Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
-
Upload
anonymous-mv713l -
Category
Documents
-
view
219 -
download
0
Transcript of Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
1/27
ASAM AMINO DAN PROTEIN
MAKALAH
Disusun untuk Memenuhi Tugas Matakuliah Biokimia
Yang Dibimbing Oleh :
Drs. I Wayan Sumberartha
Dilakukan Oleh :
Kelompok : VIII
. Moh Sholeh !l"#oyyim $%&%'()&%'*+,
(. -inya /l0a Warhani $%&%'()&%'1%,
%. Sulistiana $%&%'()&%'*,
2/3/S!- BIO4O5I
6!K/4T!S 78-DIDIK!- M!T8M!TIK! D!- I4M/ 78-58T!9/!- !4!M
/-IV83SIT!S -8583I M!4!-5
(&%(&'
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
2/27
Kata Pengantar
7u;i syukur kami pan;atkan kehairat !llah SWT yang telah memberikan rahmat serta
karunia"nya kepaa kami sehingga kami berhasil menyelesaikan Makalah ini yang
alhamulillah tepat paa .
Makalah ini berisikan tentang in0ormasi mengenai apa itu asam amino an protein?
serta 0ungsi? kegunaan? persamaan an peranan antara keuanya. Saya menyaari bah
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
3/27
BAB I
Pendahuluan
. 3umusan Masalah
. Bagaimana struktur asam amino an protein se@ara umumA
(. Bagaimana klasi0ikasi asam aminoA
%. Bagaimana klasi0ikasi proteinA
'. Bagaimana proses pembentukan proteinA
+. !pa 0ungsi protein se@ara struktural an 0ungsionalA
.( Tu;uan
. /ntuk mengetahui srtuktur asam amino an protein se@ara umum.
(. /ntuk mengetahui klasi0ikasi asam amino.%. /ntuk mengetahui klasi0ikasi protein.
'. /ntuk men;elaskan proses pembentukan protein.
+. /ntuk men;elaskan 0ungsi protein se@ara struktural an 0ungsional.
BAB II
Isi
Asam Amin
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
4/27
!sam amino merupakan satuan penyusun protein. !sam amino apat ipanang
sebagai turunan ari asam karboksilat? yang satu atom hirogennya iganti oleh gugus amino
$-9%,. !sam amino tergolong am0oter yaitu apat beraksi engan asam atau basa.
Masing"masing gugus asam amino apat bereaksi? misalnya engan pembentukan
garam? esteri0ikasi an oksiasi. 3eaksi umum untuk menun;ukkan aanya asam amino
aalah aksi ninhirin. -inhirin aalah suatu proses yang menyebabkan ekarboksilasi
oksiati0 ari asam amino yang menghasilkan O(? -9% an alehi engan kehilangan
atom karbon. Senya
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
5/27
peptia. Sebagian protein menganung asam amino tambahan yang terbentuk alam
moi0ikasi asam amino yang suah aa alam peptia. Moi0ikasi"moi0ikasi yang ter;ai
bisa memperluas keberagaman biologis protein engan mengubah aya larut? stabilitas? an
interaksi protein"protein ini engan rotein yang lain.
!sam 4"C"!mino yang terapat alam protein.
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
6/27
Klasi"ikasi Asam Amin
!sam amino apat ibagi alam
. Berasarkan gugus an rumus bangunannya
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
7/27
!sam amino apat ibagi men;ai:
a. !sam amino yang mempunyai gugus ali0atik
@ontoh: analin?glisin.isoleusin?leusin?alin
b. !sam amino yang mempunyai gugus hiroksil
@ontoh: serin an treonin
@. !sam amino yang mempunyai gugus sul0ur
@ontoh: sistein an metionin
. !sam amino yang bersi0at asam
@ontoh: asam asparat?asam glutamat?asparagin an glutamin
e. !saam amino yang bersi0at basa
@ontoh: arginine?hiroksilisin?lisin an histinin
0. !sam amino engan @in@in aromatis
@ontoh: 0enil alanine?tripto0an an tirosin
g. !sam amino yang mempunyai gugus imino
@ontoh: prolin an hiroksi prolin
(. Berasarkan 0ungsinya
!sam amino apat ibagi ua yaitu:
a. !sam amino essensial
ontoh: 0enilalanin?isoleusin?leusin?netionin?lisin??treonin?tripto0an an alin
b. !sam amino non essensial
ontoh: alanine? asam asparat? asam glutamat? asparagin? arginin? glisin? glutamin?
