Możliwość wykrycia 18 zespołów wad wrodzonych

www.nifty.pl

Najbardziej wiarygodny i kompleksowy nieinwazyjny test prenatalny wykonywany w Polsce

BEZPIECZNY, SZYBKI, WIARYGODNY

Możliwość wykrycia 18 zespołówwad wrodzonych

Obsługa klienta: [email protected], +48 22 6446019www.nifty.plwww.facebook.com Test NIFTY

Zalety NIFTYTM

Największe możliwosci i zakres czynią badanie NIFTYTM

najbardziej konkurencyjnym na rynku

Jedyne badanie NIPT, które oferuje możliwość wykrycia delecji i aneuploidii chromosomów

płci bez dodatkowych kosztów

Posiada europejski certyfi kat EC Certifi cate – Full Quality Assurance, potwierdzający

spełnienie wymagań dyrektywy 98/79/EC, dotyczącej wyrobów medycznych,

używanych do diagnostyki in vitro

Najbardziej wiarygodne badanie NIPT na rynku dla identyfi kacji trisomii 21, 18 i 13

Badanie wykonywane w Polsce w laboratorium Genomed S.A., najbardziej rekomendowanym, prywatnym centrum

diagnostycznym w Polsce

Opublikowane badania dla 147 000 ciężąrnych, ponad 600 000 testów

NIFTYTM przeprowadzonych na świecie

SPIS TREŚCI

01 Wprowadzenie do testu NIFTYTM

02 Dlaczego NIFTYTM (nieinwazyjne prenatalne badanie

genetyczne – NIPT)?

03 - 05 Nieprawidłowości genetyczne badane w NIFTYTM

06 Opinie profesjonalistów nt. NIPT

07 Badania naukowe a metoda NIFTYTM

08 Wymagania dotyczące próbki i przebieg badania

09 Wskazania do badania

10 Walidacja kliniczna

11 NIFTYTM a inne testy NIPT

12 - 13 Opisy przypadków

14 - 15 Literatura

16 O Genomed S.A.

Odkrycia związane z genetyką

Rozwój technologii genetycznych

Fakty związane z NIFTYTM

1866

1947

1997

2005

2008

1977

1959

1879 1928

1953

1986

2011

2010

2012 2013 2014

Najważniejsze wydarzenia

01.

2015

Wprowadzenie do testu NIFTYTM

W ciągu ostatniej dekady rozwój genetyki oraz olbrzymi postęp technologiczny w badaniach genetycznych zmieniły

naszą zdolność rozumienia chorób, ich diagnozowania oraz stosowania najskuteczniejszego sposobu leczenia. Postęp

ten nastąpił również w dziedzinie badań prenatalnych i dopro wadził do powstania nowego, nieinwazyjnego gene-

tycznego testu prenatalnego NIFTYTM (opartego na analizie wolnego DNA), który bardzo dokładnie określa ryzyko

wystąpienia aneuploidii u płodu.

Test NIFTYTM (Nieinwazyjny Genetyczny Test Prenatalny w Kierunku Trisomii Płodu) jako pierwszy spośród nieinwa-

zyjnych testów prenatalnych, wkroczył w fazę badań klinicz nych w 2010 roku, a w 2013 roku wprowadzony został na

rynek europejski. NIFTYTM określa ryzyko wystąpienia najczęściej występujących trisomii, a także ustala genetyczną

płeć dziecka, wykrywa aneuploidie chromosomów płci i delecje chromosomowe. NIFTYTM określa ryzyko wystąpienia

aneuploidii znacznie dokładniej niż tradycyjne badania przesiewowe, a to pozwala zminimalizować liczbę pacjentek

niepotrzebnie narażonych na badania inwazyjne i zmniejsza ryzyko związanych z nimi poronień.

Do połowy 2015 roku wykonano ponad 600 000 testów NIFTY na świecie. NIFTYTM został stworzony przez BGI Diagno-

stics, fi rmę należącą do BGI, największego na świecie instytutu genomiki. W Polsce NIFTYTM wykonywane jest przez

Genomed S.A. we własnym, wysokoprzepustowym laboratorium o najwyższej klasie czystości.

Na początku 2015 r. opublikowano w “New England Journal of Medicine” wyniki badania oceniającego skuteczność

testu NIFTY przeprowadzonego na grupie 147 000 ciężarnych. To największe jak do tej pory badanie wśród testów

typu NIPT.

Opisanie zespołu Downa

Odkrycie chromosomów

Odkrycie wolnego DNA

krążącego w krwi obwodowej

Odkrycie trisomii 21 jako przyczyny zespołu Downa

Odkrycie struktury podwójnej helisy DNA

Rozwój technologii sekwencjonowania pierwszej generacji

Odkrycie zjawiska krążenia wolnego DNA

płodu w krwi matki

Rozwój technologii sekwencjonowania następnej generacji

Wdrożenie metodologii testu NIFTY™

NIFTY™ jako pierwszy przebadany klinicznie

nieinwazyjny test prenatalny

Liczba przeprowadzonych na świecie testów NIFTY™

przekroczyła 10 000

NIFTY™ uzyskuje akceptację China FDA



Uzupełnienie NIFTY™ o zespoły delecyjne

Pierwszy automatyczny sekwenator

Obsługa klienta: [email protected], +48 22 6446019www.nifty.pl

Odkrycie, że chromosomy są

nośnikami genów



Test NIFTY uzyskał europejski certyfi kat EC Certifi cate – Full Quality Assurance, potwierdzający spełnienie wymagań dyrektywy 98/79/EC, dotyczącej wyrobów medycznych, używanych do diagnostyki in vitro.

