EwaTykarska AUTOREFERAT...się w supramolekularne architektury o określonej strukturze i funkcji...
Transcript of EwaTykarska AUTOREFERAT...się w supramolekularne architektury o określonej strukturze i funkcji...
1
Załącznik nr 2
Ewa Tykarska
AUTOREFERAT
Katedra Technologii Chemicznej Środków Leczniczych
Wydział Farmaceutyczny
Uniwersytet Medyczny w Poznaniu
Poznań 2015
2
1. Imię i nazwisko: Ewa Tykarska
2. Posiadane dyplomy i stopnie naukowe
• 1981 – Magister Nauk Biologicznych. Dyplom Wydziału Biologii i Nauk
o Ziemi Uniwersytetu im. A. Mickiewicza w Poznaniu w zakresie biologii ze
specjalnością biologii molekularnej, specjalizacją biochemii. Praca magisterska
pt. „Tb3+ jako marker fluoroscencyjny w badaniach interakcji tRNA z różnymi
ligandami”, promotor: prof. dr hab. Jacek Augustyniak.
• 1984 – Doktor Nauk Chemicznych. Dyplom Wydziału Chemii Uniwersytetu
im. A. Mickiewicza w Poznaniu. Rozprawa doktorska pt. „Badania strukturalne
cząsteczek z przeszkodami przestrzennymi”, promotor: prof. dr hab. Zofia
Kosturkiewicz.
3. Przebieg pracy zawodowej
1981-1982 Zakład Krystalografii, Wydział Chemii Uniwersytetu im. Adama
Mickiewicza w Poznaniu – pracownik naukowo-techniczny
1982-1984 Zakład Krystalografii, Wydział Chemii Uniwersytetu im. Adama
Mickiewicza w Poznaniu – asystent
1984-1986 Zakład Krystalografii, Wydział Chemii Uniwersytetu im. Adama
Mickiewicza w Poznaniu – asystent z doktoratem
1986-2005 Zakład Krystalografii, Wydział Chemii Uniwersytetu im. Adama
Mickiewicza w Poznaniu – adiunkt
2006-obecnie Katedra Technologii Chemicznej Środków Leczniczych, Wydział
Farmaceutyczny Uniwersytetu Medycznego im. Karola
Marcinkowskiego w Poznaniu – adiunkt
3
4. Wskazanie osiągnięcia wynikającego z art. 16 ust. 2 ustawy z dnia 14 marca
2003 r. o stopniach naukowych i tytule naukowym oraz o stopniach i tytule
w zakresie sztuki (Dz. U. nr 65, poz. 595 ze zm.):
a) Tytuł osiągnięcia naukowego:
Supramolekularna organizacja kwasu glicyryzynowego, jego soli oraz
farmakologicznie aktywnych związków pokrewnych.
b) Osiągnięcia naukowe będące podstawą ubiegania się o tytuł doktora
habilitowanego przedstawiają cykl 4 powiązanych tematycznie publikacji
naukowych.
Analiza scientometryczna:
Sumaryczny Impact Factor (IF) dla 4 publikacji wynosi 15.9 (w roku wydania
według Journal Citation Reports),
Punktacja Ministerstwa Nauki MNiSW = 145
H1. Ewa Tykarska, Stanisław Sobiak, Maria Gdaniec
Supramolecular Organization of Neutral and Ionic Forms of Pharmaceutically
Relevant Glycyrrhizic Acid – Amphiphile Self-Assembly and Inclusion of
Small Drug Molecules.
Crystal. Growth & Design, 2012, 12, 2133-2137.
IF = 4.689;; punktacja KBN/MNiSW = 40
H2. Ewa Tykarska, Maria Gdaniec
Toward Better Understanding of Isomorphism of Glycyrrhizic Acid and its
Mono- and Dibasic Salts.
Crystal. Growth & Design, 2013, 13, 1301-1308.
IF = 4.558;; punktacja KBN/MNiSW = 40
4
H3. Ewa Tykarska, Zbigniew Dutkiewicz, Daniel Baranowski, Zofia Gdaniec,
Maria Gdaniec
Effect of neighbors on the conformational preferences of glycosidic linkages in
glycyrrhizic acid and its mono- and dideprotonated forms: X-ray, NMR and
computational studies.
Crystal. Growth & Design, 2014, 14, 5871−5880.
IF= 4.558;; punktacja KBN/MNiSW = 40
H4. Ewa Tykarska, Maria Gdaniec
Solid State Supramolecular Architecture of Carbenoxolone – Comparative
Studies with Glycyrrhetinic and Glycyrrhizic Acids.
Acta Cryst. B, 2015, 71, 25-33.
IF= 2.095;; punktacja KBN/MNiSW = 25
*Do wniosku o wszczęcie postępowania habilitacyjnego dołączono oświadczenia
wszystkich współautorów określające udział każdego z nich w przygotowanie
poszczególnych prac (załącznik 5). Oświadczenia dotyczące wkładu habilitanta w
powstanie publikacji znajdują się w załączniku 4.
Z tematyką kwasu glicyryzynowego związane są trzy publikacje przeglądowe
(publikacje 42-44, załącznik 4), które nie zostały włączone do cyklu prac
oryginalnych stanowiących podstawę ubiegania się o tytuł doktora habilitowanego.
W publikacjach 42 i 43 zostały przedstawione badania z ostatnich lat dotyczące
właściwości farmakologicznych kwasu glicyryzynowego i jego aglikonu kwasu
glicyretynowego oraz możliwości zastosowania wyżej wymienionych związków
w nowoczesnej technologii farmaceutycznej. Praca 43 omawia zagrożenia dla
zdrowia płynące z niekontrolowanego spożycia lukrecji, której głównym,
aktywnym biologicznie składnikiem jest kwas glicyryzynowy.
5
5. Komentarz dotyczący najważniejszych osiągnięć naukowych zawartych
w pracach będących przedmiotem postępowania habilitacyjnego
5.1 WPROWADZENIE
Chemia supramolekularna jest dziedziną nauki zajmującą się badaniem złożonych
układów chemicznych powstających samorzutnie w wyniku łączenia komponentów
molekularnych za pomocą międzycząsteczkowych, odwracalnych, niekowalencyjnych
oddziaływań takich, jak wiązania wodorowe, oddziaływania van der Waalsa,
oddziaływania typu π-π lub oddziaływania elektrostatyczne typu jon-jon, czy też jon-dipol.
Tworzące się agregaty mają zwykle odmienne właściwości fizykochemiczne od
wchodzących w ich skład poszczególnych komponentów. Poszukiwanie
samoorganizujących się układów tj. układów zdolnych do spontanicznego organizowania
się w supramolekularne architektury o określonej strukturze i funkcji jest przedmiotem
zainteresowań chemii, biologii i medycyny.1-3
Materia ożywiona dostarcza wielu przykładów funkcjonalnych systemów
supramolekularnych ważnych z punktu widzenia procesów fizjologicznych. Budowa błon
komórkowych, podwójnej helisy DNA, oddziaływania typu receptor-cząsteczka
sygnałowa, różne formy transportu, reakcje enzymatyczne, czy reakcje obronne organizmu
(np. oddziaływania przeciwciało-antygen) zawdzięczają swoje funkcje zdolności
cząsteczek do samoorganizacji i tzw. „rozpoznania molekularnego”. Dążenie badaczy do
odwzorowania tego typu układów w warunkach in vitro prowadzi do poznania istoty oraz
mechanizmów oddziaływań niekowalencyjnych, a także ich wpływu na strukturę i funkcję
supramolekularnych architektur. Pozwala to z jednej strony pełniej zrozumieć procesy
zachodzące w komórkach organizmów żywych, a z drugiej nadaje badaniom charakter
aplikacyjny.4-6
Rozwój chemii supramolekularnej wywiera ogromny wpływ na farmację i medycynę.
Poznanie właściwości układów supramolekularnych pozwala na: (a) projektowanie
bardziej skutecznych substancji aktywnych (API - Active Pharmaceutical Ingredient) o
grupach funkcyjnych i konformacji komplementarnej do struktury układu docelowego (np.
centrum aktywnego enzymu, czy receptora), (b) opracowanie nowoczesnych systemów
dostarczania leku (DDS - Drug Delivery System) takich, jak micele, mikrosfery, liposomy,
kropki kwantowe, dendrymery, nanocząstki polimerowe i nieorganiczne, czy kompleksy
typu gospodarz-gość, w których uczestniczą np. cyklodekstryny. To właśnie systemy
dostarczania leków ułatwiają kontrolę transportu i uwalniania leku w organizmie,
6
modyfikują właściwości farmakokinetyczne i profil dystrybucji substancji aktywnej,
zwiększają jej biodostępność i obniżają działania niepożądane.7-15
Charakterystyka układów supramolekularnych w roztworach jest znacznie utrudniona
ze względu na ich labilność. Rentgenowska analiza strukturalna umożliwia określenie
konformacji cząsteczek oraz ich supramolekularnej organizacji w fazie krystalicznej, co
może prowadzić do ustalenia zależności pomiędzy strukturą i funkcją, przyczynić się do
lepszego zrozumienia procesów asocjacji cząsteczek, czy wpływu sposobu organizacji
cząsteczek na właściwości fizykochemiczne związków.