hiroksiprolin? prolin? histiin? serin? sistein an tirosin
Prtein
Kata protein berasal ari protos atau proteos
yang berarti pertama atau utama. 7rotein
merupakan komponen penting atau komponen utama sel he
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
8/27
7rotein mempunyai molekul besar engan bobot molekul berariasi antara +&&&
sampai ;utaFan. Dengan @ara hirolisis oleh asam atau enEim? protein akan menghasilkan
asam"asam amino. !a (& ;enis asam amino yang terapat alam molekul protein. !sam"
asam amino ini terikan satu engan yang lain oleh ikatan pertia. 7rotein uah ipengaruhi
oleh suhu tinggi? p9? an pelarut organik
7rotein teriri atas satu atau beberapa rantai polipeptia yang mempunyai BM tinggi.
7rotein aalah makromolekul paling rumit. Bilg ma# Perut$ sampai menghabiskan (+
tahun sebagian besar karisnya hanya untuk mempela;ari satu ma@am protein:
HEMO%LOBIN& pemba
Subunit molekul protein aalah asam amino? seluruhnya aa (& asam amino
=standar> yang telgolong protein :
asam amino 5lisin !lanin Valin 4eusin Isoleusin Serin Theroin 4isin
Disingkat 54I !4! V!4 48/ I48 S83 T93 4IS
!sam asparatik !rginin !sparasin 5lutamin Sistein Metionin 7rolin
!S7 !35 !S- 54- SIS M8T 73O
!sam 5lutamik 9istiin Tripto0an Tirosin 6enilalanin
!S7 9IS T37 TI3 798
Setiap protein menganung asam amino alam ;umlah an urutan tertentu. !sam
amino saling tarik sehingga rantai protein melilit an memaat? sekalipun tetap lentur =sering
beberapa rantai polipeptia melilit bersama seperti paa hemoglobin>
Struktur Prtein
Struktur protein ibagi men;ai empat tingkatan yaitu struktur primer? sekuner?
tertier? an kuartener. Struktur primer terbentuk oleh ikatan peptie antara asam amino
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
9/27
membentuk polipeptia. Struktur primer aalah rangkaian asam amino yang membentuk
rantai tunggal an lurus berupa polipeptia.
Beberapa rantai lurus polipeptia apat membentk struktur sekuner yang apat
pilinan atau isebut alfa $C, helix dan beta $G, pleated sheet yang menyerupai lembaran yang
berlipat banyak. Keua ;enis struktur sekuner ini apat bergabung membentuk struktur
tertier seperti @ontohnya paa molekul protein yang isebut myoglobin yaitu pigmen merah
alam otot yang ber0ungsi menyimpan oksigen.
Keua struktur sekuner ini kemuian apat pula membentuk struktur kuartener
seperti @ontohnya paa molekul protein yang isebut hemoglobin yaitu pigmen merah alam
arah yang bertugas mengikat an mengangkut oksigen.
Struktur Primer
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
10/27
Se@ara seerhana? struktur primer protein aalah
urutan asam amino penyusun protein yang isebutkan ari
kiri $-"terminal, ke kanan $"terminal,.!! bisa itulis
alam singkatan % huru0 atau huru0.
5ly"7ro"Thr"5ly"Thr"5ly"5lu"Ser"4ys"ys"7ro"4eu"Met"
Val"4ys"Val"4eu"!sp"!la"Val"!rg"5ly"Ser"7ro"!la
atau
%PT%T%ESK'PLM(K(LNA(R%SPA
ara penulisan yang terakhir $koe huru0, lebih banyak igunakan karena lebih praktis.
Struktur primer terbentuk karena ikatan peptia antar !! selama proses biosintesis
protein atau translasi. /rutan asam amino apat itentukan engan metoe Degraasi 8man
atau Tanem Mass Spe@trophotometry. !tau bisa ;uga ari hasil translasi in silico gen
pengkoe protein tersebut.
