1. RÓWNOWAGA GENETYCZNA POPULACJI -...
Transcript of 1. RÓWNOWAGA GENETYCZNA POPULACJI -...
ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT 1. RÓWNOWAGA GENETYCZNA POPULACJI
Prowadzący: dr Wioleta Drobik
Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt
Fot. W. Wołkow
POPULACJA
Zbiór organizmów żywych, które łączy jakaś własność, np.: przynależność do jednostki systematycznej
bytują w danym środowisku
Subpopulacja: grupa osobników danego gatunku zajmujących dane siedlisko
Cechy charakterystyczne: Wielkość, liczebność, gęstość
Określona struktura wieku i płci
Organizacja przestrzenna, socjalna, zdolność do ruchu i migracji
Różnorodność genotypowa i fenotypowa
Procesy wewnątrzpopulacyjne (rozrodczość, śmiertelność)
GENETYKA POPULACJI
Nauka która respektując zasady dziedziczenia z zakresu genetyki klasycznej bada mechanizmy dziedziczenia w odniesieniu do populacji
Struktura genetyczna:
opis alleli i genotypów w poszczególnych loci wraz z częstością (prawdopodobieństwem) ich występowania w populacji
STRUKTURA GENETYCZNA POPULACJI
- A2
- A1
W populacji organizmów haploidalnych frekwencja alleli jest równa frekwencji genotypów
N – ogólna liczba osobników
m – liczba alleli w danym locus
A – umownie oznaczamy allel dominujący
a – umownie oznaczamy allel recesywny
Loci dwualleliczne:
p = częstość alellu A, p=P+1/2Q, p ≤1
q = częstość allelu a, q=R+1/2Q, q≤1
Trzy formy genotypów:
P = częstość występowania homozygot dominujących AA
Q = częstość występowania heterozygot Aa
R = częstość występowania homozygot recesywnych aa
Loci wieloalleliczne – liczba możliwych genotypów:
m(m+1)/2
STRUKTURA GENETYCZNA POPULACJI
p + q = 1
STRUKTURA GENETYCZNA POPULACJI
A a
Locus D u kotów odpowiedzialne jest za rozjaśnienie podstawowej barwy sierści. W locus tym występują dwa allele, z których jeden ma charakter dominujący (A), natomiast drugi recesywny (a). Podaj frekwencje alleli i genotypów dla poniższej populacji.
PRAWO HARDY’EGO-WEINBERGA
W populacji znajdującej się w stanie równowagi genetycznej częstość występowania genotypów zależy wyłącznie od częstości alleli i jest stała z pokolenia na pokolenie
p2 = frakcja homozygot AA
2pq = frakcja heterozygotyczna
q2 = frakcja homozygot aa
(p + q)2 = p2 + 2pq + q2 = 1
ZAŁOŻENIA DO PRAWA HARDY’EGO I WEINBERGA
1. Organizmy są diploidalne
2. Rozmnażanie płciowe
3. Pokolenia nie zachodzą na siebie
4. Rozpatrywane są pojedyncze loci
5. Kojarzenia wyłącznie losowe
6. Populacja jest nieskończenie liczna
7. Brak wpływu czynników zewnętrznych, które mogą zmieniać frekwencję genów i genotypów Migracja
Dryf genetyczny
Selekcja
Mutacje
CZĘSTOŚĆ GENOTYPÓW WYNIKAJĄCA Z PRAWA HARDY’EGO I WEINBERGA
Częstość allelu a
Czę
sto
ść g
eno
typ
u
Heterozygotyczność oczekiwana (He) –
frekwencja heterozygot oszacowana dla frekwencji alleli danego locus w populacji w warunkach równowagi Hardy’ego-Weinberga.
Heterozygotyczność obserwowana (Ho) –
rzeczywista frekwencja heterozygot występujących w populacji.
RÓWNOWAGA HARDY’EGO-WEINBERGA A ANALIZA STRUKTURY GENETYCZNEJ POPULACJI
Odstępstwa od równowagi HW świadczą o obecności procesów demograficznych, które zmieniają (zaburzają)
frekwencje i rozkład alleli
ZADANIA:
1) U muszek owocówek szara barwa tułowia warunkowana jest dominującym allelem A, podczas gdy czarna allelem recesywnym a. Do słoika wpuszczono 210 szarych homozygotycznych drozofili oraz 90 czarnych.
1) Oblicz częstość alleli wyznaczających barwę tułowia.
2) Czy populacja jest w równowadze genetycznej?
3) Oblicz oczekiwany rozkład alleli, genotypów i fenotypów w pokoleniu F1
2) Oblicz heterozygotyczność oczekiwaną dla każdej z populacji w tabeli. Która z nich znajduje się w równowadze genetycznej?
3) Oblicz częstość występowania alleli i genotypów w populacji liczącej 1000 muszek, z których 840 ma szarą barwę tułowia, a 520 jest homozygotami.
populacja\genotypy AA Aa aa
1 - 15 125
2 98 84 18
3 49 60 49
GENY SPRZĘŻONE Z PŁCIĄ
Geny zlokalizowane na chromosomach płci np. hemofilia, daltonizm
Hemofilia
Gen odpowiedzialny za krzepliwość krwi jest zlokalizowany na chromosomie X i oznacza się go H, recesywny allel tego genu h, jest odpowiedzialny za hemofilię
PRAWO HARDY’EGO-WEINBERGA DLA GENÓW SPRZĘŻONYCH Z PŁCIĄ
U samców częstość genotypów równa jest częstości alleli
p+q=1
U samic częstość genotypów wyrażana jest klasycznym wzorem na prawo H-W
p2+2pq+q2=1
ZADANIA:
Kolor rudy u kotów związany jest z locus położonym na chromosomie X. W locus tym mogą występować dwa allele. Allel O blokuje produkcje eumelaniny (zależnie od typu: kolor czarny, czekoladowy, cynamonowy) oraz allel o, który nie blokuje produkcji eumelaniny. Możliwe genotypy:
Oo – szylkretowe, OO – rude, oo – czarne (lub inne…)
p - frekwencja allelu O
q - frekwencja allelu o
1. Szylkretowa kotka urodziła kocięta, wśród których były rude kotki oraz dwa koty – jeden rudy, drugi czarny. Jaki był samiec.
2. Ile będzie kotów czarnych, rudych i szylkretowych w populacji liczącej 1000 osobników w której p=q. *Przyjmujemy równą liczbę samców i samic
Źródło: http://zszywka.pl/p/kochana-szylkretowa-kotka-3-5237470.html