5.2 CHARAKTERYSTYKA I UZASADNIENIE WYBORU ZWIĄZKÓW
BĘDĄCYCH PRZEDMIOTEM BADAŃ
Obiektem moich naukowych zainteresowań jest saponina - kwas glicyryzynowy oraz
jego półsyntetyczny, aktywny biologicznie związek pokrewny – karbenoksolon (Schemat
1)
Schemat 1
Saponiny stanowią niezwykle ciekawy obiekt badań dla chemii supramolekularnej.
Związki te są metabolitami wtórnymi szeroko rozpowszechnionymi w świecie roślin.
Wytwarzane są również przez niższe zwierzęta morskie (np. szkarłupnie) oraz przez
niektóre owady.16-17 Należą do glikozydów, jednej z największych i najbardziej
zróżnicowanych grup substancji biologicznie czynnych występujących w świecie
organizmów żywych.
7
Saponiny wykazują niezwykle szerokie spektrum działań farmakologicznych.16,18,19
Zbudowane są z części cukrowej - hydrofilowego glikonu oraz aktywnej biologicznie
części niecukrowej – hydrofobowego aglikonu połączonych wiązaniem glikozydowym. Ze
względu na charakter aglikonu związki te dzielone są na dwie zasadnicze grupy: saponiny
triterpenowe i steroidowe. Amfifilowa budowa cząsteczki określa właściwości
fizykochemiczne saponin, które są związkami powierzchniowo czynnymi zdolnymi do
tworzenia supramolekularnych układów np. micel20 oraz podnoszenia rozpuszczalności
substancji hydrofobowych. Nazwa saponin pochodzi od łacińskiego słowa „sapo”
oznaczającego mydło, gdyż ich wodne roztwory po wstrząśnięciu wytwarzają pianę.16
Pomimo dużego zainteresowania tą grupą związków oraz ciągle wzrastającą liczbą
wyizolowanych i scharakteryzowanych saponin, w światowym piśmiennictwie istnieje
bardzo niewiele informacji dotyczących ich trójwymiarowej struktury oraz sposobu
asocjacji cząsteczek w ciele stałym. W Bazie Danych CSD (Cambridge Structural
Database version 5.35 updates May 2014)21 znajduje się zaledwie 25 struktur saponin
triterpenowych (20 o szkielecie tetracyklicznym i 5 o szkielecie pentacyklicznym),
3 prosapogeniny typu β-amyryny oraz 15 saponin steroidowych o aglikonie typu
cholostanu lub spirostanu. Z tych względów uznałam za celowe podjęcie badań nad tą
ważną, ale mało poznaną pod względem strukturalnym grupą związków bioaktywnych.
Kwas glicyryzynowy(GA)
Jednym z przedstawicieli saponin triterpenowych, od lat cieszącym się dużym
zainteresowaniem, jest kwas glicyryzynowy (GA). Związek ten jest głównym, aktywnym
biologicznie składnikiem korzenia lukrecji (od 2 do 25% suchej masy w zależności od
gatunku), rośliny znanej z właściwości leczniczych już w czasach starożytnych.22-24
Występuje w postaci mieszaniny soli potasowej i wapniowej nazywanej glicyryzyną.16
GA, jako naturalna substancja posiadająca właściwości immunomodulacyjne25
charakteryzuje się niezwykle szerokim spektrum działań farmakologicznych. Liczne
badania eksperymentalne i kliniczne26 wykazały, że GA i jego sole mogą być skutecznie
stosowane w infekcjach wirusowych27-29, chorobach nowotworowych30,31, zapaleniu
wątroby28-29, wrzodach żołądka i jelit32 oraz alergiach.33-34 Użyte w systemach dostarczania
leków jako substancje aktywne lub pomocnicze zwiększają efektywność terapii
celowanych.35,36
8
Cząsteczka GA jest zbudowana z hydrofilowej części cukrowej, którą stanowi dimer
kwasu glukuronowego (glikon) oraz hydrofobowej reszty kwasu glicyretynowego
będącego aglikonem typu β-amyryny (Schemat 1a). Ze względu na obecność trzech grup
karboksylowych, kwas glicyryzynowy może występować w formie neutralnej oraz
zjonizowanej o różnym stopniu deprotonacji, co jest o tyle istotne, że w przemyśle
farmaceutycznym przeprowadzanie związków kwasowych w różnego typu sole jest
jednym ze sposobów poszukiwania substancji czynnej charakteryzującej się lepszą
rozpuszczalnością w wodzie, a tym samym większą efektywnością kliniczną. Z powodu
amfifilowej budowy, GA jest związkiem powierzchniowo czynnym, który w wodnych
roztworach agreguje tworząc micele (krytyczne stężenie miceli CMC = 0.05-1.0 mM)20,37,
a w wyższych stężeniach żeluje.20,38
Zarówno kwas glicyryzynowy, jak i jego sole podnoszą rozpuszczalność, stabilność
i bioaktywność wielu, nierozpuszczalnych w wodzie substancji leczniczych. Badania
ostatnich lat wykazały, że właściwości te związane są ze zdolnością GA do tworzenia
kompleksów z hydrofobowymi lekami.37,39,40 Tworzenie kompleksów jest jedną z metod
stosowaną w celu zwiększenia efektywności farmakologicznej związku aktywnego,
poprzez zmianę jego właściwości fizykochemicznych, kontrolę transportu i uwalniania
leku w organizmie. W medycynie od wielu lat stosowane są cyklodekstryny tworzące
z lekami kompleksy typu „gość – gospodarz”, w których cyklodekstryna pełni funkcję
gospodarza, a kompleksowany związek hydrofobowy jest gościem.41-44 Jednak budowa
cyklodekstryn - hydrofilowa powierzchnia i niepolarna, wewnętrzna kieszeń ograniczają
zastosowanie tych związków do leków o określonej wielkości, kształcie oraz
hydrofobowości. Ze względu na swoją budowę, kwas glicyryzynowy jest doskonałym
kandydatem do tworzenia kompleksów inkluzyjnych z lekami. W przeciwieństwie do
cyklodekstryn jest cząsteczką o strukturze liniowej, a więc nie występują tutaj
rygorystyczne restrykcje dotyczące wielkości cząsteczki „gościa”. Obecność w GA
hydrofilowego i hydrofobowego fragmentu sprawia, że oddziaływania pomiędzy
cząsteczkami „gospodarza” i „gościa” mogą być różnej natury - oddziaływania
hydrofobowe, wiązania wodorowe, a także jonowe w przypadku soli GA. Według
doniesień literaturowych, w porównaniu z cyklodekstrynami, kompleksy GA
charakteryzują się dużo wyższą stabilnością.40,45
Badania NMR i spektroskopii optycznej20 dostarczają pewnych informacji na temat
budowy i stechiometrii supramolekularnych kompleksów kwasu glicyryzynowego. Brak
jest jednak dokładnych informacji na temat molekularnej struktury tworzonych
9
kompleksów. Sugeruje się powstawanie cyklicznych dimerów GA, które połączone
międzycząsteczkowymi wiązaniami wodorowymi, tworzą hydrofobową kieszeń.40 Tak
więc, powstawanie kompleksów typu „gospodarz-gość” byłoby podobne, jak w przypadku
cyklodekstryn. Jednakże amfifilowa budowa cząsteczki sprawia, że GA w wodnych
i alkoholowych roztworach może tworzyć micele. Ponadto wykryto różnego typu agregaty,
w których w zależności od stężenia, różna liczba cząsteczek „gościa” może przypadać na
cząsteczkę „gospodarza”.37 Mimo wielu przeprowadzonych badań zdolność GA do
tworzenia kompleksów i ich rozpuszczalność w wodzie jest nieprzewidywalna. Nieznany
jest też sposób asocjacji cząsteczek GA i jego soli.
W mojej ocenie lepsze zrozumienie licznych właściwości kwasu glicyryzynowego
wymagało znajomości jego molekularnych i supramolekularnych właściwości
strukturalnych. Celem podjętych badań rentgenograficznych było ustalenie sposobu
agregacji neutralnych i zjonizowanych form kwasu glicyryzynowego. Ze względu na
zdolność GA do modyfikowania właściwości leków, zostały podjęte próby otrzymania
krystalicznych kompleksów kwasu glicyryzynowego z biologicznie czynnymi związkami
zarówno rozpuszczalnymi, jak i nierozpuszczalnymi w wodzie.
Uzyskane wyniki miały szansę rzucić światło na sposób asocjacji cząsteczek GA
w roztworach i w żelu oraz przyczynić się do wzbogacenia wiedzy na temat mechanizmów
tworzenia kompleksów GA wykazujących aktywność biologiczną. W dalszej perspektywie
powinny pozwolić na zaprojektowanie całego szeregu nowych pochodnych o określonych
właściwościach umożliwiających transport różnego rodzaju leków.