Struktur Sekunder
7aa bagian tertentu ari protein? terapat susunan !! yang membentuk suatu
struktur yang reguler engan suut"suut geometri tertentu.!a ua struktur sekuner utama
yaitu al0a"heliH an beta"sheet.Struktur ini ter;ai akibat aanya ikatan hirogen antar !!.
Struktur Sekuner 7rotein
7aa gambar sebelah kiri? terlihat bah
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
11/27
teriri atas %.) resiu asam amino an struktur ini terbentuk karena aanya ikatan hirogen
antara atom O paa gugus O engan atom 9 paa gugus -9 $itanai engan garis
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
12/27
Ikatan hidrgen
2ika paa struktur sekuner ikatan hirogen ter;ai paa backbone? maka ikatan
hirogen yang ter;ai antar gugus samping akan membentuk struktur tersier. Karena paa
gugus samping bisa banyak terapat gugus seperti JO9? JOO9? JO-9( atau J-9( yang
bisa membentuk ikatan hirogen.
Ikatan hirogen
%a)a Dis*ersi (an Der +aals
Beberapa asam amino memiliki gugus samping $3, engan rantai karbon yang @ukup
pan;ang. -ilai ipol yang ber0luktuati0 ari satu gugus samping apat membentuk ikatan
engan ipol berla
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
13/27
ysteine memiliki gugus samping JS9 imana apat membentuk ikatan sul0ia
engan JS9 paa @ystein lainnya? ikatan ini berupa ikatan koalen sehingga lebih kuat
ibaning ikatan"ikatan lain yang suah isebutkan i atas.
Struktur .uartener
7rotein atau polipeptia yang suah memiliki struktur tersier apat saling berinteraksian bergabung men;ai suatu multimer. 7rotein pembentuk multimer inamakan subunit. 2ika
suatu multimer inamakan imer ;ika teriri atas ( subunit? trimer ;ika % subunit an tetramer
untuk ' subunit. Multimer yang terbentuk ari subunit"subunit ientik isebut engan a
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
14/27
7rotein apat ibagi alam ( kelompok besar?yaitu
. protein seerhana $simple protein,
biasanya hanya menganung asam C"amino sa;a
o albumin
o globulin
o glutelin
o prolamin
o albuminoi
o histon
o protamine
(. 7rotein ma;emuk $@on;ugate protein,
7rotein yang menganung Eat lain $prostheti@ group, yang berikatan engan protein
engan ikatan lain selain @ara ikatan ion.
o -ukleo protein
o 5liko protein
o 6os0o protein
o Kromo protein
o 4ipo protein
o Metalo protein
Prses Pem-entukan Prtein
("amino karboksilat atau asam C"amino karboksilat. Se@ara umum
memiliki struktur sebagai berikut:
Molekul !sam !mino
http://sciencebiotech.net/wp-content/uploads/2010/09/200px-AminoAcidball.pnghttp://sciencebiotech.net/wp-content/uploads/2010/09/200px-AminoAcidball.pnghttp://sciencebiotech.net/wp-content/uploads/2010/09/200px-AminoAcidball.png
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
15/27
Dimana 3 aalah gugus samping mulai ari yang paling seerhana J9 $gly@ine L gly,
hingga yang memiliki gugus samping siklik seperti tryptophan $trp,.5ambar i ba
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
16/27
Karena reaksi pembentukan peptia membebaskan molekul air? maka ;umlah !!
penyusun polipeptia isebut resiu.
Berasarkan konensi? penyebutan urutan !! imulai ari !! yang memiliki gugus J
-9( $isebut - terminal, hingga yang memiliki gugus JOO9 bebas $ terminal,.
Struktur Molekul 7olipeptia
7roses sintesis protein apat ibeakan men;ai ua tahap. Tahap pertama aalah
transkripsi yaitu pen@etakan !3- oleh !D- yang berlangsung i alam inti sel. !3-
inilah yang akan memba
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
17/27
%. Setelah terbentuk? !3- keluar ari inti sel melalui pori"pori membran inti menu;u
ke ribosom alam sitoplasma.
