Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

15

Click here to load reader

Transcript of Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

Page 1: Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

Œrodowisko niewodne – miejscekatalizy enzymatycznej

Renata Bancerz1, Gra¿yna Ginalska2

1Zak³ad Biochemii, Uniwersytet Marii Curie-Sk³odowskiej, Lublin2Katedra i Zak³ad Biochemii, Uniwersytet Medyczny, Lublin

Nonaqueous media – site of enzymatic catalysis

S u m m a r y

Lipases, esterases, acylases, glycosidases, aldolases are the most used en-

zymes in synthetic organic chemistry. Among the biocatalysts, lipases are the

most frequently used. This class of enzymes is able to catalyze the hydrolysis of

carboxylic acid esters in aqueous medium on the reverse reaction in organic sol-

vents. The use of enzymes in organic solvents is now well established and there

are several advantages of conducting enzymatic reaction in water poor media

such as increased solubility of hydrophobic substrates, shifting of thermody-

namic equilibrium in favour of synthesis over hydrolysis and increased

thermostability of the enzyme. However, the practical application of enzyme in

organic solvents has been hampered by the low catalytic activities compared to

those expressed in water. This review highlights recent research on the stabili-

zation of enzymes using both chemical and biological means to increase the

lifetime of the biocatalyst.

Key words:

lipase, organic solvents, stabilization, modification.

1. Wprowadzenie

Aktywacja enzymów w rozpuszczalnikach organicznych jest

godnym uwagi osi¹gniêciem w dziedzinie enzymologii oraz che-

mii organicznej. Wiele enzymów wykazuje aktywnoœæ w ró¿no-

rodnych rozpuszczalnikach organicznych, a ich wydajnoϾ katali-

tyczna w organicznych œrodowiskach jest porównywalna do tej

w wodzie. Z analitycznego punktu widzenia zast¹pienie wody

rozpuszczalnikiem organicznym zapewnia liczne zalety przepro-

wadzania enzymatycznych reakcji:

P R A C E P R Z E G L ¥ D O W E

Adres do korespondencji

Renata Bancerz,Zak³ad Biochemii,Uniwersytet MariiCurie-Sk³odowskiej,ul. Akademicka 19,20-033 Lublin.

4 (87) 168–182 2009

Page 2: Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

– przesuniêcie termodynamicznej równowagi reakcji w kierunku syntezy es-

trów,

– wzrost rozpuszczalnoœci niepolarnych substratów i produktów,

– wiêksz¹ wydajnoœæ reakcji spowodowan¹ pominiêciem d³ugotrwa³ych proce-

dur w czasie odzysku produktu oraz ³atwiejszy odzysk produktów,

– ³atwy odzysk enzymu,

– wyeliminowanie wielu zale¿nych od wody ubocznych reakcji, m.in. hydrolizy

czy polimeryzacji,

– eliminacjê mikrobiologicznych zanieczyszczeñ,

– wzrost termostabilnoœci enzymu,

– mo¿liwoœæ zmiany substrato- i enancjoselektywnoœci,

– inhibicja enzymu, wywo³ana przez lipofilne substraty czy produkty, jest zmini-

malizowana z powodu ich ma³ego stê¿enia na powierzchni enzymu (1,2).

Obecnie prowadzone w wielu laboratoriach naukowych badania koncentruj¹ siê

g³ównie na wyjaœnieniu struktury i w³aœciwoœci enzymów w niewodnym œrodowisku,

udoskonalaniu w³aœciwoœci katalizatorów do stosowania ich w organicznych roz-

puszczalnikach, projektowaniu nowych typów reakcji, i w koñcu na wdra¿aniu tych

nowych osi¹gniêæ dla zastosowañ syntetycznych.

2. Wp³yw wody na katalityczn¹ aktywnoœæ enzymu

Ca³kowicie bezwodny rozpuszczalnik nie jest zdolny do utrzymania aktywnoœci

enzymu. Niewielka iloϾ wody jest zawsze wymagana przez enzym dla zachowania

jego natywnej struktury odpowiedzialnej za katalizê. Woda dzia³aj¹c jako „nawil-

¿acz” pozwala enzymom na wykonywanie konformacyjnych ruchów wymaganych do

optymalnej katalizy. Organiczne rozpuszczalniki nie s¹ do tego przystosowane, po-

niewa¿ nie posiadaj¹ one, tak jak woda, zdolnoœci do anga¿owania siê w wielokrot-

ne wi¹zania wodorowe. Maj¹ równie¿ ma³¹ sta³¹ dielektryczn¹ prowadz¹c¹ do sil-

nych elektrostatycznych oddzia³ywañ i powoduj¹c¹ tym samym wiêksz¹ sztywnoœæ

bia³ek (3). Wskazuje to, ¿e enzymy powinny byæ mniej aktywne w bezwodnych roz-

puszczalnikach ani¿eli w wodzie w³aœnie z powodu ograniczonej ruchliwoœci kon-

formacyjnej. Jednak obecnoœæ mocno zwi¹zanej monowarstwy wody wokó³ cz¹s-

teczki enzymu przyczynia siê do tego, ¿e bia³ka enzymatyczne wykazuj¹ znaczn¹

aktywnoœæ katalityczn¹ w takich pod³o¿ach (4).

Woda wystêpuj¹ca w biologicznych systemach podzielona jest na dwie fizycznie

ró¿ne kategorie. Wiêkszoœæ wody (ponad 98%) s³u¿y jako „prawdziwy” rozpuszczal-

nik (tzw. woda ca³kowita – rozpuszczona w ca³ej niewodnej fazie), podczas gdy

ma³a frakcja jest mocno zwi¹zana z powierzchni¹ enzymu (tzw. woda zwi¹zana).

Zaks i Klibanov (4) udowodnili, ¿e aktywnoœæ enzymu jest zale¿na od iloœci wody

zwi¹zanej z bia³kiem, a nie od stê¿enia wody w rozpuszczalniku organicznym.

Stwierdzili równie¿, ¿e woda zwi¹zana z cz¹steczk¹ enzymu mog³a nie tworzyæ

Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

BIOTECHNOLOGIA 4 (87) 168-182 2009 169

Page 3: Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

prawdziwej monowarstwy otaczaj¹cej enzym, ale raczej tworzy³a kilka skupisk zlo-

kalizowanych prawdopodobnie wokó³ na³adowanych i polarnych regionów na po-

wierzchni enzymu (rys.).

Woda zwi¹zana z enzymem jest istotniejsza dla struktury i aktywnoœci biokatali-

zatora ani¿eli woda ca³kowita. Woda zaadsorbowana do cz¹steczki enzymu wp³ywa

na mechanizm dzia³ania i strukturê bia³ka ró¿nymi sposobami:

– oddzia³uj¹c na strukturê enzymu poprzez niekowalencyjne wi¹zania,

– zmieniaj¹c strukturê bia³ka przez rozrywanie wi¹zañ wodorowych,

– u³atwiaj¹c dyfuzjê reagentów,

– wp³ywaj¹c na przesuniêcie równowagi reakcji.