Zakończenie transferu technologii. Badanie NIFTY wykonywane jest

w Polsce w laboratorium Genomed S.A.

Dlaczego NIFTYTM (nieinwazyjne prenatalne badanie genetyczne – NIPT)?

Obecnie istnieje wiele możliwości przeprowadzenia badań prenatalnych. Jednak w porównaniu z nie-inwazyjnym prenatalnym badaniem genetycznym (ang. Non Invasive Prenatal Test, NIPT), tradycyjne metody przesiewowe charakteryzują się niską czułością i dużym odsetkiem wyników fałszywie pozytyw-nych. Metody inwazyjne, takie jak amniopunkcja lub biopsja kosmówki (trofoblastu) (CVS), są wiarygod-ne, ale niosą ze sobą 0,5-2% ryzyko poronienia.

Badanie NIFTYTM w porównaniu z tradycyjnymi badaniami przesiewowymi

Obsługa klienta: [email protected], +48 22 6446019 www.nifty.pl

Porównanie poziomu wykrywalności

Porównanie występowania wyników fałszywie pozytywnych

Test zintegrowany

dostępny od 10 tygodnia ciąży >99%

dostępny od 15 tygodnia <96%

Badania biochemiczne I i II trymestr dostępne od 15 tygodnia <88%

Badania biochemiczne II trymestr

dostępne od 15 tygodnia <81%

USG I trymestr (pomiar NT) dostępne od 11 tygodnia <80%

Test zintegrowany <4%

0,05%

Badania biochemiczne I i II trymestr

Badania biochemiczne II trymestr

USG I trymestr (pomiar NT)

<7%

<10%

<9%

NIFTY™ jest najbardziej wiarygodnym, najczęściej wykonywanym na świecie nieinwazyjnym gene-tycznym testem prenatalnym.

02.

99.9%

Podstawowy zakres testu

Wykrywane trisomie

zespół Downa (trisomia 21)

zespół Edwardsa (trisomia 18)

zespół Patau (trisomia 13)

Zaburzenia liczby chromosomów płci

zespół Turnera (monosomia X)

zespół Klinefeltera (XXY)

XXX

XYY

Zespoły delecyjne

zespół „Cri-du-chat” – kociego krzyku (5p)

1p36

zespół Pradera-Williego/Angelmana (15q11.2)

Rozpoznawanie płci

męska/żeńska

Test dostępny jest także w przypadku

Ciąży bliźniaczej (tylko na obecność trisomii)

Ciąży po zapłodnieniu in vitro

Ciąży u biorczyni komórki jajowej

Standardowy czas oczekiwania na wynik to 9 dni roboczych.

Możliwy do przeprowadzenia już od 10. tygodnia ciąży.

Rozszerzony zakres testu* (w cenie badania)

Wykrywane trisomie

trisomia 9

trisomia 16

trisomia 22

zespół Jacobsena (11q23 )

2q33.1

zespół DiGeorge’a 2 (10p14-p13)

zespół Van der Woude (1q32.2)

16p12.2-p11.2

www.nifty.pl03.

Nieprawidłowości genetyczne badane w NIFTYTM

* ze względu na małą liczbę przypadków badania w trakcie walidacji; informacja na wyniku umieszczana za zgodą pacjentki

04.Obsługa klienta: [email protected], +48 22 6446019 www.nifty.pl


TrisomieTrisomia to rodzaj aberracji chromosomowej, polegającej na obecności dodatkowego (trzeciego) chro-mosomu w danej parze chromosomów homologicznych. Trisomie chromosomów 21 (zespół Downa), 18 (zespół Edwardsa), 13 (zespół Patau) są najczęściej występującymi zespołami wad wrodzonych, wy-wołanymi przez obecność dodatkowych kopii chromosomów. Odpowiadają one za wystąpienie cech dysmorfi i, wad wrodzonych i różnego stopnia niepełnosprawności intelektualnej dziecka. Trisomie chromosomów 9, 16 i 22 powodują ciężkie wady rozwojowe płodu, prowadzące w większości przypadków do poronień w I trymestrze ciąży.

