Porównanie enzymatycznych metod redukcji z metodami ... · Utleniania. 3. Hydrolizy estrów. 4....
Transcript of Porównanie enzymatycznych metod redukcji z metodami ... · Utleniania. 3. Hydrolizy estrów. 4....
Porównanie enzymatycznych metod redukcji z
metodami redukcji klasycznej chemii
organicznej
Instrukcja do zajęć laboratoryjnych z przedmiotu
Chemia Bioorganiczna i Bionieorganiczna
Dla studentów kierunku Chemia specjalność Chemia Bioorganiczna
Opracowanie: mgr inż. Roman Komor
Materiały zostały wykonane w ramach realizowanego na Politechnice Śląskiej projektu nr UDA-POKL.04.01.01-00-114/09-01 pt.: „Unowocześnienie i rozszerzenie oferty edukacyjnej na kierunku Chemia na Wydziale Chemicznym Politechniki Śląskiej – otwarcie specjalności Chemia Bioorganiczna” współfinansowanego ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego.
Porównanie enzymatycznych metod redukcji z metodami redukcji klasycznej chemii organicznej
1
CEL ĆWICZENIA
Wykonanie ćwiczenia będzie polegało na przeprowadzeniu redukcji grupy karbonylowej w 2-metyloacetylooctanie etylu, redukcji podwójnego wiązania węgiel-węgiel w α-metylo-β-(2-furylo)akroleinie oraz redukcji grupy nitrowej w 1,2-dinitrobenzenie z zastosowaniem drożdży piekarniczych oraz innych odpowiednich chemicznych metod redukcji. Po wydzieleniu i analizie otrzymanych produktów zostanie dokonane porównanie tych metod.
PODSTAWY TEORETYCZNE Drożdże piekarnicze to powszechna nazwa szczepów drożdży używanych jako
spulchniacze w przemyśle piekarniczym. Należą one do gatunku Saccharomyces cerevisiae, podobnie jak gatunki używane do przeprowadzania fermentacji alkoholowej w przemyśle browarniczym i gorzelnianym. Pierwsze transformacje z udziałem mikroorganizmów (w tym drożdży) były przeprowadzane już w starożytnym Egipcie przy wyrobie chleba, produktów mlecznych i alkoholu. Ich wykorzystanie w syntezie organicznej miało miejsce już ponad sto lat temu – w 1874 roku Dumas zaobserwował wydzielanie się siarkowodoru po dodaniu siarki do zawiesiny drożdży w roztworze cukru. Redukcja furfuralu do alkoholu furfurylowego była pierwszą opisaną reakcją cząsteczki organicznej.
Na przestrzeni kolejnych lat drożdże zyskały coraz większe znaczenie w syntezie głównie ze względu na ich powszechną dostępność, niską cenę i łatwość zastosowania. Reakcje z ich udziałem dają zwykle produkty enancjomerycznie czyste. Dużą ich zaletą jest również fakt, że do przeprowadzenia reakcji z ich użyciem nie jest wymagana znajomość mikrobiologii. Drożdży piekarniczych używa się przede wszystkim jako całych komórek. Niestety, nie do pominięcia są w takim przypadku efekty związane ze stopniem penetracji i dyfuzji substratów do wnętrza komórek oraz produktów z wnętrza komórek do otaczającego je środowiska. Również mnogość enzymów występujących w komórkach drożdży powoduje powstawanie ubocznych produktów, które jednak zwykle powstają w niewielkich ilościach jeśli zachowane są odpowiednie warunki fermentacji. Wpływ na aktywność poszczególnych enzymów, a co za tym idzie kierunek reakcji oraz jej chemo- i enancjoselektywność mają następujące czynniki:
− poziom pH,
− temperatura,
− skład i postać pożywki,
− czas reakcji,
− stężenie substratu,
− stosunek biomasa/substrat,
− immobilizacja enzymu (komórek),
− obecność inhibitorów i stymulatorów,
− warunki wzrostu,
− przygotowanie mieszaniny. Najlepszym rozwiązaniem byłoby zastosowanie oczyszczonych enzymów, jednak ze
względu na niekiedy bardzo wysoką cenę ich użycie ogranicza się jedynie do zastosowań laboratoryjnych. Najczęściej napotykane problemy podczas przeprowadzania biotransformacji z udziałem drożdży zostały przedstawione na Schemacie 1. Podane rozwiązania nie ograniczają się jedynie do reakcji prowadzonych w małej skali. Są stosowane z powodzeniem w skali przemysłowej.
