การปรับแต่งจีโนม (Genome Editing) เพื่อ ... · 2018. 3....
Transcript of การปรับแต่งจีโนม (Genome Editing) เพื่อ ... · 2018. 3....
Focus&
>>> 10 July-August 2016, Vol.43 No.247
ความผดปกตแตกำาเนด
ปจจบนมยนกวา 25,000 ยนทถกคนพบในจโนมของมนษย ในจ�านวนนมมากกวา 3,000 ยนทเกยวของกบการเกดโรค ปจจยทท�าใหการวจยทมงศกษาพนธกรรมของโรคตาง ๆ ในมนษยไดรบความสนใจมากขน ไดแก มขอมลล�าดบดเอนเอจากโครงการจโนมมนษย (human genome project) จ�านวนมาก ตนทนในการหาล�าดบเบสในดเอนเอลดลงอยางมาก และขอมลล�าดบเบสทเกยวของกบโรคตาง ๆ ในมนษยมมากขน การศกษากลไกการท�างานของยนกบการเกดโรคจะน�าไปสแนวทางในการรกษา โดยแนวทางหนงทก�าลงเปนทสนใจ คอ การเปลยนล�าดบเบส หรอการปรบแตงจโนมในเซลลหรอเนอเยอทเกดโรค โดยเฉพาะโรคทเกดจากยนเดยว (monogenic disease) เชน โรคภมค มกนบกพรองชนด Severe Combined Immonodefficiency: SCID โรคฮโมฟเลย (hemophilia เลอดออกงายแตหยดยาก) เปนตน
ดร.สชาต อดมโสภกจ
สำ�นกง�นคณะกรรมก�รนโยบ�ยวทย�ศ�สตร
เทคโนโลยและนวตกรรมแหงช�ต (สวทน.)
เพอการบ�าบดรกษาการปรบแตงจโนม (Genome Editing)
เทคโนโลยการปรบแตงจโนมเปนเทคโนโลยในการเปลยน รหสพนธกรรมทต�าแหนงจ�าเพาะของสงมชวตใหคงอยอยางถาวร ดวยการท�าใหดเอนเอสายค ณ จดทมล�าดบเบสเปาหมายแยกออกจากกน เรยกวา Double-Stranded Brake: DSB โดยใชเอนไซม Endonuclease โดยทวไปหากปรากฏการณ DSB เกดขนตามธรรมชาตและปลอยทงไวจะเปนอนตรายตอสงมชวต จงมกลไกในการซอมแซม DSB เชน
➲ Homologous Recombination-Directed Repair หรอ Homology-Directed Repair: HDR ซงน�าเอาชนสวนดเอนเอทปกตสอดแทรกเขาไปทดแทนในบรเวณเปาหมายของจโนม
➲ Non-Homologous End Joining: NHEJ เปนการท�าใหสวนของดเอนเอทผดปกตหลดออกไป แลวเชอมปลายโครโมโซมทง 2 ขางทเหลออยเขาหากน ท�าใหยนทผดปกตไมสามารถแสดงออกไดอกตอไป (เรยกวา gene knockout)
เทคโนโลยการปรบแตงจโนมทไดรบการพฒนาในปจจบนสวนใหญใชเอนไซมทเรยกวา Programmable Nuclease ซงม หลายชนด เชน Meganuclease, Zinc Finger Nuclease, TALEN, CRISPR เปนตน
Focus&
July-August 2016, Vol.43 No.247 11 <<<
อยางไรกตาม นกวทยาศาสตรบางกลมมองวาเทคโนโลยนอาจสามารถน�าไปใชรกษาโรคทเกดจากไวรสไดดวย เชน HIV (ไวรสท�าใหเกดโรคเอดส) Human Papilloma Virus: HPV ไวรสท�าใหเกดโรคหด ไวรสตบอกเสบชนดบ (hepatitis B virus) เปนตน
รจกผพทกษเซลลกนกอน