Zespoły delecyjneSą to zespoły cech klinicznych, związane z ubytkiem (delecją) fragmentu chromosomu. Lokalizacja i roz-miar delecji warunkuje występowanie i nasilenie różnych objawów klinicznych, związanych z brakiem (delecją) fragmentu chromosomu.Lokalizacja i rozmiar delecji determinują rodzaj i stopień nasilenia objawów klinicznych. U chorych z de-lecjami mogą występować liczne nieprawidłowości, m.in. opóźniony rozwój psychoruchowy, niepełno-sprawność intelektualna, problemy z zachowaniem, nietypowy wygląd (dysmorfi a), zaburzenia napięcia mięśniowego (wiotkość lub spastyczność), zaburzenia wzrastania, odżywiania, padaczka.

5p / Zespół Cri-du-Chat – kociego krzyku:Delecja części krótkiego ramienia chromosomu 5; charakterystycznymi objawami są: mały rozmiar głowy, niska waga urodzeniowa, obniżone napięcie mięśni (hipotonia), opóźnienie rozwoju oraz umiarkowana lub głęboka niepełnosprawność intelektualna. Częste są także problemy z ssaniem i oddychaniem.

1p36:Delecja części krótkiego ramienia chromosomu 1; typowymi objawami są: hipotonia, wrodzone wady serca i innych organów, upośledzenie słuchu. W większości przypadków występuje opóźnienie rozwoju oraz różny stopień niepełnosprawności intelektualnej.

2q33.1:Delecja fragmentu długiego ramienia chromosomu 2; charakterystycznymi objawami są: opóźniony wzrost, behawioralne problemy rozwojowe. Często występują problemy ze ssaniem, ze snem, hipotonia, czasem rozszczep podniebienia.

Zespół DiGeorge’a 2:Delecja fragmentu krótkiego ramienia chromosomu 10; wiele problemów klinicznych, objawy zbliżone do klasycznego zespołu DiGeorge’a, w tym wady serca, niedoczynność przytarczyc, niedobór odporno-ści (niedobór limfocytów T), oraz dysmorfi a twarzy.

16p12.2-p11.2:Delecja krótkiego ramienia chromosomu 16; częsta: dysmorfi a rysów twarzy, problemy z karmieniem, nawracające infekcje uszu, opóźnienie rozwoju i zaburzenia funkcji poznawczych. Mogą występować wady serca i niski wzrost.

Zespół Jacobsena:Delecja końcowego fragmentu długiego ramienia chromosomu 11; typowe cechy: opóźnienie wzrostu, problemy psychomotoryczne, dysmorfi a twarzy i kończyn.

05. Obsługa klienta: [email protected], +48 22 6446019www.nifty.pl

Częstość występowania

na 100 000 urodzeń

0

50

100

150

200

Zesp

ół K

linef

elte

ra (X

XY)

Zesp

ół D

owna

(tris

omia

21)

XYY XX

XZe

spół

Tur

nera

(X)

Zesp

ół E

dwar

dsa

(tris

omia

18)

Del

ecja

1p3

6

Zesp

ół P

atau

(tris

omia

13)

Zesp

ół C

ri-du

-Cha

t (de

lecj

a 5p

)

Del

ecja

2q3

3.1

Zesp

ół V

an d

er W

oude

(1q3

2.2)

Zesp

ół P

rade

ra-W

illie

go/A

ngel

man

a (1

5q11

.2)

Zesp

ół J

acob

sena

(11q

23)

Zesp

ół D

iGeo

rge’

a 2

(10p

14-p

13)

16p1

2.2-

p11.

2

Tris

omia

9, 2

2, 1

6 - n

ajcz

ęsts

ze p

rzyc

zyny

por

onie

ń w

I tr

ymes

trze

cią

ży

Częstość nieznana

Częstość populacyjna nieprawidłowości

genetycznych wykrywanych w NIFTYTM

Zespół Van der Woude:Mutacja w genie IRF6 lub delecja fragmentu długiego ramienia chromosomu 1; zmienne objawy klinicz-ne, częste dołki lub torbiele śluzowe dolnej wargi oraz rozszczep wargi i podniebienia.

Zespół Pradera-Williego/Angelmana:Brak ekspresji genów z fragmentu długiego ramienia chromosomu 15, pochodzącego od ojca, w ok. 70% przypadków spowodowany delecją tego fragmentu (Prader-Willi) lub delecja fragmentu długiego ra-mienia chromosomu 15, pochodzącego od matki (Angelman); zbliżone cechy kliniczne: hipotonia, opóź-niony rozwój psychoruchowy, nieprawidłowa artykulacja mowy oraz niepełnosprawność intelektualna (zazwyczaj lekkiego stopnia).

Aneuploidia chromosomów płciAneuploidia chromosomów płci dotyczy występowania niewłaściwej liczby (większej lub mniejszej) chromosomów płci X lub Y. Większość typów aneuploidii chromosomów płci ma przebieg łagodny, bez zaburzeń rozwoju intelektualnego, konsekwencją niektórych może być niepłodność czy problemy w nauce.



Międzynarodowe Towarzystwo Diagnostyki Prenatalnej

(ISPD) uważa, że nieinwazyjne prenatalne badania gene-

tyczne są pomocne, przy zachowaniu zasad poradnictwa

genetycznego, jako badania przesiewowe u kobiet, dla

których występuje wysokie ryzyko ciąży z trisomią 21.