Obecnie biotransformacje przy użyciu mikroorganizmów stosuje się (lub próbuje się zastosować) wszędzie tam, gdzie dany etap reakcji jest trudny do pokonania przy
Porównanie enzymatycznych metod redukcji z metodami redukcji klasycznej chemii organicznej
2
zastosowaniu metod klasycznej chemii organicznej. Drożdże piekarnicze można zastosować m.in. w procesach rozdzielania racematów, selektywnego przekształcania jednej spośród wielu grup funkcyjnych cząsteczki związku chemicznego o podobnej reaktywności, wprowadzania centrum asymetrii i funkcjonalizacji łańcucha węglowego.
Schemat 1 W chemii organicznej drożdże piekarnicze stosuje się najczęściej w czterech typach reakcji:
1. Tworzenia wiązania węgiel-węgiel.
2. Utleniania.
3. Hydrolizy estrów.
4. Redukcji. W tej grupie możemy wyróżnić reakcje redukcji β-ketoestrów i innych pochodnych ketokwasów, β-diketonów, α-hydroksyaldehydów i α,β-hydroksyketonów do α,β-dioli, związków zawierających wiązanie C=C, aromatycznych i nienasyconych ketonów oraz związków nitrowych.
Porównanie enzymatycznych metod redukcji z metodami redukcji klasycznej chemii organicznej
3
Reakcje redukcji z użyciem drożdży wymagają obecności węglowodanów (niekiedy dodaje się etanolu i przedmuchuje tlenem) oraz wydajnego mieszania. W takich warunkach mikroorganizmy zużywają cukier jako źródło energii potrzebne do regeneracji koenzymu. Redukcja przez reduktazy jest ściśle związana z systemami odnawiania NADPH z jego postaci utlenionej (NADP+) (Schemat 2). W związku z tym nie jest konieczne dodawanie kofaktora do środowiska reakcji, ponieważ znajduje się on we wnętrzu komórek drożdżowych.
Schemat 2
Gdy zamiast cukru użyje się alkoholu, regeneracja następuje przez utlenianie go do aldehydu i następnie kwasu. Otrzymuje się wtedy protonowaną postać koenzymu, która może być zawrócona do reakcji redukcji. Badania wykazały, że zmiana węglowodanu na alkohol etylowy nie ma znaczącego wpływu na wydajność i czystość optyczną produktów.
Redukcja związków karbonylowych
W klasycznej chemii organicznej, podobnie jak w chemii nieorganicznej, pojęcie redukcja oznacza proces, w którym substrat zostaje obdarzony elektronami. Reakcje redukcji ketonów do alkoholi można przeprowadzić na kilka sposobów, a najpopularniejsze odczynniki stosowane w tym procesie to:
• Wodorki metali. Najczęściej używanymi związkami są glinowodorek litu (LiAlH4) oraz borowodorek sodu (NaBH4). Reakcja z użyciem LiAlH4 jest mało selektywna - poza grupą karbonylową redukowane są także inne grupy obecne w substracie np. NO2, CN, COOR itd. Borowodorek sodu wykazuje większą selektywność i nie redukuje grup takich jak nitrowa czy halogenowa. Dodatkową jego zaletą jest możliwość stosowania w roztworach wodnych. Wodorki metali nie uwodorniają podwójnych ani potrójnych wiązań węgiel – węgiel (za wyjątkiem wiązań C=C sprzężonych z grupą COOR).
Porównanie enzymatycznych metod redukcji z metodami redukcji klasycznej chemii organicznej
4
Reagent Preferowany
rozpuszczalnik Substrat → produkt
Przerób mieszaniny
reakcyjnej
NaBH4
Etanol i jego wodne roztwory, roztwory NaOH, należy unikać mocnych kwasów
Aldehyd→1o alkohol Keton → 2o alkohol Obojętny dla większości grup funkcyjnych
Łatwa neutralizacja Łatwa ekstrakcja produktu
LiAlH4
Eter dietylowy, THF, należy unikać mocnych kwasów, fluorowców, alkoholi i amin
Aldehyd → 1o alkohol Keton → 2o alkohol Kwas → 1o alkohol Ester → alkohol Epoksyd -> alkohol
Ostrożnie dodawać wodę Należy usunąć sole glinu
• Wodór gazowy i katalizator metaliczny (platyna, ruten, pallad, nikiel itp.). To rozwiązanie obciążone jest najmniejszą selektywnością – w tych warunkach zredukowane zostają także wiązania wielokrotne.
• Etanolan sodu w alkoholu etylowym. Stosowana zanim odkryto LiAlH4, częściej używana do redukcji estrów niż ketonów.
• Diborowodór (B2H6). Sam odczynnik jest bardzo reaktywny. Najczęściej syntezuje się go bezpośrednio przed dodaniem do środowiska reakcji. Redukuje również wiązania wielokrotne obecne w cząsteczce
Opisane układy przez lata zyskały wiele modyfikacji. Ich najczęstszym celem było uzyskanie chemoselektywności reakcji. Uzyskuje się ją dzięki stosowaniu różnych warunków: kombinacji metal - jon wodorkowy, różnym katalizatorom i rozpuszczalnikom. Jednakże stosowane wodorki metali, jak i katalizatory metaliczne są drogim i nierzadko niewygodnym w pracy surowcem. Także praca z wodorem niesie za sobą niebezpieczeństwo wybuchu.