Zbyt ma³a zawartoœæ wody generalnie obni¿a aktywnoœæ enzymu. Z kolei wysoka

zawartoœæ wody mo¿e równie¿ redukowaæ szybkoœæ reakcji poprzez agregacjê cz¹s-

teczek enzymu oraz wywo³uj¹c ograniczenia dyfuzyjne (7). Optymalna iloœæ wody

istotna dla reakcji katalitycznej czêsto zawiera siê w w¹skim przedziale. OdpowiedŸ

na decyduj¹ce pytanie dotycz¹ce tego, jak du¿a iloœæ wody jest konieczna dla utrzy-

mania katalitycznej aktywnoœci, zale¿na jest od samego enzymu. S¹ enzymy, dla

dzia³ania których wystarczaj¹ca jest du¿o ni¿sza iloœæ wody, ni¿ wymagana do utwo-

rzenia pojedynczej warstwy wody wokó³ biokatalizatora, np. �-chymotrypsyna po-

trzebuje tylko 50 cz¹steczek wody przypadaj¹cych na jedn¹ cz¹steczkê enzymu dla

zachowania aktywnoœci (5). Inne enzymy, takie jak subtylizyna czy lipaza, s¹ podob-

ne w swoich wymaganiach, co do œladowych iloœci wody (4).

Do wskazania iloœci wody obecnej w mieszaninie reakcyjnej, Halling (8,9) suge-

ruje stosowanie terminu „aktywnoœæ wody” (aw) zamiast „zawartoœæ wody”, ponie-

wa¿ aktywnoœæ wody opisuje jej oddzia³ywanie na równowagê reakcji i dlatego jest

lepsz¹ miar¹.

Renata Bancerz, Gra¿yna Ginalska

170 PRACE PRZEGL¥DOWE

Rys. Uproszczony schemat katalizy enzymatycznej w rozpuszczalniku organicznym (6).

Page 4: Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

Iloœæ wody wymagana do aktywnoœci biokatalizatora mo¿e znacznie ró¿niæ siê,

gdy zmieniaj¹ siê rozpuszczalniki. Rozpuszczalniki polarne wymagaj¹ wy¿szej za-

wartoœci wody, aby uzyskaæ tak¹ sam¹ dostêpnoœæ substratu do aktywnej cz¹steczki

enzymu w porównaniu ze zwi¹zkami niepolarnymi (10). Aktywnoœæ wody wymagana

do dobrej sprawnoœci katalitycznej mo¿e ulegaæ zmianie w zale¿noœci od Ÿród³a po-

chodzenia enzymu. Na przyk³ad niektóre lipazy zachowuj¹ wysok¹ aktywnoœæ nawet

po wysuszeniu za pomoc¹ sit molekularnych, np. lipaza z Rhizomucor miehei (11)

oraz z Candida antarctica (12).

Podsumowuj¹c, woda odgrywa dwojak¹ rolê w aktywnoœci enzymów w rozpusz-

czalnikach organicznych. Z jednej strony jest ona wymagana do ochrony konforma-

cji katalitycznej i funkcjonalnoœci enzymu. Z drugiej jednak, mo¿e ona bezpoœred-

nio oddzia³ywaæ na specyficzne reakcje, jak np. na estryfikacje, w których woda nie-

korzystnie wp³ywa na termodynamiczn¹ równowagê reakcji chemicznych (10). Ogól-

nie stwierdza siê, ¿e tylko ma³e objêtoœci wody s¹ wymagane do pomyœlnego stoso-

wania enzymów w rozpuszczalnikach organicznych.

3. Wybór rozpuszczalnika organicznego

Dla wysokiej aktywnoœci lipaz w reakcjach w systemie niewodnym istotny jest

dobór rozpuszczalnika z tego powodu, ¿e mo¿e on w ró¿ny sposób oddzia³ywaæ na

katalizê enzymatyczn¹:

1. Rozpuszczalnik mo¿e inaktywowaæ enzym poprzez bezpoœrednie oddzia³ywanie

z nim. Natywna struktura bia³ka jest utrzymywana poprzez z³o¿one niekowalencyjne

oddzia³ywania, takie jak: wi¹zania wodorowe i jonowe, van der Waalsa oraz od-

dzia³ywania hydrofobowe, a woda jest wymagana do utrzymywania wielu z tych

oddzia³ywañ. Natomiast brak wody i obecnoœæ rozpuszczalnika organicznego mo¿e

modyfikowaæ natywn¹ konformacjê enzymu poprzez wnikanie rozpuszczalnika do hy-

drofobowego rdzenia bia³ka powoduj¹c tym samym rozerwanie zarówno wi¹zañ wo-

dorowych, jak i oddzia³ywañ hydrofobowych oraz redukcjê aktywnoœci i stabilnoœci

bia³ka enzymatycznego (13). Oddzia³ywanie to jest szczególnie istotne w przypadku

rozpuszczalnych enzymów w systemach bifazowych (woda – nie mieszaj¹cy siê

z wod¹ rozpuszczalnik) oraz w systemach wodnych z niskim stê¿eniem mieszaj¹cego

siê z wod¹ rozpuszczalnika organicznego. W specyficznych przypadkach, dla enzy-

mów z wysokim polarnym stanem przejœciowym, wnikanie rozpuszczalnika organicz-

nego bêdzie zmniejszaæ „lokaln¹” polarnoœæ enzymu w pobli¿u jego centrum aktywne-

go, tym samym destabilizuj¹c polarny stan przejœciowy (14). Przeciwnie, nierozpusz-

czalnoœæ enzymów w monofazowym rozpuszczalniku organicznym zapobiega dodat-

kowym zniekszta³ceniom konformacyjnej stabilnoœci katalizatora. Poza tym, stabiliza-

cja enzymu mo¿e byæ te¿ powodowana tzw. „efektem pu³apki”: cz¹steczki enzymu

bêd¹ mocno œciœniête ze wszystkich stron przez otaczaj¹ce cz¹steczki, przypominaj¹c

immobilizacjê, która powinna sprzyjaæ wzrostowi stabilnoœci konformacyjnej (15).

Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

BIOTECHNOLOGIA 4 (87) 168-182 2009 171

Page 5: Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

2. Rozpuszczalnik organiczny mo¿e oddzia³ywaæ na aktywnoœæ enzymatyczn¹

poprzez bezpoœrednie interakcje z wod¹ zwi¹zan¹ wokó³ cz¹steczki enzymu (16).

