Genetyka i biologia eksperymentalna do przedmiotów... · G. Elsevier Health Sciences Poland, 2012;...

22
Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia Genetyka i biologia eksperymentalna Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych Załącznik nr 6 SYLABUSY DO PRZEDMIOTÓW FAKULTATYWNYCH 1. Błonowe białka transportujące w komórkach roślinnych 2. Membrane transport proteins in plant cells 3. WNB, IBE, Zakład Fizjologii Molekularnej Roślin 4. Zgodny z USOS 5. Fakultatywny 6. Genetyka i biologia eksperymentalna 7. Poziom studiów II 8. Rok studiów I lub II 9. Semestr letni 10. wykład 15 godz., seminarium 15 godz. 11. dr hab. Małgorzata Janicka, dr hab. Katarzyna Kabała 12. Wymagania wstępne: podstawowa wiedza z fizjologii roślin i biologii molekularnej roślin 13. Cele przedmiotu: poznanie budowy, mechanizmu działania oraz roli białek funkcjonujących jako transportery w błonach komórek roślinnych 14. Zakładane efekty kształcenia: Student zna przebieg procesu sortowania białek do poszczególnych kompartymentów komórek roślinnych i otaczających je błon (mitochondria, chloroplasty, ER, peroksysomy, tonoplast, plazmolema). Umie zdefiniować typy białek błonowych. Rozumie, w jaki sposób funkcjonują w błonach bierne i aktywne transportery. Zna ich strukturę, mechanizmy regulacji i funkcje, jakie pełnią w komórkach roślinnych. Rozróżnia szlaki importu białek do różnych kompartymentów komórkowych. Na podstawie charakterystycznych elementów strukturalnych i domen regulatorowych identyfikuje poszczególne klasy białek transportowych. Student swobodnie wykorzystuje światową literaturę naukową dotycząca białek błonowych, na jej podstawie przygotowuje prezentację na zadany temat. Student jest świadomy różnorodności białek występujących w błonach komórek roślinnych i ich istotnego znaczenia dla prawidłowego funkcjonowania organizmów roślinnych. Umie przeanalizować zdobytą wiedzę i wykorzystać ją w zrozumieniu metabolizmu komórkowego. K_W02 K_U02 K_U08 K_K01 15. Treści programowe: Sortowanie i transport białek do poszczególnych błon i kompartymentów komórki roślinnej (mitochondria, chloroplasty, peroksysomy, ER, tonoplast, plazmolema). ATPazy typu P – ich różnorodność w świecie roślin. Mitochondrialne i chloroplastowe ATPazy typu F. Wakuolarne pompy protonowe komórek roślinnych – V-ATPazy i V-PPazy. Pierwotne i wtórne transportery metali ciężkich. Białka uczestniczące w transporcie składników mineralnych. Białka kanałowe. Akwaporyny i ich znaczenie dla roślin. 16. Zalecana literatura: Wojtaszek P., Woźny A., Ratajczak L. Biologia komórki roślinnej. 2006. Rozdział 4. Sortowanie i transport białek, 135-201, PWN; Buchanan B., Gruissem W., Jones R.L. Biochemistry and molecular biology of plants. 2000. Rozdział 3. Membrane transport, 110-157, Rozdział 4. Protein sorting and vesicle traffic, 160-201; Janicka-Russak M. 2011. Plant plasma membrane H + -ATPase in

Transcript of Genetyka i biologia eksperymentalna do przedmiotów... · G. Elsevier Health Sciences Poland, 2012;...

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

Załącznik nr 6

SYLABUSY DO PRZEDMIOTÓW FAKULTATYWNYCH

1. Błonowe białka transportujące w komórkach roślinnych

2. Membrane transport proteins in plant cells

3. WNB, IBE, Zakład Fizjologii Molekularnej Roślin

4. Zgodny z USOS

5. Fakultatywny

6. Genetyka i biologia eksperymentalna

7. Poziom studiów II

8. Rok studiów I lub II

9. Semestr letni

10. wykład 15 godz., seminarium 15 godz.

11. dr hab. Małgorzata Janicka, dr hab. Katarzyna Kabała

12. Wymagania wstępne: podstawowa wiedza z fizjologii roślin i biologii molekularnej

roślin

13. Cele przedmiotu: poznanie budowy, mechanizmu działania oraz roli białek

funkcjonujących jako transportery w błonach komórek roślinnych

14.

Zakładane efekty kształcenia:

Student zna przebieg procesu sortowania białek do

poszczególnych kompartymentów komórek roślinnych i

otaczających je błon (mitochondria, chloroplasty, ER,

peroksysomy, tonoplast, plazmolema). Umie zdefiniować typy

białek błonowych. Rozumie, w jaki sposób funkcjonują w

błonach bierne i aktywne transportery. Zna ich strukturę,

mechanizmy regulacji i funkcje, jakie pełnią w komórkach

roślinnych. Rozróżnia szlaki importu białek do różnych

kompartymentów komórkowych. Na podstawie

charakterystycznych elementów strukturalnych i domen

regulatorowych identyfikuje poszczególne klasy białek

transportowych.

Student swobodnie wykorzystuje światową literaturę naukową

dotycząca białek błonowych, na jej podstawie przygotowuje

prezentację na zadany temat.

Student jest świadomy różnorodności białek występujących w

błonach komórek roślinnych i ich istotnego znaczenia dla

prawidłowego funkcjonowania organizmów roślinnych. Umie

przeanalizować zdobytą wiedzę i wykorzystać ją w zrozumieniu

metabolizmu komórkowego.

K_W02

K_U02

K_U08

K_K01

15.

Treści programowe: Sortowanie i transport białek do poszczególnych błon i

kompartymentów komórki roślinnej (mitochondria, chloroplasty, peroksysomy,

ER, tonoplast, plazmolema). ATPazy typu P – ich różnorodność w świecie roślin.

Mitochondrialne i chloroplastowe ATPazy typu F. Wakuolarne pompy protonowe

komórek roślinnych – V-ATPazy i V-PPazy. Pierwotne i wtórne transportery metali

ciężkich. Białka uczestniczące w transporcie składników mineralnych. Białka

kanałowe. Akwaporyny i ich znaczenie dla roślin.

16.

Zalecana literatura:

Wojtaszek P., Woźny A., Ratajczak L. Biologia komórki roślinnej. 2006. Rozdział

4. Sortowanie i transport białek, 135-201, PWN; Buchanan B., Gruissem W.,

Jones R.L. Biochemistry and molecular biology of plants. 2000. Rozdział 3.

Membrane transport, 110-157, Rozdział 4. Protein sorting and vesicle traffic,

160-201; Janicka-Russak M. 2011. Plant plasma membrane H+-ATPase in

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

adaptation of plants to abiotic stresses, w: Abiotic stress response in plants -

physiological, biochemical and genetic perspectives, Shanker A.K. i

Venkateswarlu B. (Eds), InTech, 197-218; Kabała K. 2011. Struktura i regulacja

roślinnych wakuolarnych H+-ATPaz. Postępy Biologii Komórki 38: 517-532;

Kabała K., Kłobus G. 2005. Plant Ca2+-ATPases. Acta Physiologiae Plantarum 27:

559-574; Wdowikowska A., Kłobus G. 2011. Roślinne ATPazy typu P. Postępy

Biochemii, 57: 85-91; Migocka M., Nowojska E., Kłobus G. 2007. Wtórne

transportery metali ciężkich u roślin. Postępy Biochemii 53: 272-279; Migocka M.

2006. Rola pierwotnych pomp metalowych (P1B-ATPaz) w utrzymywaniu

homeostazy metali ciężkich w komórkach roślinnych. Postępy Biologii Komórki

33: 657-666; Papierniak A., Migocka M. 2009. Charakterystyka roślinnych

antyporterów kationowo/protonowych typu CAX. Postępy Biologii Komórki 36:

601-616

17.