Redukcja wiązania podwójnego węgiel-węgiel
Redukcję wiązania podwójnego węgiel-węgiel najczęściej i najłatwiej przeprowadza
się używając do tego celu gazowego wodoru i katalizatora heterogenicznego (Rh/C, Pd/C, nikiel Raney’a) lub tlenków metali (PtO2) w kombinacji z różnymi rozpuszczalnikami (acetonitryl ,woda, THF, metanol, octan etylu). Niestety, nie można ich stosować jeśli w cząsteczce obecne są grupy zabezpieczające (benzylowa, benzoilowa, alliloksykarbonylowa). Redukują one także grupę nitrową, ketony benzylowe i arylowe pochodne fluorowców.
Redukcja grupy nitrowej
W reakcjach redukcji grupy nitrowej najczęściej stosowane są:
• Katalizator metaliczny (Zn, Sn, Fe i inne) w obecności kwasu.
• Siarczki (NaHS, (NH4)2S).
• Hydrazyna w obecności katalizatora.
• Glinowodorek litu LiAlH4. Powstają zanieczyszczenia w postaci oksymów i hydroksyloamin.
Porównanie enzymatycznych metod redukcji z metodami redukcji klasycznej chemii organicznej
5
W reakcjach redukcji grupy nitrowej w związkach aromatycznych oprócz wyżej wymienionych reagentów stosuje się również:
• Siarczek sodu Na2S. Selektywnie redukuje grupy nitrowe przy pierścieniu aromatycznym nie redukując przy tym grup nitrowych przyłączonych do łańcucha węglowego związku.
• Nikiel elektrochemiczny. Elektrochemicznie generowany nikiel selektywnie redukuje aromatyczne grupy nitrowe, nie redukując obecnych w związku ugrupowań alkenylowych, alkinylowych, cyjanowych, formylowych, halogenowych i benzoksylowych.
• Związki samaru. Selektywne w stosunku do grup nitrowych.
• Ditionian sodu Na2S2O4.
• Chlorek tytanu TiCl3
Porównanie enzymatycznych metod redukcji z metodami redukcji klasycznej chemii organicznej
6
PRZEBIEG ĆWICZENIA
Redukcja grupy karbonylowej Część A: Redukcja 2-metyloacetylooctanu etylu przy użyciu drożdży piekarniczych
Ta część ćwiczenia obejmuje reakcję redukcji 2-metyloacetylooctanu etylu przy użyciu drożdży piekarniczych prowadzącą do mieszaniny (2R,3S) i (2S,3S)-3-hydroksy-2-metylomaślanu etylu w stosunku izomerów 3:1 (Schemat 3).
Schemat 3 Odczynniki:
• 2-metyloacetylooctan etylu (0,50 g; 3,85 mmol)
• drożdże piekarnicze Saccharomyces
cerevisiae (30 g*)
• sacharoza (7,5 g)
• woda destylowana (100 cm3)
• Celite®
• etanol (1 cm3)
• octan etylu
• 2 M wodny roztwór wodorotlenku sodu
• chlorek sodu
• bezwodny siarczan(VI) magnezu
• eter naftowy
• eter dietylowy * Jeżeli używane są drożdże z pożywką należy doliczyć 50% masy
Szkło i inne materiały oraz potrzebny sprzęt laboratoryjny:
• łaźnia wodna
• cieplarka
• wyparka rotacyjna
• kolba stożkowa 500 cm3
• zlewka 25 cm3
• kolba okrągłodenna 250 cm3
• lejek Büchnera
• kolba ssawkowa 250 cm3
• cylinder 100 cm3
• rozdzielacz 500 cm3
• lejek
• pipeta
• płytki TLC
• komora chromatograficzna
• łyżka
• bagietka
• bibuła filtracyjna
• wata
• papierek uniwersalny Wykonanie ćwiczenia:
1. Drożdże, sacharozę oraz wodę umieszcza się w kolbie stożkowej (500 ml) i zatyka wylot kolby watą, a następnie umieszcza w łaźni wodnej (30°C) na około 20 minut w celu zapoczątkowania fermentacji. Co jakiś czas energicznie miesza się zawartość kolby.
Porównanie enzymatycznych metod redukcji z metodami redukcji klasycznej chemii organicznej
7
2. 2-Metyloacetylooctan etylu rozpuszcza się w 1 cm3 etanolu i dodaje jednorazowo do kolby z fermentującymi drożdżami. Mieszaninę reakcyjną pozostawia się w cieplarce na 48h w temperaturze 30°C.