/ntuk setiap satu
molekul protein yang
ibentuk akan selalu
dimulai engan
kdn inisiasi atau
kdn start yaitu !/5
yang mengkoekanasam amino metionin. 2ika
satu molekul protein telah
terbentuk akan selalu
diakhiri engan tana
berupa kdn st*
atau kdn terminasi?
yaitu /5!? /!!? atau /!5
20 Translasi
Setelah !3- keluar ari alam inti? selan;utnya ia bergabung engan ribosom alam
sitoplasma. 4angkah berikutnya aalah pener;emahan koe genetik $koon, yang ilakukan
oleh !3-t. aranya? !3-t akan mengikat asam amino tertentu sesuai yang ikoekan oleh
koon? lalu memba
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
18/27
Setelah asam amino iba
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
19/27
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
20/27
4ungsi Prtein se!ara Struktural dan 4ungsinal
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
21/27
7rotein yang membangun tubuh isebut Protein Struktural seangkan protein yang
ber0ungsi sebagai enEim?antiboi atau hormon ikenal sebagai Protein Fungsional.
7rotein struktural paa umumnya bersenya
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
22/27
9ormon"hormon tubuh an enEim merupakan bentukan ikatan"ikatan tubuh yang
bertinak sebagai katalisator atau membantu perubahan"perubahan biokimia yang ter;ai
ialam tubuh. engan mengonsumsi protein yang @ukup maka ikatan"ikatan ini akan
ber0ungsi engan baik.
• Mengatur keseimbangan air
airan alam tubuh manusia ipisahkan oleh membran"membaran sel. membran"
membran sel ini neganbantuan protein memiliki 0unsi untuk men;aga homeostatis ari
@airan itu seniri? salah satu masalah yang timbul ;ika ter;ai kekurangan protein? aalah
engan ter;ainya eema paa bagian tubuh tertentu.
• -etralitas Tubuh
Sebagian besar ;arignan tubuh membutuhkan p9 netral untuk men;alankan 0ungsinya?
an protein apat bereaksi terhaap asam an basa alam tubuh untuk men;aga p9 paa
konisi konstan.
• 7embentukan !ntiboi
Tinggi"renahnya aya tahan tubuh sangat bergantung paa pembentukan antiboi
alam tubuh. an kemampuan tubuh untuk memprouksi antiboi ini sangat bergantung paa
tinggi renahnya protein tubuh. sebab protein tubuhlah yang mampu untuk membentuk
enEim"enEim yang berguna alam pembentukan antiboi ini.
• Mengangkut Eat giEi
Dalam hal transportasi sari"sari makanan alam tubuh protein ;uga memiliki anil
yang sangat besar? sebab sebagian besar ari Eat"Eat giEi ialam tubuh hanya bisa iangkut
oleh protein.
• 2uga sebagai Sumber energi
Sumber makanan he
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
23/27
Semua ;enis protein yang kita makan akan i@erna i alam saluran pen@ernaan men;ai
Eat yang siap iserap i usus halus?yaitu berupa asam amino"asamamino.!sam amino"asam
amino yang ihasilkan ari proses pen@ernaan makanan berperan sangat penting i alam
tubuh?untuk:
• Bahan alam sintesis subtansi penting seperti hormon?Eat antiboi?an organel sel
lainnya
• 7erbaikan?pertumbuhan an pemeliharaan struktur sel?;aringan an organ tubuh
• Sebagai sumber energi?setiap gramnya akan menghasilkan '? kalori.
• Mengatur an melaksakan metabolisme tubuh?misalnya sebagai enEim$protein
mengakti0kan an berpartisipasi paa reaksi kimia kehiupan,
• Men;aga keseimbangan asam basa an keseimbangan @airan tubuh.Sebagai senya
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
24/27
Kesim*ulan
• ("amino karboksilat atau asam C"amino karboksilat. Se@ara umum memiliki struktur
imana 3 aalah gugus samping mulai ari yang paling seerhana J9 $gly@ine L gly,
hingga yang memiliki gugus samping siklik seperti tryptophan $trp,.
• asam amino sekurang"kurangnya menganung ua buah gugus 0ungsional? yaitu
gugus karboksil $"OO9, an gugus amina $"-9(,..
• Struktur protein ibagi men;ai empat tingkatan yaitu struktur primer?
sekuner?tertier? an kuartener.
• Struktur primer aalah rangkaian asam amino yang membentuk rantai tunggal an
lurus berupa polipeptia.