Karbenoksolon (CBXH2)
Podobnie jak naturalnie występujące saponiny, ich związki pokrewne również
posiadają szerokie spektrum aktywności biologicznej. Prowadzone od wielu lat badania
wykazały, że niektóre syntetyczne analogi GA o właściwościach przeciwzapalnych,
przeciwwrzodowych, przeciwwirusowych i immunostymulacyjnych charakteryzują się
lepszymi właściwościami farmakokinetycznymi, większą skutecznością działania
i obniżoną toksycznością w stosunku do tradycyjnie stosowanych leków.46-48
Jednym z biologicznie czynnych analogów kwasu glicyryzynowego jest karbenoksolon
- CBXH2 (Schemat 1b), którego dobrze rozpuszczalna w wodzie sól disodowa została
w latach 60-tych ubiegłego stulecia zarejestrowana w Wielkiej Brytanii jako lek
przeciwwrzodowy.49 W CBXH2 słabo hydrofilowa, stosunkowo niewielka reszta kwasu
10
bursztynowego zastępuje duży, silnie hydrofilowy dimer kwasu glukuronowego GA.
Związek ten został włączony w prowadzone przeze mnie badania, gdyż: (1)
w przeciwieństwie do amfifilowego charakteru kwasu glicyryzynowego, CBXH2 jest
cząsteczką o właściwościach lipofilnych, trudno rozpuszczalną w wodzie, (2) podobnie jak
kwas glicyryzynowy, CBXH2 może występować w formie neutralnej lub zjonizowanej
o różnym stopniu deprotonacji, (3) struktura karbenoksolonu i jego soli w fazie stałej nie
została dotąd określona. Porównanie supramolekularnej organizacji amfifilowych
cząsteczek GA i lipofilnych CBXH2 oraz ich form anionowych powinno prowadzić do
lepszego zrozumienia wpływu niekowalencyjnych, odwracalnych oddziaływań na
właściwości fizykochemiczne tych pokrewnych substancji.
5.3 OMÓWIENIE WYNIKÓW
Z powodu żelujących właściwości kwasu glicyryzynowego ustalenie powtarzalnych
warunków krystalizacji oraz otrzymanie monokryształów odpowiednich do badań
rentgenograficznych okazało się zadaniem niezwykle trudnym. W początkowym okresie,
wszelkie próby krystalizacji kończyły się niepowodzeniem. Określenie minimalnego
stężenia rozpuszczalnika, który zapobiegał żelowaniu oraz optymalizacja warunków
krystalizacji dla GA i jego monoamonowej soli zajęły prawie trzy lata i wymagały
zastosowania techniki wiszącej kropli stosowanej do krystalizacji białek. Wszystkie
kryształy były bardzo nietrwałymi solwatami, które trzymane w roztworze ulegały
rozkładowi, a wyjęte z roztworu macierzystego bardzo szybko pękały i ulegały
dezintegracji, co w dużej mierze utrudniało rejestrowanie dobrej jakości danych
dyfrakcyjnych. Biorąc pod uwagę problemy związane z krystalizacją GA przestaje dziwić
tak niewielka liczba struktur saponin zdeponowanych w krystalograficznej bazie danych
CSD i brak systematycznych badań rentgenograficznych nad tą interesującą grupą
związków. Podobną nietrwałością charakteryzowała się również większość otrzymanych
kryształów karbenoksolonu.
Ze względu na tendencję GA i jego soli do krystalizacji w postaci solwatów,
szczególnie niewdzięcznym i żmudnym zadaniem okazało się otrzymanie kokryształów
GA z biologicznie aktywnymi związkami (API). Dodatkowym utrudnieniem
prowadzonych badań był izomorfizm GA i jego soli oraz ich kompleksów z API, gdyż
identyfikacja składu kryształu wymagała pełnego pomiaru dyfrakcyjnego. Uzyskanie
struktur kompleksów zajęło kilka lat. W tym czasie zostały wykonane pomiary
11
i rozwiązane struktury dla ponad 80 kryształów, lecz efekt tych prac był mało
satysfakcjonujący, gdyż większość dobrze rozpraszających kryształów okazała się
wcześniej otrzymanymi solwatami GA lub jego soli. W rezultacie, jedynie dla kompleksu
soli monoamonowej (AGA) z kwasem p-aminobenzoesowym (PABA) uzyskano dobrej
jakości dane dyfrakcyjne. Próby krystalizacji AGA-PABA wykazały, że elementem
warunkującym powstanie kryształów kompleksu był wzajemny stosunek
AGA:PABA:metanol:woda. Ścisła zależność pomiędzy tymi czterema składnikami układu
w znacznym stopniu utrudniała optymalizację warunków, a niewielkie zmiany prowadziły
do otrzymania żelu, kryształów AGA, PABA lub kompleksu AGA-PABA.
Celem badań przedstawionych w publikacji H1 było określenie trójwymiarowej
struktury cząsteczki i sposobu agregacji obojętnej i anionowej formy kwasu
glicyryzynowego. W początkowej fazie prac zostały ustalone warunki krystalizacji dla GA
i jego monoamonowej soli (AGA), która wykazuje podobne właściwości biologiczne do
GA i jest stosowana na szeroką skalę w różnych gałęziach przemysłu m. in. w przemyśle
spożywczym, tytoniowym, farmaceutycznym i kosmetycznym.50,51 Z uwagi na
właściwości kompleksujące kwasu glicyryzynowego i jego soli oraz brak przekonującej
teorii wyjaśniającej wzrost rozpuszczalności wielu lipofilnych leków prowadzone były
również próby kokrystalizacji AGA z wieloma API rozpuszczalnymi i nierozpuszczalnymi
w wodzie. Odpowiedniej wielkości kryształy zostały otrzymane jedynie dla kompleksu
AGA z kwasem p-aminobenzoesowym (PABA).
Ku mojemu ogromnemu zaskoczeniu wszystkie badane kryształy okazały się
praktycznie izomorficzne. Konformacja cząsteczki kwasu i jego formy monoanionowej,
a także supramolekularna organizacja GA, AGA oraz kompleksu AGA-PABA były niemal
identyczne. Rentgenowska analiza strukturalna wykazała, że budowa kwasu i jego anionu
przypomina kształtem literę L, której podstawę stanowią dwie skręcone względem siebie
reszty kwasu glukuronowego (Rysunek 1).
12
Rysunek 1. Konformacja cząsteczki GA
Przedstawione struktury potwierdziły konfigurację β obu wiązań glikozydowych oraz
pozwoliły na identyfikację grupy karboksylowej GA, która w pierwszej kolejności ulega
deprotonacji. Badania wykazały przede wszystkim, że asocjacja amfifilowych cząsteczek
saponiny prowadzi do powstania struktury warstwowej (Rysunek 2a) z naprzemiennie
ułożonymi obszarami hydrofilowymi (dimer kwasu glukuronowego) i hydrofobowymi
(szkielet triterpenowy). Podstawową jednostką supramolekularnej budowy kryształów jest
dwuwymiarowy agregat zbudowany z cukrowej platformy, której obie powierzchnie
pokryte są luźno rozmieszczonymi, nie oddziałującymi ze sobą szkieletami
triterpenowymi. Częściowe przenikanie się tego typu jednostek prowadzi do powstania
w hydrofobowej warstwie przecinających się kanałów, w których znajdują się cząsteczki
rozpuszczalnika i gościa (PABA). Miejscem wiązania PABA jest grupa karboksylowa
triterpenoidu (Rysunek 2b) znajdująca się wewnątrz obszaru hydrofobowego, co może
wyjaśniać zdolność GA do podnoszenia rozpuszczalności w wodzie związków słabo
hydrofilnych. W solwatach GA i AGA grupa ta jest związana z cząsteczką
rozpuszczalnika.
13
Rysunek 2. Struktura AGA-PABA: (a) budowa warstwowa, (b) miejsce wiązania
PABA. R oznacza dimer kwasu glukuronowego
Z kolei, obszar hydrofilowy w postaci cukrowej dwuwarstwy zbudowany jest
z łańcuchów utworzonych przez połączone wiązaniami wodorowymi reszty kwasu
glukuronowego. Integralną częścią warstwy hydrofilowej są w GA trzy cząsteczki wody
(jedna nieuporządkowana), które znajdują się w miejscach oznaczonych jako I-III i spinają
łańcuchy dodatkowo stabilizując strukturę cukrowej platformy (Rysunek 3). W strukturze
AGA cząsteczka wody z miejsca I jest wymieniona na jon NH4+. Modyfikacja ta nie
wpływa jednak na supramolekularną budowę kryształu, gdyż warstwa cukrowa, poprzez
reorganizację wiązań wodorowych, jest zdolna do akomodacji zmian wynikających
z zastąpienia cząsteczki wody, która jest podwójnym akceptorem i podwójnym donorem
wiązań wodorowych na czterodonorowy kation amonowy.
14
Rysunek 3. Budowa obszaru hydrofilowego. Miejsca zajmowane przez (a) trzy
cząsteczki wody w GA, (b) kation NH4+ i dwie cząsteczki wody w AGA.
(c) Struktura podwójnej warstwy cukrowej w AGA. R oznacza aglikon.
Prezentowane w publikacji H1 struktury dostarczają informacji na temat nieznanej do
tej pory konformacji cząsteczki kwasu (GA) i jego anionu oraz budowy molekularnego
kompleksu AGA-PABA. Budowa warstwy hydrofobowej pozwala wyjaśnić zdolności GA
do zwiększania rozpuszczalności związków słabo hydrofilowych, natomiast izomorfizm
GA i AGA tłumaczy podobne właściwości fizykochemiczne i biologiczne badanej
saponiny i jej monoamonowej soli.