3. Zakładając odpowiedni stopień przereagowania, reakcję przerywa się doprowadzając mieszaninę do temperatury pokojowej. Następnie dodaje się 2 łyżki celitu i dokładnie miesza. Tak przygotowaną mieszaninę pozostawia się na ok. 30 minut od czasu do czasu mieszając.
4. Zawiesinę drożdży odsącza się na lejku Büchnera przez 3 mm złoże celitu. Operację powtarza się, jeśli w przesączu stwierdzi się obecność drożdży. Przesącz zobojętnia się przy użyciu 2 M wodnego roztworu NaOH. Tak powstały żółty filtrat poddaje się ekstrakcji octanem etylu (4x60 ml). W przypadku trudności z rozdzielaniem warstw, mieszaninę wysala się lub/oraz odwirowuje w wirówce laboratoryjnej.
5. Zlane ekstrakty organiczne suszy się nad bezwodnym siarczanem(VI) magnezu, który odsącza się na lejku z sączkiem karbowanym, a przesącz odparowuje w wytarowanej kolbie okrągłodennej na wyparce rotacyjnej do uzyskania żółtej pozostałości.
6. Przebieg reakcji sprawdza się metodą TLC. W tym celu pobiera się próbkę mieszaniny reakcyjnej i rozcieńcza ją w octanie etylu (ok. 25 mg/ml). Jako układ rozwijający stosuje się mieszaninę eter naftowy - eter dietylowy 3:1 (v/v). Jako wzorzec stosuje się roztwór substratu. Płytki obserwuje się pod lampą UV.
7. Surowy produkt można oczyścić metodą chromatografii kolumnowej. Jako wypełnienie kolumny stosuje się żel krzemionkowy, a jako eluent układ eter naftowy - eter dietylowy 3:1 (v/v).
Część B: Redukcja 2-metyloacetyooctanu etylu przy użyciu borowodorku sodu w metanolu
Ta część ćwiczenia obejmuje redukcję 2-metyloacetylooctanu etylu przy użyciu borowodorku sodu w metanolu prowadzącą do mieszaniny 2-metylobutano-1,3-diolu oraz 3-hydroksy-2-metylomaślanu etylu (Schemat 4).
Schemat 4
Odczynniki:
• 2-metyloacetylooctan etylu (0,50 g; 3,85 mmol)
• metanol (20 cm3)
• borowodorek sodu (0,43 g; 11,5 mmol)
• 5 M wodny roztwór kwasu solnego
• żel krzemionkowy
• metanol
• chloroform
• solanka
Szkło i inne materiały oraz potrzebny sprzęt laboratoryjny:
• mieszadło magnetyczne
• wyparka rotacyjna
• kolba okrągłodenna 50 cm3
• cylinder 50 cm3
• rozdzielacz
• pipeta
• płytki TLC
• komora chromatograficzna
• łyżka
• papierek uniwersalny
Porównanie enzymatycznych metod redukcji z metodami redukcji klasycznej chemii organicznej
8
Wykonanie ćwiczenia: 1. W kolbie okrągłodennej umieszcza się metanol oraz 2-metyloacetylooctan etylu
i miesza na mieszadle magnetycznym. Do kolby dodaje się borowodorku sodu w trzech równych porcjach co 1 minutę.
2. Po 5, 10, 20 i 30 minutach reakcji pobiera się próbkę mieszaniny reakcyjnej, rozcieńcza w niewielkiej ilości octanu etylu i nakłada na płytkę TLC wraz z wzorcem substratu. Jako układ rozwijający stosuje się mieszaninę eter naftowy - eter dietylowy 3:1 (v/v).
3. Po stwierdzeniu całkowitego przereagowania substratu, mieszaninę doprowadza się do pH 6 przy użyciu 5 M kwasu solnego.
4. Rozpuszczalnik odparowuje się na wyparce rotacyjnej do uzyskania jasnobrązowej pozostałości, którą rozpuszcza się w niewielkiej ilości metanolu i przepuszcza przez 3 cm warstwę żelu krzemionkowego. Produkt wymywa się układem metanol - chloroform 1:4 (v/v).
5. Surowy produkt można oczyścić metodą chromatografii kolumnowej. Jako wypełnienie kolumny stosuje się żel krzemionkowy, a jako eluent układ heksan -octan etylu.
Redukcja podwójnego wiązania węgiel-węgiel Część A: Redukcja α-metylo-β-(2-furylo)akroleiny przy użyciu drożdży piekarniczych
Ta część ćwiczenia obejmuje reakcję redukcji α-metylo-β-(2-furylo)akroleiny przy użyciu drożdży piekarniczych prowadzącą do nasyconego alkoholu (Schemat 5).