Forma zaliczenia

wykład: zaliczenie w formie testu (K_W02, K_U02)

seminarium: prezentacja (K_U02, K_U08), aktywność na zajęciach (K_K01)

18. Język wykładowy: polski

19. Obciążenie pracą studenta

Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie

aktywności

Godziny zajęć (wg planu studiów)

z nauczycielem:

- wykład:

- seminarium:

15

15

Praca własna studenta:

- czytanie wskazanej literatury:

- przygotowanie do testu:

- przygotowanie prezentacji:

10

10

10

Suma godzin 60

Liczba punktów ECTS 2

1. Choroby cywilizacyjne

2. Diseases of affluence

3. WNB, Katedra Fizjologii i Neurobiologii Molekularnej

4. Zgodny z USOS

5. Fakultatywny

6. Genetyka i biologia eksperymentalna

7. Poziom studiów: II

8. Rok studiów: I lub II

9. Semestr: zimowy

10. Wykład: 15 godz., konwersatorium 15 godz.

11. dr Piotr Mamczur

12. Wymagania wstępne: podstawowa wiedza z fizjologii zwierząt oraz biologii

komórki

13.

Cele przedmiotu: Zapoznanie studenta ze zmianami fizjologicznymi

towarzyszącymi chorobom cywilizacyjnym i neurodegeneracyjnym; zapoznanie

studenta z molekularnym podłożem wybranych jednostek chorobowych człowieka,

takich jak: cukrzyca, otyłość, alkoholizm, astma, alergie, choroba wieńcowa,

nowotwór, depresja i inne zaburzenia psychiczne; zaznajomienie studenta z

podstawowymi problemami w leczeniu chorób układów sercowo-naczyniowego i

oddechowego; określenie znaczenia profilaktyki w leczeniu; nakreślenie

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

współczesnych trendów w leczeniu wybranych chorób; nabycie przez studentów

umiejętności wyszukiwania i prezentowania informacji.

14.

Zakładane efekty kształcenia:

Student potrafi wymienić jednostki chorobowe występujące w

krajach wysoko rozwiniętych i związane ze zmianami

cywilizacyjnymi; potrafi określić podłoże molekularne

wybranych chorób cywilizacyjnych i opisać towarzyszące im

zmiany fizjologiczne. Student potrafi nakreśli trendy w

leczeniu wybranych jednostek chorobowych człowieka; potrafi

określić znaczenie profilaktyki; rozumie wyzwania stojące

przed współczesną medycyną i biologią molekularną.

Potrafi przygotować (sam oraz w zespole) i zaprezentować

omawiany temat z zakresu zagadnień ujętych w programie

przedmiotu; potrafi samodzielnie zdobywać wiedzę z literatury

specjalistycznej w języku polskim i angielskim. Potrafi

aktywnie uczestniczyć w dyskusjach naukowych.

K_W02

K_W03

K_U02

K_U08

K_K01

15.

Treści programowe:

Molekularne podłoże chorób cywilizacyjnych: otyłość, cukrzyca, nowotwory,

alkoholizm, podagra, cellulit, nadcisnienie tętnicze i choroba wieńcowa; choroby

neurodegeneracyjne i psychiczne; choroby tarczycy; astma, alergie i procesy

zapalne. Podstawy molekularne wybranych jednostek chorobowych układów

sercowo-naczyniowego oraz oddechowego. Choroby metaboliczne. Komórki

macierzyste. Starzenie organizmu. Znaczenie profilaktyki w leczeniu. Terapie

genetyczne, hormonoterapie.

16.

Zalecana literatura:

„Fizjologia człowieka – podręcznik dla studentów medycyny” Stanisław J.

Konturek (red.), Elsevier Urban & Partner (2007 lub 2013), (wybrane rozdziały);

„Wprowadzenie do fizjologii Klinicznej” Stanisław Kozłowski i Krystyna Nazar

(red.), Wydawnictwo Lekarskie PZWL (1999), (wybrane rozdziały); „Fizjologia

krwi – wybrane zagadnienia” Zbigniew Dąbrowski (red.), Wydawnictwo naukowe

PWN (1998), (wybrane rozdziały); Stres metaboliczny w chorobach

neurodegeneracyjnych i psychicznych, Zbigniew Srebro, Henryk Lach,

Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego (wybrane rozdziały)

17.

Forma zaliczenia:

Wykład: zaliczenie w formie testu (K_W02, K_W03)

konwersatorium: ocena prezentacji (K_U02, K_U 08; K_K01); ciągłe ocenianie

aktywności na zajęciach (K_W02, K_W03)

18. Język wykładowy: polski

19. Obciążenie pracą studenta

Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie

aktywności

Godziny zajęć (wg planu studiów)

z nauczycielem:

- wykład:

- konwersatorium:

15

15

Praca własna studenta:

- przygotowanie do zajęć:

- czytanie wskazanej literatury:

- przygotowanie do zaliczenia:

10

5

15

Suma godzin 60

Liczba punktów ECTS 2

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

1. Dylematy i granice biologii molekularnej

2. Dilemmas of molecular biology

3. WNB, IBE, Zakład Genetyki i Fizjologii Komórki

4. Zgodny z USOS

5. Fakultatywny

6. Genetyka i biologia eksperymentalna

7. Poziom studiów II

8. Rok studiów I lub II

9. Semestr zimowy

10. Konwersatorium 30 godz.

11. dr Donata Wawrzycka

12. Wymagania wstępne: zaawansowana wiedza z genetyki i biologii molekularnej

13. Cele przedmiotu: zrozumienie problemów współczesnej biologii molekularnej

14.

Zakładane efekty kształcenia:

Student rozumie problemy etyczne i metodyczne biologii

molekularnej.

Student potrafi wskazać na pozytywne i negatywne efekty

manipulacji genetycznych. Student potrafi określić

zastosowanie metod biologii molekularnej w przemyśle,

medycynie farmaceutyce.

Student wykorzystuje biegle literaturę naukową w zakresie

biologii molekularnej w języku ojczystym i angielskim; zbiera i

interpretuje dane empiryczne, na podstawie wyników formułuje

właściwe i kreatywne wnioski.

Student analizuje zdobytą wiedzę z zakresu nauk biologicznych

odczuwając potrzebę jej stałego pogłębiania;

K_W07

K_W10

K_U02

K_U07

K_K01

15.

Treści programowe:

Metody i techniki biologii molekularnej wykorzystywane w przemyśle i medycynie.

Wybór organizmu do badań. Problemy etyczne badań ssaków. Pozytywne i

negatywne skutki sekwencjonowania genomów. Pozytywne i negatywne aspekty

tworzenia organizmów transgenicznych. Problem antybiotykooporności jako

wynik horyzontalnego transferu genów. Klonowanie organizmów. Terapie

genowe. Zapłodnienie in vitro. Pózne rodzicielstwo i starzenie się społeczeństwa.

Diagnostyka prenatalna badań wad genetycznych. Szczepienia; Szanse rozwoju

technik genetycznych. Eugenika.

16.

Zalecana literatura:

„Podstawy biologii komórki”- wybrane rozdziały, Alberts i in., PWN 2009.

„Molecular Biology of the Cell” – wybrane rozdziały, 5th Ed, Alberts I wsp.,

Garland Science, 2008.