Nieprawidłowy wynik testu powinien zostać potwierdzo-

ny przy zastosowaniu metody inwazyjnej.

Amerykańskie Stowarzyszenie Doradców Genetycznych

(NSGC) wspiera metodę NIPT jako alternatywę dla pa-

cjentek, których ciąża jest obarczona podwyższonym ry-

zykiem nieprawidłowości chromosomowych. Pacjentki,

dla których wyniki testu NIPT są nieprawidłowe lub które

mają inne czynniki ryzyka wskazujące na nieprawidłowo-

ści chromosomowe u płodu, powinny otrzymać poradę

genetyczną oraz możliwość przeprowadzenia standardo-

wych (inwazyjnych) badań diagnostycznych.

Wprowadzenie metody masywnego równoległego sekwen-

cjonowania umożliwiło zastosowanie nieinwazyjnych te-

stów w praktyce klinicznej, a prowadzone w ostatnich latach

liczne badania dowiodły skuteczności metody w diagnosty-

ce prenatalnej trzech najczęściej występujących trisomii.

Ginekol Pol 2013, 84,714-719.

Opinie profesjonalistów na temat NIPT

Obsługa klienta: [email protected], +48 22 6446019www.nifty.pl07.

Wolny DNA płoduWolny DNA matki

Płód

Łożysko

Naczynie

krwionośne

matki

Badania naukowe a metoda NIFTYTM

Cząsteczki wolnego, pozakomórkowego DNA (cfDNA) to małe fragmenty DNA, które krążą we krwi. Pod-czas ciąży fragmenty DNA pochodzące zarówno od matki, jak i od płodu są obecne w krwiobiegu ciężar-nej. Wolny pozakomórkowy DNA płodu (cff DNA) jest obecny tylko jako mniejszościowa frakcja w osoczu matki, co stanowi wyzwanie techniczne dla niektórych metod NIPT.

Jak działa NIFTYTM?

Test NIFTY wymaga pobrania od ciężarnej niewielkiej objętości krwi (10ml), w której analizowany jest cff DNA w celu określenia nieprawidłowości chromosomowych. Jeśli występuje aneuploidia, podczas badania zostanie wykryte niezrównoważenie genomu płodu, wynikające z nadmiaru lub niedoboru chromosomów.

NIFTY skutecznie rozwiązuje problem pomiaru niewielkich różnic w stężeniu chromosomowego DNA poprzez wykorzystanie wielkoskalowej technologii sekwencjonowania. To znaczy, że podczas badania sekwencjonowane są miliony fragmentów DNA matki i płodu. Przy użyciu techniki sekwencjonowa-nia genomowego oraz czterech różnych, własnych algorytmów analizy bioinformatycznej, NIFTYTM jest w stanie przeanalizować dane z całego genomu i porównując wyniki pomiaru dla chromosomów refe-rencyjnych, wykryć obecność nieprawidłowości genetycznych.

W przeciwieństwie do metod sekwencjonowania stosowanych w innych testach NIPT, metodologia NIFTYTM pozwala na uzyskanie bardzo dokładnych wyników, niezależnie od objawów klinicznych pa-cjenta dla szerokiego zakresu nieprawidłowości: trisomii, aneuploidii chromosomów płci i zespołów delecyjnych.


Wymagania dotyczące próbki

PrzesyłkaRodzaj próbki Objętość Pobranie

Krew matki

10 ml w probówce Streck BTC

Bezpośrednio po pobraniu delikatnie

zamieszaćprobówkę z krwią, obracając 10 razy

Przechowywanie i transport: pionowo

w temp. 6-35˚C, dostarczenie do

laboratorium w ciągu 3 dni (72 godziny)

Przebieg badania

Jednostka kierująca

Konsultacja przed

badaniem

Formularz zamówienia

i zgody

Pobranie krwi

Konsultacja wyniku badania

Badanie laboratoryjne

Analiza danych

Wydanie wyniku

Laboratorium Genomed


Wskazania do badania

Aby przeprowadzić badanie NIFTYTM, ciężarna powinna otrzymać wyczerpujące informacje dotyczące nieinwazyjnego genetycznego badania prenatalnego oraz odbyć konsultacje ze specjalistą genetyki lub ginekologii i położnictwa. Test NIFTYTM jest dostępny od 10. tygodnia ciąży.