Schemat 5
Mechanizm tej reakcji jest trójetapowy: redukcja – utlenianie – redukcja. Wyjściowy aldehyd pozostaje w równowadze z pochodną alkoholu allilowego, przy czym równowaga jest przesunięta w stronę alkoholu. Jednakże już małe (równowagowe) ilości α-metylo-β-(2-furylo)akroleiny ulegają powolnej trans-addycji wodoru w poprzek wiązania podwójnego, do nasyconego aldehydu. Nasycony aldehyd jest wówczas szybko redukowany do nasyconego alkoholu.
Porównanie enzymatycznych metod redukcji z metodami redukcji klasycznej chemii organicznej
9
Odczynniki:
• α-metylo-β-(2-furylo)akroleina (0,45 g; 3,30 mmol)
• drożdże piekarnicze Saccharomyces
cerevisiae (12 g*)
• glukoza (4 g)
• woda destylowana (80 cm3)
• Celite®
• etanol (2 cm3)
• octan etylu
• nasycony roztwór węglanu sodu
• chlorek sodu
• bezwodny siarczan(VI) magnezu
• 2 M wodny roztwór kwasu solnego
• chlorek metylenu * Jeżeli używane są drożdże z pożywką należy doliczyć 50% masy
Szkło i inne materiały oraz potrzebny sprzęt laboratoryjny:
• łaźnia wodna
• cieplarka
• wyparka rotacyjna
• kolba stożkowa 500 cm3
• zlewka 25 cm3
• kolba okrągłodenna 250 cm3
• lejek Büchnera
• kolba ssawkowa 250 cm3
• cylinder 100 cm3
• rozdzielacz 500 cm3
• lejek
• pipeta
• płytki TLC
• komora chromatograficzna
• łyżka
• bagietka
• bibuła filtracyjna
• wata
• papierek uniwersalny Wykonanie ćwiczenia:
1. Drożdże, glukozę oraz wodę umieszcza się w kolbie stożkowej (500 ml) i zatyka wylot kolby watą, a następnie umieszcza w łaźni wodnej (30°C) na około 45 minut w celu zapoczątkowania fermentacji. Co jakiś czas energicznie miesza się zawartość kolby.
2. pH fermentującej mieszaniny podnosi się następnie do wartości ok. 5,5 przez dodanie nasyconego roztworu węglanu sodu.
3. α-Metylo-β-(2-furylo)akroleinę rozpuszcza się w 2 cm3 etanolu i dodaje jednorazowo do kolby z fermentującymi drożdżami delikatnie mieszając zawartość kolby. Mieszaninę reakcyjną pozostawia się w cieplarce na 48h w temperaturze 30°C. Co 12 – 15 godzin sprawdza się pH mieszaniny i utrzymuje je na poziomie ok. 5 przez dodatek 5 M roztworu kwasu solnego.
4. Zakładając odpowiedni stopień przereagowania, reakcję przerywa się doprowadzając mieszaninę do temperatury pokojowej. Następnie dodaje się 2 łyżki celitu i dokładnie miesza. Tak przygotowaną mieszaninę pozostawia się na ok. 30 minut od czasu do czasu mieszając.
5. Zawiesinę drożdży odsącza się na lejku Büchnera przez 3 mm złoże celitu. Operację powtarza się, jeśli w przesączu stwierdzi się obecność drożdży. Klarowny, jasnobrązowy filtrat poddaje się ekstrakcji octanem etylu (4x60 ml). W przypadku trudności z rozdzielaniem warstw, mieszaninę wysala się lub/oraz odwirowuje w wirówce laboratoryjnej.
6. Zlane ekstrakty organiczne suszy się nad bezwodnym siarczanem magnezu, który odsącza się na lejku z sączkiem karbowanym, a przesącz odparowuje w wytarowanej kolbie okrągłodennej na wyparce rotacyjnej do uzyskania żółtej, oleistej pozostałości.
Porównanie enzymatycznych metod redukcji z metodami redukcji klasycznej chemii organicznej
10
7. Przebieg reakcji sprawdza się metodą TLC. W tym celu pobiera się próbkę mieszaniny reakcyjnej i rozcieńcza ją w octanie etylu (ok. 25 mg/ml). Jako układ rozwijający stosuje się chlorek metylenu. Jako wzorzec stosuje się roztwór substratu. Płytki obserwuje się pod lampą UV. Ponieważ aldehyd szybko przechodzi w nienasycony alkohol, na płytce przy Rf=0,38 mogą być widoczne 2 plamy w kształcie ósemki (nasycony i nienasycony alkohol). Świadczy to o niecałkowitym przereagowaniu substratu. Jeżeli obecna jest tylko 1 plamka przy Rf=0.34 pochodząca od produktu, można uznać całkowite przereagowanie substratu.
8. Surowy produkt można oczyścić metodą chromatografii kolumnowej. Jako wypełnienie kolumny stosuje się żel krzemionkowy, a jako eluent układ eter naftowy - eter dietylowy 3:1 (v/v).
