Asam Amino Dan Protein 2015

8/18/2019 Asam Amino Dan Protein 2015

1/32

BIOKIMI

A

LaboratoriumFisiologi Biokimia

Fapet Unpad2014/201

!ehe!

A"AM AMI#O


2/32

PENDAHULUAN

• Protein berasal dari bahsa Yunani kuno

(Proteus = penting) - ditemukan hampir !"

dari bobot kering sel

• #omposisi terdiri atas unsur $%H%&% N danbeberapa ' dan P

• Protein memiliki bobot molekul tinggi (!!!

*uta)

• Protein mempun+ai beberapa ,ungsi biologis

• Protein merupakan polimer asam amino +ang

dirangkai oleh ikatan peptida


3/32

BERAT MOLEKUL BERBAGAI PROTEIN

PROTEIN BM

• Insulin (sapi)

• Ribonuklease (pancreas sapi)

• Lisosini (puti telur)

• Mio!lobin ("antun! ku#a)

• Ki$otripsin (pancreas sapi)

• %e$o!lobin ($anusia)

• &eru$ albu$in ($anusia)

• %eksokinase

• ' Globulin (ku#a)

• Gluta$at #ei#ro!enase (ati sapi)

*++

,-./0

,+1+0

,.210

--.00

./00

.200

,0-000

,/1100

,000000


4/32

3 PENGGOLONGAN PROTEIN BER4A&ARKAN 5UNG&I BIOLOGI&

GOLONGAN 3ONTO%

En6i$ ' Ribonuklease

' Tripsin

Protein transport ' %e$o!lobin

' Albu$in seru$

' Mio!lobin' , 7 lipoprotein

Protein nutrien ' Glia#in (!an#u$)

' O8albu$in (telur)

' Kasein (susu)

' 5eritin

Protein kontraktil ' Aktin

' Miosin' Tubulin

' 49nein

Protein struktural ' Keratin

' 5ibroin

' Kola!en

' Elastin

' Proteo!likan

Protein pertaanan ' Antibo#i

' 5ibrino!en

' Tro$bin

' Toksin botolinus

' Toksin #i:teri

' Bisa ular

Protein pen!atur ' Insulin

' Kortikotropin

' G


5/32

%I4ROLI&I& %I4ROLI&I&

PROTEIN A&AM AMINO 3;%;N;O;&;P; 5e;3u;


6/32

ini berbe#a

ini sa$a

protein #en!an ratusan atau ribuan

$olekul AA

AA bersa$a'sa$a berantai $e$bentuk

protein

→ -0 AA 4ikete$ukan #i #ala$ protein; #ina$akan $ono$er → &uatu rantai protein'protein #ina$akan pol9$er

→ &etiap AA #ibentuk 3; %; O; N ka#an!'ka#an! & =

3-%

O

-N Gl9cine

3.%

,/O

-N

- L9sine

3+%

*O

-N& 39steine


7/32

A'A. A./N&

• Asam amino adalah pen+usun protein

• .emiliki 0 gugus ,ungsional 1 gugus amino

dan gugus karboksilat

• #edua gugus ,ungsional terikat pada $ α -(atom karbon +ang sama ) sehingga disebut α

asam amino

•

.olekul +ang mempun+ai si,at asam dan basadisebut 1 amphoteri2

• Asam amino dibedakan berdasarkan 3antai

samping


8/32

Asam Amino

• 'truktur1

satu atom $ sentral +ang

mengikat se2ara ko4alent1

–gugus amino%

– gugus karboksil%

– satu atom H dan

–

rantai samping (gugus 3)


9/32

Molekul'$olekul a$poteric $un!kin $e$bentuk >

internal salts?; #isebut = 6@itterions

O

3

3 7 N %

% R

%

O' 7 %

• Pa#a $olekul asa$ a$ino ter#apat ato$ 3 asi$etrik

→Pa#a ru$us ruan! (stereo) posisi 7 N%- a#a #ua

(Me$iliki - iso$er ruan!)