Clustered Regulatory-Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR - อานวา “ครสเพอร”) เปนสวนหนงของดเอนเอซงมล�าดบเบสซ�า ๆ พบไดในสงมชวตชนต�าจ�าพวกแบคทเรย ท�าหนาทคลายภมค มกนแกเซลลในการก�าจดดเอนเอแปลกปลอม โดยมบทบาทในการจดจ�าล�าดบเบสของดเอนเอแปลกปลอมอยางจ�าเพาะ
นอกจากนยงมยนทเกยวของอยางใกลชดกบ CRISPR เรยกวายน CRISPR-associated (cas) ซงสรางเอนไซม Nuclease, Helicase หรอ RNAse ทสามารถตดสายดเอนเอ หรออารเอนเอ จากกน และท�าใหเกลยวคของดเอนเอคลายออกจากกน
CRISPR และเอนไซมจากยน cas ท�างานรวมกนอยางเปนระบบในการท�าลายดเอนเอแปลกปลอม
ยน cas9 เปนยนในกลม Type-II CRISPR-Cas system (เรยกวา CRISPR/Cas9) ซงสรางเอนไซม Nuclease ทมขนาดใหญ สามารถท�าหนาทไดหลายอยางจนกระบวนการท�าลายดเอนเอ แปลกปลอมเสรจสมบรณ
CRISPR/Cas9 ตดดเอนเอดวยคว�มชวยเหลอของอ�รเอนเอนำ�ท�ง (ทมา: Callaway (2016))
เรองหม ๆ ท ไมหม
มความพยายามปลกถายอวยวะของสกรใหแกมนษยมานานแลว โดยประสบความส�าเรจในระดบหนง อยางไรกตาม เซลลของสกรมกมไวรสฝงชนดหนงตวอย เรยกวา Porcine Endogenous Retrovi-ruses: PERVs โดยดเอนเอของไวรสดงกลาวถกผนวกเปนสวนหนง
ของดเอนเอของสกร หากปลกถายอวยวะของสกรใหแกผปวย อาจท�าใหดเอนเอของไวรสดงกลาวรบกวนการท�างานของยนส�าคญของ ผปวย ซงอาจกอใหเกดโรคหรอมะเรง
จากคณสมบตดงกลาวขางตนของ CRISPR/Cas9 จงมแนวคดในการน�ามาประยกตใชเพอปรบแตงยนในสกรส�าหรบน�าอวยวะมาปลกถายในมนษย ผลการศกษาโดย Yang คณะในป 2015 พบวา การใช CRISPR/Cas9 เพอก�าจดดเอนเอของไวรสไดผลประมาณรอยละ 37 ซงตองท�าการศกษาตอไปเพอเพมประสทธภาพ
การทดลองทตนตาตนใจ
เดอนพฤศจกายน ค.ศ. 2013 ลงแสมฝาแฝดตวเมย ชอ หมงหมง และหลงหลง ไดถอก�าเนดขนทสถาบนวจยดานชวการแพทยในเมองคนหมง มณฑลยนนาน สาธารณรฐประชาชนจน เปนการถอก�าเนดแบบไมธรรมดา เนองจากกอนหนานนนกวทยาศาสตรไดทดลองใช CRISPR/Cas9 ไปการปรบเปลยนพนธกรรมของไขทผานการปฏสนธแลว โดยท�าการแกไขยนจ�านวน 3 ยน แลวฝงไขดงกลาวในแมลง ผลปรากฏวาลงฝาแฝดเกดมาโดยมสขภาพด การทดลองนจงเปนครงแรกท CRISPR ถกน�ามาใชเพอการปรบเปลยนพนธกรรมแบบก�าหนดเปาหมายทชดเจน อาจถอเปนจดเรมตนของยคใหมดานชวการแพทยในอนทจะรกษาโรคทมความซบซอน
ยนในจโนมของลงแสมฝ�แฝดคนถกปรบแตงไปถง 3 ยน (ทมา: http://www.technologyreview.com/featuredstory/526511/genome-editing/)