Wyniki opisane w powyżej pracy skłoniły mnie do syntezy i krystalizacji innych soli
GA w celu lepszego zrozumienia izomorfizmu GA i AGA. Chciałam ustalić, czy inne sole
też będą izostrukturalne, a jeśli tak, to jaki wpływ na budowę warstwy cukrowej będzie
miało wprowadzenie kationów (Na+, K+, Cs+, Mg2+, Ca2+) różniących się wielkością
promienia jonowego, wartościowością i typem oddziaływań (zamiana wiązań wodorowych
występujących w soli amonowej na oddziaływania typu jon-dipol), a także jaka będzie
trójwymiarowa struktura i sposób agregacji anionów GA o różnym stopniu jonizacji.
Z zsyntezowanych soli: amonowej, sodowej, potasowej i cezowej, a także soli magnezowej
i wapniowej otrzymano nadające się do dalszych badań rentgenowskich kryształy soli
jedno- i dwuamonowej (AGA i A2GA), jedno- i dwupotasowej (KGA i K2GA) oraz jedno-
i dwucezowej (CsGA i Cs2GA). Rentgenowska analiza strukturalna wykazała niezwykłą
15
stabilność architektury supramolekularnej badanych soli GA - kryształy były w znacznym
stopniu izomorficzne niezależnie od liczby, typu i wielkości kationów. Kationy
wbudowały się w warstwę cukrową w miejsca oznaczone jako I i IIa, które w strukturze
GA zajmowane były przez cząsteczki wody (Rysunki 3, 4).
Rysunek 4. Kationy potasu w miejscach I i IIb w dwupotasowej soli GA.
Dynamiczna budowa warstwy cukrowej umożliwia zmianę kierunku wiązań
wodorowych bez istotnej przebudowy strukturalnej warstwy pozwalając na zastąpienie
neutralnej cząsteczki GA na jej formy zjonizowane oraz wymianę kationów NH4+ na jony
K+ i Cs+. Struktura kryształu dostosowuje się do różnic w wielkości promienia jonowego
poprzez niewielkie zmiany położenia kationów w kierunku prostopadłym do powierzchni
warstwy cukrowej, natomiast duża liczba położonych w niewielkiej od siebie odległości
atomów tlenu pozwala na wbudowanie kationów różniących się liczbą koordynacyjną.
Szczegółowe wyniki badań wraz z analizą przyczyn niezwykłego zjawiska izomorfizmu
kwasu i jego soli zostały przedstawione w publikacji H2.
Struktura molekularna badanej saponiny zależy w głównej mierze od konformacji
reszty disacharydowej i jej orientacji względem sztywnego aglikonu. Możliwość
swobodnej rotacji wokół pojedynczych wiązań glikozydowych zwykle prowadzi do
giętkości konformacyjnej cząsteczki. Powstaje więc pytanie, czy identyczna
trójwymiarowa budowa GA i jego anionów w fazie stałej jest wynikiem oddziaływań
międzycząsteczkowych występujących w krysztale, czy też obserwowana konformacja
cząsteczki/anionów jest stabilizowana już w roztworze. W jednej z zarejestrowanych
struktur soli monoamonowej GA w warstwę hydrofilową, w miejscu oznaczonym jako IV
(publikacja H3), została wbudowana dodatkowa cząsteczka wody w wyniku czego powstał
16
łańcuch zbudowany z kationu NH4+ (miejsce I) i dwóch cząsteczek H2O (miejsce IIa i IV)
łączący grupy karboksylanową i karboksylową reszt kwasu glukuronowego (Rysunek 5).
Rysunek 5. Kation NH4
+ (miejsce I) i dwie cząsteczki wody (miejsca IIa i IV) mostkują
grupy COOH i COO¯disacharydu w jednej ze struktur AGA
Podobna sytuacja występuje w dwuzasadowych solach GA (publikacja H2), gdzie
kationy mostkują grupy COO¯ disacharydu (Rysunek 4). Tego typu schemat sugeruje, że
kationy oraz grupy OH rozpuszczalnika umieszczone w warstwie cukrowej nie tylko
wzmacniają supramolekularną budowę obszaru hydrofilowego łącząc poszczególne
łańcuchy cukrowe (publikacja H1) lecz mogą również stabilizować konformację
disacharydu oraz jego orientację względem aglikonu. Obliczenia DFT (Density Functional
Theory) przedstawione w publikacji H3 pomogły ustalić wpływ H2O/kationów obecnych w
strukturach krystalicznych w miejscach oznaczonych jako I-IV na konformację wiązań
glikozydowych. W celu monitorowania rotacji jednostek: kwas glukuronowy A – kwas
glukuronowy B oraz kwas glukuronowy A – aglikon (Rysunek 1) wokół dwóch
pojedynczych wiązań za pomocą jednego parametru, wprowadzony został kąt torsyjny H-
C…C-H, w którym atomy węgla wiązań glikozydowych nie są ze sobą bezpośrednio
połączone (opuszczony eterowy atom tlenu), co w znacznym stopniu ułatwiło analizę
otrzymanych wyników. Obliczenia wykazały, że kationy/cząsteczki wody znajdujące się
w miejscach I, II i IV w istotny sposób zmieniają wzajemne ułożenie pierścieni
piranozowych, natomiast konformacja syn wiązania glikozydowego pomiędzy resztą
cukrową i triterpenoidem jest dość stabilna. Czynnikiem odpowiedzialnym za skręcenie
pierścieni disacharydu jest mostkowanie grup COOH/COO¯ za pomocą łańcucha
zbudowanego z kationów/cząsteczek wody. Badania NMR (publikacja H3) pozwoliły
ustalić, że w roztworze konformacje obu wiązań glikozydowych w anionie AGA są
17
podobne do ich odpowiedników w strukturach krystalicznych. Skręcona konformacja
dwucukru sugeruje, że w roztworze dochodzi do asocjacji pomiędzy grupami COOH
COO¯ glikonu.
Porównanie wyników rentgenowskich, spektroskopowych i obliczeniowych pozwoliło
na określenie preferowanej konformacji na wiązaniach glikozydowych w fazie
krystalicznej, roztworze i próżni oraz umożliwiło analizę wpływu kationów i cząsteczek
rozpuszczalnika obecnych w warstwie cukrowej kryształów na molekularną strukturę
badanej saponiny.
Kolejne prace zostały podjęte w celu uzyskania informacji na temat sposobu asocjacji
lipofilnego analogu GA – karbenoksolonu (CBXH2) i jego soli sodowej oraz porównania
supramolekularnej architektury otrzymanych kryształów z wcześniej określonymi
strukturami amfifilowego GA i dostępnymi w krystalograficznej bazie danych CSD
strukturami aktywnego biologicznie hydrofobowego aglikonu GA – kwasu
glicyretynowego (GE). Te trzy związki różnią się wielkością i hydrofilowym charakterem
podstawnika przy atomie C3 (Schemat 1) i uznałam, że są one idealnymi kandydatami do
badania strukturalnych właściwości i oddziaływań o charakterze supramolekularnym w
fazie krystalicznej.
W publikacji H4 przedstawiono struktury CBXH2(1), jego dwóch solwatowanych form
(2, 3) oraz solwatu kokryształu CBXH2:CBXHNa (4). Rentgenowska analiza strukturalna
wykazała, że chociaż istnieją znaczące różnice w supramolekularnej architekturze
badanych kryształów, istnieje pewien element budowy wspólny dla wszystkich czterech
form krystalicznych karbenoksolonu. Tym powtarzającym się, najmniej zróżnicowanym
motywem jest jednowymiarowa wstęga zbudowana z ułożonych obok siebie jednostek
CBXH2/CBXH¯ pomiędzy, którymi występują jedynie oddziaływania typu van der
Waalsa. Orientacja triterpenowych szkieletów sprawia, że obie strony wstęgi, oznaczone
jako α i β są strukturalnie zróżnicowane. Na stronie β znajdują się grupy COOH i C=O
aglikonu podczas, gdy strona α pokryta jest wyłącznie grupami CH terpenoidu (Rysunek
6).
