bio5. fizyka .amu.pl
description
Transcript of bio5. fizyka .amu.pl
http://bio5.fizyka.amu.edu.pl/
Kierownik:prof. dr hab. Adam [email protected]
Web”master”dr Jacek Gapiński [email protected]
Zakład Biofizyki Molekularnej
Badanie aparatu fotosyntetycznego 2 prace magisterskie
dr Krzysztof Gibasiewicz ([email protected])promotor: prof. Andrzej DobekZakład Biofizyki Molekularnej
Przedmiot badań
TEMAT 1: Modelowanie widm absorpcji i fluorescencji fotosyntetycznych kompleksów białkowo-barwnikowych
(Środowisko Lab-View)
PSI-200
T = 1.6 K
TEMAT 2: Badanie rozmiarów i dynamiki białek fotosyntetycznych w roztworach wodnych i błonach (spektroskopia korelacji fluorescencji, dynamiczne
rozpraszanie światła)
Fotosystem I
-Optyczny efekt Kerra w roztworach tRNA-Magnetooptyczne badania polisacharydów i białek
Metody nieliniowe w badaniach biomakromolekuł
2 prace magisterskie
promotor: prof. Andrzej Dobek
Badanie cytokinin
dr hab. Genowefa ŚlósarekZakład Biofizyki Molekularnej
Cytokininy
N N
NN
NH R hormony roślinne
w postaci nukleotydów
wbudowane w cząsteczki
tRNA
związki o znaczeniu
farmaceutycznym
Struktura krystaliczna kinetyny
kinetyna
Tematy prac magisterskich
Oddziaływanie cytokinin z metalami
krystalizacja cytokinin z metalami, głównie Cu2+; badanie własności fizycznych kryształów analiza dynamiki molekularnej cytokinin w obecności metali – EPR, NMR, spektroskopia oscylacyjna Dynamika molekularna w kryształach cytokinin i innych cząsteczek
krystalizacja cytokinin z innymi zasadami nukleinowymi oraz poliaminami; badanie wiązań wodorowych; analiza warunków krystalizacji analiza dynamiki molekularnej metodami spektroskopii oscylacyjnej poszukiwanie przemian fazowych;
Bioinformatyka
• Przewidywanie i analiza struktur białek metodami obliczeniowymi
• Metody obliczeniowe racjonalnego projektowania leków
http://bioinfo.phys.amu.edu.pl/Pokój 46, parter, przy sekretariacie Instytutu Fizyki
dr Leszek Rychlewski ([email protected] )dr Ewa Banachowicz ([email protected] )Zakład Biofizyki Molekularnej
Więcej informacji o projektach Bioinformatycznych
można uzyskać na stronach:
http://bioinfo.phys.amu.edu.pl/
http://bioinfo.pl/
Kontakt: dr Leszek [email protected]
Struktura i dynamika polimerów/biopolimerów/koloidów w
roztworach
prof. dr hab. Adam Patkowski Zakład Biofizyki Molekularnej
Spektroskopia korelacji fluorescencji,Dynamiczne rozpraszanie światła
FCS mierzy czas dyfuzji sondy przez ognisko mikroskopu konfokalnego –Zalety:Oświetlona objętość: ~0.15 fl (femtolitr),Objętość próbki: >20 l (parowanie),Stężenie próbki: ~10 nM,Wysoka selektywność (sonda fluorescencyjna).
Zakład Biofizyki Molekularnej
http://bio5.fizyka.amu.edu.pl
struktura i dynamika polimerów/biopolimerów/koloidów w roztworach
Prof. dr hab. Adam Patkowski
Określenie wpływu struktury ośrodka na dyfuzję
1. Dyfuzja własna i kolektywna w złożonych mieszaninach koloidów i biopolimerów – wpływ oddziaływań elektrostatycznych (spektroskopia korelacji fluorescencji i dynamiczne rozpraszanie światła).
(Promotor – prof. dr hab. A. Patkowski, opiekun – dr A. Wilk, drJ.Gapiński)
2. Struktura i dynamika koloidów w roztworze – oddziaływania elektrostatyczne i hydrodynamiczne (dynamiczne rozpraszanie światła).
(Promotor – prof. dr hab. A. Patkowski, opiekun – dr J. Gapiński
W tym zakresie mamy rozwiniętą współpracę krajową (ICHF PAN prof. R. Hołyst) międzynarodową (USA, Niemcy, Francja), obecnie również w ramach VI Programu Europejskiego.
Zakład Biofizyki Molekularnej
Pomiar mikroskopowej lepkości cieczy (pod wysokim ciśnieniem) przy pomocy dynamicznego rozpraszania światła i spektroskopii korelacji fluorescencji (Promotor – prof. dr hab. A. Patkowski, opiekun – dr J. Gapiński)
Badania rozmiarów, kształtu i dynamiki miceli: (spektroskopia korelacji fluorescencji i dynamiczne rozpraszanie światła). (Promotor – prof. dr hab. A. Patkowski, opiekun – dr J. Gapiński).
Zakład Biofizyki Molekularnej
http://bio5.fizyka.amu.edu.pl/
Kierownik:prof. dr hab. Adam [email protected]
Web”master”dr Jacek Gapiński [email protected]