R

%-N 7 3 7 %

3

O O%

R

% 7 3 7 N%-

3

O O%

L 7 A&AM ' AMINO

( LEAO C KIRI)

4 7 A&AM AMINO

( 4EDTRO C KANAN)

Jika gugus R tidaksama dengan H, makaatom karbon disebutasimetris


10/32

→ 4i ala$ ban9ak #ite$ukan =

L 7 asa$ ' a$ino→Ato$ 3 pa#a ke -0 AA asi$etris; kecuali pa#a AA !lisina

(!u!us R n9a a#ala !u!us %)

%

N%- 7 3 7 % %

3

O O%

GLI&INA


11/32

• KE 7 -0 AA tern9ata bersi:at optika → Ma$pu $e$utar bi#an! sinar

Terpolarisasi ke kiri atau ke kanan → Alat 9an! #apat $e$baca besarn9a

putaran = polari$eter; #en!an ru$us=

LAMBANGPUTARAN K%A&

-O3 C KON4I&I &U%U PENGAMATAN

4 C PANANG GELOMBANG

aO C PUTARAN K%A&

p C PANANG TABUNG

POLARIMETER (#$)

c C KON&ENTRA&I 4ALAM !rF$l

Andi Mushawwir, S.Pt., MP.

[ ] pxc

aC D

O0

25

=α


12/32

→ PUTARAN K%A& BEBERAPA AA

AA PUTARAN K%A&

L'ALANIN

L'ARAGININ

L'I&OLEU3IN

L'PENILALANINL'%I&TI4IN

L'GLUTAMAT

L'PROLIN

,;2

,-;

,-;/

' +/;' +2;

,-;0

' 2.;-


13/32

• Gugus R rantai samping yang berbeda-bedapada setiap jenis asam amino

• Gugus R pada asam amino tersebut

menentukan:- Struktur- Ukuran- Muatan elektrik

- Sifat kelarutan di dalam air


14/32

S!"# $S!"# "S"M "M%&:

'( )arut dalam air

*( #idak larut dalam pelarut organik

+( "" dalam air, gugus karboksilat akan melepas ion H

sedangkan ggs amina akan menerima ion H

( "" dalam larutan , bisa membentuk ion positif dan ionbermuatan negatif ./itterion ion amfoter

0( 1eadaan ion sangat bergantung pH larutan,a( lar("" dlm air basa bentuk basa

b( )ar "" dlm air asam

bentuk asam 2( "" memiliki titik isoelektrik yang berbeda-beda 3#abel

4(

5entingnya mengetahui sifat asam basa dari "", diperlukan

untuk menganalisis danmengerti sifat-sifat protein


15/32

Asa$ a$ino Titik Isoelektrik Alanin Arginin As AspartatHistidinLeusin

5enilalaninProlin6ripto,an7alin

8%!!9!%:80%:::%;

%;<

%<8%>!%


16/32

Asa$ a$ino stan#ar • Asa$ a$ino stan#ar a#ala

Asam amino +ang men+usunprotein organisme

• 6erdapat 0! ma2am asam amino

pen+usun protein

•

Diketahui asam amino ke 09disebut selenosistein (*arang

ditemukan) % terdapat pada

beberapa en?im seperti gluthatione

pero@idase

• 'elenenosistein mempun+ai kodegenetik1 UA biasa utk stop

kodon t*d pd m3NA dgn struktur

0nd +g ban+ak

&INGKATAN AA


17/32

• &INGKATAN AAA&AM AMINO &INGKATAN LAMBANG

ALANIN

ARGININ

A&PARGIN

A&AM A&PARTAT

&I&TEIN

GLUTAMIN

A&AM GLUTAMAT

GLI&IN

%I&TI4IN

I&OLEU3IN

LEU3IN

LI&IN

METIONIN

5ENILALANIN

PROLIN

&ERIN

TREONIN

TRIPTO5AN

TIRO&IN

ALIN

ALA

ARG

A&N

A&P

3&

GLN

GLU

GL

%I&

ILE

LEU

L&

MET

P%E

PRO

&ER

T%R

TRP

TR

AL

A

R

N

4

3

H

E

G

%

I

L

K

M

5

P

&

T


18/32

Asa$ a$ino non stan#ar

• .erupakan asam amino

diluar 0! m2m as Amino

standar

• 6er*adi karena modi,ikasi

+ang ter*adi setelah suatu

asam amino standar

men*adi protein

• #urang lebih >!! asam

amino non standardi*umpai pada sel

modi8kasi serinyang mengalamifosforilasi olehprotein kinase


19/32

• modifikasi prolin dlm prosesmodifikasi posttranslasi, olehprokolagen prolin hidroksilase.