18
Rysunek 6. Budowa wstęgi CBXH2 w strukturze 2: a) strona β, b) strona α
Wstęgi asocjują głowa-do-ogona (głową jest reszta kwasu bursztynowego, a ogonem
grupa karboksylowa aglikonu) tworząc różnego typu dwuwymiarowe agregaty, które
można opisać jako warstwy zbudowane z hydrofobowego rdzenia (triterpenowe szkielety)
i hydrofilowych powierzchni zewnętrznych (grupy COOH aglikonu i grupy COOH/COO¯
reszty kwasu bursztynowego) [Rysunek 7]. W niesolwatowanej strukturze 1 warstwy
posiadają prawie płaską powierzchnię, a typowe dla grup karboksylowych syntony
supramolekularne wiązań wodorowych [cykliczny motyw R22(8)] łączą sąsiadujące ze
sobą warstwy. W kryształach 2-4 cząsteczki rozpuszczalnika lub kation Na+ wbudowują
się w położone na granicy warstw, biegnące wzdłuż wstęgi kanały, modyfikując
występujący w 1 układ wiązań wodorowych, w wyniku czego zmienia się również
struktura warstwy. Różnice dotyczą budowy powierzchni warstwy (płaska lub
pofałdowana), konformacji reszty kwasu bursztynowego, orientacji szkieletów
triterpenowych, wzajemnego przesunięcia wstęg w kierunku prostopadłym do powierzchni
warstwy oraz dwóch odmiennych sposobów asocjacji sąsiadujących ze sobą wstęg: (a) typ
α-β (1, 3-4), gdzie strona α jednej wstęgi oddziałuje ze stroną β drugiej bądź (b) typ α-α
i β-β (2), w którym sąsiadujące wstęgi kontaktują się stronami α lub β. Szczegółowa
analiza zróżnicowania strukturalnego warstwy oraz parametry pozwalające na
monitorowanie zmian występujących w budowie zarówno wstęgi, jak i warstwy zostały
przedstawione w publikacji H4.
19
Rysunek 7. Budowa warstwy w strukturach karbenoksolonu 1-4. Rzut wzdłuż osi
wstęgi. Atom tlenu grupy karbonylowej narysowany jako sfera wskazuje stronę β wstęgi.
Analogiczny schemat budowy wstęgi i warstwy występuje również w dwóch z trzech
znajdujących się w bazie danych CSD strukturach farmakologicznie aktywnego aglikonu
GA - kwasu glicyretynowego (GE), w którym podstawnikiem przy atomie C3 jest grupa
hydroksylowa. Jedna ze struktur reprezentuje budowę warstwy typu α-β52, a druga typu
α-α i β-β53.
Wstęga obecna w różnych formach krystalicznych CBXH2 i GE, w strukturach GA jest
zastąpiona przez jednowymiarowy motyw nazwany przeze mnie łańcuchem (Rysunek 8).
W przeciwieństwie do wstęgi, gdzie jednostki CBXH2/CBXH¯ oddziałują ze sobą jedynie
poprzez słabe siły van der Waalsa, łańcuchy powstają w wyniku utworzenia wiązań
wodorowych pomiędzy dimerami kwasu glukuronowego. Wielkość glikonu prowadzi do
rozdzielenia aglikonów sąsiadujących ze sobą cząsteczek/anionów GA, na skutek czego
w strukturze łańcucha pojawiają się wnęki, w których znajdują się lipofilne fragmenty
cząsteczek rozpuszczalnika lub gościa. W strukturze AGA-PABA w miejscu tym
umieszczony jest pierścień benzenowy kwasu p-aminobenzoesowego. Podobnie jak
wstęgi, łańcuchy również posiadają wyróżnione strony α i β, a szkielety triterpenowe
ułożone głowa-do-ogona tworzą w krysztale hydrofobową warstwę (Rysunek 9).
20
Rysunek 8. Łańcuchy w strukturach GAi jego soli: a) strona α, b) strona β.
Rysunek 9. Dwuwymiarowy agregat GA pokazujący asocjację łańcuchów
głowa-do-ogona. Rzut wzdłuż osi łańcucha. Atom tlenu grupy karbonylowej
narysowany jako sfera wskazuje stronę β łańcucha.
Porównanie form krystalicznych CBXH2 i GE z formami krystalicznymi GA
wykazało, że ich trójwymiarowa struktura zbudowana jest z naprzemiennie ułożonych
hydrofilowych i hydrofobowych regionów. Warstwowa budowa badanych struktur wynika
z kooperatywnego działania sił van der Waalsa i kierunkowych oddziaływań
specyficznych, stąd wzajemna proporcja pomiędzy hydrofilowym, a hydrofobowym
fragmentem cząsteczki jest niezwykle istotnym czynnikiem wpływającym na
supramolekularną architekturę kryształu. W strukturach GA duży, silnie hydrofilowy
dimer kwasu glukuronowego tworzy warstwę cukrową, która jest stabilizowana licznymi
wiązaniami wodorowymi i oddziaływaniami typu jon-dipol, stąd sposób asocjacji
cząsteczek GA jest niemal identyczny, a otrzymane do tej pory kryształy są izomorficzne.
21
Hydrofilowe ugrupowania CBXH2 i GE nie są zdolne do utworzenia trwałych motywów
strukturalnych opartych na silnych oddziaływaniach specyficznych, co prowadzi do
odmiennego sposobu agregacji cząsteczek, a w konsekwencji do różnorodności
strukturalnej badanych kryształów. Zmiany w wzajemnym przesunięciu sąsiadujących
wstęg w kierunku prostopadłym do powierzchni warstwy (określone w publikacji H4
odległością między leżącymi po obu stronach warstwy płaszczyznami policzonymi przez
atomy C3 terpenoidu) sugerują, że istnieje możliwość otrzymania kryształów GA,
w których grupa karboksylowa aglikonu mogłaby utworzyć wiązanie wodorowe z cukrową
platformą. W takim przypadku doszłoby do zamknięcia kanałów, a jedynym obszarem
dostępnym dla cząsteczek rozpuszczalnika lub gościa stałyby się wnęki obecne
w strukturze łańcucha.
Struktury krystaliczne GA i jego lipofilnych analogów umożliwiają monitorowanie
zmian zachodzących w supramolekularnej organizacji cząsteczek tych trzech pokrewnych
związków. Różnice w budowie pozwalają lepiej zrozumieć kompleksujące właściwości
GA oraz sugerują, że chociaż siłą napędową tworzenia micel są oddziaływania typu van
der Waalsa, obecność dużej liczby wiązań wodorowych lub/i oddziaływań typu jon-dipol
jest czynnikiem niezbędnym do uzyskania w roztworach stabilnych konstrukcji w skali
nano.
5.4 NAJWAŻNIEJSZE OSIĄGNIĘCIA I DALSZE PERSPEKTYWY ROZWOJU BADAŃ
Wiele saponin, włączając GA tworzy w wodzie koloidalne zawiesiny lub żele stąd
krystalizacja tych związków jest niezwykle trudnym zadaniem. Świadczy o tym niewielka
liczba struktur saponin określonych metodami dyfrakcji rentgenowskiej. Wykorzystanie
techniki wiszącej kropli stosowanej do krystalizacji białek pozwoliło na opracowanie
warunków krystalizacji dla kwasu glicyryzynowego, jego jedno- i dwuzasadowych soli
(NH4+, K+, Cs+) i kompleksu AGA z PABA. Otrzymanie całej serii kryształów saponiny
oraz jej lipofilnego analogu karbenoksolonu umożliwiło rozpoczęcie systematycznych
badań nad tą interesującą grupą związków.
Najważniejszym, a jednocześnie najbardziej zaskakującym odkryciem prowadzonych
przeze mnie badań było ustalenie, że w ciele stałym konformacja neutralnej i anionowej
formy kwasu glicyryzynowego jest niemal identyczna, a otrzymane kryształy są
izomorficzne niezależnie od typu i wielkości kationu, stopnia jonizacji GA i rodzaju
wbudowanego rozpuszczalnika. Badania wykazały, że izomorficzna jest również struktura
22
kompleksu AGA z kwasem p-aminobenzoesowym. Analiza supramolekularnej budowy
otrzymanych kryształów pozwoliła na określenie przyczyn izomorfizmu oraz umożliwiła
lepsze zrozumienie właściwości kompleksujących GA i jego zdolności do podnoszenia
rozpuszczalności w wodzie hydrofobowych leków. Struktury krystaliczne jedno-
i dwuzasadowych soli GA umożliwiły ustalenie kolejności deprotonacji grup
karboksylowych. Badania spektroskopowe wykazały, że pomimo możliwości rotacji wokół
pojedynczych wiązań glikozydowych, konformacja monoanionu GA w środowisku
wodnym i w ciele stałym jest niezwykle podobna, a metody obliczeniowe pozwoliły na
określenie czynników stabilizujących strukturę disacharydu. Porównanie
supramolekularnej budowy kryształów GA, CBXH2 i GE wykazało, że zarówno
amfifilowe jak i lipofilne cząsteczki badanych związków asocjują tworząc trójwymiarowe
architektury o budowie warstwowej, których różnorodność strukturalna wzrasta wraz ze
spadkiem liczby wiązań wodorowych/oddziaływań elektrostatycznych. Obecność
uporządkowanej warstwy cukrowej w strukturach GA sugeruje, że kluczem do uzyskania
stabilnych nano-agregatów w roztworze mogą być wiązania wodorowe.