NIFTYTM jest właściwym wyborem w następujących sytuacjach:

Wiek ciężarnej powyżej 35 lat

Podejrzenie wystąpienia trisomii 21,18 lub 13 w związku z nieprawidłowymi wynikami USG płodu lub testów biochemicznych

Urodzenie z poprzedniej ciąży dziecka z pełną trisomią chromosomu 21, 18 lub 13

Niepokój rodziców pomimo prawidłowych wyników rutynowych badań przesiewowych

Ciąża po zapłodnieniu in vitro lub u biorcy komórki jajowej

Przeciwwskazania do inwazyjnej diagnostyki prenatalnej, np. łożysko przodujące, zwiększone ryzyko poronienia, infekcja wirusem zapalenia wątroby typu B

Obecność u rodzica zrównoważonej translokacji robertsonowskiej, zwiększającej ryzyko wystąpienia u płodu trisomii 21 lub 13

Należy każdorazowo konsultować z laboratorium możliwość wykonania NIFTYTM, jeżeli:– u ciężarnej występuje aneuploidia, translokacja, delecja lub mikroduplikacja chromosomowa, także

w formie mozaicyzmu,– ciężarna jest po przeszczepie narządu/szpiku,– ciężarna została poddana terapii komórkami macierzystymi,– w ciągu ostatnich 12 miesięcy ciężarna została poddana transfuzji krwi.– w wywiadzie obumarcie płodu(ów) w aktualnej ciąży

Obsługa klienta: [email protected], +48 22 6446019www.nifty.plwww.facebook.com Test NIFTY

Walidacja kliniczna

Walidacja testu NIFTYTM metodą ślepej próby

Trisomia 21 Trisomia 18 Trisomia 13

189 64 10Nieprawidłowy wynik NIFTYTM

Nieprawidłowy kariotyp 188 63 10

100% 100% 100%Czułość NIFTYTM

Swoistość NIFTYTM

Odsetek wyników fałszywie dodatnich

Współczynnik predykcji dodatniej

99,97% 99,97% 100%

0,03% 0,03% 0,0%

99,49% 99,44% 100%

Łącznie 3 464 próbki krwi

3 203 próbki krwi – ciąże z prawidłowym kariotypem płodu

Wynik badania kariotypu.

Wynik testu NIFTYTM Porównanie wyników

261 próbek krwi – ciąże z potwierdzoną trisomią, w tym:

188 - T21 63 - T18 10 - T13

Zaślepienie wyników badania

Wyniki walidacyjne testu NIFTYTM na dużą skalę


NIFTYTM nie jest jedynym dostępnym nieinwazyjnym genetycznym badaniem prenatalnym. W tabeli zawarto charakterystykę dostępnych na polskim rynku produktów NIPT, na podstawie publikacji i danych, podanych przez ich producentów. NIFTYTM wyróżnia się dbałością o najwyższą jakość i dokładność badania oraz najniższym odsetkiem braku możliwości wydania wyniku.

NIFTYTM a inne testy NIPT

NIFTY test (Genomed/BGI)

Harmony test (Ariosa Diagnostics)

IONA test (Medgenetix/Premaitha)

Liczba placówek wykonujących test w Polsce

>200Brak danych i centralnego

rejestru ośrodków wykonujących test

>70

Wynik badania w języku polskim TAK

Tylko tłumaczenie zawartości raportu.

Oryginał wyniku w języku angielskim

TAK

Wynik podpisany przez polskiego diagnostę TAK NIE TAK

Miejsce wykonania Polska USA Polska

Technologia

sekwencjonowanie nowej generacji (ang. Next

Generation Sequencing, NGS), losowe fragmenty ze wszystkich chromosomów

Aktualnie mikromacierz DNA

Brak publikacji naukowych potwierdzających rodzaj przeprowadzanej analizy

Zakres testu18 zespołów wad

wrodzonych8 zespołów wad

wrodzonych3 zespoły wad wrodzonych

Dostępny od 10 tc 10 tc 10 tc

Ciąża bliźniacza TAK TAK NIE

Aneuploidia chromosomów płci TAK TAK NIE

Informacja o płci płodu TAK TAK TAK

Zespoły delecji/duplikacji TAK TAK NIE

Triploidia NIE NIE NIE

Biorczyni komórki jajowej TAK TAK NIE

Objętość próbki 10 ml 2x10 ml 10 ml

Czas otrzymania wyniku (dni robocze) 7-9 dni 9-11 dni 10 dni

Raport o % cff DNA (próg czułości) NIE (3.5%) TAK (4%) NIE

Posiadane certyfi katy CE IVD CLIA Accreditation CE IVD

Publikacje naukowe na temat skuteczności metody na populacjach większych niż 100 000 pacjentek

TAKNIE (dostępne publikacji naukowe na mniejszych

grupach pacjentek)

Brak publikacji naukowych potwierdzających walidację

testu

Liczba przeprowadzonych testów >600 000 >400 000 >402 (deklaracja producenta)

Liczebność największej opublikowanej grupy badanej

112 669* 15 841** Brak publikacji

Czułość T21 (liczba przypadków) 99,17% (726) 100,00%(38) Brak publikacji

Czułość T18 (liczba przypadków) 98,24% (170) 90,00%(10) Brak publikacji

Czułość T13 (liczba przypadków) 100% (22) 100,00%(2) Brak publikacji

Swoistość T21 99,95% >99,9% Brak publikacji



Dokładność oznaczenia płci 98,00% 99,00% nie dotyczy

Wartość predykcyjna dodatnia (Positive predictive value – PPV) uśredniona dla T21, T18 i T13