17. Forma zaliczenia:

Konwersatorium: prezentacja ( K_W07, K_W10, K_U02; K_U07, K_K01)

18. Język wykładowy: polski

19. Obciążenie pracą studenta

Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie

aktywności

Godziny zajęć (wg planu studiów)

z nauczycielem:

- konwersatorium:

30

Praca własna studenta:

- przygotowanie do zajęć:

- czytanie wskazanej literatury:

10

5

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

- przygotowanie prezentacji: 10

Suma godzin 55

Liczba punktów ECTS 2

1. Genetyka mitochondriów

2. Mitochondrial genetics

3. WNB, IBE, Zakład Genetyki i Fizjologii Komórki

4. Zgodny z USOS

5. Fakultatywny

6. Genetyka i biologia eksperymentalne

7. Poziom studiów II

8. Rok studiów I lub II

9. Semestr letni

10. Wykład 15 godz.

11. dr Ewa Maciaszczyk-Dziubińska

12. Wymagania wstępne: podstawowy zakres wiedzy z biochemii, genetyki i

biologii komórki

13. Cele przedmiotu: poznanie budowy, zasad funkcjonowania, dziedziczenia,

ewolucji genomów mitochondrialnych

14.

Zakładane efekty kształcenia:

Student opisuje budowę i zasady funkcjonowania

genomów mitochondrialnych wybranych

organizmów. Rozumie rolę interakcji pomiędzy

genomem mitochondrialnym a jądrowym w

funkcjonowaniu komórki. Rozróżnia i opisuje

rodzaje mutacji w mtDNA. Zna molekularne

podłoża chorób mitochondrialnych u człowieka.

Dostrzega związki pomiędzy genomem

mitochondrialnym a ewolucją organizmów. Zna

metody i techniki badania genomu

mitochondrialnego.

Student korzysta ze specjalistycznej literatury

naukowej z zakresu biologii i genetyki

mitochondriów; uczy się samodzielnie

wyznaczonych przez prowadzącego zagadnień

korzystając z różnych źródeł.

Student rozumie potrzebę stałego pozyskiwania i

uzupełniania wiedzy z zakresu genetyki

mitochondriów z uwzględnieniem najnowszej

literatury naukowej w celu poszerzenia i

pogłębienia wiedzy i podnoszenia swoich

kwalifikacji zawodowych.

K_W02

K_W03

K_W06

K_W07

K_U02

K_K01

15.

Treści programowe: Budowa genomów mitochondrialnych. Dziedziczenie

mitochondrialnego DNA. Ekspresja genomu mitochondrialnego: replikacja,

transkrypcja, translacja. Współdziałanie genomu jądrowego i

mitochondrialnego. Badanie cech kodowanych przez mtDNA. Choroby

mitochondrialne. Pochodzenie i ewolucja genomu mitochondrialnego. mtDNA

a ewolucja człowieka.

16.

Zalecana literatura: „Genetyka medyczna. Podręcznik dla studentów” Drewa

G. Elsevier Health Sciences Poland, 2012; „Genomy” Brown T. A.

Wydawnictwo Naukowe PWN, 2013

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

17.

Forma zaliczenia

wykład: zaliczenie w formie testu ( K_W02, K_W03, K_W06, K_W07, K_U02,

K_K01)

18. Język wykładowy: polski

19. Obciążenie pracą studenta

Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na

zrealizowanie aktywności

Godziny zajęć (wg planu studiów) z nauczycielem:

- wykład: 15

Praca własna studenta:

- czytanie wskazanej literatury:

- przygotowanie do zaliczenia:

5

10

Suma godzin 30

Liczba punktów ECTS 1

1. Genotoksykologia

2. Genotoxicology

3. WNB, IBE, Zakład Genetyki i Fizjologii Komórki

4. Zgodny z USOS

5. Fakultatywny

6. Genetyka i biologia eksperymentalna

7. Poziom studiów II

8. Rok studiów I lub II

9. Semestr letni

10. Wykład: 15 godz., konwersatorium: 10 godz.

11. prof. Robert Wysocki

12. Wymagania wstępne: podstawowy zakres wiedzy z biochemii kwasów

nukleinowych i genetyki molekularnej

13. Cele przedmiotu: zrozumienie mechanizmów genotoksycznego działania

czynników fizycznych i chemicznych i ich roli w kancerogenezie

14.

Zakładane efekty kształcenia:

Student nazywa i klasyfikuje czynniki genotoksyczne

oraz typy uszkodzeń DNA. Zna metody wykrywania

różnych typów uszkodzeń DNA oraz wie jak można

oznaczyć genotoksyczność substancji. Opisuje

mechanizmy mutagenezy oraz reparacji DNA.

Opisuje procesy przyczyniające się do powstawania

nowotworów. Zna molekularne podłoże zwiększające

wrażliwość na czynniki genotoksyczne. Opisuje

mechanizmy działania genotoksycznych leków

antynowotworowych.

Biegle wykorzystuje specjalistyczną literaturę

naukową z zakresu genetoksykologii w języku

polskim i angielskim. Krytycznie analizuje i

selekcjonuje informacje w przygotowaniu opracowań

naukowych z zakresu genotoksykologii. Wygłasza

referaty i przygotowuje prezentacje przy użyciu

nowoczesnych technik multimedialnych.

Rozumie potrzebę stałego pozyskiwania i

uzupełniania wiedzy z zakresu genetoksykologii z

wykorzystaniem najnowszej literatury naukowej w

K_W02

K_W03

K_W07

K_U02

K_U03

K_U08

K_K01

K_K05

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

celu poszerzenia i pogłębienia wiedzy i podnoszenia

swoich kwalifikacji zawodowyc.

15.

Treści programowe:

Klasyfikacja czynników genotoksycznych. Klasyfikacja uszkodzeń DNA.

Mechanizmy mutagenezy. Mechanizmy reparacji DNA. Metody wykrywania

różnych typów uszkodzeń DNA. Testy na genotoksyczność substancji.

Mechanizmy kancerogenezy. Chemoterapia w oparciu o związki

genotoksyczne.

16.

Zalecana literatura:

Molecular, Clinical and Environmental Toxicology, Volume 1: Molecular

Toxicology, Series: Experientia Supplementum, Vol. 99, Luch, Andreas (Ed.),

2009, Birkhäuser Basel; Genotoxicity and DNA Repair. A Practical Approach,

Series: Methods in Pharmacology and Toxicology Sierra, L. María, Gaivão,

Isabel (Eds.), 2014, Humana Press; Toksykologia współczesna. Witold

Seńczuk, 2012, PZWL

17.

Forma zaliczenia:

wykład: zaliczenie w formie testu (K_W02, K_W03, K_K05)

konwersatorium: zaliczenie na podstawie prezentacji (K_W05, K_W10,

K_U02, K_U03, K_U08, K_K01, K_K05) i aktywności na zajęciach ( K_W07,

K_K01, K_K05)

18. Język wykładowy: polski

19. Obciążenie pracą studenta

Forma aktywności studenta

Średnia liczba godzin

na zrealizowanie

aktywności

Godziny zajęć (wg planu studiów)

z nauczycielem:

- wykład

- konwersatorium:

15

10

Praca własna studenta:

- przygotowanie do zajęć

- czytanie wskazanej literatury:

- przygotowanie do testu:

5

10

10

Suma godzin 50

Liczba punktów ECTS 2

1. Hormonalna regulacja życia człowieka: od narodzin do starości

2. Hormonal regulation of human life: from birth to senescence

3. WNB, Katedra Fizjologii i Neurobiologii Molekularnej

4. Zgodny z USOS

5. Fakultatywny

6. Genetyka i biologia eksperymentalna

7. Poziom studiów: II

8. Rok studiów: I lub II

9. Semestr: letni

10. wykład 10 godz.; konwersatorium 10 godz.

11. dr Piotr Mamczur

12. Wymagania wstępne: podstawowa wiedza z fizjologii zwierząt oraz biologii

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

komórki

13.