Do najważniejszych osiągnięć pracy habilitacyjnej zaliczam:
• opracowanie warunków krystalizacji dla GA i jego soli - związków żelujących
w wodzie, które jednocześnie wykazywały zbyt niską rozpuszczalność
w rozpuszczalnikach organicznych, aby otrzymać kryształy o wymiarach
odpowiednich do badań rentgenowskich,
• ustalenie, że kryształy GA, jego jedno- i dwuzasadowych soli (NH4+, K+, Cs+)
oraz kompleksu AGA-PABA są izomorficzne,
• określenie przyczyn izomorfizmu kryształów GA, jego soli i kompleksu AGA-
PABA,
• określenie grupy COOH, która jest odpowiedzialna za kompleksujące
właściwości GA i jego soli,
• określenie kolejności w jakiej grupy karboksylowe GA są deprotonowane,
• ustalenie, że dla soli amonowej kwasu glicyryzynowego konformacja wiązań
glikozydowych w roztworze i ciele stałym jest podobna
• określenie czynników stabilizujących preferowaną konformację wiązań
glikozydowych w dimerze kwasu glukuronowego
• ustalenie, że cząsteczki GA i jego lipofilnych analogów agregują tworząc
struktury warstwowe
23
• określenie wpływu wielkości i hydrofilowego charakteru podstawnika na
supramolekularną architekturę kryształów GA, CBXH2 i GE
Uzyskane wyniki dostarczają informacji na temat nieznanej do tej pory
supramolekularnej struktury kwasu glicyryzynowego, jego soli i lipofilnych analogów
w fazie krystalicznej oraz stanowią istotny wkład w zrozumienie i wyjaśnienie właściwości
solubilizacyjnych badanej saponiny. Praca poszerza wiedzę dotyczącą kooperatywnego
efektu wiązań wodorowych i oddziaływań typu van der Waalsa na agregację badanych
cząsteczek. Różnice w supramolekularnej organizacji tych trzech pokrewnych związków
mogą mieć szersze przełożenie na właściwości fizykochemiczne badanych substancji.
W chwili obecnej kontynuuję temat badawczy dotyczący supramolekularnej
organizacji cząsteczek GA i karbenoksolonu w fazie stałej. W swoich badaniach skupiam
się nad uzyskaniem nowych kokryształów saponiny z różnego rodzaju API. W świetle
dotychczasowych wyników, szczególnie interesującym wydaje się otrzymanie
kompleksów GA z cząsteczkami gościa, który nie ma żadnych atomów o właściwościach
protono-donorowych. Zakładając, że istnieje możliwość przesunięcia grupy COOH
aglikonu w kierunku warstwy cukrowej, próbuję uzyskać kryształy desolwatowanej lub
w nieznacznym stopniu solwatowanej formy GA. W dalszym ciągu zajmuję się
krystalizacją różnych soli GA i karbenoksolonu, szczególnie z metalami ziem alkalicznych
oraz próbuję uzyskać kryształy trójzasadowych soli GA. W celu określenia wpływu
ugrupowań hydrofilowych na warstwową budowę kryształów planuję syntezę
i krystalizację szeregu pochodnych kwasu glicyretynowego i karbenoksolonu o
zmodyfikowanych zarówno grupach COOH aglikonu, jak i podstawnikach przy atomie C3.
Dalsze badania mogą przyczynić się do jeszcze lepszego zrozumienia właściwości
solubilizacyjnych GA oraz pogłębienia wiedzy na temat oddziaływań o charakterze
supramolekularnym dla tego typu cząsteczek. Uzyskane wyniki mogą w przyszłości
umożliwić zaprojektowanie samoorganizujących się układów, które podobnie jak GA będą
tworzyły micele o 100% zawartości substancji aktywnej (którą jest GE), a jednocześnie
będą zdolne do transportowania dodatkowych trudno rozpuszczalnych w wodzie API
zwiększając ich biodostępność oraz wykazując synergistyczny efekt działania,
5.5 PIŚMIENNICTWO
1. Lehn, J.-M. Toward Self-Organization and Complex Matter. Science 2002, 295,
2400-2403.
24
2. Lehn, J.-M. Toward complex matter: Supramolecular chemistry and self-
organization. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2002, 99, 4763-4768.
3. Steed, J. W.;; Atwood, J. L. Supramolecular chemistry, John Wiley & Sons, 2009, 2
nd ed.
4. Tseng, Y.-H.;; Birkbak, M. E.;; Birkedal, H. Spatial Organization of Hydroxyapatite
Nanorods on a Substrate via a Biomimetic Approach. Cryst. Growth Des. 2013, 13,
4213−4219.
5. Fuhrhop, J. H.;; Wang, T. Bolaamphiphiles. Chem. Rev. 2004, 104, 2901-2937.
6. Lehn, J.-M. Supramolecular Chemistry—Scope and Perspectives Molecules,
Supermolecules, and Molecular Devices (Nobel Lecture). Angew. Chem., Int. Ed.
Engl. 1988, 27, 89-112.
7. Reddy, P. D.;; Swarnalatha, D. Recent Advances in Novel Drug Delivery Systems.
Int. J. PharmTech. Res. 2010, 2, 2025-2027.
8. Müller-Goymann, C. C. Physicochemical characterization of colloidal drug
delivery systems such as reverse micelles, vesicles, liquid crystals and
nanoparticles for topical administration. Eur. J. Pharm. Biopharm. 2004, 58, 343-
356.
9. Benson, H. A. E. Transdermal Drug Delivery: Penetration Enhancement
Techniques. Curr. Drug Deliver. 2005, 2, 23-33.
10. Malmsten, M. Soft drug delivery systems. Soft Matter 2006, 2, 760-769.
11. Kingsley, J. D.;; Dou, H.;; Morehead, J.;; Rabinow, B.;; Gendelman, H. E.;; Destache,
C. J. Nanotechnology: A Focus on Nanoparticles as a Drug Delivery System. J.
Neuroimmune Pharmacol. 2006, 1, 340–350.
12. Bae, Y.;; Kataoka, K. Intelligent polymeric micelles fromfunctional poly(ethylene
glycol)-poly(amino acid) block copolymers. Adv. Drug Deliver. Rev. 2009, 61,
768–784.
13. Yoon, H.-J.;; Jang, W-D. Polymeric supramolecular systems for drug delivery. J.
Mater. Chem. 2009, 20, 211-222.
14. Saraf, A. S. Applications of novel drug delivery system for herbal formulations.
Fitoterapia, 2010, 81, 680-689.
15. Lembo, D.;; Cavalli, R. Applications of novel drug delivery system for herbal
formulations. Antiviral Chem. Chemother. 2010, 21, 53-70.
16. Hostettmann, K.;; Marston, A. in Chemistry & Pharmacology of Natural Products:
Saponins;; Cambridge University Press: New York , 2005;; Chapter 7, pp 312-318.
25
17. Vincken, J. P.;; Heng, L.;; de Groot, A.;; Gruppen, H. Saponins, classification and
occurrence in the plant kingdom. Phytochemistry 2007, 68, 275–297.
18. Lacaille-Dubois, M.A.;; Wagner, H. A review of the biological and pharmacological
activities of saponins. Phytomedicine 1996, 2, 363-386.
19. Sparg, S. G.;; Light, M. E.;; Van Staden, J. Biological activities and distribution of
plant saponins. J. Ethnopharmacol. 2004, 94, 219-243.
20. Kornievskaja, V. S.;; Kruppa, A. I.;; Leshina, T. V. NMR and photo-CIDNP
investigations of the glycyrrhizinic acid micelles influence on solubilized
molecules. J. Incl. Phenom. Macrocycl. Chem., 2008, 60, 123-130.
21. Allen, F. H. The Cambridge Structural Database: a quarter of a milion crystal
structures and rising. Acta Cryst 2002, B58, 380-388.
22. Fiore C.;; Eisenhut M.;; Ragazzi E.;; Zanchin G.;; Armanini D. A history of the
therapeutic use of liquorice in Europe. J. Ethnopharmacol. 2005, 99, 317-324.
23. Olukoga, A.;; Donaldson, D. The history of liquorice: the plant, its extract,
cultivation,comercialisation and entymology. J. Roy. Soc .Health, 1998, 118, 300-
304.
24. Davis, E. A.;; Morris, D. J. Medicinal uses of licorice through the millennia: the
good and plenty of this Mol. Cell. Endocrinol. 1991, 78, 1-6.
25. Patwardhan, B.;; Gautam M. Botanical immunodrugs: scope and opportunities.
Drug Discov. Today 2005, 10, 495-502.
26. Asl M. N., Hosseinzadeh H. Review of Pharmacological Effects of Glycyrrhiza sp.
and its Bioactive Compounds. Phytother. Res. 2008, 22, 709–724.
27. Fiore, C.;; Eisenhut, M.;; Krausse, R.;; Ragazzi, E.;; Pelatti, D.;; Armanini, D.;;
Bielenberg, J. Antiviral Effects of Glycyrrhiza species. Phytother. Res. 2008, 22,
141-148.
28. Ashfag, U. A.;; Masoud, M. S.;; Nawaz, Z.;; Riazuddin, S. Glycyrrhizin as antiviral
agent against Hepatitis C Virus. J. Transl. Med. 2011, 9, 112-119.
29. Van Rossum T. G. J.;; Vulto A. G.;; De Man, R. A., Brouver J. T.;; Schlam, S. W.
Glycyrrhizin as antiviral agent against Hepatitis C Virus. Aliment Pharmacol Ther.
1998, 12;; 199-205.
30. Khan R.;; Khan A.Q.;; Lateef A.;; Rehman, M. U.;; Tahir, M.;; Ali, F.;;. Hamiza, O. O.;;
Sultana, S. Glycyrrhizic acid suppresses the development of precancerous lesions
via regulating the hyperproliferation, inflammation, angiogenesis and apoptosis in
the colon of wistar rats. PLOS ONE, 2013, 8, e56020-42.