Chocia¿ te oddzia³ywania nie wp³ywaj¹ na sam enzym, to maj¹ one znaczenie dla

katalizy. Generalnie, istnieje odwrotna korelacja pomiêdzy aktywnoœci¹ enzyma-

tyczn¹ w rozpuszczalnikach organicznych a hydrofilnoœci¹ tych¿e rozpuszczalników

– najwy¿sz¹ aktywnoœæ obserwuje siê zwykle w rozpuszczalnikach hydrofobowych

(4). Wynika to st¹d, ¿e hydrofobowe rozpuszczalniki posiadaj¹ mniejsz¹ zdolnoœæ

ni¿ ich hydrofilowe odpowiedniki do odci¹gania czy zniekszta³cania istotnej dla

cz¹steczki enzymu warstwy wody niezbêdnej. Hydrofobowe rozpuszczalniki chro-

ni¹ warstwê wody tworz¹c¹ pokrywê ochronn¹ enzymu i dziêki temu zachowana

zostaje aktywnoœæ katalityczna lipaz (17). Istniej¹ jednak od tej zasady godne uwagi

wyj¹tki, np. subtylizyna oraz lipaza z wieprzowej trzustki funkcjonuj¹ jeszcze wte-

dy, gdy s¹ zawieszone w rozpuszczalnikach mieszaj¹cych siê z wod¹ (hydrofilo-

wych) (18). Jednym z mo¿liwych wyjaœnieñ tego zjawiska jest to, ¿e wymienione en-

zymy s¹ zdolne do utrzymania swojej otoczki hydratacyjnej tak mocno, ¿e nawet hy-

drofilowe rozpuszczalniki nie potrafi¹ odci¹gn¹æ niezbêdnej warstwy wody. Takie

enzymy s¹ aktywne zarówno w hydrofobowych, jak i w hydrofilowych rozpuszczal-

nikach.

Parametrem dobrze opisuj¹cym rozpuszczalnik i obrazuj¹cym istniej¹c¹ zale¿-

noœæ pomiêdzy hydrofobowoœci¹ rozpuszczalnika a aktywnoœci¹ lipaz w nim dzia-

³aj¹cych jest tzw. wspó³czynnik polarnoœci (hydrofobowoœci), okreœlany jako log P

(wspó³czynnik podzia³u rozpuszczalnika pomiêdzy oktanolem a wod¹) (19). Ogólnie

aktywnoϾ enzymatyczna lipaz jest niska w polarnych rozpuszczalnikach o log P < 2,

œrednia w rozpuszczalnikach o log P pomiêdzy 2 i 4 oraz wysoka w apolarnych roz-

puszczalnikach o log P > 4 (tab.).

T a b e l a

Wartoœæ log P dla niektórych rozpuszczalników organicznych (19)

Rozpuszczalnik Log P Rozpuszczalnik Log P

1 2 3 4

DMSO -1,30 kwas benzoesowy 1,90

dioksan -1,10 eter dipropylowy 1,90

metanol -0,76 chloroform 2,00

acetonitryl -0,33 heptanol 2,40

etanol -0,24 toluen 2,50

aceton -0,23 ksylen 3,10

propanol 0,28 cykloheksan 3,20

tetrahydrofuran 0,49 heksan 3,50

butanol 0,80 dekanol 4,00

cykloheksanon 0,96 heptan 4,00

Renata Bancerz, Gra¿yna Ginalska

172 PRACE PRZEGL¥DOWE

Page 6: Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

1 2 3 4

heksanon 1,30 oktan 4,50

fenol 1,50 dodekanol 5,00

cykloheksanol 1,50 tetradekan 7,60

heksanol 1,80 oleinian butynu 9,80

3. Nastêpnym parametrem, który nale¿y uwzglêdniæ przy wyborze rozpuszczal-

nika jest rozpuszczalnoœæ substratów i produktów w œrodowisku (20) oraz zgodnoœæ

produktów reakcji z rozpuszczalnikami. Polarne produkty mog¹ pozostawaæ w war-

stwie wody otaczaj¹cej enzym i w ten sposób powodowaæ inhibicjê katalizatora, czy

nawet podlegaæ niepo¿¹danym reakcjom ubocznym.

4. W³aœciwoœci katalizatorów w rozpuszczalnikach organicznych

4.1. Struktura enzymu

Jednym z wa¿niejszych problemów „niewodnej enzymologii” jest pytanie, jak

kontakt z rozpuszczalnikiem organicznym wp³ywa na strukturê enzymu. Wiedza

o konformacji bia³ek w œrodowisku niewodnym jest podstawowa dla zrozumienia

i lepszego wykorzystania enzymatycznej katalizy w takim œrodowisku. Badania do-

tycz¹ce wp³ywu organicznych rozpuszczalników na strukturê enzymu s¹ prowadzo-

ne intensywnie od lat. Niestety, rozpuszczalnoœæ bia³ek w wiêkszoœci tych zwi¹zków

znacz¹co ogranicza liczbê badanych rozpuszczalników. Zwi¹zki organiczne, w któ-

rych bia³ka rozpuszczaj¹ siê, a zatem DMSO, DMF, 2-chloroetanol, bezpoœrednio

oddzia³uj¹ z bia³kiem enzymatycznym, powoduj¹c znacz¹ce zmiany w ich struktu-

rze (zawartoœæ �-helis i struktur � mocno ró¿ni siê od zawartoœci tych struktur

w wodnych roztworach) (21). Rozpuszczalniki te mog¹ ³atwo usuwaæ wodê z po-

wierzchni bia³ka i konkuruj¹ o wi¹zania wodorowe pomiêdzy atomami cz¹steczki

enzymu, co prowadzi do doœæ du¿ego rozfa³dowania ³añcucha bia³kowego, powo-

duj¹c jego denaturacjê.

W licznych eksperymentach kinetycznych ujawnia siê tak¿e, ¿e enzymy w nie-

których rozpuszczalnikach organicznych wykazuj¹ aktywnoœæ porównywaln¹ do ak-

tywnoœci w wodzie (4). To wskazuje, ¿e ich struktura nie ró¿ni siê znacz¹co od

osi¹ganej w wodzie. Wa¿ne informacje o zmianach struktury mo¿na uzyskaæ ekspe-

rymentalnie, dziêki badaniom krystalograficznym. Kilka lat temu uda³o siê ustaliæ

krystaliczn¹ strukturê usieciowanej subtylizyny w bezwodnym acetonitrylu (22). Po-

równanie tej struktury z jej odpowiednikiem w wodzie ujawni³o, ¿e s¹ one praktycz-

nie identyczne. Takie same wyniki otrzymano dla lekko usieciowanej subtylizyny

Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

BIOTECHNOLOGIA 4 (87) 168-182 2009 173

Page 7: Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

w niewodnym dioksanie (23). Krystalografia z wykorzystaniem promieniowania X

nie mo¿e byæ niestety stosowana w przypadku enzymów liofilizowanych, zawieszo-

nych w rozpuszczalnikach organicznych. Mimo to, niektóre dane o strukturze takich

enzymów mog¹ byæ uzyskane dziêki zastosowaniu metody FTIR, czyli absorpcyjnej

spektrometrii w podczerwieni z transformacj¹ Fouriera. U¿ycie tej metody pozwo-

li³o ostatnio na stwierdzenie, ¿e bia³ka (np. liofilizowana subtylizyna) s¹ raczej nie-

wra¿liwe na rodzaj organicznych rozpuszczalników, które ró¿ni¹ siê znacznie polar-

noœci¹ i natur¹ chemiczn¹. Jednak¿e, katalityczne w³aœciwoœci enzymu mocno ró¿-

ni¹ siê w obrêbie tej samej grupy rozpuszczalników, co sugeruje, ¿e zale¿noœæ kata-

litycznej aktywnoœci od rozpuszczalnika mo¿e nie byæ t³umaczona strukturalnymi

zmianami w cz¹steczce enzymu (24).