87% 81% Brak publikacji

Odsetek wyników fałszywie pozytywnych 0,14% 0,09% Brak publikacji

Odsetek wyników fałszywie negatywnych <0.01% <0.1% Brak publikacji

Konieczność powtórnego pobrania krwi 2,2%3,5% (deklaracja

producenta)Brak publikacji

Brak wyniku 0,07% 3,0% 1.2% (deklaracja producenta)

* Ultrasound Obstet Gynecol 2015; 45: 530–538** N Engl J Med 2015; 372:1589-1597, dane uzyskane metodą NGS

Obsługa klienta: [email protected], +48 22 6446019 www.nifty.pl

44–letnia ciężarna (w trzeciej ciąży, dwa porody) przeszła rutynowe badanie przesiewowe USG I trymestru, w wyniku którego ryzyko wystąpienia trisomii 21 określono na poziomie 1/153 (ryzyko wysokie, obniżone w stosunku do podstawowego). Kobieta w 23tc wykona-ła badanie NIFTYTM, którego wynik wykazał, że ryzyko wystąpienia trisomii 21 u płodu jest bardzo wysokie (wynik poniżej). Obecność trzeciego chromosomu 21 została potwierdzona badaniem kariotypu po kordocentezie.

Opisy przypadków

NZOZ Genomed -badanie genetycznych predyspozycji do chorób dziedzicznych i nowotworów. Poradnia genetyczna.Warszawa, ul. Ponczowa 12, tel. 644 60 19, www.genomed.pl

Nieinwazyjne prenatalne badanie genetyczne – wynik analizy cffDNA

Dane pacjentkimi i nazwis o pacjent i xxxxxxxxxxxxx

P xxxxxxxxxxx

od prób i 15B67xxxxx

odzaj badania NIFTY

ata pobrania 16-01-2015

ata otrzymania materia u 16-01-2015

Wie ci y w dniu pobrania 23tc+1d

Placów a ieruj ca Genomed SA

Wynik:nieprawid wy – wy kie ryzyk tri ii

yzy o trisomii 21 1/1,01

yzy o trisomii18 1/247362

yzy o trisomii13 1/ 234868339

iczba chromosomów p ci prawid owa P e p odu e s a

Zespó delecyjny p, 1p 6, 2 .1 nie stwierdzono

Interpretacja:Stwierdzono wysokie ryzyko trisomii chromosomu 21, co ws azuje na mo liwo wyst powania u p odu zespo u Downa.

PPV dodatnia warto predy cyjna badania N dla 21 wynosi 92%*.

Konieczna jest wizyta w Poradni Genetycznej.

e omendowane jest wy onanie inwazyjnego badania diagnostycznego w celu wery i acji wyni u, lub wy onanie badania ariotypu postnatalnie.

Uwagi: – PP o re la, z ja im prawdopodobie stwem u p odu wyst puje wada, tórej wyso ie ryzy o zosta o wy azane w badaniu wyso ie ryzy o wyst puje dla wspó czynni a ryzy a 1 20

Data 28-01-2015 Zatwierdzi

N O OG N adanie genetyczne w ierun u ryzy a trisomii 21, 18 i 13 chromosomu, delecji 5p, 1p36 i 2q33.1 oraz nieprawid owo ci liczbowych w za resie chromosomów p ci wy onano z wolnego DN p odu c DN pozys anego z rwi ci arnej, zwy orzystaniem testu N w laboratorium Genomed. Nie mo na wy luczy obecno ci u p odu aberracji chromosomowych innych nibadane.N jest bardzo do adnym testem szacowania ryzy a, ale N jest badaniem diagnostycznym. zu o badania 21-99,1 , 18-98,24%,

13-100%, swoisto 99,95% . Do adno oszacowania p ci 98%. Nie mo na zapewni wiarygodno ci wyni u, je li u ci arnej zosta a wy onana trans uzja rwi w ci gu ostatnich 12 miesi cy , przeszczep narz du, immunoterapia lub terapia z wy orzystaniem omóre macierzystych. Wiarygodno wyni u obni aj ta e aberracja chromosomowa u ci arnej oraz mozaicyzm chromosomowy o ys a.

12.

13. Obsługa klienta: [email protected], +48 22 6446019www.nifty.pl

38-letnia ciężarna (pierwsza ciąża) przeszła rutynowe badania przesiewowe (USG i bioche-miczne), w wyniku których ryzyko wystąpienia trisomii 21 określono na poziomie 1/8 (bardzo wysokie ryzyko), a trisomii 13 na 1/364 (wysokie ryzyko). Kobieta wykonała w 16tc badanie NIFTYTM, którego wynik wykazał, że ryzyko wystąpienia u płodu każdej z badanych trisomii jest niskie (wynik poniżej). Kobieta urodziła zdrowe dziecko.

