Struktur Dna Dan Rna

27
STRUKTUR DNA DAN RNA KELOMPOK 2 Indra Wahyu Saputra Nurul Hidayah Devi Haryati Muhardi Elisabet Paskalia Misnawati Dayang Irma Suryani Septami Setiawati Risa Arisna Desy Amma Nur Aulia Junaini Era Tiara Mega Arianti

description

Dna

Transcript of Struktur Dna Dan Rna

STRUKTUR DNA DAN RNA

KELOMPOK 2Indra Wahyu SaputraNurul HidayahDevi HaryatiMuhardiElisabet PaskaliaMisnawatiDayang Irma SuryaniSeptami SetiawatiRisa ArisnaDesy Amma Nur AuliaJunainiEra Tiara Mega Arianti

ASAM NUKLEAT Asam nukleat polimer yang dibentuk oleh mononukleotida Fungsi menyimpan, mereplikasi dan mentranskripsi informasi genetika

NUKLEOSIDA Merupakan seny. N-glikosida dr bs purin dan pirimidin yg dihubungkan oleh ikt glikosida antara atom karbon-1 dr pentosa dg atom nitrogen 1(N – 1) dr pirimidin atau nitrogen 9 (N -9) dr purin

BASA PURIN DAN PIRIMIDIN

NUKLEOTIDA Nukleotida (nukleosida fosfat) adl ester asam fosfat dr nukleosida merupakan nukleosida yg terfosforilasi. Berperan serta dlm sejumlah besar proses biokimiawi peran yg paling dikenal adl sbg prekursor monomer RNA dan DNA

NH2

N

N

N

N

OCH2P

O

HO

O

OH OH

O

Basa(adenin)

1

23

4

5

Subunit Nukleotida dari DNA Subunit Nukleotida dari RNA

H

Timin

H3C H

POLINUKLEOTIDA Polimer mononukleotida Deoksi asam ribonukleat (DNA) Asam ribonuklaet (RNA)

DNA DNA merupakan struktur yang dibangun oleh KH pentosa (deoksiribosa), fosfat dan suatu basa dalam bentuk polimer dan berkombinasi membentuk helix ganda. Blok pembangun DNA adalah “5-carbon sugar deoxyribose” yang saling dihubungkan oleh ikatan fosfodiester sehingga terbentuk dua untai ganda dengan tulang punggungnya dibentuk dari ikatan KH-fosfat pada bagian luar helix.

STRUKTUR DNA

Kedua strand dari helix saling merupakan komplemeternya masing-masing.

Setiap pentosa-nya juga terikat pada salah satu dari keempat basa yang terdiri dari adenine (A), guanine (G), cytosine (C) atau thymine (T). Gula deoksiribosa dan fosfat yg menyusun DNA terletak dibgn luar molekul, sdgkan bs purin dan pirimidin t’letak di sebelah dlm untaian (heliks)

Strand yang berlawanan diikat

oleh suatu ikatan non kovalen diantara dua basa yang selalu berpasangan G dengan C oleh tiga ikatan hidrogen dan A dipasangkan dengan T oleh dua ikatan hidrogen.

Terdapat dua posisi dari pentosa yang terikat pada gugus fosfat yaitu pada ujung 5’-P dan ujung 3’-OH.

Menurut James Watson & Francis Crick

Ukuran jarak antara pasangan basa

0,34 nm (3,4 oA) Setiap putaran untaian td 10

ps basa dan jarak satu putar heliks 3,4 nm

Diameter untaian DNA 2,0 nm

Bentuk Fisik Struktur DNA B’dsrkan jml ps basa bbrp tipe (bentuk) TipeTipe Pasangan Pasangan

bs/putaranbs/putaranDiameter Diameter

heliks (nm)heliks (nm)

AABBCCDDEEZZ

11111010

9,339,3388

7,57,51212

2,3 2,3 1,91,91,91,9----

1,81,8

Untaian (strand) DNA td dua

lekukan (groove)

lekukan besar (major groove)

lekukan kecil (minor groove)

lekukan pada tipe B lebih mudah m’ikat protein

drpd tipe A ( lebih dalam)

DNA (Gen) terdiri dari tiga struktur penting yaitu : Bagian yang disebut “gene regulatory segment”

m’ngdung srtuktur yang terlibat pada proses inisiasi dan pengaturan proses transkripsi.

Exon bagian yang mengandung codon untuk ditranslasikan oleh mRNA menjadi protein.

Intron bagian struktur yang tidak mengandung codon (intervening sequence).

KROMOSOM

KROMATIN

NUKLEOSOM

RNA Spt pd DNA molekul RNA dibentuk oleh nukleotida

yang saling dihubungkan menjadi satu rantai

KH pada DNA deoksiribosa. Sedangkan RNA KH-nya adalah ribosa.

Basa timin diganti oleh urasil pada RNA

STRUKTUR RNA DNA terdiri dari dua untai yang saling komplementer membentuk helix ganda, ttp RNA hanya terdiri dari satu untai tunggal, akan tetapi dapat melipat lipat dirinya dalam suatu aturan tertentu.

Basa pada RNA sama spt DNA, kecuali timin diganti oleh urasil.

3 macam RNA penting

mRNA (messenger-RNA) yg melakukan tranfer informasi mengenai deretan asam amino pada protein yang akan dibangun sesuai dengan urutan kode pada DNA asal.

rRNA (ribosomal-RNA) yang membangun ribosom

bersama dengan protein

tRNA (transfer-RNA) yang mentransfer asam amino ke ribosom untuk sintesis protein.

mRNA

rRNA

rRNA

tRNA

tRNA Td 75 bh nukleotida Td 4 lengan utama lengan

akseptor lengan

antikodon lengan D lengan T C lengan

tambahan Fungsi sbg

penyelaras utk translasi

FAKTOR YANG MEMPENGARUHI KESTABILAN DNA

Kestabilan struktur DNA

Tumpukan (stacking) basa nukleotida pd satu rantai interaksi hidrofobik antara basa-basa nukleotida hilang krn panas & reagensia struktur tdk

teratur : serapan

cahaya Ikatan hidrogen antara basa-basa yg berpasangan pd rantai ganda terutama pada ps antara C dan G makin >> ps C-G, makin stabil struktur

Denaturasi DNA Pecahnya ikatan hidrogen antara ps basa pada rantai

ganda rantai tunggal (single Stranded)

Penyebab Denaturasi Panas ikt hidrogen stacking Asam – basa asam protonasi ggs N dr A,G dan C basa deprotonasi ggs N dr G dan C

Tingkat denaturasi DNA t’gantung pd tinggi suhu

p’ubahan tk denaturasi DNA suhu b’tingkat absorban 260

makin > p’geseran str, mk makin > nilai absorban cahaya

efek hiperkromik denaturasi lengkap DNA suhu > 90oC

Renaturasi Proses p’bentukan kembali str untai ganda dr keadaan terdenaturasi