Blok licencjacki genetyczny - biol.uni.lodz.pl · w 1866 r. odkrył podstawowe prawa przekazywania...
Transcript of Blok licencjacki genetyczny - biol.uni.lodz.pl · w 1866 r. odkrył podstawowe prawa przekazywania...
Za twórcę genetyki uważa się czeskiego
zakonnika Grzegorza Mendla, który
w 1866 r. odkrył podstawowe prawa
przekazywania cech dziedzicznych
i postawił hipotezę istnienia jednostek
dziedziczności, które dziś nazywamy
genami.
Przełomowym osiągnięciem w genetyce,
stanowiącym jednocześnie jedno
z największych odkryć w historii nauki, było
odkrycie w 1953 r. struktury DNA przez
Jamesa Watsona i Francisa Cricka, co
doprowadziło w kolejnych latach
do rozszyfrowania kodu genetycznego.
Przedmioty specjalnościowe na bloku
genetycznym
• Choroby genetyczne
• Technologie DNA
• Genetyka drobnoustrojów
• Genetyka molekularna
• Podstawy cytogenetyki i cytogenetyka molekularna
• Analiza DNA
Jednostki wiodące
• Katedra Cytobiochemii (Instytut Biochemii)
• Katedra Genetyki Molekularnej (Instytut Biochemii)
• Pracownia Cytogenetyki w Katedrze Genetyki Ogólnej, Biologii Molekularnej i Biotechnologii Roślin (Instytut Biologii Eksperymentalnej)
• Zakład Genetyki Drobnoustrojów (Instytut Mikrobiologii, Biotechnologii i Immunologii)
Pracownia Cytogenetyki
Katedry Genetyki Ogólnej, Biologii Molekularnej
i Biotechnologii Roślin
Kierownik Pracowni:
prof. dr hab. Regina Osiecka
([email protected]; pok. A333)
Pracownicy:
dr hab. Alina Błaszczyk,
prof. nadzw. UŁ, ([email protected]; pok. A308)
dr Renata Kontek,
st. wykładowca, ([email protected]; pok. A307)
Pracownia Cytogenetyki
Katedry Genetyki Ogólnej, Biologii Molekularnej
i Biotechnologii Roślin
Tematyka badawcza:
• badania biologicznych właściwości nanocząsteczek węglowych (nanodiamenty, nanorurki, grafit)
• cytotoksyczność i genotoksyczność związków o potencjalnej aktywności przeciwnowotworowej oraz antyoksydacyjnej
• badania indukcji uszkodzeń DNA i ich naprawy w warunkach in vitro
• badanie indukcji aberracji chromosomowych i mikrojąder
Materiał badawczy:
• prawidłowe i nowotworowe komórki człowieka
• komórki roślinne
Obrazy „komet”
(metoda elektroforezy
pojedynczych komórek
w żelu agarozowym)
Metody podwójnych barwień
fluorochromami (rozróżnianie
komórek żywych,
apoptotycznych
i nekrotycznych)
Test MTT (ocena
cytotoksyczności
związków
chemicznych)
Aberracje
chromosomowe w
komórkach roślinnych
Pracownia Cytogenetyki Katedry Genetyki Ogólnej, Biologii Molekularnej i Biotechnologii Roślin
Wybrane przykłady proponowanych tematów prac licencjackich:
• Metody cytogenetyczne w diagnostyce prenatalnej
• Nieprawidłowy przebieg podziału mejotycznego a choroby genetyczne
• Budowa chromosomów człowieka i metody ich barwienia stosowane w diagnostyce klinicznej
• Zespół Pradera-Williego i jego uwarunkowania genetyczne
• Zastosowanie irinotekanu w leczeniu nowotworów
• Analogii cisplatyny w terapii przeciwnowotworowej
• Genomowy imprinting i uniparentalna disomia: zespół Angelmana
• Mechanizm inaktywacji jednego z chromosomów X u kobiet: ciałka Barra
• Chromosom Y u człowieka
• Regiony pseudoautosomalne (PAR) chromosomów X i Y u człowieka
• Mozaika a chimera genetyczna
• Rodzaje aberracji chromosomowych w wybranych typach nowotworów człowieka
• Test mikrojądrowy w badaniach biomonitoringowych
Student może również zaproponować swój własny temat którym się interesuje
dr hab. Anna Sajduda, prof. nadzw. UŁ , dr Anita Ciesielska, dr Marek Gadzalski, mgr Aleksandra Strzelczyk (doktorantka), dr hab. Paweł Stączek, prof. nadzw. UŁ - kierownik zakładu.