Wielu badaczy w prowadzonych przez siebie doœwiadczeniach stara³o siê daæ

odpowiedŸ na pytanie, czy cz¹steczka bia³ka enzymatycznego mo¿e w³aœciwie fa³-

dowaæ siê w rozpuszczalniku niewodnym. Rariy i Klibanov (25) wykazali, ¿e lizozym

umieszczony w glicerolu zawieraj¹cym iloœæ wody równ¹ 0,2%, móg³ ponownie spon-

tanicznie fa³dowaæ siê do aktywnej katalitycznie konformacji. To sugerowa³oby, ¿e

woda nie jest jedynym œrodowiskiem posiadaj¹cym zdolnoœæ do utrzymywania od-

dzia³ywañ molekularnych wymaganych do fa³dowania ³añcuchów polipeptydowych

w konformacje aktywne katalitycznie.

Podsumowuj¹c te rozwa¿ania mo¿na stwierdziæ, ¿e to nie kontakt enzymu z roz-

puszczalnikiem organicznym, lecz wa¿niejsze w tym przypadku odwodnienie bia³ka

enzymatycznego, powoduje zmiany w jego strukturze i bez w¹tpienia obni¿a aktyw-

noœæ katalityczn¹. Ten niekorzystny efekt mo¿na powstrzymaæ lub przynajmniej

zminimalizowaæ, np. poprzez stosowanie do liofilizacji enzymów tzw. lioprotektan-

tów, o czym bêdzie mowa w dalszej czêœci artyku³u.

4.2. „Pamiêæ pH” enzymów

W wodnych roztworach kataliza enzymatyczna jest mocno zale¿na od pH i ka¿da

reakcja posiada swoje optimum stê¿enia jonów wodorowych. Jednak w przypadku

rozpuszczalników organicznych pojêcie pH nie ma sensu. Z tego powodu, stan

uprotonowania enzymu grupami jonowymi musi byæ kontrolowany przez inne czyn-

niki. Grupa naukowców pod kierunkiem Klibanova (26) dowiod³a, ¿e enzymy posia-

daj¹ tzw. „pamiêæ pH”. W wodnych roztworach buforowanych jonotwórcze grupy

enzymu nabywaj¹ odpowiedni i w³aœciwy stan jonizacji, który pozostaje niezmienio-

ny w rozpuszczalnikach organicznych. Innymi s³owy, katalityczne zachowanie siê

enzymów w rozpuszczalnikach organicznych odzwierciedla pH ostatniego roztwo-

ru, z którego zosta³y one pozyskane (np. z którego zosta³y zliofilizowane). Chocia¿

w ostatnich badaniach liofilizowanych enzymów z zastosowaniem metody FTIR po-

twierdzono istnienie „pamiêci pH”, to jednak istniej¹ wyj¹tki od tej koncepcji. Na

przyk³ad dehydrogenaza alkoholowa izolowana z koñskiej w¹troby wykazywa³a

Renata Bancerz, Gra¿yna Ginalska

174 PRACE PRZEGL¥DOWE

Page 8: Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

w heptanie najwy¿sz¹ aktywnoœæ, gdy by³a liofilizowana z roztworu wodnego

o pH 2,0, mimo ¿e w wodzie w tym pH by³a zupe³nie nieaktywna (27).

4.3. Zmiana specyficznoœci substratowej enzymu

Si³¹ napêdow¹ dla molekularnego rozpoznania substratu oraz katalizy enzyma-

tycznej jest energia wi¹zania. Miêdzycz¹steczkowe oddzia³ywania warunkuj¹ moc

wi¹zania pomiêdzy ligandami a receptorami oraz s¹ odpowiedzialne za wi¹zanie

substratów do enzymów. W biologicznych systemach energia wi¹zania jest zawsze

wyznaczana przez ró¿nice w energii pomiêdzy cz¹steczkami w roztworze, oddzia-

³uj¹cymi z rozpuszczalnikiem a cz¹steczkami w kompleksie oddzia³uj¹cymi miêdzy

sob¹ (21). Zatem, jeœli wodne œrodowisko reakcji zostanie zast¹pione przez roz-

puszczalnik organiczny, wówczas wolna energia wi¹zania enzym – substrat zmie-

nia zarówno specyficznoœæ substratow¹, jak równie¿ aktywnoœæ katalizatora. Ta

zmiana specyficznoœci enzymu powstaje w wyniku modyfikacji konformacji centrum

aktywnego. Eliminacja ca³ej wody z pod³o¿a reakcji prowadzi bowiem do zwiêksze-

nia sztywnoœci konformacyjnej (15), a tak¿e powoduje niezdolnoœæ wi¹zania sub-

stratów przez enzym. Zaks i Klibanov (28) prowadz¹c badania na wieprzowej lipazie

trzustkowej stwierdzili, ¿e „wilgotny” enzym mo¿e akceptowaæ szeroki zakres sub-

stratów o ró¿nych rozmiarach. Sugeruje to, ¿e szkielet bia³kowy tej¿e lipazy jest

elastyczny i mo¿e przybieraæ ró¿ne konformacje dopasowuj¹c siê do cz¹steczki da-

nego substratu. Jednak¿e „suchy” enzym nie reaguje ze wszystkimi substratami,

prawdopodobnie z powodu wiêkszej sztywnoœci centrum aktywnego, które nie jest

ju¿ zdolne do dopasowania siê do ró¿norodnych substratów.

Zatem równie¿ w przypadku zmiany specyficznoœci substratowej enzymu istotna

jest obecnoœæ wody w pod³o¿u. Ma ona znaczenie dla hydrofobowych oddzia³ywañ

pomiêdzy ³añcuchami bocznymi aminokwasów a wi¹zaniem do samego centrum kata-

litycznego enzymu, a preferencja substratów dla tych enzymów w œrodowisku orga-

nicznym ró¿ni siê znacz¹co od tej w wodzie. Najlepiej przebadany enzym, lipaza,

w œrodowisku organicznym, ale z ma³ym stê¿eniem wody katalizuje ró¿norodne reak-

cje, m.in. aminolizê, transestryfikacjê, estryfikacjê, wymianê reszt acylowych (29). Na-

tomiast w wodzie, reakcje te s¹ prawie ca³kowicie t³umione przez procesy hydrolityczne.