• polipeptia apat membentk struktur sekuner yang apat pilinan atau isebut alfa $C,
helix dan beta $G, pleated sheet yang menyerupai lembaran yang berlipat banyak.• struktur sekuner apat bergabung membentuk struktur tertier. Struktur tersier
men;elaskan bagaimana seluruh rantai polipeptia melipat seniri sehingga
membentuk struktur % imensi. 7elipatan ini ipengaruhi oleh interaksi antar gugus
samping $3, satu sama lain.
• Keua struktur sekuner kemuian apat pula membentuk struktur kuartener
• 7rotein atau polipeptia yang suah memiliki struktur tersier apat saling berinteraksi
an bergabung men;ai suatu multimer.7rotein pembentuk multimer inamakan
subunit
• Berasarkan gugus an rumus bangunannya !sam amino apat ibagi men;ai:
a. !sam amino yang mempunyai gugus ali0atik
b. !sam amino yang mempunyai gugus hiroksil
@. !sam amino yang mempunyai gugus sul0ur
. !sam amino yang bersi0at asam
e. !saam amino yang bersi0at basa0. !sam amino engan @in@in aromatis
http://sciencebiotech.net/wp-content/uploads/2010/09/200px-AminoAcidball.png
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
25/27
g. !sam amino yang mempunyai gugus imino
Berasarkan 0ungsinya !sam amino apat ibagi ua yaitu:
a. !sam amino essensial
b. !sam amino non essensial
• 7rotein apat ibagi alam ( kelompok besar?yaitu
protein seerhana $simple protein,>biasanya hanya menganung asam C"amino sa;a>
o albumin
o globulin
o glutelin
o prolamin
o albuminoi
o histon
o protamine
7rotein ma;emuk $@on;ugate protein,
7rotein yang menganung Eat lain $prostheti@ group, yang berikatan engan protein
engan ikatan lain selain @ara ikatan ion.
o -ukleo protein
o 5liko protein
o 6os0o protein
o Kromo protein
o 4ipo protein
o Metalo protein
• 7roses sintesis protein apat ibeakan men;ai ua tahap. Tahap pertama aalah
transkripsi yaitu pen@etakan !3- oleh !D- yang berlangsung i alam inti sel.
!3- inilah yang akan memba
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
26/27
ari setiap pesan. !"/"5 an koon berikutnya menyatu engan t3-! yang
komplementer an @o@ok engan lubang paa ribosom. Setiap t3-! memba ibuangN
3ibosom kembali bergerak isepan;ang sisi pesan melarik asam amino yang akan
menggulung irinya seniri men;ai protein. 7roses ini berlan;ut sampai ribosom
men;ai salah satu tana =berhenti> 3ibosom berhenti karena tiak aa lagi t3-!
untuk ipasangkan engan anti koon. 7rotein lengkap ini akan ipangkas oleh enEim
ribosom lainnya. Biasanya paa saat ini protein ;uga ibersihkan engan berbagai
ma@am @ara.
• 6ungsi protein stru@tural an 0ungsional:
o Bahan alam sintesis subtansi penting seperti hormon?Eat antiboi?an organel
sel lainnya
o 7erbaikan?pertumbuhan an pemeliharaan struktur sel?;aringan an organ
tubuh
o Sebagai sumber energi?setiap gramnya akan menghasilkan '? kalori.
o Mengatur an melaksakan metabolisme tubuh?misalnya sebagai enEim$protein
mengakti0kan an berpartisipasi paa reaksi kimia kehiupan,
o Men;aga keseimbangan asam basa an keseimbangan @airan tubuh.Sebagai
senya
-
8/19/2019 Asam Amino Dan Protein Biokimia Last Part
27/27
Da"tar Pustaka
7oe;iai? !nna an Suprianti? 6.M. Titin? 11'? =DASAR5DASAR BIOKIMIA> $eisi ke"
(,N 2akarta: /niersitas Inonesia $/I"7ress,.
Moul 7erkliahan J Mata Kuliah Biokimia : 7engantar an 7roseur 7raktikum BiokimiaN 3.
3 7ri;o /tomo kk $penulis,N Institut Keguruan an Ilmu peniikan Malang? 2rusan
7eniikan Biologi? MalangN 11*? '* halaman.
Moul 7erkuliahan J Mata Kuliyah Biokimia : 7rotein !sam -ukleatN 3etno Mur? /nite States o0 !meri@aN M@5ra