Cele przedmiotu: Zdobycie poszerzonej wiedzy dotyczącej procesów

hormonalnych sterujących wzrostem, rozwojem, dojrzewaniem i procesem

starzenia się organizmu ludzkiego. Również: poznanie hormonalnej regulacji

zapłodnienia i utrzymania ciąży.

14.

Zakładane efekty kształcenia:

Student ma pogłębioną wiedzę dotyczącą funkcjonowania układu

endokrynnego człowieka. Rozumie związki między

nieprawidłowościami w wydzielaniu danych hormonów a

zaburzeniami wzrostu i rozwoju człowieka. Zna mechanizmy

hormonalne regulujące dojrzewanie płciowe, popęd płciowy i

funkcje rozrodcze człowieka. Ma wiedzę na temat zmian

hormonalnych związanych z procesem starzenia się organizmu.

K_W01

K_W02

15.

Treści programowe:

Budowa i działanie osi podwzgórze-przysadka; zmiany hormonalne związane z

okresem dojrzewania; „dojrzewanie mózgu”; hormonalne aspekty reakcji

seksualnych człowieka; regulacja hormonalna zapłodnienia, utrzymania ciąży i

porodu; andropauza i menopauza; zmiany hormonalne związane z procesem

starzenia się; stres a układ endokrynny; wpływ substancji egzogennych o

aktywności hormonalnej na procesy życiowe człowieka; patologie układu

endokrynnego

16.

Zalecana literatura:

„Fizjologia człowieka – podręcznik dla studentów medycyny” Stanisław J.

Konturek (red.), Elsevier Urban & Partner (2007 lub 2013), (wybrane

rozdziały); „Wprowadzenie do fizjologii Klinicznej” Stanisław Kozłowski i

Krystyna Nazar (red.), Wydawnictwo Lekarskie PZWL (1999), (wybrane

rozdziały)

17.

Forma zaliczenia:

wykład: zaliczenie w formie testu (K_W01, K_W02);

konwersatorium: zaliczenie na podstawie aktywności na zajęciach (K_W01,

K_W02)

18. Język wykładowy: polski

19. Obciążenie pracą studenta

Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie

aktywności

Godziny zajęć (wg planu studiów)

z nauczycielem:

- wykład: (obecność obowiązkowa dla osób,

które wybrały przedmiot)

- konwersatorium:

10

10

Praca własna studenta:

- czytanie wskazanej literatury:

- przygotowanie do zaliczenia:

15

15

Suma godzin 50

Liczba punktów ECTS 2

1. Modelowanie procesów rozwojowych u roślin

2. Modelling plant development

3. WNB: IBE, Zakład Biologii Rozwoju Roślin

4. Zgodny z USOS

5. Fakultatywny

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

6. Genetyka i biologia eksperymentalna

7. Poziom studiów: II

8. Rok studiów: II

9. Semestr: letni

10. Wykład 15 godz.

11. Prof. dr hab. Beata Zagórska-Marek

12. Wymagania wstępne: Zaliczony przedmiot Genetyczno-molekularne podstawy

rozwoju roślin

13. Cele przedmiotu: Poznanie zalet stosowania współczesnych metod modelowania

zjawisk rozwojowych u roślin przy użyciu programów komputerowych

14.

Zakładane efekty kształcenia

Student zna przykłady zastosowania technik komputerowych

do symulacji procesów związanych z tworzeniem

modularnego planu budowy ciała rośliny i jej reakcjami

fizjologicznymi. Zna i rozumie regulacyjną rolę mechanizmu

dyfuzji reakcji Turinga w tworzeniu okresowych wzorów

organogenezy, pigmentacji, czy różnicowania tkanek

heterogennych. Zna i rozumie przyczyny plastyczności

fenotypowej u roślin.

Student posługuje się prostymi programami komputerowymi

pozwalającymi na symulacje zjawisk rozwojowych u roślin,

analizuje efekty symulacji i wyciąga wnioski z porównania

zjawisk wirtualnych z realnymi.

Student jest aktywny, spostrzegawczy i krytyczny, zdolny do

logicznego myślenia, umiejący podjąć aktywną dyskusję,

zachowujący dyscyplinę w posługiwaniu się sprzętem

komputerowym

K_W01

K_W05

K_W06

K_U05

K_K01

15.

Treści programowe:

Model Turinga dyfuzji reakcji na przykładzie nitki sinicowej Anabaena; Model

Meinhardta periodycznych wzorów pigmentacji; Model modularnej (fraktalnej)

budowy ciała rośliny – L-systemy, rośliny wirtualne, reiteracje w budowie pędu,

liścia i kwiatu; Model geometryczny ontogenetycznych zmian wzorów ulistnienia –

symulacje komputerowe dyslokacji w parakrystalicznych sieciach filotaktycznych

(Helianthus, Magnolia); Modele zjawisk fizjologicznych: akropetalnego i

bazypetalnego zakwitania pędu (Prusinkiewicz); hormonalnej aktywacji rozwoju

pędów bocznych u Arabidopsis (Prusinkiewicz, Leyser)

16.

Zalecana literatura:

Wybrane zagadnienia z następujących podręczników i artykuły: Prusinkiewicz

P., Lindenmayer A. Algorithmic Beauty of Plants. Springer-Verlag. 1990.

Meinhardt H. Algorithmic Beauty of Sea Shells. Springer-Verlag. 2003.

Prusinkiewicz P., Crawford S., Smith R., Ljung K., Bennett T., Ongaro V.,

Leyser O. 2009. Control of bud activation by an auxin transport switch. PNAS

106: 17431. Zagórska-Marek B., Szpak. 2008. Virtual phyllotaxis and real

plant model cases. FPB 35:1025.

17.

Forma zaliczenia:

Wykład – zaliczenie w formie odpowiedzi ustnej (K_W01; K_W05; K_W06;

K_U05; K_K01)

18. Język wykładowy: polski

19. Obciążenie pracą studenta

Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie

aktywności

Godziny zajęć z nauczycielem:

- wykład:

15

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

Praca własna studenta, np.:

- czytanie wskazanej literatury:

- przygotowanie do zaliczenia:

5

10

Suma godzin 30

Liczba punktów ECTS 1

1. Modyfikacje genetyczne roślin dla celów biofortyfikacji i fitoremediacji

2. Genetic modification of plants for the purpose of phytoremediation and

biofotification

3. WNB, IBE, Zakład Fizjologii Molekularnej Roślin

4. Zgodny z USOS

5. Fakultatywny

6. Genetyka i biologia eksperymentalna

7. Poziom studiów: II

8. Rok studiów I lub II

9. Semestr: zimowy

10. Seminarium: 30 godz.

11. dr Magdalena Migocka

12. Wymagania wstępne: student powinien posiadać podstawowy zakres wiadomości

z biologii roślin, biochemii i genetyki.

13.

Cele przedmiotu: poznanie aktualnych zagadnień związanych z fitoremediacją

(wykorzystaniem roślin do oczyszczania gleb zanieczyszczonych metalami) i

biofortyfikacją (modyfikacją roślin w celu zwiększenia ich wartości odżywczej dla

zwierząt i człowieka).

14.

Zakładane efekty kształcenia:

Student umie zdefiniować pojęcia fitoremediacja i

biofortyfikacja. Student zna zagrożenia związane z

zanieczyszczeniami gleb metalami ciężkimi oraz

konsekwencje niedoboru mikroelementów takich jak Zn i

Fe w mineralnym żywieniu roślin oraz diecie zwierząt i

człowieka. Student zna gatunki i biologię życia naturalnych

hiperakumulatorów metali ciężkich.

Student zna molekularne podstawy hiperakumulacji metali

w roślinach. Student zna złożone mechanizmy regulujące

poziom metali w komórkach roślinnych. Student

klasyfikuje rodziny białek zaangażowanych w dystrybucję

metali w komórkach i tkankach roślinnych.