4.4. TermostabilnoϾ

W wysokich temperaturach enzymy staj¹ siê nieaktywne z powodu czêœciowego

rozfa³dowania cz¹steczki, jak równie¿ zmian kowalencyjnych w I-rzêdowej struktu-

rze bia³ka (30). Procesy, które prowadz¹ do nieodwracalnej inaktywacji enzymów,

czyli tworzenia nieprawid³owych struktur, wymiany wi¹zañ disiarczkowych, czy hy-

drolizy wi¹zañ peptydowych wymagaj¹ obecnoœci wody. Jest zatem oczywiste, ¿e

Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

BIOTECHNOLOGIA 4 (87) 168-182 2009 175

Page 9: Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

enzymy powinny byæ bardziej stabilne w œrodowisku o ma³ej zawartoœci wody, ta-

kim jak rozpuszczalniki organiczne. Ponadto spadek aktywnoœci wody zmniejsza ru-

chliwoœæ cz¹steczek bia³ek i w rezultacie chroni je przed czêœciowym rozfa³dowa-

niem, które jest pierwszym krokiem procesu termoinaktywacyjnego (21). Tak za-

tem, w niewodnych œrodowiskach termostabilnoœæ enzymu roœnie g³ównie w wyni-

ku wzrostu sztywnoœci bia³ek w tych systemach. Zosta³o to potwierdzone przez Za-

ksa i Klibanova (28), którzy wykazali, ¿e wieprzowa lipaza trzustkowa umieszczona

w bezwodnej mieszaninie trimaœlan-heptanol w temperaturze 100°C utrzymuje sta-

bilnoϾ przez ponad 12 godzin. Ponadto, w tej temperaturze enzym jest 10 razy bar-

dziej aktywny ani¿eli w temperaturze 20°C.

Innym powodem wzrastaj¹cej termostabilnoœci enzymów w œrodowiskach orga-

nicznych jest to, ¿e wiele wymagaj¹cych wody, kowalencyjnych procesów wywo-

³uj¹cych odwracaln¹ b¹dŸ nieodwracaln¹ inaktywacjê bia³ek, w niewodnych systemach

zachodzi niezwykle wolno. Ueda i wsp. (31) zaobserwowali, ¿e lipaza pochodz¹ca

z Rhodococcus equi posiada bardzo wysok¹ aktywnoœæ w alkoholowym rozpuszczalniku

w temperaturze 70°C tak d³ugo, jak rozpuszczalnik ten pozostaje suchy. W „wilgot-

nym” pod³o¿u stabilnoœæ enzymu jest ju¿ bardzo ma³a. Podnoszenie termostabilnoœci

bia³ek enzymatycznych w organicznych pod³o¿ach jest równie¿ istotne ze wzglêdu na

fakt, ¿e rozszerza siê wówczas zakres temperatury, w których enzymy te s¹ aktywne.

Zatem na stabilnoœæ enzymów w niewodnych pod³o¿ach mocny wp³yw ma iloœæ

wody, jak równie¿ i natura samego rozpuszczalnika. Reslow i wsp. (32), a tak¿e Zaks

i Klibanov (28) zgodnie potwierdzaj¹, ¿e termiczna stabilnoœæ enzymu wzrasta wraz

z hydrofobowoœci¹ rozpuszczalników – enzymy umieszczone w bezwodnych hy-

drofobowych rozpuszczalnikach wykazuj¹ najwy¿sz¹ stabilnoœæ. Natomiast termo-

stabilnoœæ biokatalizatorów w polarnych zwi¹zkach jest doœæ niska.

Z kolei, podczas reakcji syntezy w rozpuszczalnikach organicznych (np. estryfika-

cji) mog¹ pojawiaæ siê zak³ócenia spowodowane obecnoœci¹ wody, która jest jednym

z produktów reakcji. Gromadzenie wody wp³ywa na zmianê poziomu równowagi,

i w efekcie obni¿enie aktywnoœci enzymu. Ponadto akumulacja wody niekorzystnie

oddzia³uje na d³ugoterminow¹ stabilnoœæ enzymu (33), natomiast redukcja zawarto-

œci wody w pod³o¿u reakcji prowadzi zwykle do wzrostu stabilnoœci enzymu.

5. Strategie stabilizacji enzymów

5.1. Modyfikacje œrodowiska reakcji

Enzymy w systemach niewodnych pozostaj¹ aktywne przy za³o¿eniu, ¿e istotna

i niezbêdna monowarstwa wokó³ cz¹steczki enzymu pozostaje nienaruszona. In¿ynie-

ria œrodowiska, w kontekœcie biokatalizy w œrodowisku organicznym, bêdzie dotyczyæ

przede wszystkim modyfikacji najbli¿szego s¹siedztwa biokatalizatora. Niepolarne

Renata Bancerz, Gra¿yna Ginalska

176 PRACE PRZEGL¥DOWE

Page 10: Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

rozpuszczalniki s¹ lepsze ni¿ polarne, poniewa¿ zapewniaj¹ korzystne mikroœrodowi-

sko dla dzia³ania enzymu. Przy konstruowaniu œrodowiska reakcji powinny byæ rów-

nie¿ brane pod uwagê w³aœciwoœci substratów i produktów, które bêd¹ uczestniczyæ

w danej reakcji. Szybkoœæ reakcji bêdzie wysoka, w przypadku gdy œrodowisko bia³ka

enzymatycznego preferuje substraty o du¿ej rozpuszczalnoœci, a produkty o ma³ej roz-

puszczalnoœci. Przy wyborze odpowiedniego rozpuszczalnika bierze siê pod uwagê

m.in. nisk¹ gêstoœæ w celu zminimalizowania ograniczeñ w przep³ywie materii, jego

kompatybilnoœæ z przeprowadzan¹ w nim reakcj¹, toksycznoœæ czy ³atwopalnoœæ (33).

5.2. Modyfikacje enzymów

Wiadomo, ¿e enzymy w niekonwencjonalnych œrodowiskach (np. organicznych)

wykazuj¹ mniejsz¹ aktywnoœæ, ani¿eli w ich naturalnym œrodowisku dzia³ania. Po-

szukuje siê obecnie metod pozwalaj¹cych na zwiêkszenie szybkoœci reakcji enzyma-

tycznych. Szybkoœæ takich reakcji w œrodowisku organicznym jest w znacznym stop-

niu zale¿na równie¿ od sposobu przygotowania enzymu (34,35). In¿ynieria kataliza-

tora dotyczy zatem przede wszystkim sterowania aktywnoœci¹ enzymu poprzez

zoptymalizowanie jego preparatyki do zastosowania w reakcjach organicznych.

W niewodnych systemach stosowane s¹ ró¿ne formy enzymów:

– enzymy natywne,

– enzymy liofilizowane zawieszone w rozpuszczalnikach organicznych,

– enzymy sta³e zaadsorbowane na noœnikach,

– rozpuszczalne w rozpuszczalnikach organicznych enzymy modyfikowane gli-

kolem polietylenowym (36),

– enzymy pu³apkowane w ¿elu czy w mikroemulsjach (37),

– biokatalizatory immobilizowane.

Brak jest jednak ogólnych wskazówek, co do wyboru najodpowiedniejszej formy

enzymu katalizuj¹cego specyficzne reakcje. W celu bardziej ekonomicznego i sku-

tecznego stosowania enzymów w wodnych i niewodnych rozpuszczalnikach prze-

prowadzaæ mo¿na modyfikacje tych enzymów w sposób fizyczny, jak i chemiczny.

5.2.1. Modyfikacja przez immobilizacjê

Obecnie najczêœciej stosowan¹ modyfikacj¹ biokatalizatorów w odniesieniu do

lipaz, jest immobilizacja, czyli kowalencyjne b¹dŸ niekowalencyjne przy³¹czanie en-

zymów do sta³ych lub rozpuszczalnych noœników (38). Niektóre z szeroko stosowa-

nych metod immobilizacji to:

– adsorpcja do hydrofobowych lub jonowych noœników (m.in. do szk³a, ¿elu),

– kowalencyjne przy³¹czanie do odpowiednich aktywowanych chemicznie sta-

³ych matryc,

Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

BIOTECHNOLOGIA 4 (87) 168-182 2009 177

Page 11: Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

– pu³apkowanie lub kapsu³kowanie w ¿elowych polimerach czy mikroemulsjach (39).