• Ditemukan pada kolagen untukmenstabilkan struktur

• Dari modi,ikasi lu oleh 4it #

• γ karboksi glutamat mampu mengikat

$a penting utk pen*endalan darah

•

Ditemukan pd protein protombin


20/32

•Modi8kasi lisin( #erdapat pada kolagen dan miosin3protein kontraksi pd otot4 dan berperan untuk sisiterikatnya polisakarida

•

7eberapa ditemukan asam amino nonstandar yangtidak menyusun protein merupakan senya/aantara metabolisme 3biosintesis arginin dan urea4


21/32

Pen!!olon!an Asa$ a$ino•

Penggolongan berdasar pada gugus 3 (rantai samping)• Biasan+a si,at-si,at seperti1 hidro,obikChidro,ilik% polarCnon

polar% adaCtidakn+a gugus terionisasi

• Assam amino 1

9 Asam Amino aromatik 0 Asam amino Polar

> Asam amino nonPolar

Asam amino a2idi2 (-)

Asam amino basi2 ()

A$OMA%IK

&OLA$

A'I(I' )!*


22/32

, Asa$ a$ino non polar

• .emiliki gugus 3 ali,atik

• lisin% alanin% 4alin% leusin% isoleusin dan prolin

• Bersi,at hidro,obik 'emakin hidro,obik suatu AA spt

/le (/)

biasa terdapat di bagian dlm protein• Prolin berbeda dgn AA siklis 6api mempun+ai

b+k kesamaan si,at dgn kelompok ali,atis ini

• Umum terdapat pada protein +ang berinteraksi

dengan lipid


23/32


24/32

- Asa$ a$ino polar •

.emiliki gugus 3 +ang tidak bermuatan• 'erin % threonin% sistein% metionin% asparagin%

glutamin

• Bersi,at hidro,ilik mudah larut dalam air

•

$enderung terdapat di bagian luar protein• 'istein berbeda dgn +g lain% karena ggs 3

terionisasi pada pH tinggi (pH = ) sehingga dapatmengalami oksidasi dengan sistein membentukikatan disul,ide

• (-'-'-) sistin (tdk tmsk dlm aa standar karenaselalu t*d dari 0 buah molekul sistein dan tidakdikode oleh DNA)


25/32


26/32

+ Asa$ a$ino #en!an !u!us R

aro$atik

• 5enilalanin% tirosin dan tripto,an

• Bersi,at relati, non polar hidro,obik

• 5enilalanin bersama dgn 7% L / aa plg

hidro,obik• 6irosin gugus hidroksil % tripto,an 2in2in indol

sehingga mampu membentuk ikatan hidrogen

penting untuk menentukan struktur en?im

• Asam amino aromatik mampu men+erap sinar U7 F0

protein


27/32


28/32

/ Asa$ a$ino #en!an !u!us R ber$uatan

positi: •

Lisin% arginin% dan histidinn• .empun+ai gugus +g bersi,at basa pd rantai

sampingn+a• Bersi,at polar terletak di permukaan protein dapat

mengikat air• Histidin mempun+ai muatan mendekati netral (pd

gugus imida?ol) dibanding – lisin gugus amino

– arginin gugus guanidino

• #rn histidin dpt terionisasi pada pH mendekati pH,isioligis sering berperan dlm reaksi ensimatis +gmelibatkan pertukaran proton


29/32


30/32


31/32

Asa$ a$ino #en!an !u!us R ber$uatan

ne!ati:

• Aspartat dan glutamat

• .empun+ai gugus karboksil pada rantai

sampingn+a bermuatan (-) C a2id pada pH :


32/32

#o be 9ontinue thank you

Asam Amino Dan Protein 2015

Documents

Transcript of Asam Amino Dan Protein 2015