Student umie wyszukać geny i białka związane z

odpowiedzią roślin na niedobór lub nadmiar metali w

bazach internetowych. Student umie rozpoznać domeny i

motywy aminokwasowe związane z wiązaniem i

transportem metali przez błony komórkowe. Student umie

porównać homologiczne białka z różnych roślin i wyciągnąć

wnioski na podstawie otrzymanych wyników.

Student prezentuje wybrane zagadnienia dotyczące

metalotionein i fitochelatyn oraz wybranych rodzin

transporterów metali u roślin.

Student umie pracować w zespole i krytycznie analizować

dostępne informacje dotyczące tematu.

K_W01

K_W02

K_W03

K_U05

K_U06

K_U08

K_K02

K_K04

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

15.

Treści programowe:

Fitoremediacja i biofortyfikacja, wyjaśnienie pojęć i konsekwencji wynikających z

zaburzenia równowagi metali ciężkich w środowisku i diecie żywych organizmów.

Cele i założenia projektu Copenhagen Consensus w zakresie problemu niedoboru

cynku na świecie. Lista naturalnie występujących hiperakumulatorów metali

ciężkich i metaloidów; szczegółowe omówienie biologii modelowych

hiperakumulatorów o istotnym znaczeniu dla fitoremediacji: Arabidopsis halleri,

Thlaspi goesigense, Brassica juncea, Pteris vittata, Stylosanthes hamata.

Molekularne podstawy naturalnej hiperakumulacji i hipertolerancji na metale

ciężkie. Potencjalne wykorzystanie białek i peptydów zaangażowanych w

pobieranie metali do komórek roślinnych i ich organelli oraz ochronę komórek

przed nadmiarem metali w cytoplazmie (białka ZIP, Nramp, HMA, CDF, CAX,

metalotioneiny, fitochelatyny) w modyfikacji genetycznej roślin dla celów

biofortyfikacji i fitoremediacji. Duplikacje genów i elementów regulatorowych w

promotorach jako mechanizm zwiększający odporność roślin na metale ciężkie.

Cechy idealnego roślinnego hiperakumulatora. „Green technology”, aktualne

projekty badań nad otrzymaniem i zastosowaniem hiperakumulatorów do

oczyszczania gleb skażonych metalami ciężkimi.

16.

Zalecana literatura:

Jonathan Shaw. Heavy metal tolerance in plants. Evolutionary aspects. CRC

Press, 1989

Sergey Shabala. Plant stress physiology, CABI, 2012

Najnowsze publikacje przeglądowe i oryginalne prace naukowe dotyczące tematu

dostępne w czasopismach naukowych.

Internetowe bazy genów, genomów i białek

17.

Forma zaliczenia:

Seminarium – prezentacja (K_W02, K_W03, K_U08, K_K04), projekt (K_U05,

K_U06, K_K02), test (K_W01, K_W02, K_W03)

18. Język wykładowy: polski

19. Obciążenie pracą studenta

Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie

aktywności

Godziny zajęć (wg planu studiów)

z nauczycielem - seminarium:

30

Praca własna studenta, np.:

- przygotowanie do zajęć:

- czytanie wskazanej literatury:

- opracowanie wyników:

- przygotowanie prezentacji:

5

10

5

10

Suma godzin 60

Liczba punktów ECTS 2

1. Molekularne podstawy adaptacji roślin

2. Molecular basis of plant stress physiology

3. WNB, IBE, Zakład Fizjologii Molekularnej Roślin

4. Zgodny z USOS

5. Fakultatywny

6. Genetyka i biologia eksperymentalna

7. Poziom studiów II

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

8. Rok studiów I lub II

9. Semestr letni

10. wykład 15 godz.; laboratorium 30 godz.

11. Prof. dr hab. Grażyna Kłobus, dr Ewa Młodzińska, dr Magdalena Migocka

12. Wymagania wstępne: wiedza z zakresu biologii komórki, genetyki i fizjologii roślin

13. Cele przedmiotu: uzyskanie wiedzy o zaburzeniach metabolicznych i

specyficznych procesach naprawczych zachodzących w organizmach roślinnych

poddanych działaniu środowiskowych czynników stresogennych

14. Zakładane efekty kształcenia:

Student definiuje pojęcie stresu fizjologicznego, identyfikuje

specyficzne deformacje metaboliczne w kontekście działania

stresogennych czynników środowiskowych; zna mechanizmy

percepcji bodźców zewnętrznych i ścieżki sygnałowe, rozróżnia i

charakteryzuje procesy adaptacji i aklimacji; rozumie molekularne

podstawy tych zjawisk.

Student potrafi wykorzystać specjalistyczny sprzęt pomiarowy do

określenia natężenia podstawowych procesów fizjologicznych;

umie przeprowadzać eksperymenty, interpretować uzyskane

wyniki i wyciągać właściwe wnioski; postrzega związki i zależności

przyrodnicze

Student jest kreatywny i dostrzega związek pomiędzy warunkami

środowiskowymi a aktywnością procesów fizjologiczne i wzrostem

roślin; jest także zdolny do pracy w zespole z zachowaniem

podstawowych zasad bezpieczeństwa pracy w laboratorium i

chętny do pozyskiwania i uzupełniania wiedzy przyrodniczej.

K_W02

K_W06

K_W07

K_U01

K_U04

K_U05

K_K01

K_K05

15. Treści programowe:

Definicja stresu fizjologicznego; klasyfikacja czynników stresogennych i

zaburzenia metaboliczne; percepcja czynników fizycznych (natężenie światła,

temperatura) i chemicznych (woda, NaCl, metale ciężkie); specyficzne ścieżki

przekazywania sygnału ze szczególnym uwzględnieniem roli wapnia oraz kinaz

białkowych typu CDPKs i SnRKs; modyfikacje czynników transkrypcyjnych i

aktywacja specyficznych genów jako podstawowe mechanizmy adaptacyjne

(model regulonu); rola ABA w adaptacji roślin do stresów suszy, NaCl i chłodu;

posttranslacyjne mechanizmy adaptacyjne.

16. Zalecana literatura:

Abiotic Stress Adaptation in Plants. Pareek A, Sopory S.K., Bohnert H.J. (ed.).

2010, Plant Abiotic Stress. Jenks M.A., Hasegawa P.M (ed.)., 2005, Bleckwell

Publishing; Genes for Plant Abiotic Stress. Jones R.L., 2000, Wiley-Blackwell.

Biochemistry and Molecular Biology of Plants, Buchanan B.B. i in. 2000, pp.1158-

1174

17. Forma zaliczenia

wykład: zaliczenie w formie testu (K_W02, K_W06, K_W07)

laboratorium: zaliczenie na podstawie pracy pisemnej (K_U05, K_K05) i

aktywności na zajęciach (K_U01, K_U04, K_K01)

18. Język wykładowy: polski

19. Obciążenie pracą studenta

Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie

aktywności

Godziny zajęć (wg planu studiów)

z nauczycielem:

- wykład:

- laboratorium:

15

30

Praca własna studenta:

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

- czytanie wskazanej literatury:

- przygotowanie do zajęć:

- opracowanie wyników:

- przygotowanie do zaliczenia:

10

5

10

20

Suma godzin 90

Liczba punktów ECTS 3

1. Molekularne podstawy układów symbiotycznych roślin i

mikroorganizmów

2. Molecular basis of plant and microorganism symbiotic systems

3. WNB, IBE, Zakład Fizjologii Molekularnej Roślin

4. Zgodny z USOS

5. Fakultatywny

6. Genetyka i biologia eksperymentalna

7. Poziom studiów: II

8. Rok studiów I lub II

9. Semestr letni

10. Seminarium 30 godz.

11. dr Małgorzata Reda, dr Magdalena Migocka

12. Wymagania wstępne: student powinien posiadać podstawowy zakres wiadomości

z biologii roślin i mikroorganizmów, biochemii i genetyki.