CRISPR ได รบการพฒนาโดยนกวจยทมหาวทยาลยแคลฟอรเนย เบรกลย ฮาวารด เอมไอท และทอน ๆ เปนเครองมอทเชอกนวาจะชวยใหนกวทยาศาสตรท�าการ “ศลยกรรมจโนม” ได คอนขางแมนย�าและงายดาย เปาหมายของการทดลองทคนหมง จงเปนการยนยนวาเทคโนโลยดงกลาวสามารถสรางลงทมการ กลายพนธหลายต�าแหนงในจโนมไดชดแจง
Focus&
>>> 12 July-August 2016, Vol.43 No.247
ปรบแตงจโนมตงแตหลงปฏสนธ
เดอนพฤษภาคมป ทแล ว เป นคร งแรกของโลกทนกวทยาศาสตรจนไดรายงานความส�าเรจของการปรบแตงจโนมของ ตวออนมนษย
คณะผวจยของมหาวทยาลยซนยดเซน ในเมองกวางโจว ซงน�าโดย Junjiu Huang เลอกน�าตวออนทจะไมสามารถเกดมาเปน สงมชวต (non-viable embryo) มาทดสอบ โดยไดตวออนจาก คลนกแหงหนงในทองถน คณะผวจยไดตดยนของโปรตนทมชอวา เบตาโกลบน (β-globin gene) ทผดปกต ซงเกยวของกบโรคโลหตจางเบตาธาลสซเมย (β-thalassemia) ออกจากจโนมโดยใชเอนไซม CRISPR/Cas9 ซงไดผลตามทคาดหวง แตประสทธภาพของการซอมแซมโดยเทคนค HDR ยงอยในระดบต�า คณะผวจยชแจงวา ผลการทดลองของพวกเขาแสดงใหเหนถงอปสรรคทส�าคญในการใชวธดงกลาวในทางการแพทย
“ผมเชอวานเปนรายงานแรกทแสดงการใช CRISPR/Cas9 กบตวออนของมนษยกอนการฝงในมดลก (pre-implantation em-bryo) การศกษานเปนหลกหมดส�าคญพอ ๆ กบเปนการเตอนไปในตว” George Daley นกชววทยาเซลลตนก�าเนดท Harvard Medical School ในบอสตนกลาว “การศกษาของพวกเขาเปนการเตอนอยางชดเจนไปยงผทคดวาเทคโนโลยนมความพรอมส�าหรบการทดสอบในการก�าจดยนทเปนสาเหตของโรค”
ความหวงกบความกงวล
บางคนเหนวาการแกไขยนในตวออนมอนาคตทสดใส เพราะเชอวาจะชวยก�าจดโรคทางพนธกรรมกอนทารกจะถอก�าเนด ในขณะทบางคนมองวางานวจยดงกลาวขามเสนจรยธรรม นกวจยบางคนเตอนวาการเปลยนแปลงพนธกรรมของตวออนเปนการปรบ-เปลยนระดบเซลลสบพนธ จงอาจเปนมรดกตกทอดทสามารถสงตอไปยงสงมชวตรนตอ ๆ ไปได และหากน�าเทคโนโลยนมาใชกบมนษย เราไมสามารถคาดเดาผลกระทบทจะเกดขนกบมนษยรนตอไปในอนาคต
Focus&
July-August 2016, Vol.43 No.247 13 <<<
อนทจรงเทคนคการฉดตวออนดวยเอนไซม CRISPR/Cas9 นถกน�ามาศกษากบเซลลของผใหญและตวออนของสตวแลว แตยง ไมเคยมรายงานการใชงานในตวออนมนษยเชนนมากอน
Huang และคณะตงใจใชเทคนคนเพอ “จดการ” ยนท เปนปญหาอยางจ�าเพาะเจาะจง โดยพวกเขาเลอกใชตวออนทถก สรางขนเพอใชในการปฏสนธในหลอดทดลอง (in vitro fertilization) แตตวออนนมโครโมโซมเพมขนมาอก 1 ชด (ปกตเซลลของคนมโครโมโซม 2 ชด) เพอปองกนไมใหตวออนดงกลาวเตบโตเปนตวเปนตนได แมจะเตบโตไปจนถงขนตอนแรกของการเจรญเตบโต (first stage development) ไดกตาม