Część B: Redukcja α-metylo-β-(2-furylo)akroleiny przy użyciu katalizatora metalicznego
Ta część ćwiczenia obejmuje redukcję α-metylo-β-(2-furylo)akroleiny przy użyciu katalizatora platynowego na węglu aktywnym (Schemat 6).
Schemat 6
Odczynniki:
• α-metylo-β-(2-furylo)akroleina (0,90 g; 6,60 mmol)
• metanol (5 cm3)
• katalizator platynowy na węglu aktywnym
• wodór gazowy
• bezwodny siarczan(VI) magnezu
Szkło i inne materiały oraz potrzebny sprzęt laboratoryjny:
• mieszadło magnetyczne
• wyparka rotacyjna
• kolba okrągłodenna 25 cm3
• cylinder 25 cm3
• rozdzielacz 50 cm3
• kolba stożkowa 100 cm3
• balon z wężem gumowym i zaworem
• korek gumowy
• igła
• lejek
• pipeta
• płytki TLC
• komora chromatograficzna
• łyżka
• bagietka
• bibuła filtracyjna Wykonanie ćwiczenia:
1. W kolbie okrągłodennej umieszcza się metanol oraz 2 α-metylo-β-(2-furylo)akroleinę i miesza na mieszadle magnetycznym. Do kolby dodaje się niewielką ilość katalizatora platynowego i zaopatruje kolbę w gumowy korek z igłą.
Porównanie enzymatycznych metod redukcji z metodami redukcji klasycznej chemii organicznej
11
2. Kolbę zaopatruje się następnie w balon z wężem gumowym i zaworem wypełniony wodorem. Przepływ wodoru powinien powodować pojawianie się niewielkiej ilości pęcherzyków na powierzchni roztworu.
3. Po 1, 2 i 3 godzinach reakcji pobiera się próbkę mieszaniny reakcyjnej, rozcieńcza w niewielkiej ilości octanu etylu i nakłada na płytkę TLC wraz z wzorcem substratu. Jako układ rozwijający stosuje się chlorek metylenu.
4. Po stwierdzeniu całkowitego przereagowania substratu katalizator odsącza się, a przesącz zatęża na wyparce rotacyjnej. Pozostałość rozpuszcza się w niewielkiej ilości eteru dietylowego i oczyszcza się metodą chromatografii kolumnowej. Jako wypełnienie kolumny stosuje się żel krzemionkowy, a jako eluent eter dietylowy.
Redukcja grupy nitrowej Część A: Redukcja 1,2-dinitrobenzenu przy użyciu drożdży piekarniczych
Ta część ćwiczenia obejmuje redukcję grupy nitrowej 1,2-dinitrobenzenu przy użyciu drożdży piekarniczych prowadzącą do 2-nitroaniliny (Schemat 7).
Schemat 7
Badania wykazały, że przebieg redukcji monopodstawionych nitrobenzenów silnie zależy od charakteru podstawnika. Jeśli związek zawiera grupę elektronodonorową (np.: NH2, OH, SH, OCH3, CH3, Br) to wydajność reakcji redukcji jest niska lub reakcja nie zachodzi wogóle. Jeżeli podstawnik ma charakter elektronoakceptorowy (np.: NO2, CN, CF3, COOEt) redukcja nitrobenzenów zachodzi łatwo z dobrymi wydajnościami. Przykładem tego jest katalizowana drożdżami redukcja 1,2-dinitrobenzenu, w rezultacie której powstaje 2-nitoranilina z wysoką wydajnością, porównywalną z otrzymywanymi w redukcji metodami chemicznymi
Odczynniki:
• 1,2-dinitrobenzen (0,25 g; 1,49 mmol)
• drożdże piekarnicze Saccharomyces
cerevisiae (25 g*)
• sacharoza (7,5 g)
• woda destylowana (100 cm3)
• Celite®
• etanol (2,5 - 3 cm3)
• octan etylu
• 2 M wodny roztwór wodorotlenku sodu
• chlorek sodu
• bezwodny siarczan(VI) magnezu
Szkło i inne materiały oraz potrzebny sprzęt laboratoryjny:
• łaźnia wodna
• cieplarka
• wyparka rotacyjna
• kolba stożkowa 500 cm3
• zlewka 25 cm3
• kolba okrągłodenna 250 cm3
• lejek Büchnera
• kolba ssawkowa 250 cm3
• cylinder 100 cm3
• rozdzielacz 500 cm3
Porównanie enzymatycznych metod redukcji z metodami redukcji klasycznej chemii organicznej
12
• eter naftowy * Jeżeli używane są drożdże z pożywką należy doliczyć 50% masy
• lejek
• pipeta
• probówka
• płytki TLC
• komora chromatograficzna
• łyżka
• bagietka
• bibuła filtracyjna
• wata
• papierek uniwersalny
Wykonanie ćwiczenia:
1. Drożdże, sacharozę i wodę umieszcza się w kolbie stożkowej (500ml) i zatyka wylot kolby watą, a następnie umieszcza w łaźni wodnej (30°C) na około 1 godzinę w celu zapoczątkowania fermentacji. Co jakiś czas energicznie miesza się zawartość kolby.