13. Cele przedmiotu: poznanie podstaw powstawania i funkcjonowania na poziomie

molekularnym układów symbiotycznych między bakteriami wiążącymi azot i

roślinami wyższymi

14. Zakładane efekty kształcenia:

Student wymienia rodzaje bakterii wiążących azot

atmosferyczny. Student zna podstawowe informacje na temat

infekcji i powstawania bakteroidów oraz rozumie rolę rośliny i

bakterii w tym procesie. Student zna i klasyfikuje bakteryjne

białka nod, roślinne noduliny, rozumie ich znaczenie. Student

zna budowę i funkcjonowanie kompleksu nitrogenazy,

rozumie mechanizm asymilacji N2 przez bakterie.

Student zna mechanizmy funkcjonowania układu

symbiotycznego między bakteriami wiążącymi N2 a roślinami

wyższymi, rozumie ich znaczenie dla obu komponentów tych

układów.

Student prezentuje wybrane zagadnienia dotyczące rodzin

bakteryjnych białek nod, roślinnych nodulin oraz kompleksu

nitrogenazy na podstawie najnowszej literatury, dokonuje

wnikliwej analizy prac oryginalnych i przeglądowych,

formułuje wnioski, które dyskutuje z grupą.

Student sprawnie posługuje się dostępnymi narzędziami

stosowanymi w badaniach nad genami i białkami: wynajduje i

operuje sekwencjami z bazy białek roślinnych organizmów

modelowych, wynajduje homologiczne geny w genomach

innych roślin i zestawia kompletne rodziny kodowanych przez

nie białek, poznaje metody analizy funkcji genów kodujących

białka regulujące powstawanie i funkcjonowanie układów

symbiotycznych bakteria-roślina wyższa.

K_W01

K_W02

K_U05

K_U06

K_U08

K_K02

K_K05

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

Student jest kreatywny, chętny do dyskusji prezentowanych

faktów naukowych. Student jest otwarty na poznawanie

nowych metod analizy danych, aktywnie realizuje powierzone

zadania.

15. Treści programowe:

Mikroorganizmy redukujące azot atmosferyczny (wolnożyjące beztlenowe i

tlenowe, fotosyntetyzujące, cyjanobakterie i bakterie symbiotyczne). Proces

infekcji i tworzenia bakteroidu, znaczenie specyficznych substancji wytwarzanych

przez rośliny w tym procesie. Rola bakteryjnych białek nod, ich klasyfikacja

strukturalna i funkcjonalna. Udział roślinnych białek nodulin w funkcjonowaniu

bakteroidów i procesie asymilacji N2. Identyfikacja genów kodujących noduliny.

Wyszukiwanie genów ENOD i LNOD w zsekwencjonowanych genomach roślin

modelowych, przeszukiwanie baz danych, analizy strukturalne i filogenetyczne

analizowanych genów i białek. Molekularne podstawy wiązania azotu

atmosferycznego przez bakterie, budowa i funkcjonowanie kompleksu

nitrogenazy, geny nif. Molekularne mechanizmy regulacji aktywności

nitrogenazy.

16. Zalecana literatura:

Taiz L., Zeiger E. Plant Physiology. Sinauer Associates, Inc. Wydanie piąte.

Kopcewicz J., LewakS. Fizjologia roślin, Wydawnictwo Naukowe PWN 2005

Najnowsze publikacje przeglądowe i oryginalne prace naukowe dotyczące tematu

dostępne w czasopismach naukowych.

Internetowe bazy genów, genomów i białek

17. Forma zaliczenia:

Seminarium – zaliczenie na podstawie pracy pisemnej (K_U05, K_U06: K_K02) i

prezentacja (K_W01, K_W02, K_U08, K_K05)

18. Język wykładowy: polski

19. Obciążenie pracą studenta

Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie

aktywności

Godziny zajęć (wg planu studiów)

z nauczycielem:

seminarium:

30

Praca własna studenta, np.:

- przygotowanie do zajęć:

- czytanie wskazanej literatury:

- opracowanie wyników:

- przygotowanie prezentacji:

5

10

5

10

Suma godzin 60

Liczba punktów ECTS 2

1. Naprawa DNA i rekombinacja

2. DNA Repair and recombination

3. WNB, IBE, Zakład Genetyki i Fizjologii Komórki

4. Zgodny z USOS

5. Fakultatywny

6. Genetyka i biologia eksperymentalna

7. Poziom studiów II

8. Rok studiów II

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

9. Semestr letni

10. Wykład 15 godz., laboratorium 20 godz.

11. prof. dr hab. Robert Wysocki,

12. Wymagania wstępne: zaawansowana wiedza z genetyki, biochemii i biologii

molekularnej

13. Cele przedmiotu: zapoznanie studentów z mechanizmami jakie komórki stosują,

aby utrzymać integralność chromosomów, w tym z systemami naprawy

uszkodzeń DNA, których zaburzenia są przyczyną nowotworów u ludzi

14. Zakładane efekty kształcenia:

Student ma pogłębioną wiedzę z genetyki w zakresie rodzajów

uszkodzeń DNA i mechanizmów reparacji DNA na poziomie

molekularnym, ze szczególnym uwzględnieniem naprawy pęknięć DNA

oraz replikacyjnych uszkodzeń DNA na drodze rekombinacji. Student

zna metody wykrywania mutagennego działania czynników fizycznych

i chemicznych oraz różne techniki badawcze z wykorzystaniem

rekombinacji DNA. Student zna zasady bezpieczeństwa w pracy z

czynnikami mutagennymi i kancerogennymi.

Student umie przeprowadzać testy wykrywające mutagenne działanie

różnych czynników fizycznych i chemicznych. Student potrafi

zaplanować i przeprowadzić eksperymenty z zakresu naprawy DNA

oraz przeanalizować uzyskane wyniki i wyciągnąć na ich podstawie

wnioski.

Student potrafi pracować w zespole podczas planowania i

przeprowadzania eksperymentów naukowych. Podczas wykonywania

eksperymentów zachowuje czystość i porządek podczas pracy, dba o

wykorzystywaną w pracy aparaturę badawczą.

K_W03

K_W09

K_W11

K_U01

K_U04

K_U06

K_K02

K_K03

15. Treści programowe:

Rodzaje mutagenów. Rodzaje uszkodzeń DNA. Biologiczne metody wykrywania

mutagenów. Rodzaje naprawy uszkodzeń DNA. Rekombinacja homologiczna.

Naprawa widełek replikacyjnych. Niestabilność genomów a nowotwory.

Rekombinacja DNA jako technika manipulacji genetycznych.

16. Zalecana literatura:

„Genome Stability”, James H. Haber, Garland Science; wybrane rozdziały:

„Biochemia”, J.M. Berg, L. Stryer, J. L. Tymoczko, PWN 2011; „Molecular Biology

of the Cell”, 5th Ed, Alberts i wsp., Garland Science, 2008; “Podstawy biologii

molekularnej”, L.A. Allison, WUW, 2009.