คณะผวจยไมไดท�าการทดลองกบเซลลตวออนเพยงเซลลเดยว แตใชเซลลตวออนถง 86 เซลล โดยฉด CRISPR/Cas9 ใหแตละเซลล แลวรอเปนเวลา 48 ชวโมง ซงมากพอส�าหรบกระบวนการซอมแซมดเอนเอ ณ ยนเบตาโกลบน ผลปรากฏวามตวออน 71 เซลลทรอดชวต ในจ�านวนนม 54 เซลลทถกน�ามาทดสอบพนธกรรม และแสดงใหเหนวามเพยง 28 เซลลเทานนทยนเบตาโกลบนถกก�าจดออกไป นอกจากนมเพยงบางสวนนนทมการทดแทนดวยดเอนเอปกต
“ถาคณตองการทจะใชเทคนคนในตวออนปกต คณจะตองมนใจวามนไดผลเกอบ 100%” Huang กลาว “นนเปนเหตผลทเราหยดไวแคน เราคดวายงไมถงเวลา”
เดมรายงานนถกปฏเสธจากวารสาร Science และ Nature สวนหนงเพราะมการคดคานดานจรยธรรม ซง Huang ยอมรบ ค�าวจารณ แตเขาเสรมวา ขอวจารณทตงขอสงเกตวาการทดลอง มประสทธภาพต�าและมอตราการกลายพนธสงนน อาจเปนเพราะ ตวออนทใชในการศกษาเปนตวออนทผดปกต และเขาเลอกใช
ตวออนชนดนเพราะมความคลายคลงกบตวออนมนษยปกตมากกวาตวออนของสตวหรอเซลลของมนษยทเปนผใหญ
“เราตองการทจะแสดงขอมลของเราทเกดขนจรงกบตวออนทเราใช มากกวาเพยงการพดคยเกยวกบสงทจะเกดขนโดยไมมขอมลใด ๆ มารองรบ” เขากลาว
อยางไรกตาม Huang วางแผนทจะหาทางลดอตราการ กลายพนธ โดยทดลองในเซลลของมนษยทเปนผใหญหรอตวออน ของสตว รวมกบการใชเทคนคอน ๆ ทตางจากเดม เชน เทคนคท เรยกวา TALENs (Transcription Activator-Like Effector Nucleases) ซงเปนททราบกนดวาท�าใหเกดการกลายพนธทไมไดตงใจนอยกวา
Focus&
>>> 14 July-August 2016, Vol.43 No.247
คำาถามและคำาตอบ
แมการปรบแตงจโนม จะไดรบความสนใจมากขนเรอย ๆ แตยงคงมค�าถามบางประการทหลายคนยงของใจ ตอไปนคอค�าถามและ ค�าตอบส�าคญ ๆ ทควรร
คำ�ถ�ม สำ�คญอย�งไร เร�รอะไร ขนตอนตอไปคออะไร
1. เราจะลดผลกระทบทเกดกบยน ทมใชเปาหมายไดแคไหน
การปรบแตงจโนมอาจท�าใหเกดความเปลยนแปลงทยนซงไมใชเปาหมาย การใชเทคนคนในหองปฏบตการจงนากงวล และการใชเพอการรกษายงนากงวลกวา
การปรบแตงจโนมดวยเทคนค TALENs มความผดพลาดนอยกวาเทคนค ZFNs และ CRISPR/Cas9
สามารถเพมความจ�าเพาะเจาะจงของ CRISPR/Cas9 ดวยการปรบล�าดบเบสบนสายอารเอนเอน�าทาง (guide RNA) และโครงสรางของ CRISPR
2. การปรบแตงจโนมเหมาะกบการรกษาโรคประเภทใด
ยงเทคนคปรบแตงจโนมใชกบการรกษาโรคไดมากเพยงใด จะชวยใหผปวยไมตองทนทกขทรมานจากโรคเหลานนไดมากขนเปนเงาตามตว
มรายงานความส�าเรจในการใชเทคนคปรบแตงจโนมกบการรกษาผตดเชอ HIV จงมความหวงวาจะใชในการรกษาโรคทไมไดเกดจากพนธกรรมไดดวย