26
31. Smolarczyk, R.;; Cichon, T.;; Matuszczak, S.;; Mitrus, I.;; Lesiak, M.;; Kobusinska,
M.;; Kamysz, W.;; Jarosz, M.;; Sieron, A.;; Szala, S. The Role of Glycyrrhizin, an
Inhibitor of HMGB1 Protein in Anticancer Therapy. Arch. Immunol. Ther. Exp.
2012, 60, 391-399.
32. Yuan, H.;; Ji, W.-S.;; Wu, K.-X.;; Jiao, J.-X.;; Sun, L.-H.;; Feng, Y.-T. Anti-infl
ammatory effect of Diammonium Glycyrrhizinate in a rat model of ulcerative
colitis. World J. Gastroenterol. 2006, 12, 4578-4581.
33. Ram, A.;; Mabalirajan, U.;; Das, M.;; Battacharya, I.;; Dinda, A. K.;; Gangal, S. V.;;
Ghosh, B. Glycyrrhizin alleviates experimental allergic asthma in mice. Int.
Immunopharmacol. 2006, 6, 1468-1477.
34. Li, X.-L.;; Zhou, A.-G. Evaluation of the Immunity Activity of Glycyrrhizin in AR
Mice. Molecules 2012, 17, 716-727.
35. Zhao M.-X.;; Ji, L.-N.;; Mao, Z.-W. β-Cyclodextrin/glycyrrhizic acid functionalized
quantum dots selectively enter cells and induce apoptosis. Chem. Eur. J. 2012, 18,
1650-1658.
36. Paolino D.;; Lucania, G.;; Mardente, D.;; Alhaique, F.;; Fresta, M. Ethosomes for Skin
Delivery of Ammonium Glycyrrhizinate: In Vitro Percutaneous Permeation
through Human Skin and in Vivo Anti-Inflammatory Activity on Human
Volunteers J. Control. Release, 2005, 106, 99-110.
37. Polyakov, N. E.;; Leshina, T. V. Glycyrrhizic Acid as a Novel Drug Delivery
Vector: Synergy of Drug Transport and Efficacy. Open Conf. Proc. J. 2011, 2, 64-
72.
38. Yoshioka H. Kinetics of the Gel-Sol Transition of the Aqueous Solutions of β-
Glycyrrhizin Studied by the Temperature Jump-Spin Probe Method. J. Colloid
Interf. Sci. 1985, 105, 65-72.
39. Polyakov, N. E.;; Khan, V. K.;; Taraban, M. B.;; Leshina, T. V. Complex of Calcium
Receptor Blocker Nifedipine with Glycyrrhizic Acid. J. Phys. Chem. B 2008, 112,
4435−4440.
40. Polyakov, N. E.;; Leshina, T. V.;; Salakhutdinov, N. F.;; Kispert, L.D. Host-Guest
Complexes of Carotenoids with â-Glycyrrhizic Acid. J. Phys. Chem. B 2006, 110,
6991−6998.
41. Zhou, J.;; Ritter, H. Cyclodextrin functionalized polymers as drug delivery systems.
Polym. Chem. 2010, 1, 1552-1559.
27
42. Brewster, M. E.;; Loftsson, T. Cyclodextrins as pharmaceutical solubilizers. Adv.
Drug Deliver. Rev. 2007, 59, 645-666.
43. Loftson, T.;; Duchene, D. Cyclodextrins and their pharmaceutical applications. Int.
J. Pharm. 2007, 329, 1-11.
44. Uekama, K.;; Hirayama, F.;; Irie, T. Cyclodextrin Drug Carrier Systems. Chem. Rev.
1998, 98, 2045-2076.
45. Connors K.A. The stability of cyclodextrin complexes in solution. Chem. Rev.
1997, 97, 1325-1357.
46. Baltina, L. A. Chemical Modification of Glycyrrhizic Acid As A Route to New
Bioactive Compounds for Medicine. Curr. Med. Chem. 2003, 10, 155-171.
47. Du, D.;; Yan, J.;; Ren, J.;; Lv, H.;; Li, Y.;; Xu, S.;; Wang, Y.;; Ma, S.;; Qu, J.;; Tang, W.;;
Hu, Z.;; Yu, S. Synthesis, biological evaluation, and molecular modeling of
glycyrrhizin derivatives as potent high-mobility group box-1 inhibitors with anti-
heart-failure activity in vivo. J. Med. Chem. 2013, 56, 97–108.
48. Kang, L.;; Li, X.;; Chen, C.;; Wang, F. Research progress on structure modification
and biological activity of 18b-Glycyrrhetinic acid. Curr. Opin. Complement Altern.
Med. 2014;; 1, 34–44.
49. Brown, H. M.;; Christie, B. G. B.;; Colin-Jones, E;;. Finney, R. S. H.;; Macgregor, W.
G.;; Morrison Smith, J.;; Smith, W. G.;; Sullivan, F. M.;; Tarnoky, A. L.;; Turner, E.
E.;; Watkinson, G.;; Wotton, D. E. M. Glycyrrhetinic acid hydrogen succinate
(disodium salt). A new anti-inflammatory compound. Lancet 1959;; 274: 492–493.
50. Fenwick, G. R.;; Lutomski, J.;; Nieman, C. Liquorice, Glycyrrhiza glabra L. Composition, Uses and Analysis. Food Chem. 1990, 38, 119-143.
51. Isbrucker, R. A.;; Burdock, G. A. Risk and safety assessment on the consumption of
Licorice root (Glycyrrhiza sp.), its extract and powder as a food ingredient, with
emphasis on the pharmacology and toxicology of glycyrrhizin. Regul. Toxicol.
Pharmacol. 2006;; 46: 167–192.
52. Campsteyn, H.;; Dupont, L.;; Lamotte, J.;; Dideberg, O.;; Vermeire, M. Crystal and
Molecular Structure of Glycyrrhetinic Acid Acetone Monohydrate. Acta Cryst.
1977, B33, 3443–3448.
53. Beseda, I.;; Czollner, L.;; Shah, P. S.;; Khunt, R.;; Gaware, R.;; Kosma, P.;; Stanetty,
C.;; del Ruiz-Ruiz, M. C.;; Am, H., Mereiter, K.;; Cunha, T. D.;; Odermatt, A.,
Claßen-Houben, D.;; Jordis, U. Synthesis of glycyrrhetinic acid derivatives for the
treatment of metabolic diseases. Bioorg. Med. Chem. 2010, 18, 433–454.
28
6. Pozostałe osiągnięcia naukowe
6.1. Omówienie działalności naukowo-badawczej przed doktoratem
Moje zainteresowania naukowe związane z zagadnieniami chemii
supramolekularnej datują się już od czasów studiów. W pracy magisterskiej pt. „Tb3+
jako marker fluoroscencyjny w badaniach interakcji tRNA z różnymi ligandami”
wykonywanej na Wydziale Biologii i Nauk o Ziemi Uniwersytetu im. A. Mickiewicza
w Poznaniu pod kierunkiem prof. dr hab. Jacka Augustyniaka zajmowałam się
określaniem zmian konformacyjnych tRNA zachodzących pod wpływem różnych
kationów, poliamin, czy też białek histonowych (zależność struktura-funkcja). Wyniki
badań zostały przedstawione na międzynarodowej konferencji i opublikowane jako
rozdział w książce (załącznik 4).
Stopień magistra nauk biologicznych w zakresie biologii ze specjalnością biologii
molekularnej, specjalizacją biochemii uzyskałam w 1981 r. W tym samym roku,
jeszcze przed ukończeniem pracy dyplomowej, zostałam zatrudniona na Wydziale
Chemii UAM w Poznaniu w Zakładzie Krystalografii, gdzie rozpoczęłam intensywną
naukę w zakresie krystalografii i rentgenografii strukturalnej. Wiedzę tę pogłębiałam
uczestnicząc w szkołach organizowanych w kraju (krystalografia małych cząsteczek)
i za granicą (krystalografia białek). Pierwsze postawione przede mną zadanie badawcze
dotyczyło określenia warunków krystalizacji hemoglobiny wołowej i wstępnej
charakterystyki rentgenowskiej otrzymanych kryształów. W tym czasie w Polsce nie
były prowadzone żadne badania w zakresie krystalografii białek, a kierowany przez
prof. dr hab. Zofię Kosturkiewicz projekt był unikatowy w skali krajowej.
W zależności od warunków krystalizacji (środowisko redukujące lub utleniające)
otrzymałam różne formy krystaliczne tego białka, co świadczyło o zmianach
konformacyjnych makrocząsteczki zachodzących pod wpływem tlenu. Wyniki badań
zostały zaprezentowane na Konwersatorium Krystalograficznym w Wrocławiu.