U¿ywanie modyfikowanych w ten sposób lipaz jest bardzo korzystne ze wzglêdu

na poprawê stabilnoœci temperaturowej, immobilizacja jest bowiem procesem, któ-

ry zapobiega bezpoœredniemu kontaktowi enzymu z rozpuszczalnikiem organicz-

nym. Lipaza z Mucor miehei immobilizowana na noœniku jonowymiennym jest stabil-

na nawet w temperaturze 70°C, podczas gdy natywny wolny enzym ulega znacznej

deaktywacji ju¿ w temperaturze 50°C po 3 godz. (40). Modyfikuj¹c fizycznie enzym

bez problemu mo¿na go równie¿ odzyskaæ w koñcowym etapie reakcji oraz wyko-

rzystaæ ponownie do pracy ci¹g³ej (41). Interesuj¹ce jest tak¿e to, ¿e immobilizacja

lipaz mo¿e chroniæ te enzymy przed inaktywacj¹ przez niektóre produkty reakcji.

Dobrze znanym przyk³adem jest inhibuj¹cy wp³yw acetaldehydu na lipazy rozpusz-

czalne. Ten produkt przejœciowy tworzony jest podczas reakcji transestryfikacji,

w których estry winylowe wykorzystywane s¹ jako donory grup acylowych (42).

Immobilizacja mo¿e prowadziæ równie¿ do zmian w specyficznoœci substratowej. Li-

paza z Pseudomonas cepacia pokazuje zupe³nie odwrócon¹ specyficznoœæ wzglêdem

substratów po immobilizacji na polipropylenie (43). Enzym wolny preferuje d³u-

go³añcuchowe estry kwasów t³uszczowych (C14 – C18), podczas gdy biokatalizator

immobilizowany wykazuje wiêksze powinowactwo do substratów z krótkimi ³añcu-

chami t³uszczowymi (C2 – C6). Efekt taki mo¿e byæ t³umaczony czêœciowym oczysz-

czeniem surowej lipazy podczas procesu immobilizacji oraz ograniczeniami dyfuzyj-

nymi dla enzymów immobilizowanych.

W procesie unieruchamiania enzymów, stosowanych nastêpnie w reakcjach w œro-

dowiskach organicznych, istotny jest dobór w³aœciwej matrycy. Wa¿ne jest, aby noœnik

by³ obojêtny i nie wp³ywa³ na kinetyczne zachowanie siê enzymu. Równie wa¿ne jest,

by noœnik nie zmienia³ mikroœrodowiska w pobli¿u cz¹steczki enzymu. Hydrofilowe

noœniki (np. alginian wapnia) s¹ kompatybilne z enzymami i mog¹ byæ stosowane w ce-

lu zwiêkszenia poziomu uwodnienia enzymu, omijaj¹c w ten sposób tworzenie od-

dzielnej fazy wodnej w pod³o¿u organicznym. Ekstremalnie polarne matryce mog¹ zaœ

ograniczaæ szybkoœæ przep³ywu hydrofobowych substratów do warstwy enzymu (44).

Przy wyborze metody immobilizacji biokatalizatorów znaczenie ma ³atwoœæ przepro-

wadzania tego procesu. Generalnie adsorpcja jest naj³atwiejsz¹ do wykonania tech-

nik¹, jednak wi¹zania s¹ czêsto s³abe i s¹ atakowane przez rozpuszczalniki organicz-

ne. Biokatalizatorom unieruchamianym w ten sposób brakuje zatem czasami stabilno-

œci takiej, jak¹ uzyskuje siê dziêki kowalencyjnemu wi¹zaniu czy pu³apkowaniu (2).

5.2.2. Modyfikacje chemiczne

W chemicznych modyfikacjach lipaz stosuje siê ró¿nego rodzaju modyfikatory,

które oddzia³uj¹c ze specyficznymi resztami aminokwasowymi, umo¿liwiaj¹ wyja-

œnienie struktury bia³ka i jego centrum aktywnego oraz zmianê i poprawê natyw-

nych w³aœciwoœci lipaz.

Renata Bancerz, Gra¿yna Ginalska

178 PRACE PRZEGL¥DOWE

Page 12: Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

5.2.2.1. Kowalencyjna modyfikacja glikolem polietylenowym oraz innymi polimerami

Do kowalencyjnej modyfikacji lipaz stosowane s¹ hydrofobowe polimery, np. po-

listyren, jak równie¿ ampifiliczne polimery, np. glikol polietylenowy (PEG). Modyfi-

katory te zapewniaj¹ biokatalizatorom wodnopodobne œrodowisko. Lipazy mody-

fikowane PEG staj¹ siê rozpuszczalne w wiêkszoœci rozpuszczalników organicznych,

takich jak benzen, czy chlorowane wêglowodany, natomiast nie rozpuszczaj¹ siê

m.in. w n-heksanie (45). W wyniku chemicznych modyfikacji polimerami hydrofobo-

wymi wolne grupy aminowe enzymów, które s¹ aktywne katalitycznie, mog¹ byæ

czêœciowo utracone przez te enzymy. Inaczej jednak zachowuj¹ siê enzymy modyfi-

kowane PEG. W obecnoœci niepolarnych rozpuszczalników organicznych utrzymuj¹

one swoj¹ aktywnoœæ, poniewa¿ mocno uwodnione ³añcuchy PEG tworz¹ wokó³

cz¹steczki biokatalizatora wodn¹ otoczkê chroni¹c¹ bia³ko przed denaturacj¹. Jed-

nak¿e rozpuszczalniki organiczne mieszaj¹ce siê z wod¹ powoduj¹ ca³kowit¹ inak-

tywacjê enzymów modyfikowanych PEG, poprzez zniszczenie w³aœnie tej wodnej

otoczki (15).

5.2.2.2. Sieciowanie

Do tworzenia nierozpuszczalnych usieciowanych kryszta³ów enzymów (CLEC)

stosuje siê aldehyd glutarowy. Chocia¿ chemiczne sieciowanie jest metod¹ ³atw¹

i niedrog¹, to jednak iloœæ oraz dok³adna lokalizacja modyfikacji biokatalizatora nie

jest do koñca poznana. Trudne do interpretacji jest te¿ to, które zmiany prowadz¹

do wzrostu stabilnoœci enzymu (2).

5.2.2.3. Op³aszczanie enzymów lipidami i surfaktantami

Op³aszczanie lipaz ró¿nymi surfaktantami, czy lipidami nale¿y do niekonwencjo-

nalnych metod modyfikacji enzymów. Polega ona na tym, ¿e hydrofilowy koniec sur-

faktanta wi¹¿e siê niekowalencyjnie do polarnych (jonowych) grup na powierzchni

lipazy, tworz¹c w ten sposób kompleks enzym-surfaktant, którego powierzchnia

jest hydrofobowa z powodu wystaj¹cego na zewn¹trz hydrofobowego koñca mody-

fikatora (2).