NZOZ Genomed -badanie genetycznych predyspozycji do chorób dziedzicznych i nowotworów. Poradnia genetyczna.Warszawa, ul. Ponczowa 12, tel. 644 60 19, www.genomed.pl

Nieinwazyjne prenatalne badanie genetyczne – wynik analizy cffDNA

Dane pacjentkimi i nazwis o pacjent i xxxxxxxxxxxxx

P xxxxxxxxxxx

od prób i 14B67xxxxx

odzaj badania NIFTY

Data pobrania 09-06-2014

Data otrzymania materia u 09-06-2014

Wie ci y w dniu pobrania 15tc+5d

Placów a ieruj ca Genomed SA

Wynik:prawid wyyzy o trisomii 21 1/1093602295



iczba chromosomów p ci prawid owa P e p odu m s a

Zespó delecyjny5p, 1p36, 2q33.1 nie stwierdzono

Interpretacja:Nie stwierdzono odwy szone o ryzyka trisomii chromosom w 21, 18 u 13 ary ani nieprawid owo ci w za resie liczby chromosomów p ci. W badaniu pilota owym nie stwierdzono obecno ci delecji 5p, 1p36 ani 2q33.1. Badanyp ód jest p ci m s iej.

e omendowane jest omówienie wyni u badania ze specjalist genety i lub gine ologii i po o nictwa, w onte cie pozosta ych wyni ów bada wy onywanych w ci y, zw aszcza bada G.

Uwagi: braData 28-06-2014 Zatwierdzi

N O OG N Badanie genetyczne w ierun u ryzy a trisomii 21, 18 i 13 chromosomu, delecji 5p, 1p36 i 2q33.1 oraz nieprawid owo ci liczbowych w za resie chromosomów p ci wy onano z wolnego DN p odu c DN pozys anego z rwi ci arnej, zwy orzystaniem testu N w laboratorium Genomed. Nie mo na wy luczy obecno ci u p odu aberracji chromosomowych innych nibadane.N jest bardzo do adnym testem szacowania ryzy a, ale N jest badaniem diagnostycznym. zu o badania 21-99,1 %, 18-98,24%,

13-100%, swoisto 99,95% . Do adno oszacowania p ci 98%. Nie mo na zapewni wiarygodno ci wyni u, je li u ci arnej zosta a wy onana trans uzja rwi w ci gu ostatnich 12 miesi cy , przeszczep narz du, immunoterapia lub terapia z wy orzystaniem omóre macierzystych. Wiarygodno wyni u obni aj ta e aberracja chromosomowa u ci arnej oraz mozaicyzm chromosomowy o ys a.

Obsługa klienta: [email protected], +48 22 6446019 www.nifty.pl 14.

Literatura

A: Metodologia

1. Chiu RW, et al. Non-invasive prenatal assessment of trisomy 21 by multiplexed maternal plasma DNA sequencing: large scale validity study. BMJ. 2011; 342:c7401, doi:10.1136/bmj.c7401.

2. Chen EZ, et al. Non-invasive prenatal diagnosis of fetal trisomy 18 and trisomy 13 by maternal plasma DNA sequencing. PLoS One. 2011;6(7):e21791. doi:10.1371/journal.pone.0021791.

3. Dan S, et al. Prenatal detection of aneuploidy and imbalanced chromosomal arrangements by massi-vely parallel sequencing. PLoS One. 2012;7(2):e27835.

4. Fuman Jiang, et al. Non-invasive Fetal Trisomy (NIFTY) test: an advanced non-invasive prenatal diag-nosis methodology for fetal autosomal and sex chromosomal aneuploidies. BMC Med Genomics. 2012 Dec 1;5:57.

5. Yuan Y, et al. Feasibility study of semiconductor sequencing for noninvasive prenatal detection of fetal aneuploidy. Clin Chem. 2013 May; 59(5):846-9.

6. Chen S, et al. A method for noninvasive detection of fetal large deletions/duplications by low covera-ge massively parallel sequencing. Prenat Diagn. 2013 Jun;33(6):584-90.

B: Walidacja kliniczna

7. Lau TK, et al. Non-invasive prenatal diagnosis of common fetal chromosomal aneuploidies by mater-nal plasma DNA sequencing. J Matern Fetal Neonatal Med. 2012 Aug; 25(8):1370-4.

8. Dan S, et al. Clinical application of massively parallel sequencing-based prenatal noninvasive fetal trisomy test for trisomies 21 and 18 in 11,105 pregnancies with mixed risk factors. Prenat Diagn. 2012 Dec;32(13):1225-32.

9. Lau TK, et al. Clinical utility of non-invasive fetal trisomy (NIFTY) test--early experience. J Matern Fetal Neonatal Med. 2012 Oct;25(10):1856-9.

10. Lau TK, et al. Non-invasive prenatal screening of fetal sex chromosomal abnormalities: perspective of pregnant women. J Maternal Fetal Neonatal Med. 2012 Dec;25(12):2616-9.