Równolegle do prac związanych z krystalizacją hemoglobiny zajmowałam się
badaniami strukturalnymi kryształów związków organicznych. Przedmiotem
prowadzonych przeze mnie badań były (i) amidyny - związki biologicznie czynne,
które w zależności od rodzaju podstawników wykazują właściwości grzybobójcze,
karcynogenne lub antykarcynogenne oraz (ii) związki Reisserta znajdujące
zastosowanie w syntezie m. in. alkaloidów izochinoliny. Wspólną cechą obu grup
związków jest obecność układów skoniugowanych oraz znaczna liczba objętościowo
29
dużych podstawników, które zakłócają energetycznie faworyzowaną planarną
konformację układów sprzężonych. Analiza defektów konformacyjnych powstających
pod wpływem zawad sterycznych w cząsteczkach przestrzennie zatłoczonych była
przedmiotem mojej rozprawy doktorskiej pt. „Badania strukturalne cząsteczek
z przeszkodami przestrzennymi” przygotowanej pod kierunkiem prof. dr hab. Zofii
Kosturkiewicz. Stopień doktora nauk chemicznych uzyskałam w roku 1984.
Wyniki prowadzonych w latach 1982-1984 badań zostały opublikowane w cyklu 6
prac o zasięgu międzynarodowym (publikacje 1-6, załącznik 4), z których jedna
ukazała się przed uzyskaniem stopnia doktora oraz przedstawione na 9 konferencjach
krajowych i międzynarodowych, z czego 4 komunikaty prezentowane były przed
obroną doktoratu.
6.2. Omówienie działalności naukowo-badawczej po doktoracie
W pierwszych latach po doktoracie mój rozwój naukowy przebiegał dwutorowo.
W kraju zajmowałam się badaniami rentgenostrukturalnymi cząsteczek organicznych,
a za granicą dokształcałam się w dziedzinie krystalografii białek.
W latach 1985-1986 przebywałam na półtorarocznym stażu naukowym w USA
na Uniwersytecie Południowej Karoliny (University of South Carolina), gdzie mogłam
rozwijać swoje zainteresowania dotyczące struktur enzymów oraz zależności pomiędzy
strukturą i funkcją białek. Badania, które wówczas rozpoczęłam kontynuowałam
podczas kolejnych lat na dwóch krótkoterminowych, trzymiesięcznych stażach
(w 1987 i 1989 r.). Pracując w zespole prof. Lebiody zapoznałam się z metodami
krystalizacji białek w skali mikro, sposobami krioprotekcji kryształów, wykonywaniem
pomiarów na synchrotronie oraz programami obliczeniowymi stosowanymi do
rozwiązywania i udokładniania struktur makrocząsteczek. W ramach grantów
przyznanych przez NIH (National Institutes of Health), NSF (US National Science
Foundation) and ACS (American Cancer Society) brałam udział w krystalizacji oraz
badaniach struktury (i) syntazy tymidylanowej - enzymu będącego celem
molekularnym chemioterapeutyków w kilku rodzajach nowotworu, (ii) oksydazy
alkoholowej – enzymu metabolizującego metanol oraz (iii) kompleksów enolazy
(białka będącego przedstawicielem metaloenzymów) z analogami substratów i jonami
metali, z których kation cynku (Zn2+) jest aktywatorem enzymu, a kation wapnia (Ca2+)
hamuje jego aktywność. Wyniki badań były prezentowane na konferencji naukowej w
Waszyngtonie oraz opublikowane w trzech pracach (publikacje 7, 9, 12, załącznik 4).
30
W roku 1989 przebywałam na miesięcznym stażu w Instytucie Maxa Plancka
w Hamburgu, gdzie w grupie prof. Ady Yonath, przyszłej Laureatki Nagrody Nobla,
szkoliłam się w rozwiązywaniu tak złożonych struktur jak rybosomy.
W tym czasie na UAM kontynuowałam rozpoczęty jeszcze przed doktoratem temat
badawczy dotyczący wpływu przeszkód przestrzennych na konformację amidyn
(publikacje 8, 13, załącznik 4). W ramach rozpoczętej współpracy z prof. dr hab. Zofią
Dega-Szafran i prof. dr hab. Mieczysławem Szafranem z Wydziału Chemii
Uniwersytetu im. A. Mickiewicza w Poznaniu zajmowałam się badaniami
strukturalnymi kompleksów molekularnych z silnym wiązaniem wodorowym
i zdolnością do przeniesienia protonu. Efektem tej działalności jest szereg
komunikatów zjazdowych (12) oraz 13 prac współautorskich, które ukazały się
w latach 1991 – 2004 (publikacje 10, 14-17, 19-22, 24, 25, 27, 39).
W roku 1998, po przejściu na emeryturę prof. dr hab. Zofii Kosturkiewicz,
dołączyłam do grupy badawczej prof. dr hab. Mariusza Jaskólskiego włączając się
w prowadzone przez niego badania strukturalne białek. W ramach współpracy z prof.
Iva Pichova z Instytutu Chemii Organicznej i Biochemii Czeskiej Akademii Nauk
w Pradze zajmowałam się krystalizacją proteazy aspartylowej retrowirusa Masona-
Pfizera wywołującego u małp chorobę podobną do AIDS oraz kompleksu tego enzymu
z inhibitorem statynowym. Otrzymane wyniki zostały przedstawione na konferencjach
naukowych. Zostałam również włączona w projekt badawczy dotyczący badań
strukturalnych proteazy HIV-1 i jej inhibitorów. Enzym ten bierze udział w procesie
replikacji wirusa HIV, stąd zrozumienie mechanizmu oddziaływania inhibitora
w miejscu aktywnym enzymu ma istotne znaczenie w projektowaniu efektywnych
leków w terapii AIDS (publikacje 23, 40). W ramach kolejnej tematyki badawczej
zajmowałam się krystalizacją i określeniem struktury zmutowanej formy Met8Leu
CMTI-1 – małego białka będącego inhibitorem trypsyny. Białko CMTI-1 oraz inne
białka z tej rodziny izolowane z pestek dyni są najmniejszymi znanymi inhibitorami
proteaz serynowych. Ze względu na małą liczbę aminokwasów ich struktura jest
stabilizowana przez mostki dwusiarczkowe. W otrzymanych kryształach
nieoczekiwanie w strukturę białka został wbudowany kation Zn2+. Wyniki
prowadzonych badań zostały zaprezentowane na konferencjach i opublikowane w Acta
Cryst. D w 2002 roku (publikacja 26).
W roku 2006 zostałam zatrudniona na Wydziale Farmaceutycznym Uniwersytetu
Medycznego im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu w Zakładzie i Katedrze
31
Technologii Chemicznej Środków Leczniczych kierowanej przez prof. dr hab.
Stanisława Sobiaka, gdzie pracuję do chwili obecnej. Równocześnie z badaniami
dotyczącymi tematyki rozprawy habilitacyjnej, w ramach badań własnych, statutowych
oraz grantów realizowanych w Katedrze (załącznik 4) zajmowałam się rentgenowską
analizą strukturalną kryształów należących do dwóch grup związków o potencjalnym
zastosowaniu w medycynie:
(1) pochodne nitroimidazoli, dla których fragmentem farmakoforowym
odpowiedzialnym za aktywność biologiczną jest 5(4)-bromo-2-metylo-4(5)-
nitroimidazol wykazujący zdolność hamowania wzrostu komórek Hela. Ze względu na
obecność atomu bromu oraz przynajmniej jednej elektroakceptorowej grupy
karbonylowej cząsteczki te tworzą wiązania halogenowe, które są bardzo istotnym
elementem rozpoznawania i wiązania cząsteczkowego
(2) porfirazyny, ftalocyjaniny oraz ich prekursorowe pochodne maleo-
i ftalonitrylowe. Porfirazyny i ftalocyjaniny są związkami syntetycznymi,
spokrewnionymi z porfirynami. Zastąpienie atomów węgla w pozycjach mezo przez
atomy azotu wprowadza istotne zmiany właściwości tej klasy związków, chociaż nadal
zachowują one wiele cech wykazywanych przez porfiryny. Obecność wolnych par
elektronowych, układu podwójnych wiązań, możliwość różnej koordynacji atomów
metali i synteza analogów o zmienionych właściwościach fizykochemicznych czyni te
związki interesującym obiektem badań w różnych dziedzinach nauki i przemysłu m. in.
w chemii, fizyce, biologii, przemyśle farmaceutycznym i nanotechnologii.
Obie grupy związków są syntetyzowane w zespołach badawczych naszej Katedry.
Otrzymane wyniki pozwoliły na pełną geometryczną i konformacyjną charakterystykę
badanych cząsteczek. Wyniki badań prezentowane były na 17 konferencjach w kraju
i za granicą oraz opublikowane w 9 pracach naukowych o zasięgu międzynarodowym
(publikacje 28-32, 34, 35, 37, 38). Jestem również współautorem zgłoszenia
patentowego dotyczącego dinitrili (załącznik 4).
W ramach współpracy z prof. dr hab. Marcinem Chmielewskim i prof. dr hab.
Wojciechem Rypniewskim z Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu zajmowałam się
badaniami struktury kryształów pirydyloaminoalkoholi – prekursorów termolabilnych
grup ochronnych w chemicznej syntezie kwasów nukleinowych. Analiza
rentgenograficzna umożliwiła identyfikację czynnika odpowiedzialnego za aktywność
badanych związków oraz określenie zależności pomiędzy strukturą a termoprotekcją.