Okahata i Ijiro (46) jako pierwsi opisali preparatykê lipazy powlekanej lipidami.

Lipazy z Rhizopus delemar, Pseudomonas fragi i Rhizopus niveus by³y powlekane niejo-

nowymi syntetycznymi dialkilowymi ampifilami. Wiêksz¹ szybkoœæ interestryfikacji

tripalmitynianu i kwasu stearynowego w n-heksanie zaobserwowano dla lipazy

op³aszczonej monostearynianem sorbitanu (Span 60) (47). Span 60 zosta³ równie¿

zastosowany przez Isono i wsp. (48) do syntezy kompleksu lipaza-surfaktant z enzy-

mu pochodz¹cego z Pseudomonas sp. i bior¹cego udzia³ w reakcji estryfikacji alkoho-

Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

BIOTECHNOLOGIA 4 (87) 168-182 2009 179

Page 13: Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

lu cetylowego i kwasu palmitynowego w n-heksanie. Na podstawie obserwacji mo-

dyfikacji bia³ka lipolitycznego ró¿nymi surfaktantami stwierdzono, ¿e aktywnoœæ ka-

talityczna by³a wiêksza dla enzymów op³aszczonych modyfikatorami posiadaj¹cymi

odga³êzienia lub podwójne wi¹zania, w porównaniu do surfaktantów z prostymi

³añcuchami pod warunkiem, ¿e liczba wêgli w takich zwi¹zkach by³a taka sama. Ist-

niej¹ te¿ doniesienia wskazuj¹ce na to, ¿e wp³yw surfaktantów na aktywnoœæ i sta-

bilnoœæ lipaz jest zale¿ny zarówno od pochodzenia lipazy, jak i struktury modyfika-

tora.

5.2.3. Enzymy w formie sta³ej – modyfikacje w trakcie liofilizacji

Enzymy czêsto otrzymywane s¹ z odpowiednich wodnych lub buforowanych roz-

tworów w procesie liofilizacji. Udowodniono, ¿e liofilizacja to prosta i skuteczna

technika tworzenia form biokatalizatorów, które szczególnie nadaj¹ siê do katalizy

w rozpuszczalnikach organicznych. Sk³ada siê ona z trzech etapów: zamra¿ania,

pierwszego oraz drugiego suszenia. Niestety, w ka¿dym etapie procesu liofilizacji

mo¿e nastêpowaæ inaktywacja enzymów na skutek niepo¿¹danych zmian w II-rzê-

dowej strukturze bia³ek (14). W ten sposób oko³o 40% powierzchni centrum aktyw-

nego mo¿e ulec denaturacji.

Aktywnoœæ katalityczn¹ enzymu podczas liofilizacji poprawiæ mo¿na kilkoma

sposobami:

– dodaj¹c ma³e specyficzne substancje pomocnicze, m.in. wêglowodory (49),

polimery (50), kwasy t³uszczowe (51). Jednak aktywnoœæ enzymatyczn¹ w pod³o¿ach

organicznych najbardziej podnosi dodatek soli nieorganicznych (52). Monot i wsp.

(53) dowiedli ponadto, ¿e aktywuj¹cy efekt takich substancji pomocniczych jest wy-

raŸniejszy w „suchych” rozpuszczalnikach ani¿eli w rozpuszczalnikach czêœciowo

uwodnionych;

– dodaj¹c etery koronowe, np. 18-korona – 6 (54,55);

– dodaj¹c lioprotektanty (ligandy), np. sole (56). Nieligandowe lioprotektanty

(sorbitol, PEG, cukry, np. trehaloza) s¹ tak¿e zdolne do podnoszenia aktywnoœci bio-

katalizatorów w rozpuszczalnikach organicznych pod warunkiem, ¿e by³y one obec-

ne w wodnym œrodowisku przed rozpoczêciem liofilizacji. Liofilizacja enzymów

w obecnoœci wymienionych zwi¹zków zapewnia nadzwyczajny poziom aktywacji

biokatalizatorów w porównaniu do enzymów natywnych zawieszonych w rozpusz-

czalnikach organicznych. Liofilizacja w obecnoœci KCl prowadzi³a do 3700-krotnego

wzrostu aktywnoœci transestryfikacyjnej subtylizyny w heksanie (56). Interesuj¹ce

jest te¿ to, ¿e aktywnoœæ enzymatyczna by³a mocno zale¿na od stê¿enia procento-

wego KCl u¿ytego do liofilizacji. Tak du¿y wzrost aktywnoœci by³ wynikiem przede

wszystkim wzrostu obrotów katalitycznych enzymu, a nie tempa wi¹zania sub-

stratu.

Renata Bancerz, Gra¿yna Ginalska

180 PRACE PRZEGL¥DOWE

Page 14: Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

5.2.4. „Molekularne wdrukowanie”

Molekularne wdrukowanie polega na tworzeniu kompleksów pomiêdzy enzyma-

mi a niskocz¹steczkowymi ligandami w roztworze, który nastêpnie suszy siê i prze-

mywa odpowiednio dobranymi rozpuszczalnikami usuwaj¹cymi te ligandy. Bia³ko

indukowane ligandem w bezwodnych pod³o¿ach wykazuje drastyczne obni¿enie

elastycznoœci, umo¿liwiaj¹c ruchliwoœæ tylko bardzo ma³ym jego ³añcuchom i dlate-

go enzymy zachowuj¹ konformacjê indukowan¹ ligandami nawet po uwolnieniu li-

ganda z kompleksu. Po raz pierwszy „molekularne wdrukowanie” przeprowadzili

Russell i Klibanov (57) dla subtylizyny. Enzym ten zosta³ zliofilizowany z roztworu

wodnego, w którym obecny by³ inhibitor kompetycyjny, usuniêty w nastêpnym eta-

pie z kompleksu. Powsta³y w ten sposób biokatalizator wykazywa³ ok. 100-krotnie

wy¿sz¹ aktywnoœæ w porównaniu do enzymu natywnego.

6. Podsumowanie

Wiele enzymów wykazuje aktywnoœæ w œrodowisku niewodnym. Zmiana specy-

ficznoœci, równowagi chemicznej oraz rozpuszczalnoœci substratów i produktów

w rozpuszczalnikach organicznych w porównaniu do œrodowisk wodnych stwarza

mo¿liwoœci wykorzystania biokatalizatorów do otrzymywania produktów, które nie

mog¹ byæ wytwarzane w wodzie. Zdolnoœæ enzymów do pracy w niewodnych œrodo-

wiskach oferuje zatem nowe i wiêksze mo¿liwoœci ich zastosowañ w przemyœle.