17. Forma zaliczenia:

wykład: zaliczenie na podstawie testu (K_W03; K_W09; K_U04; K_U06)

laboratorium: zaliczenie na podstawie pracy pisemnej: (K_W09; K_U04; K_U06);

testu (K_W03; K_W09; K_W11; K_U04; K_U06) oraz oceny aktywności na

zajęciach (K_W09; K_W11; K_U01, K_U04; K_U06; K_K02; K_K03);

18. Język wykładowy: polski

19. Obciążenie pracą studenta

Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie

aktywności

Godziny zajęć (wg planu studiów)

z nauczycielem:

- wykład:

- laboratorium:

15

20

Praca własna studenta:

- przygotowanie do zajęć:

- czytanie wskazanej literatury:

- przygotowanie do zaliczenia

10

10

15

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

Suma godzin 70

Liczba punktów ECTS 3

1. Organizmy modelowe w eksperymentalnej biologii rozwoju zwierząt

2. Model organisms in animal experimental developmental biology

3. WNB, IBE, Zakład Biologii Rozwoju Zwierząt

4. Zgodny z USOS

5. Fakultatywny

6. Genetyka i biologia eksperymentalna

7. Poziom studiów II

8. Rok studiów I lub II

9. Semestr letni

10. Wykład 15 godz.

11. dr hab. prof. Małgorzata Daczewska, dr hab. Bożena Simiczyjew, dr Izabela

Jędrzejowska, dr Marta Mazurkiewicz-Kania, dr Arnold Garbiec, dr Magda

Dubińska-Magiera, dr Marta Migocka-Patrzałek

12. Wymagania wstępne: Podstawowa wiedza z biologii rozwoju zwierząt

13. Cele przedmiotu: uzyskanie wiedzy na temat wykorzystania organizmów

modelowych do poznania procesów zachodzących podczas rozwoju zwierząt

14. Zakładane efekty kształcenia

Student zna proces tworzenia gron komórek płciowych i

różnicowania komórek w gronie oraz transportu substancji i

organelli pomiędzy komórkami grona; morfogenezę tkanki

nabłonkowej i mechanizmy migracji komórek nabłonka; zna

przebieg i mechanizmy różnych typów śmierci komórkowej;

wczesny rozwój zarodkowy w aspekcie specyfikacji komórek;

powstawanie osi ciała i wzoru budowy modelowych gatunków

bezkręgowców i kręgowców; mechanizmy organogenezy w

systemach modelowych

Student potrafi wykorzystać uzyskaną wiedzę w analizie

porównawczej tych procesów u organizmów nie modelowych.

K_W01

15. Treści programowe: tworzenie gron komórek płciowych w gametogenezie;

morfogeneza tkanki nabłonkowej; mechanizmy migracji komórek nabłonka;

mechanizmy śmierci komórkowej; specyfikacja komórek we wczesnych etapach

rozwoju zarodkowego, powstawanie osi ciała i wzoru budowy modelowych

gatunków bezkręgowców i kręgowców; mechanizmy organogenezy

16. Zalecana literatura: Developmental Biology S.F. Gilbert, Sinauer Associates, Inc.;

Krótkie Wykłady Biologia Rozwoju R.M. Twyman, Warszawa PWN, oryginalne

publikacje naukowe

17. Forma zaliczenia

wykład: zaliczenie na podstawie testu (K_W01); warunkiem uzyskania zaliczenia

jest obecność na 5 wykładach;

18. Język wykładowy: polski

19. Obciążenie pracą studenta

Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie

aktywności

Godziny zajęć (wg planu studiów)

z nauczycielem:

- wykład:

15

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

Praca własna studenta, np.:

- przygotowanie do testu:

15

Suma godzin 30

Liczba punktów ECTS 1

1. Polarny transport auksyn w rozwoju roślin

2. Polar auxin transport in plant development

3. WNB: IBE, Zakład Biologii Rozwoju Roślin

4. Zgodny z USOS

5. Fakultatywny

6. Genetyka i biologia eksperymentalna

7. Poziom studiów: II

8. Rok studiów I lub II

9. Semestr: letni

10. Wykład 15 godz.

11. dr Alicja Banasiak

12. Wymagania wstępne: podstawowa wiedza z zakresu fizjologii i biologii rozwoju

roślin

13. Cele przedmiotu: poznanie i zrozumienie roli polarnego transportu auksyny w

regulacji procesów rozwojowych i morfogenetycznych u roślin

14. Zakładane efekty kształcenia:

Student rozumie rolę auksyn w regulacji procesów

rozwojowych i morfogenetycznych u roślin. Zna

drogi transportu auksyny i ich wpływ na procesy

rozwojowe. Charakteryzuje różne szlaki transportu

auksyny, potrafi opisać ich związek z

powstawaniem wzorów komórkowych podczas

embriogenezy i waskularyzacji tkanek. Wyjaśnia

powiązanie dystrybucji auksyny z regulacją

genetyczną morfogenezy.

Student jest otwarty na wiedzę, zdolny do

logicznego myślenia.

K_W01

K_W03

K_U02

K_K01

15. Treści programowe:

Drogi i sposoby transportu auksyny. Procesy rozwojowe zależne od auksyn.

Wpływ PAT na organogenezę (model koncepcyjny i modele komputerowe). Udział

auksyn w tworzeniu wzorów komórkowych podczas embriogenezy. Auksynowa

regulacja tworzenia tkanki przewodzącej na różnych poziomach jej organizacji,

np. aktywacja kambium, rozwój użyłkowania liścia jako model do badań wpływu

auksyny na rozwój systemu przewodzącego. Rola auksyn i ich polarnego

transportu w dominacji wierzchołkowej.

16. Zalecana literatura (podręczniki):

Wybrane zagadnienia z podręczników: Steeves TA and Sussex IM. 1989. Patterns

in Plant Development. Cambridge Univ. Press.

Lindsey K. 2004. Polarity in plants. Blackwell Publishing.; Evert, R.F. Esau’s Plant

Anatomy. Meristems, Cells, and Tissues of the Plant Body – Their Structure,

Function, and Development. John Wiley & Sons. Inc., Hoboken, New Jersey, USA,

2006.; Hejnowicz Z. Anatomia i histogeneza roślin naczyniowych. PWN. 2002.;

Prace oryginalne.

17. Forma zaliczenia

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

Wykład: zaliczenie na podstawie testu (K_W01, K_W03, K_U02, K_K01)

18. Język wykładowy: polski

19. Obciążenie pracą studenta

Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie

aktywności

Godziny zajęć (wg planu studiów)

z nauczycielem:

- wykład:

15

Praca własna studenta, np.:

- przygotowanie do testu:

10

Suma godzin 25

Liczba punktów ECTS 1

1. Presenting your research

2. Presenting your research

3. WNB, IBE, Zakład Biologii Rozwoju Roślin

4. Zgodny z USOS

5. Fakultatywny

6. Genetyka i biologia eksperymentalna

7. Poziom studiów II

8. Rok studiów II

9. Semestr letni

10. Seminarium: 25 godz.

11. Dr A. Dołzbłasz, dr E. Gola, dr K. Sokołowska

12. Wymagania wstępne: dobra znajomość języka angielskiego

13. Cele przedmiotu: prezentacja tematyki, wyników i technik badawczych z

własnych badań prowadzonych w ramach pracy dyplomowej w języku angielskim

14. Zakładane efekty kształcenia:

Student stosuje terminologię z tematyki związanej ze swoją

pracą dyplomową. Student potrafi przygotować naukową

prezentację w j. angielskim, gdzie przedstawia przegląd

literaturowy do swojej pracy dyplomowej, wyniki

dotychczasowych badań i wnioski. Student jest kreatywny,

aktywnie realizuje powierzone zadania.

K_U02

K_U03

K_U08

K_K05

15. Treści programowe:

Tematyka będzie zależna od wybranych przez studentów tematów badawczych i

miejsc realizacji pracy dyplomowej.

16. Zalecana literatura:

Najnowsze publikacje przeglądowe i oryginalne prace naukowe w języku

angielskim. Słowniki języka angielskiego.