2. 1,2-Dinitrobenzen rozpuszcza się w jak najmniejszej objętości etanolu (ok. 2,5 – 3 cm3) i dodaje jednorazowo do kolby z fermentującymi drożdżami. Mieszaninę reakcyjną pozostawia się w cieplarce na 24h w temperaturze 30°C.
3. Zakładając odpowiedni stopień przereagowania, reakcję przerywa się doprowadzając mieszaninę do temperatury pokojowej. Następnie dodaje się 2 łyżki celitu i dokładnie miesza. Tak przygotowaną mieszaninę pozostawia się na ok. 30 minut od czasu do czasu mieszając.
4. Zawiesinę drożdży odsącza się na lejku Büchnera przez 3 mm złoże celitu. Operację powtarza się, jeśli w przesączu stwierdzi się obecność drożdży. Przesącz zobojętnia się przy użyciu 2 M wodnego roztworu NaOH. Tak powstały żółty filtrat poddaje się ekstrakcji octanem etylu (4x60 ml). W przypadku trudności z rozdzielaniem warstw, mieszaninę wysala się lub/oraz odwirowuje w wirówce laboratoryjnej.
5. Zlane ekstrakty organiczne suszy się nad bezwodnym siarczanem(VI) magnezu, który odsącza się na lejku z sączkiem karbowanym, a przesącz odparowuje w wytarowanej kolbie okrągłodennej na wyparce rotacyjnej do uzyskania bladożółtej pozostałości.
6. Przebieg reakcji sprawdza się metodą TLC. W tym celu pobiera się próbkę mieszaniny reakcyjnej i rozcieńcza ją w octanie etylu (ok. 25 mg/ml). Jako układ rozwijający stosuje się mieszaninę eter naftowy – octan etylu 1:1 (v/v). Jako wzorzec stosuje się roztwór substratu (Rf 1,2-dinitrobenzenu wynosi 0,4, a Rf 2-nitroaniliny 0,55). Płytki obserwuje się pod lampą UV.
7. Surowy produkt można oczyścić metodą chromatografii kolumnowej. Jako wypełnienie kolumny stosuje się żel krzemionkowy, a jako eluent układ eter naftowy – octan etylu 10:1 → 4:1 (v/v).
Porównanie enzymatycznych metod redukcji z metodami redukcji klasycznej chemii organicznej
13
Część B: Redukcja 1,2-dinitrobenzenu przy użyciu chlorku amonu i glinu
Ta część ćwiczenia obejmuje redukcję grupy nitrowej 1,2-dinitrobenzenu przy użyciu chlorku amonu w obecności glinu prowadzącą do mieszaniny 2-nitroaniliny i 1,2-diaminobenzenu (Schemat 8).
Schemat 8
Odczynniki:
• 1,2-dinitrobenzen (0,25 g; 1,49 mmol)
• chlorek amonu (0,40 g; 7,5 mmol)
• glin (0,25 g)
• metanol (30 cm3)
• eter dietylowy
• woda destylowana
• aceton
• heksan
• bezwodny siarczan(VI) magnezu * Jeżeli używane są drożdże z pożywką
należy doliczyć 50% masy
Szkło i inne materiały oraz potrzebny sprzęt
laboratoryjny:
• mieszadło magnetyczne
• łaźnia ultradźwiękowa
• kolba okrągłodenna 100 cm3
• lejek
• cylinder 50 cm3
• rozdzielacz 250 cm3
• pipeta
• probówka
• płytki TLC
• komora chromatograficzna
• łyżka
• bagietka
• bibuła filtracyjna
• wata
• papierek uniwersalny
Wykonanie ćwiczenia: 1. W kolbie okrągłodennej umieszcza się metanol oraz 1,2-dinitrobenzen i miesza na
mieszadle magnetycznym. Do kolby dodaje się chlorku amonu oraz drobno pociętej folii aluminiowej. Następnie kolbę umieszcza w łaźni ultradźwiękowej w temperaturze pokojowej.
2. Po 15, 30 i 60 minutach reakcji pobiera się próbkę mieszaniny reakcyjnej, rozcieńcza w niewielkiej ilości octanu etylu i nakłada na płytkę TLC wraz z wzorcem substratu. Jako układ rozwijający stosuje się mieszaninę aceton – heksan 1:20 (v/v).