Literatura

1. Dordick J. S., (1992), Biotechnol. Prog., 8, 259-267.

2. Hari Krishna S., Karanth N. G., (2002), Catal. Rev., 44, 499-591.

3. Affleck R., Haynes C. A., Clark D. S., (1992), Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89, 5167-5170.

4. Zaks A., Klibanov A. M., (1988), J. Biol. Chem., 263, 3194-3201.

5. Zaks A., Klibanov A. M., (1986), J. Am. Chem. Soc., 108, 2767-2768.

6. Diaz-Garcia M. E., Valencia-González M. J., (1995), Talanta, 42, 1763-1773.

7. Hari Krishna S., (2002), Biotechnol. Adv., 20, 239-267.

8. Halling P. J., (1984), Enzyme Microb. Technol., 6, 513-516.

9. Halling P. J., (1987), Biocatalysis, 1, 109-115.

10. Muralidhar R. V., Chirumamilla R. R., Marchant R., Ramachandran V. N., Ward O. P., Nigam P.,

(2002), World J. Microb. Biotechnol., 18, 81-97.

11. Valivety R. H., Halling P. J., Macrae A. R., (1992), Biochim. Biophys. Acta, 1118, 218-222.

12. Orrenius C., Norin T., Hult K., Carrea G., (1995), Tetrahedron Asymmetry, 6, 3023-3030.

13. Kuntz I.D., Kauzmann W., (1974), Adv. Protein Chem., 28, 239-345.

14. Serdakowski A. L., Dordick J. S., (2007), Trends Biotechnol., 26, 48-54.

15. Khmelnitsky Y. L., Levashov A. V., Klyachko N. M. L., Martinek K., (1988), Enzyme Microb. Technol.,

10, 710-724.

16. Gormau L. A. S., Dordick J. S., (1992), Biotechnol. Bioeng., 39, 392-397.

17. Yamane T., (1998), Biocatalysis, 2, 1-9.

Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

BIOTECHNOLOGIA 4 (87) 168-182 2009 181

Page 15: Œrodowisko niewodne – miejsce katalizy enzymatycznej

18. Zaks A., Klibanov A. M., (1985), Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 82, 3192-3196.

19. Laane C., Boeren S., Vos K., Veeger C., (1987), Biotechnol. Bioeng., 30, 81-88.

20. Martinek K., Semenov A. N., Berezin I. V., (1981), Biochim. Biophys. Acta, 658, 76-89.

21. Zaks A., (1991), Biocatalysis for Industry, Ed. Dordick J. S., 161-180, Plenum Press, New York.

22. Fitzpatrick P. A., Steinmetz A. C. U., Ringe D., Klibanov A. M., (1993), Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90,

8653-8657.

23. Schmitke J. L., Stern L. J., Klibanov A. M., (1997), Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 94, 4250-4255.

24. Griebanov K., Klibanov A. M., (1997), Biotechnol. Bioeng., 53, 351-362.

25. Rariy R. V., Klibanov A. M., (1997), Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 94, 13520-13524.

26. Klibanov A. M., (1986), Chemtech., 16, 354-359.

27. Guinn R. M., Skerker P. S., Kavanaugh P., Clark D. S., (1991), Biotechnol. Bioeng., 37, 303-308.

28. Zaks A., Klibanov A. M., (1984), Science, 224, 1249-1251.

29. Santaniello E., Ferraboschi P., Grisenti P., (1993), Enzyme Microb. Technol., 15, 367-382.

30. Ahern T. J., Klibanov A. M., (1985), Science, 228, 1280-1284.

31. Ueda M., Mukataka S., Sato S., Takahashi T., (1986), Agric. Biol. Chem., 50, 1533-1537.

32. Reslow M., Adlercreutz P., Mattiasson B., (1987), Appl. Microbiol. Biotechnol., 26, 1-8.

33. Hari Krishna S., Divakar S., Prapulla S. G., Karanth N. G., (2001), J. Biotechnol., 87, 193-201.

34. Paradkar V. M., Dordick S. J., (1994), Biotechnol. Bioeng., 43, 529-540.

35. Triantafyllon A. O., Wehtje E., Adlercreutz P., Mattiasson B., (1997), Biotechnol. Bioeng., 54, 67-76.

36. Inada Y., Yoshimoto T., Matsushima A., Saito Y., (1986), Trends Biotechnol., 4, 68-73.

37. Bornscheuer U. T., Padmanabhan P., Scheper T., (1999), Microspheres, microcapsules and liposomes,

Ed. Arshady R., 541-558, Citus Books, London.

38. Mateo C., Palomo J. M., Fernandez-Lorente G., Guisan J. M., Fernandez-Lafuente R., (2007), Enzyme

Microb. Technol., 40, 1451-1463.

39. Villeneuve P., Muderhwa J. M., Graille J., Haas M. J., (2000), J. Mol. Catal. B: Enzymatic, 9, 113-148.

40. Gandhi N. N., Patil N. S., Sawant S. B., Joshi J. B., Wangikar P. P., Mukesh D., (1996), Catal. Rev., 42,

439-480.

41. Kilara A., Shahani K. M., (1978), CRC Crit. Rev. Food Sci. Nutr., 12, 161-198.

42. Weber H. K., Stecher H., Faber K., (1995), Biotechnol. Lett., 17, 803-808.

43. Pancreach G., Leullier M., Baratti J. C., (1997), Biotechnol. Bioeng., 56, 181-189.

44. Tramper J., (1985), Trends Biotechnol., 3, 45-50.

45. Inada Y., Nishimura H., Takahashi K., Yoshimoto T., Saha A.R., Saito Y., (1984), Biochem. Biophys.

Res. Commun., 122, 845-850.

46. Okahata Y., Ijiro K., (1995), J. Chem. Soc. Chem. Commun., 11, 1392-1394.

47. Basheer S., Mogi K., Nakajima M., (1995), Biotechnol. Bioeng., 45, 187-195.

48. Isono Y., Nabetani H., Nakajima M., (1995), J. Am. Oil Chem. Soc., 72, 887-890.

49. Dabulis K., Klibanov A. M., (1993), Biotechnol. Bioeng., 41, 566-571.

50. Otamiri M., Adlercreutz P., Mattiasson B., (1992), Biocatalysis, 6, 291-305.

51. Fishman A., Basheer S., Shatzmiller S., Cogan U., (1998), Biotechnol. Lett., 20, 535-538.

52. Bedell B. A., Mozhaev V. V., Clark D. S., Dordick J. S., (1998), Biotechnol. Bioeng., 58, 654-657.

53. Monot F., Paccard E., Borzeix F., Bardin M., Vandecasteele J.-P., (1993), Appl. Microbiol. Biotech-

nol., 39, 483-486.

54. Lee M.-Y., Dordick J. S., (2002), Curr. Opin. Biotechnol., 13, 376-384.

55. van Unen D. J., Engbersen J. F. J., Reinhoudt D. N., (2002), Biotechnol. Bioeng., 77, 248-255.

56. Iyer P. V., Ananthanarayan L., (2008), Process Biochem., 43, 1019-1032

57. Khmelnitsky Y. L, Welch S. H., Clark D. S., Dordick J. S., (1994), J. Am. Chem. Soc., 116, 2647-2648.

58. Russell A. J., Klibanov A. M., (1988), J. Biol. Chem., 263, 116624-11626.

Renata Bancerz, Gra¿yna Ginalska

182 PRACE PRZEGL¥DOWE