17. Forma zaliczenia:

Seminarium: zaliczenie na podstawie prezentacji (K_U02, K_U03, K_U08, K_K05)

i aktywności na zajęciach (K_U02, K_U03, K_U08, K_K05)

18. Język wykładowy: angielski

19. Obciążenie pracą studenta

Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie

aktywności

Godziny zajęć (wg planu studiów)

z nauczycielem

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

- seminarium 25

Praca własna studenta, np.:

- przygotowanie prezentacji:

- czytanie literatury:

15

10

Suma godzin 50

Liczba punktów ECTS 2

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

1. Protein-protein interactions: detection, analysis and implications

2. Protein-protein interactions: detection, analysis and implications

3. WNB, IBE, Zakład Genetyki i Fizjologii Komórki

4. Zgodny z USOS

5. Fakultatywny

6. Genetyka i biologia eksperymentalna

7. Poziom studiów II

8. Rok studiów I lub II

9. Semestr letni

10. Wykład: 15 godz. Konwersatorium: 15 godz.

11. dr Ewa Błaszczak;

12. Wymagania wstępne: podstawowy zakres wiedzy z genetyki, biochemii i biologii

komórki

13. Cele przedmiotu: zrozumienie podstawowych zagadnień w zakresie tematyki

odziaływań białko-białko, detekcji i technik analiz odziaływań białkowych oraz ich

potencjalnego zastosowania.

14. Zakładane efekty kształcenia:

Student zna typy interakcji między białkami w komórce oraz rozumie

sposoby i podstawowe mechanizmy tych oddziaływań. Student wie jak

znaleźć informacje dotyczące interakcji białkowych w bazach danych

oraz potrafi wymienić podstawowe narzędzia bioinformatyczne

niezbędne do przewidywania potencjalnych interakcji między

określonymi białkami. Student zna techniki służące do wykrywania

i analizy oddziaływań białko-białko, zarówno in vitro jak również in vivo

u różnych organizmów modelowych oraz rozumie podstawowy

mechanizm ich działania. Student wie, jakie znaczenie ma badanie

interakcji białko-białko i jakie zastosowanie praktyczne może mieć

wiedza na ten temat.

Student korzysta samodzielnie z baz danych oraz posługuje się

narzędziami bioinformatycznymi.

Student analizuje zdobytą wiedzę z zakresu technik wykrywania

interakcji białko-białko; wykazuje chęć jej pogłębiania; jest otwarty na

dyskusje i aktywnie uczestniczy w pracy zespołowej.

K_W01

K_W03

K_W05

K_W08

K_U02

K_U05

K_U07

K_K01

K_K02

15. Treści programowe:

Typy i sposoby oddziaływań białko-białko. Bazy danych interakcji białkowych i

przewidywanie nowych oddziaływań. Sieci interakcji białkowych i ich porównywanie

między gatunkami. Techniki analiz interakcji białkowych in vitro. Techniki analiz

interakcji białkowych in vivo. Praktyczne zastosowanie wiedzy w zakresie odziaływań

białkowych: interakcje białko-białko a projektowanie leków.

16. Zalecana literatura:

Alberts B., et al. "Molecular Biology of the Cell. New York: Garland Science; 2002." 5th

Edition (2010) wybrane rozdziały; Williamson M.P. & Sutcliffe M.J. (2010), Protein–

protein interactions. Biochemical Society Transactions, 38(4), 875-878; Nooren I.M. &

Thornton J.M. (2003), Diversity of protein–protein interactions. The EMBO

Journal, 22(14), 3486-3492; Oughtred R. et al., (2016), Use of the BioGRID Database

for Analysis of Yeast Protein and Genetic Interactions. Cold Spring Harbor Protocols.

Corbi-Verge C. & Kim P.M. (2016), Motif mediated protein-protein interactions as drug

targets. Cell Communication and Signaling, 14(1).

17. Forma zaliczenia

Wykład: zaliczenie na podstawie testu ( K_W01,K_W03, K_W05, K_W08, K_K01,

Konwersatorium: zaliczenie na podstawie prezentacji (K_W01,K_W03, K_W05,

K_W08, K_U02, K_U05, K_U07, K_K01, K_K02)

18. Język wykładowy: angielski

19. Obciążenie pracą studenta

Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie aktywności

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

1. Techniki histologiczne w medycynie

2. Histological techniques in medicine

3. WNB, IBE, Zakład Biologii Rozwoju Zwierząt

4. Zgodny z USOS

5. Fakultatywny

6. Genetyka i biologia eksperymentalna

7. Poziom studiów: II

8. Rok studiów: I lub II

9. Semestr zimowy

10. Wykład 15 godz., ćwiczenia 15 godz.

11. dr hab. prof. Małgorzata Daczewska, dr hab. Bożena Simiczyjew, dr Izabela

Jędrzejowska, dr Marta Mazurkiewicz-Kania, dr Arnold Garbiec, dr Magda

Dubińska-Magiera, dr Marta Migocka-Patrzałek

12. Wymagania wstępne: Podstawowa wiedza z histologii i cytologii zwierząt oraz

technik mikroskopowych

13. Cele przedmiotu: Uzyskanie wiedzy o zastosowaniu technik histologicznych w

medycynie.

14. Zakładane efekty kształcenia:

Student ma poszerzoną wiedzę z zakresu

stosowania technik histologicznych i interpretacji

wyników barwień histologicznych w medycynie.

Student ma pogłębioną wiedzę pozwalającą

dostrzec złożone związki zależności genetyki i

biologii eksperymentalnej z medycyną.

Student posiada umiejętność biegłego korzystania

z literatury naukowej w języku polskim i

angielskim.

Student dostrzega problemy i przestrzega zasad,

również etycznych, w wykonywaniu zawodu. Jest

zdolny do krytycznej oceny przedstawionych

wyników badań.

K_W01

K_W04

K_W06

K_U02

K_K04

15. Treści programowe:

Zastosowanie, zasady, cele, korzyści i ograniczenia stosowania technik

histologicznych oraz interpretacja wyników w aspekcie medycznym. Problemy,

także etyczne, spotykane w histologicznej diagnostyce medycznej.

16. Zalecana literatura:

„Podstawy technik mikroskopowych” J. Litwin , M. Gajda, WUJ, 2011; „Histologia”

W. Sawicki, J. Malejczyk, wyd.6, PZWL, 2012; „Ćwiczenia z histologii zwierząt” J.

Kuryszko, J. P. Madej, V. Kapuśniak, Wyd. Uniw. Przyrodniczy we Wrocławiu,

2012; „Immunocytochemia” M. Zabel, PWN 1999, prace naukowe wskazane

Godziny zajęć (wg planu studiów)

z nauczycielem:

- wykład:

- konwersatorium:

15

15

Praca własna studenta:

- czytanie wskazanej literatury oraz

praca z bazami danych

- przygotowanie prezentacji

15

15

Suma godzin 60

Liczba punktów ECTS 2

Wniosek o utworzenie nowego kierunku studiów II stopnia

Genetyka i biologia eksperymentalna

Załącznik nr 6. Sylabusy do przedmiotów fakultatywnych

przez prowadzącego.

17. Forma zaliczenia:

wykład: zaliczenie na podstawie testu (K_W01, K_W04, K_W06, K_U02, K_K04);

warunkiem zaliczenia jest obecność na 5 wykładach.

ćwiczenia: zaliczenie na podstawie testu (K_W01, K_W04, K_W06) i obecności na

zajęciach.

18. Język wykładowy: polski

19. Obciążenie pracą studenta

Forma aktywności studenta Średnia liczba godzin na zrealizowanie

aktywności

Godziny zajęć (wg planu studiów)

z nauczycielem:

- wykład:

- ćwiczenia:

15

15

Praca własna studenta, np.:

- czytanie wskazanej literatury:

- przygotowanie do testu:

10

10

Suma godzin 50

Liczba punktów ECTS 2