• Oznaczanie aktywności antytopoizomerazowej, mutagennej i genotoksycznej nowosyntetyzowanych pochodnych tiosemikarbazydów jako potencjalnych leków antybakteryjnych
- Małocząsteczkowe związki (masa <400)
- Syntetyzowane w wyniku reakcji hydrazydu kwasu heterokarboksylowego z odpowiednim izotiocyjanianem
- Siarkoorganiczne odpowiedniki semikarbazydów – hydrazydów kwasu karbaminowego (aminomocznika)
ogólny wzór tiosemikarbazydu
Wykazują właściwości: antybakteryjne, przeciwgrzybicze,
przeciwwirusowe, przeciwpasożytnicze, owadobójcze i chwastobójcze,
przeciwnowotworowe, przeciwzapalne, antydepresyjne
Zakład Genetyki Drobnoustrojów
Zakład Genetyki Drobnoustrojów
• Poszukiwanie markerów molekularnych dla celów identyfikacji
i genotypowania izolatów klinicznych patogennych grzybów
keratynofilnych (dermatofitów)
• komputerowe analizy genomów
dermatofitów
Trichophyton
Microsporum
Epidermophyton
• Wynajdywanie unikatowych lub
wysokozmiennych sekwencji
powtarzających się do
identyfikacji i genotypowania
• Opracowanie nowych technik detekcji
i różnicowania dermatofitów
Zakład Genetyki Drobnoustrojów
Proponowana tematyka prac licencjackich
Organizacja i funkcja systemów rekombinacji miejscowo-specyficznej
w świecie bakterii
Udział polimeraz naprawczych w zmienności drobnoustrojów
Metagenomika - genomika drobnoustrojów niehodowalnych
Transportery ABC w genomach grzybów: struktura i funkcje
Katedra Cytobiochemii Kierownik: prof. dr hab. Wanda M. Krajewska
prof. dr hab. Wanda M. Krajewska
• Zaburzenia szlaków przekazywania sygnałów, niestabilność
genetyczna i polimorfizm genów w aspekcie transformacji
nowotworowej
prof. dr hab. Zofia Kiliańska
• Zaburzenia limfoproliferacyjne (białaczki B-komórkowe);
apoptoza komórek jednojądrzastych indukowana wybranymi
lekami
Katedra Cytobiochemii dr hab. Magdalena Bryś
dr hab. Anna Krześlak
• Modyfikacje epigenetyczne a nowotwory
• Receptory hormonów steroidowych a modyfikacje
epigenetyczne chromatyny
Katedra Cytobiochemii Przykładowe tematy prac licencjackich
• Analiza DNA w genetyce sądowej
• Dieta a modyfikacje epigenetyczne DNA
• Genetyczne czynniki długowieczności
• Genetyczne podłoże zespołów przedwczesnego starzenia
• Komórki macierzyste - potencjalne zastosowania
• Mechanizmy epigenetyczne a transformacja nowotworowa
• Molekularny budzik - regulacja rytmu okołodobowego
• Niekodujące RNA i ich znaczenie w ekspresji genów
• Nowa twarz witaminy D
• Wpływ leków antynowotworowych na zmiany w materiale
genetycznym
• Uszkodzenia i naprawa mitochondrialnego DNA
• Ekspresja genów związanych z apoptozą w komórkach BCR/ABL+
• Regulacja cyklu komórkowego a naprawa DNA
• Udział białka RUNX2 w reakcji komórki na uszkodzenia DNA i różnicowaniu osteoblastów
• Znaczenie modyfikacji epigenetycznych w reakcji komórki na uszkodzenia DNA
• Zmienność genetyczna miRNA w nowotworach człowieka
• Analiza właściwości biologicznych syntetycznych tiocukrów w komórkach nowotworowych
• Komputery biomolekularne
• Ekspresja genów szlaku BER w chorobie Alzheimera
• Zmienność genów naprawy DNA w chorobach depresyjnych
• Białka naprawy dwuniciowych pęknięć DNA jako cele dla spersonalizowanej terapii przeciwnowotworowej opartej na syntetycznej letalności
• Efektywność naprawy jedno i dwuniciowych pęknięć DNA w raku endometrium
Tematyka prac badawczych realizowanych w Katedrze:
Proponowane tematy prac licencjackich:
• Indukowane pluripotencjalne komórki macierzyste – transfekcja czynnikami
transkrypcyjnymi vs. transfer jądrowy
• Apoptoza i autofagia – współzawodnictwo, czy współdziałanie?
• Rola miRNA w regulacji odpowiedzi komórki na uszkodzenia DNA
• DNA jako molekularny cel terapii przeciwnowotworowych wykorzystujących ligandy
małocząsteczkowe
• Wykorzystanie nanocząsteczek w medycynie
Proponowane tematy prac licencjackich:
Źródła grafiki: materiały Katedry Genetyki Molekularnej UŁ
• Depresja chorobą XXI wieku
• „Rozszerzony” kod genetyczny – perspektywy zastosowania w biochemii i medycynie
• Sekwencje Alu w genomie człowieka
• Naprawa DNA w warunkach hipoksji
• Znaczenie sumoilacji białek dla naprawy DNA
Studentów pragnących poszerzyć swoje
zainteresowania zapraszamy do
• Sekcji Genetycznej Studenckiego Koła Naukowego
Biologów (opiekun dr hab. Tomasz Śliwiński, prof. nadzw. UŁ)
oraz
• Sekcji Cytogenetycznej Studenckiego Koła
Naukowego Biologów (opiekun dr hab. Alina Błaszczyk,
prof. nadzw. UŁ)
Kierownicy Katedr i Zakładów, do których można
zgłaszać się w związku z realizacją pracy licencjackiej
• Prof. dr hab. Wanda Małgorzata Krajewska – Katedra Cytobiochemii (Instytut Biochemii)
• Dr hab. Katarzyna Woźniak, prof. nadzw. UŁ – Katedra Genetyki Molekularnej (Instytut Biochemii)
• Prof. dr hab. Janusz Błasiak – Zakład Genetyki Molekularnej w Katedrze Genetyki Molekularnej (Instytut Biochemii)
• Prof. dr hab. Regina Osiecka – Pracownia Cytogenetyki w Katedrze Genetyki Ogólnej, Biologii Molekularnej i Biotechnologii Roślin (Instytut Biologii Eksperymentalnej)
• Dr hab. Paweł Stączek, prof. nadzw. UŁ – Zakład Genetyki Drobnoustrojów (Instytut Mikrobiologii, Biotechnologii i Immunologii)