3. Po stwierdzeniu całkowitego przereagowania substratu, mieszaninę sączy się na sączku karbowanym wprost do kolby okrągłodennej.
4. Rozpuszczalnik odparowuje się na wyparce rotacyjnej do uzyskania jasnobrązowej pozostałości, którą rozpuszcza się w eterze dietylowym i przemywa wodą destylowaną.
Porównanie enzymatycznych metod redukcji z metodami redukcji klasycznej chemii organicznej
14
5. Zlane ekstrakty organiczne suszy się nad bezwodnym siarczanem(VI) magnezu, który odsącza się na lejku z sączkiem karbowanym, a przesącz odparowuje w wytarowanej kolbie okrągłodennej na wyparce rotacyjnej do uzyskania żółtej pozostałości.
6. Surowy produkt można oczyścić metodą chromatografii kolumnowej. Jako wypełnienie kolumny stosuje się żel krzemionkowy, a jako eluent układ heksan -aceton.
PRZYGOTOWANIE DO ZAJĘĆ
Przed przystąpieniem do ćwiczenia student powinien zapoznać się z niniejszą instrukcją
oraz sposobem wykonania ćwiczenia. Powinien również zapoznać się z podstawami teoretycznymi technik laboratoryjnych wykorzystywanych ćwiczeniu oraz z zagrożeniami mogącymi wystąpić podczas ich wykonywania. Student powinien zaznajomić się również następującymi zagadnieniami i pojęciami:
• współczynnik retencji Rf, stereoselektywność, stereospecyficzność, regioselektywność, regiospecyficzność, nadmiar enancjomeryczny (wraz ze sposobem jego obliczania), enancjomer, diastereoizomer, katalizator, enzym, koenzym, kataliza enzymatyczna, utlenienie, redukcja, wady i zalety katalizy enzymatycznej.
Ponadto powinien znać i przestrzegać ogólne zasady BHP. Powinien znać i wiedzieć jak zapobiegać zagrożeniom wynikającym z pracy z odczynnikami chemicznymi oraz aparaturą wykorzystywaną w ćwiczeniu.
OPRACOWANIE WYNIKÓW
Po zakończeniu ćwiczenia każda grupa laboratoryjna sporządza sprawozdanie, które
oddaje prowadzącemu do dwóch tygodni od daty zajęć. W sprawozdaniu powinny znaleźć się:
• opis wykonywanych czynności,
• obliczenia (ilości, masy, objętości odczynników, wydajności otrzymanych produktów),
• obserwacje,
• wnioski. Warunkiem zaliczenia ćwiczenia jest obecność na zajęciach, zaliczenie kartkówki (tzw.
wejściówki), czynny udział w ćwiczeniu (aktywność będzie oceniana przez prowadzącego) oraz poprawne sporządzenie sprawozdania i oddanie go w terminie.
Porównanie enzymatycznych metod redukcji z metodami redukcji klasycznej chemii organicznej
15
LITERATURA R. Csuk; Chem. Rev., 91 (1991) 49-97
S. Servi; Synthesis, (1990) 1-25
S. D. Burke, R. L. Danheiser Handbook of Reagents for Organic Synthesis, Oxidizing and
Reducing Agents, John Wiley and Sons Ltd., (1999)
C. Smit, M. W. Fraaije, A. J. Minnaard; J. Org. Chem., 73 (2008) 9482–9485
C. F. Lane; Chemical Reviews, 76 (1976) 6
R. Bruckner, M. Harmata; Organic Mechanisms – Reactions, Stereochemistry and Synthesis, Springer-Verlag Berlin Heidelberg, (2010)
C. Fuganti; Pure & Appl. Chern., 62 7 (1990) 1449-1452
S. M. Roberts, G. Poignant; Catalysts for Fine Chemical Synthesis: Hydrolysis, Oxidation and
Reduction. Volume 1, John Wiley & Sons, Ltd, (2002)
M. C. Flickinger, S. W. Drew; Encyclopedia of Bioprocess Technology: Fermentation,
Biocatalysis, and Bioseparation, John Wiley & Sons, Inc., (1999)
N. Ono; The Nitro Group in Organic Synthesis, John Wiley-VCH, (2001)
G. Fràter, U. Müller, W. Günter, S.M. Roberts; Preparative Biotransformations. Whole Cells
and Isolated enzymes in Organic Synthesis, Wiley, London, (1992)
J. Kim et al.; Tetrahedron, 66 (2010) 3995-4001
C. Ravia; Tetrahedron: Asymmetry, 20 (2009) 1393–1397
G. D. Gamalevich, A. V. Ignatenko, E. P. Serebryakov, N. E. Voishvillo; Russian Chemical
Bulletin, 44 4 (1995) 743 D. Nagaraja, M. A. Pasha; Tetrahedron letters, 40 (1999) 7855-7856