dukungan kuat dari

penemuan sianobakterium %ang berendosimbiotik dengan

protista biflagelata (0%anophora parado7a)8 sianobakterium

berfungsi sebagai &hloroplast 0%anophora parado7a8

endosimbiotik ini dikenal sebagai sianel (&%anelle)


12/23

I. PENDAHULUAN





TAKSONOMI





POKOK BAHASAN



13/23



Tingkatan taksonomi (dari ba#ah ke atas) adalah!

spesies'

genus'

famili'

ordo'

klas'

kera$aan (kingdom)8

Namun' ahli mikrobiologi seringkali menggunakan nama seksi

(suatu pengelompokan %ang kurang formal) %ang bersifat

deskriptif untuk kelompok-kelompok organisme tertentu'

seperti metanogen' purple ba&teria' bakteri asam laktat' dan

lain-lain


14/23

9alur adalah populasi organisme %ang dapat dibedakan dari

sekurang-kurang beberapa pupulasi lain dalam suatu

kategori taksonomik' galur dianggap berasal dari organisme

tunggal atau isolat kultur tunggal

Bio5ar : berbeda se&ara biokimia#i atau fisiologis

"orfo5ar : berbeda se&ara morfologi

Sero5ar : berbeda sifat antigenik

9alur tipe (T%pe strain) adalah galur suatu spesies %ang

dika$i pertama kali (%ang paling rin&i dikarakterisasi)' galur

ini tidak harus anggota %ang paling me#akili

9enus adalah kelompok spesies (satu atau lebih) %ang telah

ditentukan dengan sangat baik %ang se&ara $elas terpisah

(berbeda) dari genera lain


15/23

;alam sistem nomenklatur binomial %ang dia$ukan oleh

0arl 5on


16/23

I. PENDAHULUAN





TAKSONOMI





POKOK BAHASAN



17/23



Klasifikasi Alami (Natural &lassifi&ation) :

penataan organisme ke dalam kelompok-kelompok %ang

anggota-anggotan%a mempn%ai ban%ak kesamaan sifat dan

men&erminkan seban%ak mungkin sifat biologis organisme


18/23

Sistem (Pheneti& s%stems) adalah mengelompokkan

organisme didasarkan atas kesamaan se&ara keseluruhan

Seringkali berupa suatu sistem alami %ang didasarkan atas

kesamaan karakter

Tidak tergantung pada analisis filogenetik

"enggunakan =un#eighted traits>

Sistem terbaik $ika membandingkan seban%ak mungkin sifat(attributes)


19/23

Taksomi Numerik (Numeri&al ta7onom%)

nformasi sifat suatu organisme dikon5ersikan ke bentuk

%ang sesuai untuk analisis numerk dan dibandingkan

menggunakan komputer

Ada atau tidakn%a sekuran-kurangn%a ,/ (sebaikn%a

beberapa ratus) karakater dibandingkan8 karakter tersebut

di antaran%a karakter morfologi' biokimia#i' dan fisiologi) Koefisien asosiasi ditentukan di antara karakter-karakter

%ang dimiliki oleh dua organisme


20/23

Koefisien kesesuaian sederhana (Simple mat&hing

&oeffi&ient) : proporsi %ang sesuai (mat&h) baik untuk

karakter %ang ada maupun tidak ada

Koefisien ?a&&ard (?a&&ard &oeffi&ient) : mengabaikan

karakter-karakter %ang tidak ada pada kedua organisme

Nilai-nilai tersebut diatur untuk membentuk matriks

kesamaan (similarit% matri7)8 organisme dengan kesamaantinggi dikelompokkan bersama dalam fenon (phenons)

Perbedaan (signifi&an&e) fenon tidak selalu $elas terlihat

tetapi fenon dengan kesamaan /@ seringkali dianggap

satu spesies (bakteri)


21/23

Sistem (Pheneti& s%stems) adalah mengelompokkan

organisme didasarkan atas kesamaan se&ara keseluruhan

Seringkali berupa suatu sistem alami %ang didasarkan atas

kesamaan karakter

Tidak tergantung pada analisis filogenetik

"enggunakan =un#eighted traits>

Sistem terbaik $ika membandingkan seban%ak mungkin sifat(attributes)


22/23

Sistem filogenetik (filetik) Ph%logeneti& (ph%leti&)

-pengelompokan organisme didasarkan pada hubungan

e5olusioner

2 ntuk prokariot adalah sulit untuk mengetahui hubungan

e5olusi karena kekurangan &atatan fosil %ang baik

. Pembandingan langsung materi genetik dan produk gen

seperti r4NA dan protein dapat digunakan untuk mengatasikesulitan tersebut di atas


23/23

Kul Gen Mikroba

Documents

Transcript of Kul Gen Mikroba