11. Lau TK, Cheung SW, Lo PS, et al. Non-invasive prenatal testing for fetal chromsomal abnormalities by low-coverage whole-genome sequencing of maternal plasma DNA: review of 1982 consecutive cases in a single center. Ultrasound Obstet Gynecol. 2014 Mar;43(3):254-64

12. Y ao H, Jiang F, Hu H, et al., Detection of Fetal Sex Chromosome Aneuploidy by Massively Parallel Sequencing of Maternal Plasma DNA: Initial Experience in a Chinese Hospital. Ultrasound Obstet Gynecol. 2014 Mar 10. doi: 10.1002/uog.13361. [Epub ahead of print]

13. Zhou Q, Pan L, Chen S, et al. Clinical application of noninvasive prenatal testing for the detection of trisomies 21, 18, and 13: a hospital experience. Prenat Diagn. 2014 Jun 4. doi: 10.1002/pd.4428. [Epub ahead of print]

14. Zhang, Hongyun, et al. “Non-invasive prenatal testing for trisomies 21, 18 and 13: clinical experience from 146 958 pregnancies.” Ultrasound in Obstetrics & Gynecology 45.5 (2015): 530-538.

15. Cheung, Sau W., Ankita Patel, and Tak Y. Leung. “Accurate description of DNA-based noninvasive pre-natal screening.” New England Journal of Medicine 372.17 (2015): 1675-1677.

www.bgidx.com NIFTY test BGI Diagnostic@niftytest_

C: Opisy przypadków

14. Yao H, et al. Non-invasive prenatal genetic testing for fetal aneuploidy detects maternal trisomy X. Prenat Diagn. 2012 Nov;32(11):1114-6.

15. Choi H, et al. Fetal aneuploidy screening by maternal plasma DNA sequencing: ‘false positive’ due to confi ned placental mosaicism. Prenat Diagn. 2013 Feb;33(2):198-200.

16. Pan M, Li FT, Li Y, et al. Discordant results between fetal karyotyping and non-invasive prenatal testing by maternal plasma sequencing in a case of uniparental disomy 21 due to trisomic rescue. Prenat Diagn. 2013 Jun;33(6):598-601.1

17. Lau TK, Jiang FM, Stevenson RJ et al. Secondary fi ndings from non-invasive prenatal testing for common fetal aneuploidies by whole genome sequencing as a clinical service. Prenat Diagn. 2013 Jun;33(6):602-8.

18. Gao Y, Stejskal D, Jiang F, Wang W. A T18 false negative result by NIPT in a XXX, T18 case due to placen-tal mosaicism. Ultrasound Obstet Gynecol. 2013 Nov 1.

D: Ciąże bliźniacze

19. Huang X, et al. Non-invasive prenatal screening of fetal Down syndrome by maternal plasma DNA sequencing in twin pregnancies. J Matern Fetal Neonatal Med. 2013 Mar;26(4):434-7.

20. Jing Zheng. et al. Eff ective Non-invasive Zygosity Determination by Maternal Plasma Target Region Sequencing. PLOS ONE. 2013: 8 (6):e65050

Genomed SA to:

polska innowacyjna fi rma, działająca z sukcesem na rynku diagnostyki molekularnej oraz usług

i projektów badawczo-rozwojowych

wykorzystuje nowoczesne metody sekwencjonowania i syntezy DNA

wprowadza produkty i usługi diagnostyczne oparte na Sekwencjonowaniu Następnej Generacji

(ang. Next Generation Sequencing, NGS)

istnieje od 2007r., od 2011r. notowana na GPW na rynku NewConnect

Główne obszary działalności:

odczytywanie i przetwarzanie informacji zawartej w DNA

najnowsze technologie sekwencjonowania DNA wykorzystywane w:

medycznej diagnostyce molekularnej

nowotworów i predyspozycji do ich rozwoju

chorób uwarunkowanych genetycznie

niepłodności

badaniach przesiewowych

diagnostycznej analizie genomów realizacji usług i projektów badawczo-rozwojowych dla instytutów naukowo-badaw-

czych i fi rm biotechnologicznych

pierwsza w Warszawie prywatna poradnia genetyczna, otwarta w 2010 r. (konsultacje płatne)

aktywna działalność badawczo-rozwojowa w dziedzinie biotechnologii i medycyny spersonalizo-

wanej

w przyszłości – uruchomienie kliniki terapii genowych

Obsługa klienta: [email protected], +48 22 6446019www.facebook.com /Genomedpl/Test NIFTY www.genomed.pl

Szanowni Państwo!

Bardzo dziękujemy za zainteresowanie naszą ofertą dotyczącą testu NIFTY™. Jeśli chcą Państwo wykony-

wać badanie NIFTY™ dla swoich pacjentek, prosimy o zarejestrowanie się w serwisie służącym do obsługi

tego testu pod adresem: www. nifty.genomed.pl.

Rejestracja jest bardzo prosta, wymaga podania podstawowych danych. Po zarejestrowaniu wyślemy

Państwu zestawy pobraniowe NIFTY™. Wzór umowy i informacje dotyczące testu NIFTY™ są również

dostępne po zalogowaniu w serwisie: www.nifty.genomed.pl.

Możliwość wykrycia 18 zespołów wad wrodzonych

Documents

Transcript of Możliwość wykrycia 18 zespołów wad wrodzonych