นกวจยตองพยายามหาวธทมประ-สทธภาพในการจดการกบเซลลทมยนเปาหมาย โดยทวไปใช Adenovirus เปนพาหะในการเชาถงเซลล แต CRISPR/Cas9 ทใชในปจจบนมขนาดใหญเกนไป
3. สามารถคาดการณผลกระทบจากการใชเทคนคปรบแตงจโนมไดหรอไม
นกวจยตองสามารถก�าหนดผลทจะเกดขนกบเซลลจากการเปลยนแปลงดเอนเอแมเพยงเลกนอยได
มยาหลายรายการท ใช ร กษาโรค ลมบาหม (epilepsy) หรอมะเรง ดวยการเปลยนโครงสรางทางเคมของ ดเอนเอ แตไมไดเปลยนล�าดบเบส โดยยงไมทราบกลไกทแนชด
นกวจยพยายามปรบปรงเครองมอทใชในการปรบแตงจโนมเพอใหมความแมนย�ามากทสด โดยหวงวาจะท�าใหการแสดงออกของยนเปนไปตามทคาดหวง
4. เราควรจะปรบแตงจโนมของเซลลตวออนมนษยหรอไม
การปรบแตงพนธกรรมอาจชวยปองกนไมใหมการถายทอดโรคไปยงคนรน ตอไปได แตเปนการเปลยนแบบถาวรโดยทเรายงไมทราบกลไกการแสดงของยนอยางแทจรง นอกจากนอาจมคนน�าไปใชในทางทผด
การทดสอบการปรบแตงจโนมในเซลลตวออนของมนษยแบบ Non-Viable Cell เปนการทดสอบวาแนวคดมความเปนไปได โดยยงมอตราความลมเหลวสง หากการปรบแตงในเซลลตวออนแบบ Viable Cell ประสบความส�าเรจ การน�าไปฝงไวในมดลกเปนเรองทจะเกดขนในเวลาอนใกล
นกวทยาศาสตรตองท�างานอยาง ใกลชดกบรฐบาล และตองเปดโอกาสใหสาธารณะแสดงความเหนในการจดท�าแนวปฏบต (guidelines) ในการก�ากบดแลการวจยและการทดสอบทางคลนก และตองบงคบใชอยางจรงจง
เอกสารอางอง
1. http://www.technologyreview.com/featuredstory/526511/
genome-editing/
2. Callaway E. (2016) For the first time, scientists win approval
to edit human embryo genomes. Sci Am. (http://www.scientificamerican.
com/article/biologists-create-more-precise-molecular-scissors-for-ge-
nome-editing/, February 1, 2016)
3. Yang L, et al. (2015) Genome-wide inactivation of porcine
endogenous retroviruses (PERVs). Science, published online October 11,
2015.
4. Liang P, et al. (2015) CRISPR/Cas9-mediated gene editing
in human tripronuclear zygotes. Protein & Cell, 6(5): 363-372.
5. Cox DBT, et al. (2015) Therapeutic genome editing: pros-
pects and challenges. Nat. Medicine 21(2): 121-131.
6. Saey TH et al. (2015) Editing human germline cells sparks
ethics debate. Science News. 187: 16
7. Cyranoski D & Reardon S. (2015) Chinese scientists ge-
netically modify human embryos. Nature doi:10.1038/nature.2015.17378